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文献配套GitHub发表级别绘图03-条形图

下面来实现Fig.2a的条形图(barplots) 一、数据载入 rm(list = ls()) library(reshape2) library(ggplot2) library(RColorBrewer...公式的左边每个变量都会作为结果的一列,而右边的变量被当成因子类型,每个水平都会在结果中产生一列。 reshape2 (另外,tidyr包gather和spread函数也能实现功能哦!)..."表示条形的高度是y变量的值 scale_fill_manual(values = colorRampPalette(brewer.pal(11, "Spectral"))(22)) + # 设置填充颜色...极端型Diverging,生成深色强调两端、浅色表示中部的颜色,可用来标注数据的离群点。 离散型Qualitative,生成彼此差异明显的颜色,通常用来标记分类数据。...:Spectral调色板选择11个颜色,在这11个颜色之间进行连续取值(共22个颜色) # 若添加到ggplot2 # scale_fill_manual(values = colorRampPalette

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「R」ggplot2数据可视化

ggplot2 初探 在ggplot2,图是采用串联起来(+)号函数创建的。每个函数修改属于自己的部分。...fill 对填充区域着色,如条形和密度区域 alpha 颜色的透明度,从0(完全透明)到1(不透明) linetype 图案的线条(1=实线,2=虚线,3=点,4=点破折号,5=长破折号,6=双破折号...分组 在R,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...当更改图例的标题时,必须综合考虑颜色填充、尺寸等等。可以通过fill="mytitle"加到labs()函数来改变标题。 标题的位置由theme()函数的legen.position选项控制。...theme()函数的选项可以让我们调整字体、背景、颜色和网格线等。主题可以使用一次,也可以保存起来应用到多个图中。

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文献配套GitHub发表级别绘图之饼图

此外,图形还可能包含数据的统计变换(statistical transformation,缩写stats),最后绘制在某个特定的坐标系(coordinate system,缩写coord),而分面(..."count"表示条形的高度是y变量的数量 #stat="identity"表示条形的高度是y变量的值 scale_fill_manual(values = Colors) #设置填充颜色...count"表示条形的高度是y变量的数量 #stat="identity"表示条形的高度是y变量的值 scale_fill_manual(values = Colors) + #设置填充颜色...vjust = 0.5),size=5) #vjust=0.5在堆叠柱子的中间位置添加文字 四、玫瑰图 然而,当我们的数据不是代表个体占总体的百分比,而是强调数据大小的对比时,可以用玫瑰图来展示,根据上面的代码做简单的修改即可...#stat="identity"表示条形的高度是y变量的值 scale_fill_manual(values = Colors) + #设置填充颜色

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课后笔记:ggplot2优雅的显示WB结果

ggplot2柱状图基本绘制函数常用geom_bar()」 参数介绍: 「data和mapping是ggplot的基本参数,数据和映射。」...aes:颜色(color颜色或边框颜色、fill填充颜色和 alpha透明度) 形状(linetype线型、size点的大小或线的宽度和 shape形状) 位置 (x, y, xmin, xmax, ymin...「position:」 位置调整,有效值是stack、dodge和fill,默认值是stack(堆叠),是指两个条形图堆叠摆放,dodge是指两个条形图并行摆放,fill是指按照比例来堆叠条形图每个条形图的高度都相等...「width:」 条形图的宽度,是个比值,默认值是0.9 「color:」 条形图的线条颜色 「fill:」 条形图填充色 基本演示 读取ImagJ数据及转换 #读取ImageJ dat=read.csv...image.png 数据调整及误差线增加 在ggplot2可以直接结合stat_summary函数快速进行数据统计->链接 所以stat可以设置为summary,将柱状图的高度设置为各组的均值并联合stat_summary

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R语言 | 条形图绘制

1绘制基本条形图 演示数据 以gcookbook包的pg_mean数据集为例。...我们可以通过fill参数改变填充色,colour为条形图添加边框线。这里我将填充色更改为亮黄色,边框线为黑色。注意,颜色要用""引起来哦!...此时,可通过将该分类变量映射给fill参数来绘制簇状条形图,这里的fill参数用来指定条形的填充色。 position='dodge'以使得两组条形在水平方向上错开排列,否则,系统会输出堆积条形图。...= Weight,fill = Cultivar)) + geom_col() 输出图片 反转图例顺序 我们可以通过guides()函数对图例顺序进行调整,指定图例所对应的需要调整的图例属性,本例对应的是填充色...演示数据 以ggplot2的diamonds数据集为例。

