使用install.packages("rJava")
命令安装rJava时,我得到以下错误:
checking Java support in R... present:
interpreter : '/usr/bin/java'
archiver : '/usr/bin/jar'
compiler : '/usr/bin/javac'
header prep.: '/usr/bin/javah'
cpp flags : '-I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include -I/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../include/linux'
java libs : '-L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64/server -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/lib/amd64 -L/usr/lib/jvm/java-6-sun-1.6.0.20/jre/../lib/amd64 -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm'
checking whether JNI programs can be compiled... yes
checking JNI data types... configure: error: One or more JNI types differ from the corresponding native type. You may need to use non-standard compiler flags or a different compiler in order to fix this.
ERROR: configuration failed for package ‘rJava’
我安装了Java JDK,java -version
返回以下内容:
$ java -version
java version "1.6.0_20"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_20-b02)
当我在谷歌上搜索这个错误时,我发现其他人也有同样的问题,但除了“安装整个JDK,而不仅仅是JRE”之外,我没有找到解决方案。
我读到的另一件事是运行sudo R CMD javareconf
,它运行得相当顺利,没有任何错误。
你知道我的问题是什么吗?
[编辑]我已经有几个月没有遇到这个问题了。我最初通过编辑我的Java路径解决了这个问题,如我在下面发布的答案中所示。我最近在一个新的Ubuntu安装中遇到了同样的问题。我尝试了Dirk的建议,使用apt-get来安装rJava包。它工作得很完美。我最初没有意识到的是,使用Ubuntu apt-get方法安装软件包与在R中使用install.packages()加载相同的软件包有根本的不同。Ubuntu软件包解决了一些我没有意识到或欣赏的问题。
发布于 2010-07-23 02:15:22
原来我的问题是JAVA_HOME
环境变量的问题。是的,令人震惊,我知道。我对PATH
和JAVA_HOME
的初始设置如下所示:
export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
我添加了/jre
,所以它现在看起来像这样:
export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-sun/jre
export PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin
在没有/jre
的情况下,Java中的一切似乎都运行得很好,但rJava就不行。很奇怪。
发布于 2010-07-24 22:31:33
不会的
apt-get install r-cran-rjava
变得更容易了吗?你可以在useR上问我!:)
发布于 2018-10-23 17:23:38
这就是我让它工作的方式:
在Linux中(确认Ubuntu 16.04和20.04工作正常)
sudo apt-get install default-jre
sudo apt-get install default-jdk
sudo R CMD javareconf
在R中:
install.packages("rJava")
https://stackoverflow.com/questions/3311940
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