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详解人类基因在不同数据库中的ID

对于人类的基因而言,不同数据库提供了不同的命名方式。对于初学者而言,非常容易搞混淆。今天我们就来理一下,常见的基因命名方式。...首先看一下NCBI中基因的信息如何命名,NCBI的Gene数据库记录了不同物种的基因信息,在Gene数据库中,给每一个基因提供了一个唯一的ID, 这个ID叫做Entrez ID,Entrez是NCBI的检索系统的名字...以TP53为例, 链接如下 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7157 链接中的7157就是这个基因的Entrez ID。在该链接中,我们可以看到以下信息 ?...HGNC命名的基因收录在以下数据库中 http://www.genenames.org/ 除了symbol外,还提供了HGNC id, TP53基因对应的id为HGNC:11998。...Ensembl 数据库也收录了基因的信息,用Ensembl ID表示每个基因,以ENSG开头,上述例子中的TP53对应的Ensemb的ID为ENSG0000014150。

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    Ask Apple 2022 中与 Core Data 有关的问答

    Ask Apple 为开发者与苹果工程师创造了在 WWDC 之外进行直接交流的机会。本文对本次活动中与 Core Data 有关的一些问答进行了整理,并添加了一点个人见解。本文为上篇。...如果你愿意,可以将自己的元数据存储在存储文件中,但请注意你的密钥不要与现有的 Core Data 拥有的密钥重叠。元数据受到与存储文件的其余内容相同的数据保护。...如果 Core Data 内置的合并策略无法满足你的需求时,创建自定义合并策略或许是不错的选择。在多对多关系中创建谓词Q:我的视频实体与标签具有多对多关系,并且我有一个带有一些标签 ID 的数组。...例如上面的问题,可以通过在 task(id:) 中更改 request 的配置。...在 Core Data 中,NSManagedObjectID 是线程安全的。通过向其他的上下文传递 ID,并通过该 ID 在不同线程的上下文中获取托管对象,这样可以确保应用不会出现崩溃。

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    PHP中的Session工作机制与Session ID的实现原理

    Session 的工作机制 客户端第一次访问某服务器,为每个访问者创建一个唯一的 id (UID),并基于这个 UID 来存储变量。UID 存储在 cookie 中,亦或通过 URL 进行传导。...(2)服务器通过Cookie发送sessionID给客户端,并在服务器建立一个与sessionID同名的文件用于存储信息,而sessionID不能重复,即不同的客户端的sessionID是不同的。...数组与其他数组不同的是,当向该数组中添加数据时,PHP还会将其中的数据系列化写入session文件中,每次开启session时,PHP会将session文件中的数据读取到该全局数组中,实现数据共享的功能...$sess_data) { echo "sdfsf"; global $sess_save_path; $sess_file = "$sess_save_path/sess_$id"; if (...session_id(); // 在cookie中的体现是,session_name为键,session_id为值 setcookie(); // 要想起作用,必须有页面的刷新 session_destory

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    Pytorch中的Distributed Data Parallel与混合精度训练(Apex)

    然而,这篇教程里的代码是跑不同的(函数名字都对不上),也没告诉你怎么跑这个代码。和之前的教程一样,他也没给一个逻辑上分布式训练的工作概括。...每个进程都执行相同的任务,并且每个进程与所有其他进程通信。 只有梯度会在进程/GPU之间传播,这样网络通信就不至于成为一个瓶颈了。 ?...最小例程与解释 为了展示如何做到这些,这里有一个在MNIST上训练的例子,并且之后把它修改为可以在多节点多GPU上运行,最终修改的版本还可以支持混合精度运算。...Line35~39:nn.utils.data.DistributedSampler 确保每个进程拿到的都是不同的训练数据切片。...而 O1 和 O2 属于不同的混合精度程度,具体可以参阅APEX的官方文档。注意之前数字前面的是大写字母O。

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    Ask Apple 2022 中与 Core Data 有关的问答 (下)

