带optim()函数的nls模型的参数自举问题
带optim()函数的nls模型的参数自举问题
提问于 2019-02-28 05:10:56
我喜欢在我的nls模型中使用optim()，但不起作用。在我的示例中：
首先，我创建一个数据集
library(nls2)
#Data set
x <- c(1 ,10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100)
y <- c(0.033823, 0.014779, 0.004698, 0.001584, -0.002017, -0.003436,
-0.000006, -0.004626, -0.004626, -0.004626, -0.004626)
dat<-cbind(y,x)其次，我创建了一个简单的nls模型
#Create a nls model
fo3<- y ~ a4*exp(-x/a5)
fm3 <- nls2(fo3, alg = "brute-force",
start = data.frame(a4 = c(-10, 10), a5 = c(-10, 10)),
control = nls.control(maxiter = 1000))
summary(fm3)现在尝试为研究模型系数的y ~ a4*exp(-x/a5)模型创建一个bootstrap：
# bootstrap parametric
# nls model with par
#y = a4 * exp(-x/a5)
fstar<- function(dat,a) {
y= a[1]*exp(-x/a[2])
}
## Simulation 999 times
Nsim=999
RES1=NULL
for(i in 1:Nsim)
{
oo2=optim(c(0.97, 0.32),fstar, method="Nelder-Mead",control=list(maxit=10000))
RES1<-rbind(oo2$par)
write.table(RES1, file ="boot.out.mod", row.names=F, col.names=F,append=T)
}
#我得到了一个糟糕的输出：
Error in fn(par, ...) : argument "a" is missing, with no default有哪位议员可以帮我吗？
谢谢!
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2019-03-05 08:40:00
如果在函数中放入sum()，并将(dat，a)改为(a，x，y)，那么它是有效的！
# bootstrap parametric
# nls model with par
#y = a4 * exp(-x/a5)
fstar<- function(a,x,y) {
sum (y= a[1]*exp(-x/a[2]))
}
## Simulation 999 times
Nsim=999
RES1=NULL
for(i in 1:Nsim)
{
oo2=optim(c(0.97, 0.32),fstar, x=x, y=y, method="Nelder-Mead",control=list(maxit=10000))
RES1<-rbind(oo2$par)
write.table(RES1, file ="boot.out.mod", row.names=F, col.names=F,append=T)
}
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/54914546
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