将一个大的xlsx文件导入R？
将一个大的xlsx文件导入R？
提问于 2013-10-03 06:31:10
我想知道是否有人知道从一个“大”的xlsx文件(~20Mb)导入数据的方法。我尝试使用xlsx和XLConnect库。不幸的是，两者都使用rJava，我总是得到相同的错误：
> library(XLConnect)
> wb <- loadWorkbook("MyBigFile.xlsx")
Error: OutOfMemoryError (Java): Java heap space或
> library(xlsx)
> mydata <- read.xlsx2(file="MyBigFile.xlsx")
Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, :
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space在加载rJava之前，我还尝试修改了java.parameters：
> options( java.parameters = "-Xmx2500m")
> library(xlsx) # load rJava
> mydata <- read.xlsx2(file="MyBigFile.xlsx")
Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, :
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space或者在加载rJava之后(我认为这有点愚蠢)：
> library(xlsx) # load rJava
> options( java.parameters = "-Xmx2500m")
> mydata <- read.xlsx2(file="MyBigFile.xlsx")
Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl, :
java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space但是什么都不起作用。有谁有主意吗？
回答 7
Stack Overflow用户
发布于 2014-08-15 05:28:09
当有人给我发送(又一个) Excel文件进行分析时，我偶然发现了这个问题。这个错误甚至没有那么大，但无论出于什么原因，我都遇到了类似的错误：
java.lang.OutOfMemoryError: GC overhead limit exceeded根据@DirkEddelbuettel在之前的回答中的评论，我安装了openxlsx包(http://cran.r-project.org/web/packages/openxlsx/)。然后运行：
library("openxlsx")
mydf <- read.xlsx("BigExcelFile.xlsx", sheet = 1, startRow = 2, colNames = TRUE)这正是我要找的。简单易用，速度极快。这是我的新朋友。感谢你的提示@DirkEddelbuettel！
顺便说一句，我不想从Dirk E那里窃取这个答案，所以如果他发布了一个答案，请接受它，而不是我的！
Stack Overflow用户
发布于 2016-01-14 01:26:31
options(java.parameters = "-Xmx2048m") ## memory set to 2 GB
library(XLConnect)在加载任何java组件之前，使用“选项”允许更多的内存。然后加载XLConnect库(它使用java)。
就这样。开始使用readWorksheet读取数据...诸若此类。:)
Stack Overflow用户
发布于 2018-05-15 10:18:02
我知道这个问题有点老了，但现在已经有了一个很好的解决方案。当你试图用GUI在Rstudio中导入excel时，这是一个默认的包，它在我的情况下工作得很好。
library(readxl)
data <- read_excel(filename)页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/19147884
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