命令行 一键完成 所有R包更新

​#如果指定想要的r包安装路径#####安装archr包##别处复制.libPaths(c("/home/data/t040413/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2",            "/home/data/t040413/R/yll/usr/local/lib/R/site-library",             "/usr/local/lib/R/library",            "/refdir/Rlib/"))​.libPaths()#options(timeout = 1000) #help("repositories", package = "BiocManager")#install.packages("~/software/msigdbr_7.5.1.tar.gz", repos = NULL, type = "source")# 安装BiocManager（如果尚未安装）if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))    install.packages("BiocManager")​# 使用BiocManager安装特定版本的Bioconductor，并自动更新所有包而无需询问BiocManager::install(version = "3.18", ask = FALSE)​​

nohup Rscript install_bioconductor.R  >myout.log 2>&1  &​

这是一条在Linux/Unix系统下的命令，用于在后台运行一个命令并将输出重定向到一个文件中。下面对每个部分进行解释：​nohup: 这是一个命令，意为"no hang up"，用于让命令在后台一直运行，即使用户退出登录或终端关闭。yourcommand: 这是你要在后台运行的命令。​2>&1: 这个部分是将标准错误输出重定向到标准输出，也就是将命令的错误信息也输出到文件中。&: 这个符号是将整个命令放入后台运行，以便你可以在终端中继续输入其他命令，而不用等待该命令执行完毕。​综合起来，这条命令的作用是在后台运行一个命令，并将命令的输出（包括标准输出和标准错误输出）重定向到一个文件中，同时不会受到用户退出登录或终端关闭的影响。