Chimera操作—No.1

目的：

（1）使用Chimera测量分子体积以及表面积 （2）测量接触体积以及表面积

材料：

1STP，1UNA

步骤

1：单独测量分子体积或者表面积

Select-Chain-A Action-Surface-Show

操作顺序：Tools-Surface/Binding Analysis –Measure Volume and Area

一个是配体的表面积，一个是受体的表面积，Volume的单位为埃的3次方，Area的单位为埃的2次方

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结果

2:测量分子接触表面积

1STP将蛋白与配体分割为两个文件后，一起导入

Tools-Surface/Binding Analysis-Intersurf

Ctrl-全选-Apply

结果

测量：Tools-Surface/Binding Analysis-Mearsure Volume and Area

结果：

3:测量蛋白接触表面积

File-Fetch by id -1UNA

Action-Focus

Tools-Surface/Binding Anslysis-Intersurf

Chain-Ctrl-全选

结果

表面积与体积