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手把手教你如何解决日常工作中的缺失值问题(方法+代码)

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发布2021-12-06 13:39:14
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发布2021-12-06 13:39:14
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文章被收录于专栏:数据分析1480数据分析1480

圣人曾说过:数据和特征决定了机器学习的上限,而模型和算法只是逼近这个上限而已。

再好的模型,如果没有好的数据和特征质量,那训练出来的效果也不会有所提高。数据质量对于数据分析而言是至关重要的,有时候它的意义会在某种程度上会胜过模型算法。

https://blog.csdn.net/SeafyLiang/article/details/115671683

数据缺失的原因

首先我们应该知道:**数据为什么缺失?**数据的缺失是我们无法避免的,可能的原因有很多种,博主总结有以下三大类:

  • 无意的:信息被遗漏,比如由于工作人员的疏忽,忘记而缺失;或者由于数据采集器等故障等原因造成的缺失,比如系统实时性要求较高的时候,机器来不及判断和决策而造成缺失;- 有意的:有些数据集在特征描述中会规定将缺失值也作为一种特征值,这时候缺失值就可以看作是一种特殊的特征值;- 不存在:有些特征属性根本就是不存在的,比如一个未婚者的配偶名字就没法填写,再如一个孩子的收入状况也无法填写;总而言之,对于造成缺失值的原因,我们需要明确:是因为疏忽或遗漏无意而造成的,还是说故意造成的,或者说根本不存在。只有知道了它的来源,我们才能对症下药,做相应的处理。

数据缺失的类型

在对缺失数据进行处理前,了解数据缺失的机制和形式是十分必要的。将数据集中不含缺失值的变量称为完全变量,数据集中含有缺失值的变量称为不完全变量。而从缺失的分布来将缺失可以分为完全随机缺失随机缺失完全非随机缺失

  • 完全随机缺失(missing completely at random,MCAR):指的是数据的缺失是完全随机的,不依赖于任何不完全变量或完全变量,不影响样本的无偏性,如家庭地址缺失;- 随机缺失(missing at random,MAR):指的是数据的缺失不是完全随机的,即该类数据的缺失依赖于其他完全变量,如财务数据缺失情况与企业的大小有关;- 非随机缺失(missing not at random,MNAR):指的是数据的缺失与不完全变量自身的取值有关,如高收入人群不原意提供家庭收入;对于随机缺失和非随机缺失,直接删除记录是不合适的,原因上面已经给出。随机缺失可以通过已知变量对缺失值进行估计,而非随机缺失的非随机性还没有很好的解决办法。

缺失处理

方式1:删除

直接去除含有缺失值的记录,这种处理方式是简单粗暴的,适用于数据量较大(记录较多)且缺失比较较小的情形,去掉后对总体影响不大。一般不建议这样做,因为很可能会造成数据丢失、数据偏移。

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func: df.dropna(axis=0, how='any', thresh=None, subset=None, inplace=False)

# 1、删除‘age’列
df.drop('age', axis=1, inplace=True)

# 2、删除数据表中含有空值的行
df.dropna()

# 3、丢弃某几列有缺失值的行
df.dropna(axis=0, subset=['a','b'], inplace=True)

直接去除缺失变量,基于第一步我们已经知道每个变量的缺失比例,如果一个变量的缺失比例过高,基本也就失去了预测意义,这样的变量我们可以尝试把它直接去掉。

代码语言:javascript
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# 去掉缺失比例大于80%以上的变量
data=data.dropna(thresh=len(data)*0.2, axis=1)

方式2:常量填充

在进行缺失值填充之前,我们要先对缺失的变量进行业务上的了解,即变量的含义、获取方式、计算逻辑,以便知道该变量为什么会出现缺失值、缺失值代表什么含义。比如,‘age’ 年龄缺失,每个人均有年龄,缺失应该为随机的缺失,‘loanNum’贷款笔数,缺失可能代表无贷款,是有实在意义的缺失。全局常量填充:可以用0,均值、中位数、众数等填充。平均值适用于近似正态分布数据,观测值较为均匀散布均值周围;中位数适用于偏态分布或者有离群点数据,中位数是更好地代表数据中心趋势;众数一般用于类别变量,无大小、先后顺序之分。

