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科研术语扫盲:opportunistic

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小汪Waud
发布2023-09-18 12:40:00
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发布2023-09-18 12:40:00
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文章被收录于专栏:小汪Waud小汪Waud

我第一次关注到这个词是在文章 Root hair mutations displace the barley rhizosphere microbiota 中, 文章提到 “Of note, the ‘reduced-complexity’ communities inhabiting the rhizosphere of root hair mutants were clearly distinct from both the corresponding wild-type and bulk soil profiles, suggesting that these communities are the likely result of a perturbation of the host recruitment signals rather than an opportunistic colonization by the soil biota.”

Root hair mutations displace the barley rhizosphere microbiota

这一段描述了大麦根毛突变型的根际微生物群落与相应的野生型和土壤微生物群落都有明显不同的特点。这种差异可能是由于“宿主招募信号的扰动(perturbation of the host recruitment signals)”引起的,而不是由于土壤生物群落的“机会性殖民(opportunistic colonization)”。

这可能引起大家的疑惑。

我们首先看一下 opportunistic 的官方含义:充分的抓住机会;常与 infection 和 disease 搭配。

Merriam-Webster

当在谷歌学术上检索 opportunistic 的时候,我发现更多的文章使用 opportunistic pathogens,比如文章 Colonizing opportunistic pathogens (COPs): The beasts in all of us 中对COPs的定义是 "Colonizing opportunistic pathogens (COPs) are microbes that asymptomatically colonize the human body and, when the conditions are right, can cause infections."

Colonizing opportunistic pathogens (COPs): The beasts in all of us

文中对 COPs 的概念又进行了补充 "The defining feature of all opportunistic pathogens is their capacity to cause disease when they are introduced into a susceptible body site or when hosts are immunologically compromised. "

当寄主的免疫出现问题时,某些原本平平无奇的微生物抓住机会,变成病原菌快速繁殖,最终发病,这就是opportunistic与pathogen/infection/disease搭配时的含义。

回到我最开始提到的文章里,与 “opportunistic colonization”对应的是“a perturbation of the host recruitment signals”,结合微生物组知名的 cry for help 假说,我们可以知道:

  • a perturbation of the host recruitment signals:植物根系会发出一些化学信号,就像主动发出一个“邀请函”,来吸引特定的土壤微生物到它们的根际来。当这个“邀请函”或化学信号所“扰动”,吸引到根际的微生物群也会发生改变。
  • opportunistic colonization:在一个新环境 (比如上文提到的植物根际)中,可能会有一些微生物“偶然”出现并定居。它们可能没有被特定地“邀请”,但因为环境条件合适,所以它们就“搬了进来”。通常不涉及招募机制。

文章提出,在大麦根毛突变型的根际,出现了与野生型不同的微生物群。这种不同很可能是因为植物发送出的“邀请函”(化学信号)被改变了,而不是因为一些微生物偶然找到了一个好地方定居。

换句话说,这个新的微生物群落是植物有意吸引的,而不是土壤微生物偶然形成的。

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原始发表:2023-08-28 20:30,如有侵权请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除

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