自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘
虽然现在是高通量测序的时代,但是GEO、ArrayExpress等数据库储存并公开大量的基因表达芯片数据,还是会有大量的需求去处理芯片数据,并且建模或验证自己所...
如果我们要展示特定通路,需要提前筛选,如我只关注炎症和免疫反应相关的通路(查资料且保证原始k k@result中有对应通路)。
我们在可视化集合之间关系的时候,常常会绘制韦恩图。但随着集合的增多,韦恩图显示的关系会越来越复杂,很难一眼看出其中的信息。这种情况下我们需要使用 UpSetR ...
基于RNA-seq的差异表达分析Differential expression analysis的背景及标准流程。
Lg<-log (10) #计算10的自然对数值 其中, log (10)为命令, Lg 为命令产生的结果名 R 程序代码大小写必须区分, Lg ...
提示You can undo this by running conda init --reverse $SHELL 输入 yes
官网下载anaconda3,安装过程选择默认,记得勾选将anaconda放入环境变量。
对于互联网内容的自动化抓取,R语言提供了强大的工具和库来帮助我们实现这一目标。本文将介绍如何使用R语言进行头条主页内容的自动化下载,包括必要的库安装、代理服务器...
今天开始进行R语言可视化的练习,主要参照的是文献《Preoperative immune landscape predisposes adverse outco...
序列行:一个字母代表一个碱基/氨基酸,为ATCGN或20种氨基酸。#N代表在测序中无法确定具体是什么碱基
1.Gene Expression Omnibus (GEO): GEO是一个公共数据库,收集了来自全球研究机构的大量基因表达数据,其中包括很多单细胞测序数据。
R包直接在Rstudio页面下载的3大来源:官网CRAN、Biocductor、github