ggplot2绘制科研数据柱状图~
导语
GUIDE ╲
ggplot2是一个神奇的R包，可以可视化各种各样的统计数据。
背景介绍
ggplot2是一个神奇的R包，可以将自己的统计数据绘制成想要的图案。从今天起小编计划为各位观众老爷们带来一个ggplot2的系列教程。那么首先呢，大家在可视化自己的科研数据时，最最最常用的就是绘制一个带误差或者显著值的柱状图。
R包展示
01
R包载入
tidyverse是一个数据处理的R包的集合，包括ggplot2 (可视化数据) ，dplyr(处理数据)，tidyr(清理数据)，readr(读取数据)，stringr (处理字符串)等等好多个常用的R包。我们直接安装tidyverse即可。
install.packages("tidyverse")
library(tidyverse)02
最最基础的柱状图
我们首先随机生成一个用来画柱状图的数据框，这里小编以一个正态分布数据为例，用ggplot画一个五彩斑斓的柱状图。
#随机生成正态分布的数据框
num<-rnorm(5,mean=3,sd=1)
group<-c('A','B','C,','D','E')
frame<-data.frame(group,num)
#ggplot绘制柱状图
ggplot(frame,aes(group,num,fill=group)) + geom_col()
03
修改一些参数
我们发现柱状图有一丢丢粗糙，那就修改一下高度宽度，加上误差线、每组的数字或显著值。参数有geom_errorbar误差线，geom_errorbarh水平误差线，geom_point 点，geom_pointrange垂直线，geom_text文本等。
num<-rnorm(5,mean=3,sd=1)
num<-round(num,2)
group<-c('A','B','C,','D','E')
frame<-data.frame(group,num)
mean=3
sd=1
#绘制柱状图
ggplot(frame,aes(group,num,fill=group))+
geom_col()+
#加误差线
geom_errorbar(aes(group,
ymin=mean-sd,
ymax=mean+sd,
color=group),width=0.6,size=1)+
#改坐标名
xlab("Group")+ylab("OR")+
#在柱状图上加数字
geom_text(aes(label=num, vjust = -0.9, hjust = 0.4, color = group), show.legend = TRUE)
给每个柱子加标签和加加文字/数字类似。
ggplot(frame,aes(group,num,fill=group))+
geom_col()+
geom_errorbar(aes(group,
ymin=mean-sd,
ymax=mean+sd,
color=group),width=0.6,size=1)+
xlab("Group")+ylab("OR")+
theme(legend.position ="none",
axis.title = element_text(size=15),
axis.text = element_text(size=15))+
annotate("text",x=1,y=4.15,label="*",size=10)+
annotate("text",x=2,y=4.15,label="**",size=10)+
annotate("text",x=3,y=4.15,label="***",size=10)+
annotate("text",x=4,y=4.15,label="*",size=10)+
annotate("text",x=5,y=4.15,label="**",size=10)
04
叠加柱状图
有时候我们的数据是多维的，这时就需要叠加柱状图（叠加/分组/比例）。由于数据比较复杂不方便自己创建，我们这里使用ggplot2自带的汽车数据集mpg为例绘制叠加柱状图。
如果我们直接绘制原始数据的柱状图，显示的是每种汽车种类及其个数。
ggplot(mpg,aes(x=class)) + geom_bar()
但是如果绘制堆叠图，就可以把多维度数据融合进来，例如汽车的年份（year），手动档还是自动档（trans）等。
ggplot(mpg,aes(x=class)) + geom_bar(aes(fill=factor(year)),position="stack") 
ggplot(mpg,aes(x=class)) + geom_bar(aes(fill=factor(trans)),position="stack")
叠放方式还可以换成分组并排放置。
ggplot(mpg,aes(x=class)) + geom_bar(aes(fill=factor(year)),position="dodge")
小编总结
大家快来DIY自己想要的柱状图吧！
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原始发表：2022-01-13，如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除
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