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视频 | 学习Linux进行GTF解析
容器镜像服务
linux
unix
bash
bash 指令
5.2 如何获取目标基因的转录因子（上）——biomart下载基因和motif位置信息
生信宝典
2022-11-29
1.3K
0
这21个不太好搜索其含义的特殊符号你都知道吗？
编程算法
grep
linux
bash
bash 指令
Linux命令中有一些常用符号，看到时不一定好查询它们的功能和含义，这里列举一些常见的符号和解释，欢迎大家补充完善。
生信宝典
2022-03-27
789
0
速查表 | Bash cheat sheet!
linux
网站
bash
shell
bash 指令
Here, we list some basic bash syntax with a brief explanation. It is a good starting point if you are a beginner.
生信宝典
2022-01-19
225
0
这个40M的小工具助你在windows下处理数据如虎添翼！！
git
windows
linux
bash
bash 指令
NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析 （Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析 （ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析 (重磅综述：三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘（典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step)）、批次效应处理等内容。
生信宝典
2021-11-08
1.1K
0
推荐2个命令快速在本地和服务器之间上传下载文件
bash
bash 指令
FileZila是一个常用的在服务器和本地电脑之间传输大文件的工具，可以断点续传、断开重连，在传输大数据时很方便。但偶尔我们也希望能下载单个或多个小文件在本地修改或查看，或上传单个小文件，有没有不需要再次输入用户名和密码的轻量级工具呢？
生信宝典
2021-07-06
1.1K
0
一句话加速grep近30倍
grep
编程算法
bash
https
bash 指令
最近做一个项目，需要从表达矩阵中提取单个特定基因的表达值。最开始时文件比较小，使用awk单个读取处理也很快，但后来数据多了，从一个1.2 G的文件中提取单个基因的表达需要30 s，用grep来写需要25 S，这在平时写程序是可以接受的，但在网站上是接受不了的。所以就想着如何优化一下。
生信宝典
2020-08-07
3.4K
0
这个Nature推荐的代码海洋竟然有文章作者上传的所有可重现性脚本，涉及单细胞、微生物组、转录组分析、机器学习等相关
python
bash
bash 指令
开源
可重复性研究一直是学术发表希望实现的方式，更有助于判断研究结果的准确性和帮助后人以此为基础进行深入研究。计算分析类型的研究，是能够比较容易实现可重复性的 - 只要分享代码和数据就可以 （当然配置运行环境也需要一定的功底），如使用R markdown或Bookdown 或者 Jupyter notebook等，像宏基因组主编刘永鑫老师的植物根系菌群分析的NBT文章那样，把代码存放在Github上面也是一种比较好的方式。
生信宝典
2019-09-25
1.4K
0
从一段挖矿病毒代码看Linux命令的实际应用
linux
区块链
网络安全
bash
bash 指令
最近做易生信培训时新购了一块阿里云，用于演示分析流程搭建和配置。短期使用，上面没有数据，也没做什么防范，结果不曾想，被挖矿病毒盯上了，给了一个近距离接触病毒的机会。
生信宝典
2019-07-12
6.5K
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