下载整个CRAN仓库需要多少空间？

CRAN（Comprehensive R Archive Network）是一个存储和分发R语言软件包的仓库。R语言是一种用于统计分析和数据可视化的编程语言。CRAN仓库中包含了大量的R语言软件包，用于各种数据分析、机器学习、数据可视化等领域。

下载整个CRAN仓库需要的空间取决于CRAN仓库中的软件包数量和大小。截至2021年10月，CRAN仓库中包含了超过19000个软件包。每个软件包的大小不尽相同，通常在几十KB到几百MB之间。

由于CRAN仓库中软件包的数量和大小会不断增长，因此无法给出确切的空间需求。如果要下载整个CRAN仓库，建议预留足够的存储空间，以应对未来软件包的增长。

腾讯云提供了云存储服务，可以根据实际需求选择适当的存储产品。例如，对象存储（COS）是一种高可靠、低成本的云存储服务，适用于存储和分发各种类型的数据。您可以通过腾讯云对象存储（COS）来存储和管理CRAN仓库中的软件包文件。

腾讯云对象存储（COS）产品介绍链接地址：https://cloud.tencent.com/product/cos

本来以为是写了：【紧急通知】下载R包却联网失败？初学者的痛，大家应该是不再发邮件咨询我R包安装问题，没想到的是碰到了R包各大镜像纷纷宕机！ ?...关于https和http协议纯粹是增加我们的认知负担，不建议大家去学习了，如果你感兴趣，可以看：Windows电脑使用Rstudio会有多少错误呢，下面的两个代码也会对你有帮助 options(download.file.method...很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章，所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程，代码在：https://github.com/jmzeng1314/geo，如果你网络很差，就下载打包版本的...还有一个公共数据库挖掘：https://www.bilibili.com/video/av37568990 视频应该是都在：https://www.bilibili.com/video/av25643438/ 如果是需要安装...R包，请务必参考：http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 代码专门为R语言建立了 GitHub 仓库存放相关学习路线指导资料：https://github.com

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R语言︱R社区的简单解析（CRAN、CRAN Task View）

CRAN（The Comprehensive R Archive Network）：全面R档案网站 1、R社区——主界面：https://www.r-project.org/ 主要功能：提供下载、最新版本的信息...R镜像是为了方便世界各地的使用者下载R软件及相关软件包，在各地设置的镜像。各地的镜像都是R网站的备份文件，完全一样。所以，选择离你最近的镜像，你下载R软件或R包的速度相对较快。...3、R社区——Contributed Packages：https://cran.r-project.org/web/packages/ 主要功能：已有多少函数包（20160420有8280个）、按时间排列...包按功能分类，比如按计量经济学、贝叶斯、时间序列、临场试验、概率分布、空间、时空、生存等方面把包进行分类 ————————————————————————————————————————————————...Task Views”功能：http://blog.csdn.net/mjk/article/details/6229737 如果要使用这个功能，需要先下载包ctv： install.packages

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获取Github代码包以及准备工作

，因此需要先将这个设置取消：options(stringsAsFactors = F) 因为Bioconductor下载方法的变动，要学会使用BiocManager::install这个命令，例如：BiocManager...::install(c( 'scran'),ask = F,update = F)，新加的两个选项表示：不要问我要不要下载，直接下！...【除非不升级就报错】下载包存在网络的限制，毕竟R语言是国外开发，因此可以通过options()$repos看看常规CRAN安装R包的使用镜像(一般情况下是rstudio公司的)，但是这里我们可以自行设置...聚类也没有什么意义，因此可以去掉 # 但是这个细胞量设置成多少合适呢？...，显示FALSE的就是要过滤掉的，于是再用行筛选完成整个操作，并赋值给一个新变量： dat=a[apply(a,1, function(x) sum(x>1) > floor(ncol(a)/50)),

