问根据操作系统位自动加载32位/64位？

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我建议您寻找一个功能更强大的MSI打包工具。Most professional tools为您提供了一个内置的引导程序，只需单击一下即可提供此功能。

VS安装项目对于基本的应用程序打包很有用，但从来没有打算为您提供全部功能。

这取决于你所说的“启动相应的版本”是什么意思。这意味着你已经编写了需要选择的代码，在这种情况下，这根本不是安装程序的问题-你只需要找到操作系统的位，然后安装适当的MSI文件(或VS生成的setup.exe)。如果它是一个C#启动器，你可能会使用Environment.Is64BitOperatingSystem。

您的问题没有说明您是否正在交付将由客户端程序使用的代码(程序集、COM Dlls等)。我之所以提到这一点，是因为您的32位安装程序将在32位子系统中的64位操作系统版本上安装和运行。64位版本可能只包含本机64位代码。

请注意，您的64位安装程序无论如何都不会安装在32位操作系统上。