单个miRNA在单个癌种里的表达箱式图，ROC曲线，生存曲线也会在选择癌种后自动展示。...最大的不同是TCGA数据中可以做生存分析和预后模型。当选定一套miRNome数据集时，会自动产生一些summary信息，包括样本分布，年龄分布，生存曲线等等。...另外，CancerMIRNome数据库中收集的所有数据 (miRNA表达数据和样本表型数据) 都以ExpressionSet的形式存储在.RDS文件中，用户可以非常方便的下载这些数据并在R中读取用于更个性化的分析...另外有很多针对advanced Shiny app开发的R包可以直接拿来学习和使用。...从零创建一个App 理解input和output 保持正确的要点 渲染和输出 session的解释 ID的用法 根据数据更新UI 表格-方案选择 表格-renderTable 表格-kableExtra
在R和python上都可使用 readr：实现表格数据的快速导入。...haven：读取SAS，SPSS和Stata统计软件格式的数据 httr：从网站开放的API中读取数据 rvest：网页数据抓取包 xml2：读取HTML和XML格式数据 webreadr：...：绘制网络状图形 ggExtra：绘制图形的边界直方图 gganimate：绘制动画图 plotROC：绘制交互式ROC曲线图 ggspectra：绘制光谱图 ggnetwork：网络状图形的...pROC：用于可视化，平滑和对比ROC曲线 沟通交流 以下R包用于实现数据科学结果的自动化报告，以便于你跟人们进行沟通交流。...shinyjs：用于在Shiny应用程序中执行常见的JavaScript操作 miniUI：提供了一个UI小部件，用于在R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io：为创建的Shiny应用程序提供托管服务
4）选择你要的那个基因，以后下面会自动生成ROC与生存期曲线。 3、输出 5）当然可以调色 6）当然可以下载，了解站长的应该知道怎么下。 同学们看黑板，这里要重点说明一下！！！！！...3）如果是芯片数据，或者自己DIY的数据，数据中至少应该包括：倍数列，p值列，基因名列。分别在图中4、5、6填入。注意！这时在3的地方不要勾选。...2、出表出图： 1）图中右上角的表格是GSEA的结果，10的位置可以下载。 2) 下面的图是GSEA的结果图，可以在表格中选择想画图的基因集ID。...这里可以多选(最多10个），11的位置下载的是GESA的PDF图像。 3）7的位置准备了三个配色方案可选择 4）在8的位置选择Geneset，c1站长从来没用过，直接去掉。...至少要有三列：分别是 基因名（Gene Symbol），倍数（log2FlodChange），p值（padj），在右上那几个列名中分别填写自己表格中各列的名字。
在R和python上都可使用 readr：实现表格数据的快速导入。...haven：读取SAS，SPSS和Stata统计软件格式的数据 httr：从网站开放的API中读取数据 rvest：网页数据抓取包 xml2：读取HTML和XML格式数据 webreadr：读取常见的...：绘制网络状图形 ggExtra：绘制图形的边界直方图 gganimate：绘制动画图 plotROC：绘制交互式ROC曲线图 ggspectra：绘制光谱图 ggnetwork：网络状图形的...pROC：用于可视化，平滑和对比ROC曲线 沟通交流 以下R包用于实现数据科学结果的自动化报告，以便于你跟人们进行沟通交流。...shinyjs：用于在Shiny应用程序中执行常见的JavaScript操作 miniUI：提供了一个UI小部件，用于在R命令行中集成交互式应用程序 shinyapps.io：为创建的Shiny应用程序提供托管服务
以R可视化为桥梁 经常有对比R，Python和Julia之间的讨论，似乎R语言在这三者之中是最为逊色的，实则不可一概而论。...R语言在常规数据分析的场景下，如数据读入，预处理，整理，以及单机可视化方面表现出的优势，无论从用户体验，还是代码流畅度，令另两种语言略逊一筹。...plotly和shiny也是本文的重点，自然要载入。 其他显示在图，并未于此提及的包会在后续步骤中用到时再做介绍。...展示的用的是DT，专门用于显示表格数据，如下图所示： 3 创建离群值函数 目的在于返回一些离群值，用在后续的可视化内容中。...在这里我们把上边第五题的内容，用shiny展示一下：用选择框来动态选择出图。最后你会发现，一点都不难。
