小鼠早期胚胎发育空间转录组查询网站

小鼠早期胚胎发育，尤其是原肠运动时期的胚层谱系建立及细胞命运决定的分子机制尚不清晰，虽然单细胞转录组分析可以重建胚胎细胞的发育轨迹，但缺乏真实的空间位置信息，无法将发育调控过程中的时间和空间信息联合分析。为解决这一难题，景乃禾课题组及其合作团队建立了一种空间转录组分析方法—Geo-seq，并利用该技术对小鼠早期胚胎发育多个时期（E5.5、E6.0、E6.5、E7.0和E7.5）的外、中、内三个胚层构建空间转录组，建立起百科全书式全基因组的时空表达数据库（http://egastrulation.sibcb.ac.cn/）。此数据库实现了小鼠早期胚胎所有表达基因高分辨率的数字化原位杂交图谱，可供其他研究者查询和分析基因的三维表达模式、共表达关系以及根据特征表达模式检索基因等。

这是目前国际上关于小鼠原肠运动时期最全面、最完整的交互性时空转录组数据库。如果研究早期胚胎发育的话，可以通过http://egastrulation.sibcb.ac.cn对某个感兴趣的基因在空间上的表达进行查询：

参考：http://egastrulation.sibcb.ac.cn https://www.sohu.com/a/332232776_650136