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R语言确实会蛮耗费磁盘空间哦

我们一直强调大家需要安装在C盘，主要是因为大家都是新手，怕大家各自折腾带来各种各样的稀奇古怪的报错，增加我们教学辅助团队的负担！...但是这个过程中，总有学员抱怨到自己的C盘空间不够，我们的R语言会不会耗费磁盘空间。我们通常是先安慰一下，R仅仅是几十个M而已，各种R包通常是几个M，不会太耗费磁盘空间的。...代码如下： options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor/") options("repos" = c(CRAN...很多朋友之所以学习R语言其实就是为了重复一些简单的数据库挖掘文章，所以我也顺便录制了GEO数据库挖掘课程，代码在：https://github.com/jmzeng1314/geo，如果你网络很差，就下载打包版本的.../jmzeng1314/R_bilibili 生信基石之R语言B站的10个小时教学视频务必看完，参考 GitHub 仓库存放的相关学习路线指导资料：https://github.com/jmzeng1314

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求解答：为什么在r-stdio,cran安装R包总出错？

校验包的大小与下载的包大小不一样！总结就一句话：你的R包安装错误！！！！！那！这种情况如何解呢？？？...针对这两种问题，我的解决思路是：手工下载包，然后本地手动安装操作步骤如下： 1、到R镜像下载页面根据你的系统点击不同下载入口选择你的运行环境：linux/mac/windows https://mirrors.ustc.edu.cn.../CRAN/ （我的是windows） 2、点击contrib 3、点击contrib进入R包下载目录页（根据不同版本选择） 4、进入到Index of /CRAN/bin/windows/contrib.../3.6/ R包列表页 ctri+F 查找你需要下载的包 5、R-studio手动安装本地包相信接下来你也知道怎么做啦【拓展阅读】 1.通过Github仓库名和包名安装不是所有的R包都提交上传到...CRAN，如Github存放一些R包，所以偶尔也会遇到安装github上的R包 install.packages("devtools")library(devtools)install_github("

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mac实现R版本的自动切换

kinda defeating the purpose) 解决方案使pkg安装不会重置程序框架 sudo pkgutil --forget org.R-project.R.fw.pkg 然后直接安装需要版本的...每次安装均需要使用一次重置命令....terminal中使用rswitch: ln -s /Applications/RSwitch.app/Contents/Resources/rswitch-cmd /usr/local/bin/rswitch 仓库链接...mac安装实验版二进制文件的文档说明: https://mac.r-project.org RSwitch下载界面: https://rud.is/rswitch/ R for macOS pkg...下载地址: https://cran.r-project.org/bin/macosx/base/ R for macOS tar.gz下载地址: https://cran.r-project.org/

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把rstudio的project或者package同步到自己的GitHub

首先在 rstudio里面新建project或者package，需要了解Rstudio这款编辑器哦。...然后rstudio的git/svn需要设置好秘钥连接到自己的GitHub, 参考生信菜鸟团博客教程：http://www.bio-info-trainee.com/2477.html 这个需要仔细理解。...（需要耗时30分钟）接着在自己的GitHub里面新建对应的仓库最后可以进入自己本地的project或者package文件夹里面运行： cd /Users/jmzeng/Documents/Nutstore...//不是新创建的，不用再add 到remote上了这样就成功的完成了整个流程！...感兴趣的朋友可以安装看看，代码如下： options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) source("http

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高效R开发（二）：Microsoft R

基准测试代码可以从github下载，有兴趣的小伙伴们请戳：https://github.com/andrie/version.compare 整个基准测试分成了6大部分，分别为矩阵相乘、Cholesky...以矩阵相乘为例，我们发现，CRAN R在单线程下需要运行140.63秒，而同样在单线程下，MRO只需要14.11秒，速度是原来的近10倍！...在其他项目的测试中，MRO相比CRAN R都有着2x~50x的提高。可能有小伙伴会问，那CRAN R在多线程形况下性能有多少提高呢？...其实MRO的安装非常简单： 1）首先，进入MRO下载页面： https://mran.revolutionanalytics.com/download/ 2）在下载页面中，我们能够看到针对多个系统的MRO...我们只要点击对应MRO版本的MKL进行下载即可。注意，需要先安装MRO再安装MKL库，否则会安装失败。 4）大功告成！

