我国重组蛋白疫苗III期临床保护效力结果在《新英格兰医学杂志》正式发表

2022年5月4日，我国获得附条件上市的新冠重组蛋白疫苗ZF2001（商品名：智克威得®）的III期临床试验结果在国际顶级医学学术期刊《新英格兰医学杂志》在线发...

伊马替尼(imatinib)之后20年激酶药物研发进展

2001年，第一种激酶抑制剂伊马替尼(imatinib)获得批准，用于治疗慢性髓系白血病。在此之后，该领域又了重大进展，随后70多种激酶抑制剂获得批准。

超量化合物库筛选策略–P4

注：对于SMARTS不是很熟悉，所以，我在怀疑某些SMARTS写错了，从其余地方进行查找，更新了反应物的SMARTS，放在这里。

超量化合物库筛选策略–P3

[1] Kearnes S M , Maser M R , Wleklinski M , et al. The Open Reaction Database...

超量化合物库筛选策略–P2

[2] Grygorenko O O , Radchenko D S , Dziuba I , et al. Generating Multibillion...

超量化合物库筛选策略–P1

好久不见，已变成年羹尧。这篇文章好久之前就注意到了，去年的刷了一波屏。组合化学和分子对接的交叉，看起来效果还是不错的。

如何使用VS-code与远程服务器连接

一般情况下使用MobaXterm，putty或者直接使用终端与远程服务器连接。目前为止，MobaXterm体验比较好，但是他并不支持mac。所以，我一直采用的替...

Python与PubMed

这期是和半月刊一起在出，本来的想法是，使用Python构建一个可以自动整理文献的工具

半月刊--2021/12/15

To See 奥密克戎

你可以在这个链接查看我的分享:https://3dproteinimaging.com/protein-imager/?projectId=mvNYjIztkc...

量子计算与从头药物设计

对靶向特定靶点的类药性药物的设计以及优化是早期药物发现的一个重要阶段。在本文中，作者描述了一个新的lead-like 的设计策略，基于 Dengue 的 RDR...

Protein Imager-漂亮的蛋白作图网页

https://3dproteinimaging.com/about-protein-imager/

分子对接与量子计算

高斯玻色子采样器是光子量子器件，具有解决一些经典系统较难处理问题的能力。 在这里，作者展示了高斯玻色子采样器可用于分子对接，这一药物设计领域的核心问题。作者开...

【蛋白设计】Anchor extension:一种结构导向方法设计靶向酶活性位点环肽

美国华盛顿大学的David Baker教授研究组的Parisa Hosseinzadeh开发了一种新型的基于结构从头设计环状多肽的通用方法，该方法利用了已知与感...

CVPR 2021 | dMaSIF：基于蛋白质表面信息的高效端到端表征学习

今天给大家介绍发表在CVPR2021上的一项工作。在这项工作中，作者提出了一个新的蛋白质结构深度学习框架。该方法将蛋白质原子原始 3D 坐标和化学类型作为输入，...

每周一览--2021/08/17

Vina 1.2.0 --一次10年的更新

Vina 作为使用最广的对接软件之一，上一版本的 Vina 1.1.2 发布于 2010 年，已经有 10 年没有更新，最近终于更新了新版本，来尝尝鲜。vina...

AlphaFold--人类全基因组的蛋白预测！！！

人类基因组拥有大约20000种蛋白质。但只有大约三分之一有实验确定的三维结构。而且很多结构只是部分已知。

准备好迎接蛋白设计的时代了吗？--AlphaFold2的两种使用方式

AF2已经出了一段时间，上次试了试RoseTTAFold，这次试试AlphaFold2.

拯救SciHub

Sci Hub是一个免费文献下载网站，通过各种方式绕过出版商的付费墙，使得研究者可以免费访问数百万篇研究论文和书籍。Sci Hub由Alexandra Elba...