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#r 语言

自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘

单细胞分析一 下载数据,加载Seurat 包

用户11173986

参考教程:单细胞实战(1)数据下载-数据读取-seurat对象创建-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)

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识别差异微生物的方法汇总

生信学习者

现在 Nearing, Douglas et al. Nature Comm. Microbiome differential abundance method...

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文章MSM_metagenomics(六):复杂热图绘制

生信学习者

complexheatmap_plotting_funcs.R来自于R可视化:微生物相对丰度或富集热图可视化参考章节,它提供了充足的说明

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文章MSM_metagenomics(五):共现分析

生信学习者

本教程是使用一个Python脚本来分析多种微生物(即strains, species, genus等)的共现模式。

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文章MSM_metagenomics(四):Beta多样性分析

生信学习者

本教程旨在使用基于R的函数以及Python脚本来估计使用MetaPhlAn profile的微生物群落的Beta多样性

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文章MSM_metagenomics(三):Alpha多样性分析

生信学习者

本教程使用基于R的函数来估计微生物群落的香农指数和丰富度,使用MetaPhlAn profile数据。估计结果进一步进行了可视化,并与元数据关联,以测试统计显著...

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R07-R语言的综合应用

坚不可崔同学

x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."

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R06-R语言作图

坚不可崔同学

geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length, y = Petal.Length,color = Species))

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R可视化:微生物相对丰度或富集热图可视化

生信学习者

热图(Heatmap)是一种数据可视化方法,它通过颜色的深浅或色调的变化来展示数据的分布和密度。在微生物学领域,热图常用于表示微生物在不同分组(如不同的环境、时...

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不同安装R语言的R包的方法

生信学习者

在R语言中,安装R包是数据分析过程中不可或缺的一部分。当你需要执行特定的统计测试、可视化或其他任务时,你可能会发现相应的功能已经被封装在一个或多个R包中。然而,...

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Day6_鸭鸭

淘淘爱做白日梦

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

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生物信息初学者教程(癌症转录组学)

生信学习者

在生物信息学(生信)领域,随着高通量测序技术的不断发展,大量数据涌现,为科研工作者提供了丰富的资源。然而,对于初学者而言,如何从海量的数据中挖掘有价值的信息,并...

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生信入门 第六天

用户11153857

An R package is a set of R functions. Using dplyr as an example to learn R packa...

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全网最全的R语言基础图形合集

生信学习者

直方图是一种对数据分布情况进行可视化的图形,它是二维统计图表,对应两个坐标分别是统计样本以及该样本对应的某个属性如频率等度量。

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学习R包

用户11155150

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

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手把手教你R语言方差分析ANOVA

生信学习者

方差分析(ANOVA)是一种统计方法,用于比较两组或多组数据之间的均值差异。在R语言中,实现方差分析主要涉及到以下步骤:

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生信入门 第五天

用户11153857

This is my day 5 homework for BIC by 生信星球.

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数据结构

用户11155150

(2)在Console 控制台(左下)输入命令,相当于Linux的命令行,右上是脚本窗口

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Day5_鸭鸭

淘淘爱做白日梦

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R语言生存分析和科研绘图

生信学习者

生存分析的目的是分析某个时间点的“生存概率”是多少。基于这样的研究目的,需要提供生存数据,它是一种由不同的开始时间和结束时间组成的事件-时间的数据,比如在癌症研...

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