    Ask Apple 为开发者与苹果工程师创造了在 WWDC 之外进行直接交流的机会。本文对本次活动中与 Core Data 有关的一些问答进行了整理,并添加了一点个人见解。本文为下篇。...我想知道这里的最佳做法是什么。谢谢!A:一般来说,不同的视图经常使用不同的获取请求。对于日期范围之类的内容,你可能希望一次获取一批。过长的 I/O 会使您的视图绘图停滞。...实体属性的可选性Q:Core Data 中实体属性的可选性表现与预期不一致。如果我将某个属性标记为可选,则该属性不应具有默认值,并且托管属性应始终为可选属性。...让 Core Data 为你做这件事。为了管理有序的关系,Core Data 在 UInt16 空间中计算一个对象的索引,正好在前一个和后一个对象的中间。...当整数空间用完时,将在任何一个方向上跨出一个对象,并均匀地重新分配这些对象。很遗憾,有序关系无法在开启 Core Data 云同步的状态下使用,在此种情况下,提问者当前的做法应该是正确的选择。

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    rgdal包readOGR使用

    这两株数据对象都可以通过读取shp数据获得 SP数据特点 SP空间数据对象是一个dataframe(数据描述层)和polygons(几何映射层)两个对象的组合 SP将地理数据分割为两大块:描述层和映射层...描述层记录各个地理区域的名称、ID、编号、简写、iOS编码等信息,可以通过data@data来获取描述曾数据框。...映射层是每一个行政区域的多边形边界点,按照order排序,按照group分组,多边形分界点信息是一个多层嵌套的list结构,但我们可以通过fortity函数将其装换位数据框。...SF数据特点 最大特点hi是,他将每一个行政区划所对应的几何边界点封装成一个list对象,这条记录就像其他普通的文本记录一样,被排列在对应行政区划描述单元中 使用sf包的st_read()函数导入的空间数据对象完全是一个整齐的数据结构...,这些行列中包括了描述层和几何多边形的边界点信息。

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    全球公用事业级太阳能发电场卫星数据集

    cluster_id:分析级数据集中相应项目的 ID capacity_mw:资产的估计容量,单位为兆瓦 constructed_before:建造日期的上限(太阳能电站首次以建造状态出现在图像中的估计日期...1.2 原始数据集和数据源 分析级数据集隐藏了底层数据的一些复杂性,我们在 raw_polygons 和源文件中公开了这些数据。 我们每次运行都会生成新的多边形集。...为了能够跟踪每次运行的原始探测结果,并提供详细的来源信息,我们提供了所有这些原始多边形,以及一个源文件,其中列出了每个分析级多边形中包含的所有原始多边形。...raw_polygons.gpkg 包含以下字段: id:原始源多边形的 ID 几何体:定义资产的多边形或多多边形 来源:"solar asset mapper"、"osm "或 "2019_global_pv...Sources.csv 包含以下字段: cluster_id:分析级数据集中相应项目的 ID source_id:原始源多边形的 ID source:"solar asset mapper"、"osm

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    一篇小短文助你打开数据可视化的任督二脉!

    本文主要讨论ggplot2是如何通过颜色信号来对多边形进行填充的底层理念,这也是想要进阶R语言数据可视化过程中必须搞明白的关键环节。...国家线通常需要在group的基础上,施加id(该id将同属一个国家的不同group归类为一个编号),当然我们也可以将id匹配上国家(行政区划)的实际名称(通常获取的数据地图素材都会同时匹配上id和行政区划名称...group分组,组内按照order排序,这样保证最后绘制出的地理信息边界点不会出现错乱,不同多边形有连接线等这种我们不想看到的情形。...因为可能存在一个id对应多个多边形(group)的情况,所以这些同属一个id的多边形都会被填充(或者轮廓色)同一个数量级的填充色(或者轮廓色)。...所以到这里,我们再回头看以上内容: 一副完整的,带有行政区划与指标变量映射关系的geom_polygon()的图层完整的语法需要指定以下一个参数: gggplot(data=mydata)+ geom_polygon

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    MySQL空间函数实现位置打卡

    总之,MySQL可以满足我们的需求。 MySQL提供单个的存储类型 POINT、LINESTRING、POLYGON 对应几何图形点、线、多边形,GEOMETRY 可以存储三种中的任何一种。...对WKB感兴趣的可以看这里(https://www.docs4dev.com/docs/zh/mysql/5.7/reference/gis-data-formats.html#gis-wkb-format...如果几何满足诸如此(非穷举)列表中的条件,则它在语法上是 well-formed: 线串至少有两个点 多边形至少有一个环 多边形环关闭(第一个和最后一个点相同) 多边形环至少有 4 个点(最小多边形是一个三角形...还可以用ST_Within(g2,g1)达到相同的效果。 3、不相交 ST_Disjoint(g1,g2),返回 1 或 0 以指示g1是否在空间上与(不相交)g2不相交。...函数式编程了解一下 怎么理解内存中的Buffer和Cache?

