R语言笔记-3
原创
生信技能树-数据挖掘课程笔记
函数与参数
#查看函数使用方法
?rep()函数的帮助文档：
- 函数分为形式参数和实际参数
- 形式参数由函数作者指定，使用者输入实际参数时可省略实际参数
函数的自定义
#自定义函数
cal = function(a,b,c = 2){(a+b)*c} #c=2为函数默认值
cal(1,2)
cal(1,2,3) #函数默认值可更改输出结果：
R包的安装
R包库：CRAN、Bioconductor
CRAN：R包默认的安装库
Bioconductor：生信相关的R包库
#设置CRAN和Bioconductor的国内镜像
options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
#CRAN安装R包
install.packages("tidyr")
install.packages('BiocManager')
#Bioconductor安装R包
BiocManager::install("ggplot2")
# 清华镜像
# http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/
# http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/
# 中科大镜像
# http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/
# http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/
#CARN更新所有R包
update.packages()library()和require()是检验R包是否安装成功的金标准WARNING一般不会有影响，ERROR尤其注意BiocManager::install()相当于library(BiocManager)和install()
R包安装常见问题
- package not available R包名输入错误 安装命令使用错误 R语言版本与R包要求不符（极少情况） R包过时，被作者删除
- 加载某一R包，报错提醒另一R包不存在 安装所需的依赖包 更新所有安装包
- not writable / permission denied 权限问题，管理员方式打开Rstudio
- ？？？？？？？ 中文用户名引起，修改系统环境变量
#require()载入安装包，若载入成功，返回TRUE
if(!require(stringr))install.packages("stringr") #载入stringr，若未安装，安装stringr
#列出R包中所有的函数和数据
ls("package:stringr")
原创声明：本文系作者授权腾讯云开发者社区发表，未经许可，不得转载。
如有侵权，请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。
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