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TargetMine - 多组学数据整合和药物靶点分析平台
数据库
sql
go
鉴定合适的靶点(如基因、蛋白质、非肽基因产物和信号通路)进行表征是注释基因功能、药物发现和理解各种疾病发病机制的最关键步骤之一。TargetMine是一个综合数据仓库系统,主要用于候选靶点排序和早期药物发现。TargetMine基于InterMine构建。InterMine是一个灵活有效的框架,整合了多种生物数据库,使用户只在单个入口进行查询,即能够导航到不同的生物数据库。
一只羊
2022-11-30
494
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(转载)用Annovar注释人类以外的基因组
perl
数据库
sql
Annovar是一款对基因组数据进行注释的软件。所谓注释,可以这样简单理解:我们知道二代测序下机后的序列经过比对后,会得到一系列变异数据,这些变异数据只是告诉我们在基因组的某个位置发生了一段序列的改变,至于这个改变会不会影响生物学功能,我们并不清楚。而注释就是将基因组的序列变异数据转化为我们更关心的生物学功能变化的信息。
一只羊
2019-10-25
1.5K
0
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