正是考虑到网页工具的大量现实需求，我们《生信技能树》安排了《跟我一起玩转shiny》的系列课程，目录如下： 认识shiny 一些基本操作 Shiny App 的基本结构 从零创建一个App 理解input...和output 保持正确的要点 渲染和输出 session的解释 ID的用法 根据数据更新UI 表格-方案选择 表格-renderTable 表格-kableExtra 表格-DT 绘图-基本图形 绘图...-ggplot2 绘图-交互图plotly 绘图-交互图echarts 用户上传数据 用户下载数据-图表 用户下载数据-程序产生的文件 网页表格收集数据 调试-控制台 调试-shinyjs-runcodeUI...调试-reactlog 美化-应用CSS 美化-插入图片 美化-加入加载动画 部署-shinyapp.io 部署-shiny server 课程还在研发和筹备中，期待你的参与，文末有加入shiny交流群的方式...riation in single cell RNA-seq data (github.com) 用于检测和注释单细胞RNA-Seq数据中隐藏的变异源的 R Shiny APP: https://doi.org
pandas的可视化方法，分为图形可视化和表格可视化。 基础可视化 一种是针对series和dataframe的绘制方法，可以一行代码快速绘图。...) 雷达图(radviz) 引导图(bootstrap_plot图) 子图(subplot) 子图任意排列 图中绘制数据表格 1）散点矩阵图 scatter_matrix可以直接生成特征间的散点矩阵图，...，平行坐标图（parallel_coordinates）也是一种用于绘制多元数据的绘图方法，通过平行坐标可以看到数据中的聚类，并直观地估计其他统计信息。...从数据集中选择指定大小的随机子集，并为这些子集计算出相关的统计信息，指定重复的次数。...在可视化图中插入table表格，可以自定义表格的大小以及位置。
资源下载最新的 AChartEngine-1.1.0 版本的 JAR包 文档 和 示例程序; 2...., 每个曲线都有一个标题 * XYSeries 是曲线图中的 一条曲线, 其中封装了 曲线名称, X轴和Y轴数据 */ public void addXYSeries(XYMultipleSeriesDataset...(日期数据集) : 创建曲线图数据集, x轴是日期, y轴是具体的数值 * * @param titles 各条曲线的标题, 放在一个数组中 * @param xValues x轴的日志值数组组成的集合...: r.setColor(colors[i]); -- 设置单个曲线绘制风格 : r.setPointStyle(styles[i]); 代码示例 : /** * 曲线图(渲染器) : 创建曲线图图表渲染器...销售额对比图(折线图 面积图)示例 需求分析 : 给出 2007 年和 2008 年销售额, 将销售额绘制到折线图中, 并将它们的差绘制到面积图中; package org.achartengine.chartdemo.demo.chart
3）如果是芯片数据，或者自己DIY的数据，数据中至少应该包括：倍数列，p值列，基因名列。分别在图中4、5、6填入。注意！这时在3的地方不要勾选。...2、出表出图： 1）图中右上角的表格是GSEA的结果，10的位置可以下载。 2) 下面的图是GSEA的结果图，可以在表格中选择想画图的基因集ID。...这里可以多选(最多10个），11的位置下载的是GESA的PDF图像。 3）7的位置准备了三个配色方案可选择 4）在8的位置选择Geneset，c1站长从来没用过，直接去掉。...5、如果需要提取lncRNA(long noncoding RNA)在5这打钩 6、在8的位置会显示注释位置。 7、在6的位置点击下载注释以后的表格。...至少要有三列：分别是 基因名（Gene Symbol），倍数（log2FlodChange），p值（padj），在右上那几个列名中分别填写自己表格中各列的名字。
第二部分 详细数据信息 第二部分是针对第一部分而言的，对于一些公司的高层而言，没有太多的时间，只能简单的看看第一部分的数据汇总信息情况，而第二部分，实际上是给各个部门和人员来看，从更加的细致数据对比上发现问题...DAU：绘制DAU曲线，并包括具体数值汇总（可以列出表格），同时要把当日数据进行环比和同比分析。 详细数据表格（蓝色为上周同期，红色为日报当日数据） ?...详细数据表格（蓝色为上周同期，红色为日报当日数据） ? 接下来一般的处理ACU，平均在线时长信息，利用表格和曲线图直观形象的表现一下。 ?...在基础数据的人气数据部分可以将剩下的数据指标按照之前的表格形式展现出来，至于曲线，要根据需要灵活添加。 ? 新增玩家数据 ? 官网论坛数据 ? 官网专题页 ? 论坛访问 ? 客户端下载信息 ?...2）收益数据 充值数据 这里只给出了表格，实际上我们好要给出曲线图，充值金额，充值人数，充值ARPU ? 消费数据 同理消费数据也要给出曲线图，通过曲线图或者柱形图形象化展现。 ?