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ggplot2--R语言宏基因组学统计分析(第四章)笔记

每个geom只能显示特定的几何图形(例如,条形图、线和点等),每个geom都有默认统计,并且每个统计都有默认的geom 位置调整:用于调整图形上几何元素的位置以避免相互遮挡,例如在条形图中,堆叠或回避(...例如,在连续情况下,用刻度填充直方图或密度图;在离散情况下,比例用于填充直方图或条形图,或者在映射颜色、大小或形状时用于散点图。我们需要知道,映射到变量的美学属性取决于所使用的geom()函数。...实际上,在ggplot2,除了颜色之外,我们还可以使用大小、形状、笔划(边界的厚度)和填充填充颜色)来区分适当绘图中的分组。...4.3.3.3 使用坐标系统来调节和限制X轴和Y轴 坐标系的用途是在计算机屏幕上调整从坐标到二维平面的映射。在ggplot2可用的不同坐标系,笛卡尔坐标系和极坐标系是最常用的坐标系。...在下面的代码,我们创建一个新的plot对象p5,并使用coord_cartesian()更改X和Y轴的限制以放大到感兴趣的区域。

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(数据科学学习手札37)ggplot2基本绘图语法介绍

color, price/carat, data=data, geom='boxplot') 我们还可以通过传入参数colour来控制点与箱线边框的颜色、通过传入参数fill来控制箱线图填充颜色...传入colour来绘制分组的多条密度直线图: qplot(carat, data=data, geom='density', colour=color) 传入fill来控制每个曲线下的填充颜色...:  2.2.6 条形图   设置geom='bar'可以绘制条形图,当传入单个离散类别型数据时,可以自动绘制每个类别的频数统计条形图: qplot(color, data=data,...的语法规则进行探索: 3.1 ggplot2的绘图过程   我们先来看一下ggplot2的绘图过程: 仅根据上面的图,你心中一定很是疑惑,没关系,请你先短暂浏览上面这个过程,下面我们对这个过程进行一系列拆分...,ggplot2绘制的通常为2D图像,即图像的位置信息由(x,y)决定,且通常为笛卡尔坐标系,用得较少的是极坐标系和各种地图坐标系;   坐标系最大的特点是,它可以同时影响所有的位置变量,譬如说,条形图在笛卡尔坐标系是规规矩矩的条形

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R语言之 ggplot 2 和其他图形

ggplot2 各种数据可视化的基本原则完全一致,它将数学空间映射到图形元素空间。...例如,在上图中,我们将变量 am 映射到颜色,但具体使用哪种颜色ggplot2 自动选择的。如果想自己设定颜色,就需要使用标度(scale)函数了。...ggplot2 中有种类繁多的以 scale 开头的标度函数,可用于控制图形的颜色、点的大小和形状等。例如,我们可以用下面的标度函数手动设置需要的颜色,结果如下图所示。...参数 fill 用于设置填充色。参数 color 用于设置矩形边框的颜色。我们还可以将直方图和密度曲线同时展示,如下图所示。...3.3 热图 热图(heatmap)是将一个矩阵的元素数值用不同颜色表达,并对矩阵的行或列进行层次聚类的一种颜色图。通过热图,我们不仅可以直接观察矩阵的数值分布状况,还可以知道聚类的结果。

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这些条形图的用法您都知道吗?

