R记录 - 最近在学习写一个R包

最近在学习写一个R包，本文对学习过程做一个简单整理。

因为课题需要，最近需要实现一个数据可视化的功能。因为ggplot2提供了扩展接口，所以就想着基于ggplot2实现这个功能。看了一些文档之后（见文末），就开始动手实现了。

开始还比较顺利，通过ggproto创建了一些新的Geom类。在拓展一些新功能的时候发现调用另一个包的函数总是失败，我猜想可能是和environment有关。用了这么久的R却对environment一知半解，只得上网去找详细资料。一番搜索后找到一本"Advanced R"，参照修改。最后尝试打包成package，有很不错的文档可以参照学习（见文末）。

一般来说，当你需要通过R实现一个功能并想要分享给别人时，R包是一个不错的选择。对于像我一样的新手来说，从简单功能（比如R包只包含几个简单的函数）开始应该是比较合适的。

我的这次学习参照了一些在线文档，回过头来才发现这些文档都是出自Hadley Wickham（以及他的合作者）之手。在此列出这些文档，以供参考。

（尤其推荐"Advanced R"这本书，里面介绍了R的设计哲学。从这本书第一节开始就让我耳目一新。比如第一节讲变量，提到R里面变量的引用采用了copy-on-modify的策略，也就是说只有当引用变量对值修改时才会进行一份拷贝。我以前一直以为是引用时就会进行拷贝）

文档列表：

与R语言（设计理念）有关的

• "Advanced R" (2ed, free online) https://adv-r.hadley.nz/index.html

与R包开发有关的

• "R packages" (2ed, free online) https://r-pkgs.org/index.html

与ggplot2扩展开发有关的

• "ggplot2: elegant graphics for data analysis" (3ed, free online) https://ggplot2-book.org/index.html
• "Extending ggplot2" (from tidyverse vignettes) https://ggplot2.tidyverse.org/articles/extending-ggplot2.html

-- “生信了”公众号 2022年6月