在日常工作中经常会使用Excel，有时需要在excel表格中画曲线图，怎么操作呢？...1、以下图中的表格数据为例介绍在Excel中怎么画曲线图； 2、选中需要做成图的数据，即选中“季度”和“收入”两列； 3、依次点击菜单项【插入】-【图表】-【折线图】； 4、这时就插入了表格数据相对应的折线图了...，折线图以季度为横轴，以收入数字为纵轴进行显示； 5、点击折线图的标题可以重新编辑内容，点击坐标轴可以重新设置相应的格式。...未经允许不得转载：肥猫博客 » Excel怎么画折线图（曲线图）
下一步就是配置图表的呈现了。 回到首页，点击表格（Dashboard） 创建Table表格 Table面板里面的内容是可以直接选择数据库，然后根据查询出来的SQL语句结果进行直接呈现的。...” 从上图看出，从mysql中查询的结果直接就可以从Grafana表格呈现了。 下面来修改一下表格名称以及保存一下。...” 好了，基本上table表格已经呈现，但是单纯这样的一个表格满足不了我的胃口。 那么下面就来再整一个曲线图来看看。...Grafana配置曲线图 我不是想单独增加一个新的面板，而是想在刚刚创建的table上面创建一个曲线图，那么该怎么做呢？...在面板创建新的图表 编辑曲线图Graph 从上这个图表的配置我一开始也没太理解清楚，配置过后，看着图表呈现就更加好的理解了。 根据图表的内容，我查询的分析如上图。
按照脚本我已经设置好了admin的密码为 newpwd 了。 输入用户名 admin 和 密码 newpwd ，点击Log In登录系统。...Table面板里面的内容是可以直接选择数据库，然后根据查询出来的SQL语句结果进行直接呈现的。 ? 下面来编写一个SQL查询来看看。 ?...从上图看出，从mysql中查询的结果直接就可以从Grafana表格呈现了。 下面来修改一下表格名称以及保存一下。 ? ? ? ?...好了，基本上table表格已经呈现，但是单纯这样的一个表格满足不了我的胃口。 那么下面就来再整一个曲线图来看看。...Grafana配置曲线图 我不是想单独增加一个新的面板，而是想在刚刚创建的table上面创建一个曲线图，那么该怎么做呢？ 在面板创建新的图表 ? ? 编辑曲线图Graph ? ?
