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首页标签r 语言

#r 语言

自由软件编程语言与操作环境,主要用于统计分析、绘图、数据挖掘

从头学R语言——DAY 4

橙子7

1.Gene Expression Omnibus (GEO): GEO是一个公共数据库,收集了来自全球研究机构的大量基因表达数据,其中包括很多单细胞测序数据。

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从头学R语言——DAY 3

橙子7

R包直接在Rstudio页面下载的3大来源:官网CRAN、Biocductor、github

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GEO数据库学习

用户11211038

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从头学R语言——DAY 2

橙子7

数据框data.frame是二维结构,要求每一列为同一数据类型(而矩阵matrix同为二级结构,要求所有列都为同一数据类型)

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R语言-因子和表

靓且有猫

因子(factor)是R语言中许多强大运算的基础,因子的设计思想来着统计学中的名义变量(分类变量),因子可以简单的看做一个附加了更多信息的向量。

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从头学R语言——DAY 1

橙子7

开始截图(F1)| 保存截图(Enter)| 取消截图(esc)| 贴图(F3)

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将SeuratV5降为V4:目前试过最简便的方法,复制黏贴可用

依芙

此处的E:/develop/handmake_install_packages请更改为你本人安装这几个软件包的路径,如果直接复制windows的路径,记得改右斜...

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技能树Day03_直播课05-06_R作图与综合利用

sheldor没耳朵

属性设置:映射:根据数据的某一列的内容分配颜色;统一设置:把图形设置为一个颜色,与数据无关

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R语言画图——生信技能书

用户11211038

geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,

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R语言学习笔记-Day10

用户11190095

R^2越大,越接近无标度网络,选择使R^2第一次到达0.8/0.85/0.9的β值

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R语言学习笔记-Day09

用户11190095

#Fix cell sizes and save to file with correct size

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R语言学习笔记-Day08

用户11190095

获得探针ID与序列——> //读取gtf文件

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技能树Day01_R环境配置_直播课day01

sheldor没耳朵

(原网址http://www.bio-info-trainee.com/3727.html)

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FeaturePlot_scCustom作图

JJJJack

Seurat object里面有12个samples, 我想呈现A gene在12个samples里面的表达情况。FeaturePlot()是首选,然后12个s...

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将rmd文件输出为含中文的pdf:踩过的坑及最终解决

依芙

rticles包提供了适用于各类场景的rmd模板,安装以后便可以选择支持中文的模板,在rstudio菜单栏中依次选择file->new file->R Mark...

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R语言学习笔记-Day07

用户11190095

数据下载(DEO、TCGA)-差异分析(芯片与转录组不相同)-WGCNA(加权共表达网络)-富集分析(ORA、GSEA)-PPI网络-预后分析(影响生存的疾病)

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R语言学习笔记-Day6

用户11190095

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R语言学习笔记-Day5

用户11190095

拼图:par里的mfrow, grid.arrange, cowplot, patchwork

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R语言学习笔记-Day4

用户11190095

R和Bioconductor主网站位于国外,可选择国内镜像e.g.清华镜像(tuna, Beijing)、中科大镜像(ustc, Hefei)

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