在R语言的ggplot2,读者可以借助于geom_bar函数轻松地绘制条形图。对于条形图大家对其的印象是什么呢?又见过哪些种类的条形图呢?在本篇文章我将带着各位网友说道说道有关条形图的哪些品种。...ggplot2的语法讲解 ---- 如果读者对R语言比较熟悉,一定听过或使用过ggplot2的绘图体系了。...有两点需要说明,一方面,在ggplot2绘图过程均采用图层思想,将多个图形进行叠加和设置;另一方面,图层思想是通过代码的加号(+)表现出来的。...NULL, mapping = aes()) data:指定绘图所需的原始数据,如果不指定,则必须在geom_*函数中指定; mapping:通过aes的方式指定图形的属性(如x轴的变量,y轴的变量,颜色变量..., fill = fengli) # 指定x轴变量和填充色变量 ) + geom_bar(stat = 'count' # 需对明细数据的离散变量作频数统计 ) +

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商务图表案例——仿经济学人分组漏斗图~

今天看到一个看着挺养眼的经济学人图表案例,于是职业病爆发了,用ggplot2按照自己的思路写了一遍。现在把代码思路分享给大家!...加载包: library("ggplot2") library("tidyr") library("magrittr") library("dplyr") library("showtext") library...可以看到,ggplot2图形对象禁止同时在一个图形中使用两个或者两个以上的标度,否则最后的标度将会覆盖前面的同名标度。...这个问题已经困惑了我将近一年了,最初的疑惑是在这篇文章里: R语言可视化——多图层叠加(离散颜色填充与气泡图综合运用) 好在如果是多边形和气泡图同时使用颜色填充的时候,我们可以通过将气泡图使用1~5号仅有...数据地图多图层对象的颜色标度重叠问题解决方案 但是针对本例而言,这个问题没法直接解决,因为我要填充的两个图层都是fill属性,但是并不是一点儿也没有解决办法,我将其中一个图层(polygon)的颜色类别变量因子拆开成了三个图层分别映射

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绘制可自定义填充图案的统计图-patternplot

导语 GUIDE ╲ 饼图、环形图、柱状图和箱式图是我们论文写作和数据统计经常要绘制的统计图,常常是使用单一的颜色填充ggplot2大家可能都用烦了吧),小编呕心沥血终于找到一个非常实用又高级的绘图...patternplot包不仅可以绘制美观和信息丰富的统计图,它可以用颜色或纹理或png或jpeg格式的任何外部图像填充统计图,让我们一起来看看吧!!...density1<-rep(11.5, length(group1)) #环内填充颜色 pattern.line.size1=c(10, 1, 6, 1, 10, 1, 6, 1) #环内填充线/点的粗细.../点的类型,density是填充密度,color是线条/点d的颜色 #pattern.line.size是填充线/点的粗细/大小,background.color背景颜色 #pixel是分辨率, res...('white', length(group1)) #第一环线/点的填充颜色 pattern.color2<-rep('white', length(group2)) #第二环线/点的填充颜色 background.color1

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对,你没看错,真的有这种操作~

之前的ggplot2入门实践篇已经更新告一段落,也已经做了归总分类分享给大家。 最近翻看突然发现少了一个知识点,就是分面没有讲填充多边形分面的应用,虽然其理念跟其他的常用图表类型一致。...数据地图多图层对象的颜色标度重叠问题解决方案 ggplot2如何自定义数据地图版面范围~ 关于数据地图的几个遗留问题解决方案 R语言数据地图——美国地图 R语言数据地图——全球填色地图...——地图填充与散点图图层叠加 R语言可视化——多图层叠加(离散颜色填充与气泡图综合运用) R语言可视化——地图与气泡图结合应用 用R语言复盘美国总统大选结果~ R语言可视化——ggplot...mydata,all.x=TRUE) mymapdata%rename(region=NAME) 今天的目标是,使用一个省份12年份实践序列数据分别呈现填色散点气泡图、颜色填充图...geom_map函数进行颜色填充地图的绘制)。

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R语言绘图之ggplot2

那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...aes : 同样适用于修改geom_XXX() aes参数控制了对哪些变量进行图形映射,以及映射方式 图形属性(aes)横纵坐标、点的大小、颜色填充色等 几何对象函数 描述 geom_abline 线图...,由斜率和截距指定 geom_area 面积图(即连续的条形图) geom_bar 条形图 geom_bin2d 二维封箱的热图 geom_blank 空的几何对象,什么也不画 geom_boxplot...scale_gradient2 3颜色构建的渐变色 scale_gradientn n种颜色构建的渐变色 scale_grey 灰度颜色 scale_hue 均匀色调 scale_identity