软件可以从Avantes公司官网直接下载；对于含有光盘驱动的电脑，也可以将AvaSpec系列产品自带的光盘放入电脑中进行软件下载与安装。这里就介绍一下第二种下载方法。 ...在仪器中，将数据线插入写有“USB”字样的接口即可，数据线另一端与电脑连接。 随后，在上图中选择“Retry to establish communication through USB”选项。...当我们在测定任意物体的光谱曲线时，可以通过下图右侧方框中的“Autoscale Y-Axis”选项，将曲线图的Y轴数值移动到曲线附近，方便我们查看曲线。 ...如上图，软件此时的光谱曲线类型为R形状按钮“Reflectance Mode”，那么默认从资源管理器中搜索后缀名为.TRM的文件；再看下图，软件此时的光谱曲线类型为S形状按钮“Scope Mode”，那么就默认从资源管理器中搜索后缀名为...如上图所示，每一个光谱曲线文件的命名都是我们在一开始所建立的实验的名字（例如上图中的NEW和NEW2都是我建立的实验的名字）加上四位数的自动编号。
移动端主题 •miniUI https://github.com/rstudio/miniUI - 为在小屏幕上使用的 Shiny App 提供的 UI 小部件和布局。 ?...•directoryInput https://github.com/wleepang/shiny-directory-input - 用于交互式选择文件目录的小部件。 ?...•regexSelect https://github.com/yonicd/regexSelect - 在 Shiny 选择对象中实现正则表达式搜索。...•texPreview https://github.com/metrumresearchgroup/texPreview - 在 RStudio，R Markdown 和 Shiny 中预览并保存 LaTeX...•excelR https://github.com/Swechhya/excelR - 在 Shiny 中实现类似 Excel 的表格操作，包括添加/删除行列，合并，检索等。 ?
Shiny应用程序会自动刷新计算结果，这与电子表格实时计算的效果类似。当用户修改输入时，输出值自动更新，而不需要在浏览器中手动刷新。...可以在任何R环境中运行（R命令行、Windows或Mac中的Rgui、ESS、StatET、RStudio等） 基于Twitter Bootstrap的默认UI主题很吸引人。...开发和发布你自己的Shiny小工具，其他开发者也可以非常容易地将它加到自己的应用中 安装 Shiny可以从CRAN获取， 所以你可以用通常的方式来安装，在R的命令行里输入： install.packages...与常见的R语言做出的图不同，Hello shiny有一个可以调整bins（柱的个数）的滑条，用户可以滑动选择bins的数目，app图表会随即产生变化....你也可以将ui.R和server.R保存到同一个文件夹，然后改变工作路径到那个文件夹，运行 library(shiny) runApp() 也可以得到上面一样的效果。
三、选择正确的图形 在美学方面，有很多（太多了）设计都在误用图表。 最糟的是——这些“坏习惯”似乎在成倍增加。随处可见本应是饼形图的面积图，还有本应该是柱状图的曲线图。...原始数据的单调特性，会帮你思考系统中各种变量间的关联。 除了从空白数据行列入手，等待灵感忽然进入你意识。...比如一季的降雨量，或一个人的身高体重。 ? 曲线图最适合表现连续数据 简单说，曲线图最适合表现连续数据，柱状图最适合表现离散数据。...基本柱状图的例子 对我来说，有“一种尺寸通行”的图表，还有“适用于最佳尺寸”的图表。表格、曲线图和柱状图就很好，可以容纳各种类型的数据，但它们也非常普通（一种尺寸通行）。..._r=0 在这个3D图表中，透视角度的改变在视觉上非常有冲击力，也让用户更好理解数据间的关联。 ?
选择正确的图形 在美学方面，有很多（太多了）设计都在误用图表。 最糟的是——这些“坏习惯”似乎在成倍增加。随处可见本应是饼形图的面积图，还有本应该是柱状图的曲线图。...原始数据的单调特性，会帮你思考系统中各种变量间的关联。 除了从空白数据行列入手，等待灵感忽然进入你意识。...比如一季的降雨量，或一个人的身高体重。 ? 曲线图最适合表现连续数据 简单说，曲线图最适合表现连续数据，柱状图最适合表现离散数据。...基本柱状图的例子 对我来说，有“一种尺寸通行”的图表，还有“适用于最佳尺寸”的图表。表格、曲线图和柱状图就很好，可以容纳各种类型的数据，但它们也非常普通（一种尺寸通行）。..._r=0 在这个3D图表中，透视角度的改变在视觉上非常有冲击力，也让用户更好理解数据间的关联。 ?
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