图形数据库和RDF triplestore: python中图形数据的存储
我需要用python开发一个图形数据库(如果有人能加入我的开发，我会很高兴。我已经有了一些代码，但我很乐意讨论它)。
我在互联网上做了调查。在Java语言中，neo4j是一个候选者，但是我找不到任何关于实际磁盘存储的东西。在python中，有许多graph data models (请参阅此pre-PEP建议，但它们都不能满足我从磁盘存储和检索需求。
然而，我确实了解三重存储。triplestores基本上是RDF数据库，因此可以在RDF中映射和存储图形数据模型，但我通常对此解决方案感到不安(主要是因为缺乏经验)。Sesame就是一个例子。事实是，在任何情况下，您都必须从内存中的图形表示形式转换为RDF表示形式，反之亦然，除非客户端代码想要直接破解RDF文档，但这几乎是不可能的。这就像是直接处理DB元组，而不是创建对象。
目前，python中图形数据的存储和检索(a la DBMS)的最新技术是什么？希望在对实现感兴趣的人的帮助下，并与Graph API PEP的提出者合作，开始开发实现是否有意义？请注意，这将是我接下来几个月的工作的一部分，所以我对这个最终项目的贡献是非常认真的;)
编辑：也找到了directededge，但它似乎是一个商业产品
回答 7
Stack Overflow用户
发布于 2010-01-02 12:24:44
我使用过Jena和Allegrograph (Lisp、Java、Python绑定)。Jena有用于存储图形数据的姊妹项目，并且已经存在很长时间了。Allegrograph非常好，而且有一个免费的版本，我想我会建议这个原因，因为它很容易安装，免费，快速，你可以立即上线。您从学习一些RDF和SPARQL中获得的力量可能非常值得您花时间学习。如果您已经了解SQL，那么您就有了一个很好的开始。能够使用SPARQL查询您的图形将为您带来一些巨大的好处。序列化到RDF三元组是很容易的，而且一些文件格式非常容易(例如NT )。我来举个例子。假设您有以下图node-edge-node ids：
1 <- 2 -> 3 3 <- 4 -> 5
这些已经是主谓宾语形式，所以只需在其上添加一些URI表示法，将其加载到三元组存储中并通过SPARQL随意查询即可。下面是NT格式：
http://mycompany.com#1 http://mycompany.com#2 http://mycompany.com#3 .http://mycompany.com#3 http://mycompany.com#4 http://mycompany.com#5 .
现在查询距离节点1两跳的所有节点：
SELECT ?节点位置{ http://mycompany.com#1 ?p1 ?O1.?o1 ?p2 ?节点。}
这当然会产生[http://mycompany.com#5](http://mycompany.com/#5)。
另一个候选者是Mulgara，它是用纯Java编写的。但是，由于您似乎对Python更感兴趣，所以我认为您应该先看看Allegrograph。
Stack Overflow用户
发布于 2009-08-20 07:59:21
我认为解决方案实际上取决于您在设法将图形存储在磁盘/数据库中后想要对它做什么，而这在您的问题中有点不清楚。但是，您可能希望考虑以下几点：
- 如果您只想持久化图形，而不想使用任何您期望从关系型数据库管理系统解决方案(如ACID)中获得的特性或属性，那么将对象保存到一个平面文件中会怎么样？非常初级，但就像我说的，取决于你到底想要什么，achieve.
- ZODB是一个Python的对象数据库(我认为是从Zope项目中衍生出来的)。我不能说我在高性能环境中对它有过很多经验，但是有一些限制确实允许您在本地存储Python对象。
- 如果您想使用RDF，有一个RDF Alchemy项目可能会帮助您减轻从图形到RDF结构转换的一些担忧，我认为Sesame是其堆栈的一部分。
在python站点上还有一些其他的persistence tools细节可能会让人感兴趣，但是我去年花了相当多的时间研究这个领域，最终我发现没有一个原生的Python解决方案可以满足我的需求。
我最成功的是使用带有自定义ORM的MySQL，我在this question的答案中发布了几个相关的链接。此外，如果你想为一个关系型数据库管理系统项目做贡献，当我和Open Query的一些人谈到a Graph storage engine for MySQL时，他们似乎很有兴趣积极参与他们的项目。
对不起，我不能给出一个更明确的答案，但我不认为有一个…如果您真的开始开发自己的实现，我很有兴趣了解您的最新进展。
Stack Overflow用户
发布于 2011-02-14 04:23:12
来自您的Serius Cybernetics智能代理的问候！
一些有用的链接。
https://stackoverflow.com/questions/1303105
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