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kobas 3.0 做基因功能富集

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生信编程日常
发布2020-04-01 16:30:56
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发布2020-04-01 16:30:56
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文章被收录于专栏:生物信息学、python、R、linux

http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3 KOBAS是一种广泛使用的基因富集(GSE)分析工具。它的版本1.0和2.0分别于2005年和2011年发。当前版本是KOBAS 3.0,该版本于2019年底发布,涵盖了5945种具有已知知识的物种。 KOBAS做基因富集,它可以接受基因列表或基因表达数据作为输入,结果生成富集的gene sets。之前的版本不支持gene symbol的输入,最新的3.0是支持的。更多的功能及方法:http://kobas.cbi.pku.edu.cn/kobas3/help/ 如果需要基因id转化,可以用这个网站:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php

可以按照需要做以下的分析:

提交就可以了。

同时,KOBAS还提供了注释功能,可以查询一个基因的不同名称

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