代码语言:javascript
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# 均值填充
data['col'] = data['col'].fillna(data['col'].means())
# 中位数填充
data['col'] = data['col'].fillna(data['col'].median())
# 众数填充
data['col'] = data['col'].fillna(stats.mode(data['col'])[0][0])

也可以借助Imputer类处理缺失:

代码语言:javascript
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from sklearn.preprocessing import Imputer
imr = Imputer(missing_values='NaN', strategy='mean', axis=0)
imputed_data =pd.DataFrame(imr.fit_transform(df.values),columns=df.columns)
imputed_data

方式3:插值填充

采用某种插入模式进行填充,比如取缺失值前后值的均值进行填充:

代码语言:javascript
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#  interpolate()插值法,缺失值前后数值的均值,但是若缺失值前后也存在缺失,则不进行计算插补。
df['c'] = df['c'].interpolate()

# 用前面的值替换, 当第一行有缺失值时,该行利用向前替换无值可取,仍缺失
df.fillna(method='pad')

# 用后面的值替换,当最后一行有缺失值时,该行利用向后替换无值可取,仍缺失
df.fillna(method='backfill')#用后面的值替换

下述2个方式需要先处理数据

代码语言:javascript
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# 需要先对a列数据做插值填充,后续作为训练数据
df['a'] = df['a'].interpolate()

# 拆分空数据和非空数据
df_notnull = df[df.is_fill==0] # 非空数据
df_null = df[df.is_fill==1] # 空数据
x_train = df_notnull[['b', 'a']] # 训练数据x, a,b列
y_train = df_notnull['c'] # 训练数据y, c列(目标)
test = df_null[['b', 'a']] # 预测数据x, a,b列

方式4:KNN填充

利用knn算法填充,其实是把目标列当做目标标量,利用非缺失的数据进行knn算法拟合,最后对目标列缺失进行预测。(对于连续特征一般是加权平均,对于离散特征一般是加权投票) sklearn类

代码语言:javascript
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from sklearn.neighbors import KNeighborsClassifier, KNeighborsRegressor
def knn_filled_func(x_train, y_train, test, k = 3, dispersed = True):
    # params: x_train 为目标列不含缺失值的数据(不包括目标列)
    # params: y_train 为不含缺失值的目标列
    # params: test 为目标列为缺失值的数据(不包括目标列)
    if dispersed:
        knn= KNeighborsClassifier(n_neighbors = k, weights = "distance")
    else:
        knn= KNeighborsRegressor(n_neighbors = k, weights = "distance")

    knn.fit(x_train, y_train.astype('int'))
    return test.index, knn.predict(test)

index,predict = knn_filled_func(x_train, y_train, test, 3, True)

方式5:随机森林填充

随机森林算法填充的思想和knn填充是类似的,即利用已有数据拟合模型,对缺失变量进行预测。

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from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor, RandomForestClassifier

def RandomForest_filled_func(x_train, y_train, test, dispersed = True):
    # params: x_train 为目标列不含缺失值的数据(不包括目标列)
    # params: y_train 为不含缺失值的目标列
    # params: test 为目标列为缺失值的数据(不包括目标列)
    if dispersed:
        rf= RandomForestRegressor()
    else:
        rf= RandomForestClassifier()

    rf.fit(x_train, y_train.astype('int'))
    return test.index, rf.predict(test)

index,predict = RandomForest_filled_func(x_train, y_train, test, True)

预测完成后处理操作

代码语言:javascript
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# 填充预测值
df_null['c'] = predict
# 回填到原始数据中
df['c'] = df['c'].fillna(df_null[['c']].c)
df.info()


效果预览

红色为填充数据,绿色为原始数据 上图为随机森林填充 下图为插值填充

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原始发表:2021-12-06,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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  • 数据缺失的原因
  • 数据缺失的类型
  • 缺失处理
    • 方式1:删除
      • 方式2:常量填充
        • 方式3:插值填充
          • 方式4:KNN填充
            • 方式5:随机森林填充
            • 效果预览
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