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    【工具】用R软件绘制中国分省市地图

    首先,从这里下载中国地图的GIS数据,这是一个压缩包,完全解压后包含三个文件(bou2_4p.dbf、bou2_4p.shp和bou2_4p.shx),将这三个文件解压到同一个目录下,并在R中设好相应的工作空间...在上面的数据中,一共包含了925个多边形的信息,之所以有这么多是因为一些省份有很多小的附属岛屿。在这925个多边形中,每一个都对应一个唯一的ID,编号分别从1到925。...于是自然就产生了一个问题:如何获取某一个特定地区的ID,进而设置我们想要的颜色?事实上,在变量x中,就已经存储了我们想要的信息。...在x$att.data的第899行有一个NA,不知道它代表的是否就是中国澳门。 利用类似的方法就可以根据自己的需要对不同的区域进行着色,下面再举一例。...此外,在绘制地图的过程中,还有一个比较有用的参数是recs,它是一个由多边形ID组成的向量,表示在地图中只画出这些ID所代表的区域。

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    MySQL的复杂数据类型,学会使用再也不怕复杂场景了、枚举(ENUM)、集合(SET)、JSON、空间数据类型

    MySQL数据库作为关系型数据库管理系统(RDBMS)中的佼佼者,提供了多种数据类型以满足不同应用场景的需求。...与ENUM不同,SET可以包含零个或多个选定的值。 灵活性:SET类型允许用户选择多个值,并且这些值之间没有互斥关系。 应用场景:SET类型常用于表示具有多个属性的字段,如用户角色、产品标签等。...空间数据类型 描述 GEOMETRY 抽象数据类型,表示任何几何形状 POINT 表示二维或三维空间中的点 LINESTRING 表示二维或三维空间中的线 POLYGON 表示二维或三维空间中的多边形...MULTIPOINT 表示多个点的集合 MULTILINESTRING 表示多个线的集合 MULTIPOLYGON 表示多个多边形的集合 GEOMETRYCOLLECTION 表示几何形状的集合,可包含不同类型的形状...空间查询:查找距离某个点一定范围内的其他点,或查找与某个多边形相交的其他多边形。 空间分析:计算两个多边形的面积,或计算两个点之间的距离。

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    左手用R右手Python系列12——空间数据可视化与数据地图

    以前我一直觉得Python的绘图工具与R语言ggplot2比起来,不够优雅,这也是我一直坚定的选择使用R+ggplot2深入的学习数据可视化的原因,ggplot2在坐标系的整合与兼容性和扩展性上确实技高一筹...巧合的是,python中的geopandas用了同样的 技术来简化空间数据可视化的复杂度,其核心理念也是通过压缩单个地理多边形为一个Simple Features,使得所有的地理多边形与其属性信息严格对齐...) #从SP(空间数据对象)中剥离地理多边形边界点信息和多边形属性信息 xdata xsdata.frame(id=row.names(x),x) china_map_data...我能告诉你的是,geom_ploygon制作地图的时候,剥离了地理信息边界点数据和多边形属性信息,所以你需要同时兼顾、处理两个包含空间信息的数据框,如果是对不同区域进行等值线映射,你还需要对这两个数据框进行合并操作...geopandas包同时支持导入shp素材和json素材,导入之后得数据结构与R语言中得sf导入之后得结构是一致得,地理多边形边界点信息都被压缩成了一个非常整齐的列表存储,列表内每一个单独的子项目都代表着一个多边形

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    一篇文章教你搞定JSON素材,从此告别SHP时代~

    可是json文件遵循的JS语法,导入R中之后,全部被强制转化为各种嵌套的list、data.frame、array等混合体,如果没有对R数据结构很好的把握,基本看上一眼就绝望了。...,在素材提取过程中,之所以先提各区的代码和id,目的是之后与边界经纬度信息合并,这样,所有指标都可以通过合并进入整体的边界点经纬度信息数据文件中,指标(无论是连续还是分类型)可以作为映射规则(大小、颜色...但是针对省级边界的json数据文件,相对就要复杂得多,因为很多省份内的城市辖区可能地域上是分割开的(比如河北的廊坊、安徽的铜陵等),但是R语言通过多边形映射的时候,是将分离的多边形分别定义(依据就是上面的...group变量),然后通过将具有相同行政隶属关系的多边形指定一个相同的ID(我们的所有指标型数据都是跟id挂钩的,与group无关,只有在该地区行政辖区内各子行政单位没有出现地域分割的情况,此时基于行政单位编号的...id和基于多边形编号的group才会一一对应,否则不会出现严格对应关系)。