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不同安装R语言的R包的方法

当你需要执行特定的统计测试、可视化或其他任务时，你可能会发现相应的功能已经被封装在一个或多个R包中。然而，对于新手或需要一次性安装多个R包的用户来说，这个过程可能会有些繁琐。...为了大规模安装所需要的R包，你可以使用几种不同的方法。...以下是两种常见的方法：常用安装install.packages函数是我们常用的安装R包的方式，需要注意的是这些R包必须是在CRAN仓库中，否则安装将会失败。...](http://cran.us.r-project.org)")除了联网安装R包外，R还提供本地下载压缩包安装模式。...<- function(packages=packages_CRAN , type="CRAN"){ #packages=packages_CRAN #type="CRAN" #

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OSCA单细胞数据分析笔记-2—R与Bioconductor

bioconductor.org/books/release/OSCA/ （对R基本了解的读者可跳过这一节） 1、简介 R语言是生信人最熟悉的编程语言之一，其核心在于有上万个R包极大扩充了其使用范围，需要用到那个...Bioconductor 2、基础操作 2.1 设置镜像提高下载安装包的速度。...安装源自Bioconductor的包：BiocManager::install()；其中BiocManager是管理下载Bioconductor包的包，::表示引用该包的函数，install()就是下载包的函数...函数名(后面不要加括号)，前提需要加载该包才行。否则会提醒使用??进行全局搜索。 library(SingleCellExperiment) ?...p=1 关于R的一些基础知识就简单介绍这么多了；相信来了解scRNA-seq数据分析的读者多少对R也已经比较了解了。

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点击此文，无需转发，即可下载上千个免费R包

需要调整 contriburl参数,如下： > dim(available.packages(contriburl = "https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib...://mirrors.ustc.edu.cn/bioc//packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/")) [1] 1000 17 用这个参数，可以看不同仓库...然后去包的官网上面找到它的旧版本的下载链接：我这里拿ggplot2举例： http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ #packageurl...如果你是Rstudio的IDE，只需要鼠标点击直接进入全局设置，一劳永逸的选择好镜像！ ?...命令行版本安装如果是linux版本，命令行从网上自动下载包如下： sudo su - -c \ "R -e \"install.packages('shiny', repos='https://cran.rstudio.com

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「R」R4.1新特性：管道符号|>与匿名函数构造(x)

目前不同平台的安装包已经可以通过CRAN下载了，国内推荐清华大学镜像：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/ ?...5.50 7.75 10.00 > sapply(1:10, \(x) {x+1}) [1] 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 值得注意的是匿名函数构造中\需要与括号连用...根据我在RStudio官方仓库issue的检索和阅读，hadley推荐通过设置来让用户决定使用哪一种管道符号，默认快捷键保持不变，该方案已经被采用，未来可期，讨论和实施见： https://github.com...下载安装后我发现已经可以通过设定进行管道符号的切换： ? 试用后没有问题，Nice！需要注意这里的新版本不一定稳定，请根据自己的需要判断后再安装。

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GEO数据分析流程之芯片1补充

生新技能树学习笔记代码分析流程第一步：安装R包 options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")if(!...、物种、数据类型（一定要是芯片，标注array）样品信息平台点开Matrix 当这里的大小为M，证明数据完整，如果是K，说明数据可能缺失第四步运行代码下载数据 #数据下载rm(list...) #提取dim(exp)exp[1:4,1:4] #正常范围在0-20之间#检查矩阵是否正常，如果是空的就会报错，空的和有负值的、有异常值的矩阵需要处理原始数据。...#自行判断是否需要logexp = log2(exp+1) #这一行下载的数据如果取过log，就不要运行。如果在几百，需要取log。如果在0-20，不用取log。...这里可以显示下数据有多少行，小于2万行，可能数据不完整验证数据是否正常 boxplot(exp) 异常值的处理办法 1.删掉异常样本 2.exp=limma::normalizeBetweenArrays

