1.Gene Expression Omnibus (GEO): GEO是一个公共数据库，收集了来自全球研究机构的大量基因表达数据，其中包括很多单细胞测序数据。

R包直接在Rstudio页面下载的3大来源：官网CRAN、Biocductor、github

数据框data.frame是二维结构，要求每一列为同一数据类型（而矩阵matrix同为二级结构，要求所有列都为同一数据类型）

因子（factor）是R语言中许多强大运算的基础，因子的设计思想来着统计学中的名义变量（分类变量），因子可以简单的看做一个附加了更多信息的向量。

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此处的E:/develop/handmake_install_packages请更改为你本人安装这几个软件包的路径，如果直接复制windows的路径，记得改右斜...

属性设置：映射：根据数据的某一列的内容分配颜色；统一设置：把图形设置为一个颜色，与数据无关

geom_point(mapping = aes(x = Sepal.Length,

R^2越大，越接近无标度网络，选择使R^2第一次到达0.8/0.85/0.9的β值

#Fix cell sizes and save to file with correct size

获得探针ID与序列——> //读取gtf文件

（原网址http://www.bio-info-trainee.com/3727.html）

Seurat object里面有12个samples, 我想呈现A gene在12个samples里面的表达情况。FeaturePlot()是首选，然后12个s...

rticles包提供了适用于各类场景的rmd模板，安装以后便可以选择支持中文的模板，在rstudio菜单栏中依次选择file->new file->R Mark...

数据下载（DEO、TCGA）-差异分析（芯片与转录组不相同）-WGCNA（加权共表达网络）-富集分析（ORA、GSEA）-PPI网络-预后分析（影响生存的疾病）

拼图：par里的mfrow, grid.arrange, cowplot, patchwork

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