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ggplot2:正负区分条形图及美化

在数据分析报告条形图是很常见的一种表现形式,可以的反应各项之间的比较情况。在实际的应用,为了更加直接、美观,对图表的展现形式也有了越来越高的要求。...通过强大的ggplot2包,也可以画出有特色的条形图。 在网上看到有人画的正负区分条形图,花了点时间打磨其中的美化细节,基本也算是原样画出了。...实现过程 首先,载入ggplot2包,并随机生成二维数据。 ? 接下来,用ggplot()+geom_bar()画出基本的条形图。 ?...这里面,使用reorder()函数,使得按照Difference取值大小,条形图进行排序。同时,在这一步设置对每个条形加黑色边框,调整条形宽度,并使得中间留有空隙。 ?...最后,我们修改图例的颜色、字体,并在条形图两侧加入标签文字,就可以得到最终的效果了。 ? ? 想要图表做的好看,工具的使用是一方面,审美与图表思维的培养也是特别重要。从模仿开始,是不错的学习方式。

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Python可视化——3D绘图解决方案pyecharts、matplotlib、openpyxl

这篇博客将介绍python可视化比较棒的3D绘图包,pyecharts、matplotlib、openpyxl。基本的条形图、散点图、饼图、地图都有比较成熟的支持。...1. pyecharts 支持散点图、条形图、折线图、饼图、地图、热力图、图表、股票图、雷达图、箱线图、树图、树map图、日晷图、平行线图、桑葚图、漏斗图、仪表盘图、画报图、主题河流图、日历图、个性化图...绘制 3D 轮廓(水平)曲线 使用 extend3d 选项绘制 3D 轮廓(水平)曲线 将轮廓轮廓投影到图形上 将填充轮廓投影到图形上 3D 曲面图中的自定义山体阴影 3D 误差条 3D 误差线 创建...绘图 3D散点图 3D 茎 3D 图作为子图 3D 表面(颜色图) 3D表面(纯色) 3D表面(棋盘) 具有极坐标的 3D 表面 3D 文本注释 三角形 3D 等高线图 三角形 3D 填充等高线图...三角形 3D 表面图 3D 体素/体积图 numpy 标志的 3D 体素图 带有 rgb 颜色的 3D 体素/体积图 具有圆柱坐标的 3D 体素/体积图 3D 线框图 旋转 3D 线框图 一个方向的 3D

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(数据科学学习手札38)ggplot2基本图形简述

一、简介   上一篇我们介绍了ggplot2的基本语法规则,为了生成各种复杂的叠加图层,需要了解ggplot2一些基本的几何图形的构造规则,本文便就常见的基础几何图形进行说明; 二、各基础图形 2.1...abline()、hline()与vline()   在R的基础绘图系统我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2当然也有类似的方法: geom_abline():   ...'bottom')+ labs(title='堆积面积图')+ theme(plot.title = element_text(hjust=0.5)) h 2.3 bar()   基础的条形图我们前面一篇已经涉及到了...stat_density2d(aes(colour=..level..)) v   也可以不绘制等高线,将..density..作为fill的传入参数,注意这里一定要设置contour为F: # 密度图函数,通过fill设置填充颜色数据为密度...fill=factor(class))) p + geom_boxplot() 为我们的填充设置透明度,并将边框也赋以对应的颜色: p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy, fill

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如何通过R语言制作BBC风格的精美图片

在BBC数据团队开发了一个R包,以ggplot2内部风格创建可发布出版物的图形,并且使新手更容易到R创建图形。 例如: ? 加载所有所需的R语言包 通常在R创建图表需要安装和加载某些软件包。...请注意,对于折线图而言,折线的颜色或对于条形图而言是条形的颜色,并不是从bbc_style()函数中直接获得的,而是需要在其他标准ggplot图表函数明确设置 。...它本质上修改了ggplot2的主题功能的某些参数。例如,第一个参数是设置绘图标题元素的字体,大小,字体和颜色。...上面的代码会自动为每个大洲添加一个文本标签,而无需我们分别添加“ geom_label”。...例如,如果要创建带有很多条形图条形图,并要确保每个条形图和标签之间有一定的呼吸空间,则可能是这种情况。 如果您确实保留了较大高度图的边距,那么轴和标签之间的间隙可能会更大。

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