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GEO数据分析流程之芯片1

生新技能树学习笔记代码分析流程第一步：安装R包 options("repos"="https://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/")if(!...、物种、数据类型（一定要是芯片，标注array）样品信息平台点开Matrix 当这里的大小为M，证明数据完整，如果是K，说明数据可能缺失第四步运行代码下载数据 #数据下载rm(list =...) #提取dim(exp)exp[1:4,1:4] #正常范围在0-20之间#检查矩阵是否正常，如果是空的就会报错，空的和有负值的、有异常值的矩阵需要处理原始数据。...#自行判断是否需要logexp = log2(exp+1) #这一行下载的数据如果取过log，就不要运行boxplot(exp)#(2)提取临床信息pd <- pData(eSet)#(3)让exp列名与...,exp,gpl_number,file = "step1output.Rdata") 提取的转化后的eSet格式为ExpressionSet 可以被Biobase（R包）提取这里可以显示下数据有多少行

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R包终极解决方案

需要调整 contriburl参数,如下： > dim(available.packages(contriburl = "https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib...http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc//packages/3.1/bioc/bin/windows/contrib/3.2/"))[1] 1000 17 用这个参数，可以看不同仓库...然后去包的官网上面找到它的旧版本的下载链接：我这里拿ggplot2举例： http://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/ggplot2/ #packageurl...("BiocInstaller") #然后安装新的进入主页找到包下载地址可以选择用R自带的下载器来下载，也可以把下面的url拷贝到浏览器用浏览器来下载 packageurl <- "http://cran.r-project.org...命令行版本安装如果是linux版本，命令行从网上自动下载包如下： sudo su - -c \"R -e \"install.packages('shiny', repos='https://cran.rstudio.com

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AI 技术讲座精选：如何创建 R 包并将其发布在 CRAN GitHub 上？

在本文中，我将向你介绍从零开始创建包和将包公开发布在 CRAN 和 GitHub 上的整个流程。 3. 创建 R 包的好处和挑战创建 R 包的好处有：实施新的、未被利用的构想。...将包提交至像 CRAN 之类的主要仓库时需通过严格的质量测试。不断进行更新。如果包的维护人员在 CRAN 上的更新活动不活跃，他的包就会被遗弃。 4....除了通过这些测试，你需要给出关于包的运行的详尽描述。这些描述将存储在 vignettes 文件夹中，你可在主项目目录中创建该文件夹。...在 GitHub 上发布包最简单的方法是创建一个新的仓库，然后将主文件夹（在本例中为 StockPredictor）的内容上传至该仓库。我在此完成了同一步骤。...如果你的包在 CRAN 上成功发布，之后你需要确保不断更新你的包，以修正某些程序错误和/或添加新功能。如果在特定时段内你未对包进行更新，CRAN 会遗弃你的包。 9.

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R语言基础-02（数据框、下载包）

up 3## 3 gene3 down -2## 4 gene4 down -4#dimensiondim(df1)#行列## [1] 4 3nrow(df1)#返回数值，多少行...## [1] 4ncol(df1)#返回数值，多少列## [1] 3#名rownames(df1)#返回向量，行名## [1] "1" "2" "3" "4"colnames(df1)#返回向量，列名#...options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))#设置镜像#1.CRAN的直接installinstall.packages...require(string))install.packages("stringr")包是否下载成功的唯一标准是library()没有error，当提示package not available时，原因可能为...library(data.table)input <- fread("data/input.csv",header = T,row.names = 1,sep = ",")Tips：输出文件时不要覆盖原文件需要用非

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R语言︱文本挖掘——jiabaR包与分词向量化的simhash算法（与word2vec简单比较）

Rtools，这个文件比较大，下载链接在：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/ 这里我是下载不了，出现以下的报错： [html] view plain...devtools，同时需要下载Rtools才能顺利安装，还是挺麻烦的。...——Rtools下载参考官方网址：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/ 下载并安装即可。...库里的文本都转换为simhash 代码，并转换为long类型存储，空间大大减少。 1、simhash算法的介绍 ?...2、为什么需要先分词来计算hash值，不能直接整个文档计算哈希值？答：传统hash函数解决的是生成唯一值，比如 md5、hashmap等。

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