R: rJava包安装失败
R: rJava包安装失败
提问于 2010-07-23 02:08:55
使用install.packages("rJava")命令安装rJava时，我得到以下错误：
checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver : '/usr/bin/jar'
compiler : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'
java libs : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... yes
checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’我安装了Java JDK，java -version返回以下内容：
$ java -version
java version "1.6.0_20"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)当我在谷歌上搜索这个错误时，我发现其他人也有同样的问题，但除了“安装整个JDK，而不仅仅是JRE”之外，我没有找到解决方案。
我读到的另一件事是运行sudo R CMD javareconf，它运行得相当顺利，没有任何错误。
你知道我的问题是什么吗？
[编辑]我已经有几个月没有遇到这个问题了。我最初通过编辑我的Java路径解决了这个问题，如我在下面发布的答案中所示。我最近在一个新的Ubuntu安装中遇到了同样的问题。我尝试了Dirk的建议，使用apt-get来安装rJava包。它工作得很完美。我最初没有意识到的是，使用Ubuntu apt-get方法安装软件包与在R中使用install.packages()加载相同的软件包有根本的不同。Ubuntu软件包解决了一些我没有意识到或欣赏的问题。
回答 18
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2010-07-23 02:15:22
原来我的问题是JAVA_HOME环境变量的问题。是的，令人震惊，我知道。我对PATH和JAVA_HOME的初始设置如下所示：
export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin我添加了/jre，所以它现在看起来像这样：
export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin在没有/jre的情况下，Java中的一切似乎都运行得很好，但rJava就不行。很奇怪。
Stack Overflow用户
发布于 2010-07-24 22:31:33
不会的
apt-get install r-cran-rjava变得更容易了吗？你可以在useR上问我！:)
Stack Overflow用户
发布于 2018-10-23 17:23:38
这就是我让它工作的方式：
在Linux中(确认Ubuntu 16.04和20.04工作正常)
sudo apt-get install default-jre
sudo apt-get install default-jdk
sudo R CMD javareconf在R中：
install.packages("rJava")页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/3311940
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