问如何用python计算蛋白质疏水性2D-HP模型问题？程序是什么？

例7: 疏水性计算一2D-HP模型

对蛋白质折叠过程所做的主要简化之一是只考虑疏水作用。此外可以假设所有的氨基酸都位于一个网格中所有等间隔线条的交叉点上。更进一步的简化是只考虑二维网格，因为采用这种网格易于作图。该程序读入一条序列，该序列包括由氨基酸分类标识和当前氨基酸到达下一个氨基酸的方向。程序将这些位置映射为一个哈希表；计算肯定相邻的氨基酸数目,因为它们在输入序列中是相邻的；计算所有实际相邻(在网格空间相邻)的氨基酸数目；找出在初始排序中不相邻的实际相邻配对数目。这个负的记数值是一个得分,表示能量的最小值；负的值越大则结果越好。