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    R语言绘制中国地图,并展示流行病学数据

    流行病学的数据讲究“三间分布”,即人群分布、时间分布和空间分布。其中的“空间分布”最好是在地图上展示,才比较清楚。R软件集统计分析与高级绘图于大成,是最适合做这项工作了。...但是老版数据中,市级数据中缺少绘制区域的多边形数据,让市级分布图的绘制稍麻烦一些,新版中也许会有改进。 用R绘制地图比较简单。...这是因为,在绘图的过程中,默认把经度和纬度作为普通数据,均匀平等对待,绘制在笛卡尔坐标系上造成的。其实,地球的球面图形如何映射到平面图上,在地理学上是有一系列不同的专业算法的。...这种情况下,在fortify处理数据的时候一定要特别注意索引与多边形一一对应,同时又要保持地名信息,黑魔法在代码中: # mydat = readShapePoly("maps/bou4/BOUNT_poly.shp...针对空间数据,R里面有很多空间数据的分析软件包。推荐Roger S.

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    【完整案例】如何用R实现空间数据可视化

    流行病学的数据讲究“三间分布”,即人群分布、时间分布和空间分布。其中的“空间分布”最好是在地图上展示,才比较清楚。...但是老版数据中,市级数据中缺少绘制区域的多边形数据,让市级分布图的绘制稍麻烦一些,新版中也许会有改进。 用R绘制地图比较简单。...这是因为,在绘图的过程中,默认把经度和纬度作为普通数据,均匀平等对待,绘制在笛卡尔坐标系上造成的。其实,地球的球面图形如何映射到平面图上,在地理学上是有一系列不同的专业算法的。...这种情况下,在fortify处理数据的时候一定要特别注意索引与多边形一一对应,同时又要保持地名信息,黑魔法在代码中: # mydat = readShapePoly("maps/bou4/BOUNT_poly.shp...针对空间数据,R里面有很多空间数据的分析软件包。推荐Roger S.

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    Vue ArcGis鼠标打点、中心打点绘制多边形

    一、前言 ArcGis绘制多边形这里没有用官方提供的api,官方提供的api是鼠标点击打点然后大于三个点位实时绘面,这种绘制多边形的方式在pc端体验感较佳,但在移动端会差点意思,所以这里提供了另一种绘制多边形的思路以供各位看官参考...$emit('addSpot',pt); }); 复制代码 在点击绘制多边形后订阅这个全局eventBus,并push进你的点位数组 this.$eventBus....$on('addSpot',data =>{ data.id = `point_${this.spotArray.length + 1}`; this.spotArray.push(data)...this.spotArray.length >= 2){ // 实例化长度单位 let params = new this.gisGz.LengthsParameters(); // 计算多边形周长的长度单位..., y: this.mapView.center.y, spatialReference: this.mapView.spatialReference, // 几何图形的空间参照

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    打造基于GitHub的O2O应用:超炫的地图交互

    离线地图与搜索 在GitHub上搜索数据的过程中,发现了一个名为d3js-geojson的项目里面放着中国详细省、市、县数据,并且还有及GeoJSON文件。...GeoJSON是一种对各种地理数据结构进行编码的格式,基于Javascript对象表示法的地理空间信息数据交换格式。GeoJSON对象可以表示几何、特征或者特征集合。...最初的时候要用Event的形式来实现,但是发现这样似乎会让其紧耦合。就改用了监听Hash Change的形式来实现,在总的地图上每一个省都有一个对应的ID,这个ID会对应相应的省的数据。...如下图所示: 接着,我们就需要从这个Hash中判断它的级别和ID,随后转由相应的函数来处理这些逻辑即可。...但是因为这些市并不存在GEO信息,所以我只是从其多连形信息取了一个点,再将这个点放到data-geo中: 对应于省市的,对于区的处理也是如此。

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