我试图绘制一张虹膜数据集的PCA图，但总是出现一个空白图。我在哪里犯了错误？url = "https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning- databases/iris/iris.data"
principalComponen
浏览 16提问于2019-07-20得票数 0
1回答
我目前正在处理一个大型数据集(使用物种x样本计数数据)，我在其中执行了PCA。我得到的是一个巨大的点云，我想给一个特定的物种涂上颜色，以显示它在云中的位置(物种是我的变量)。如下所示：我使用包factoExtern外，并使用fviz_pca_var可视化变量。有没有办法选择一个特定
浏览 6提问于2022-07-08得票数 0
回答已采纳
1回答
自动打印更改代码的符号
、、、
我有一个小小的图谋困境，我希望你们都能给我一个快速而简单的答案。我使用prcomp()运行了一个PCA，并第一次尝试使用ggplot绘制它。我已经成功地制作了一个美观的图形，然而我刚刚有同事指出，它目前不是色盲友好的。我使用的配色方案不容易更改(因为这个PCA图需要协调许多其他图形)，所以我一直在尝试更改<em
浏览 2提问于2016-10-27得票数 3
我一直在努力调整ggplot2/ggfortify PCA中的加载(箭头)长度。我已经广泛地寻找了这个问题的答案，我找到的唯一信息要么是编写新的biplot函数，要么是引用其他完全不同的PCA包(ggbiplot，factoextra)，这两个包都没有解决我想要回答的问题：
是否可以在如果有必要，我会转到另一个包，但我
浏览 2提问于2016-03-11得票数 6
所以我做了一个PCA分析，我通常用ggplot2绘制结果，但我最近才发现可以用变量显示箭头的图形。虽然它显示了一些问题(比如改变点大小的不可能性，因此我在MWE中所做的整个层的事情)，但是ggbiplot似乎还能正常工作。我现在面临的问题是，当ggplot2绘图将绘图宽度调整到绘图区域时，ggbiplot却没有。我</e
浏览 2提问于2017-09-14得票数 0
回答已采纳
1回答
因此，基本上，我是比较新的滑雪和ML与python在总体上。我已经习惯了RapidMiner和其他GUI工具。我有超过200万行和5列的数据集，它们是我的主要组件(大约98%的方差)。：
我不知道显示数据的最佳方法是什么，因为组件的数量是5。也许我可以用前3台电脑做3D绘图，或者拿出标签，然后把它们附加到<em
浏览 5提问于2022-04-20得票数 0
回答已采纳
我正在使用dplyr管道对数据集中的组运行pcas。我从group_split开始，所以我使用一个列表。为了运行prcomp()函数，只能包含每个列表的numeric列，但我希望在末尾带回factor列进行绘图。我尝试过在管道中途使用{. ->> temp}保存中间输出，但由于它是一个列表，所以我不知道在绘图时如何索引分组列。=temp$Species)#plot each pca, l
浏览 22提问于2019-09-24得票数 2
回答已采纳
1回答
我基本上是在计算一组变量的PCA，一切都很好。假设我是以虹膜数据为例，但我的数据是不同的。虹膜数据应该足以解释我的问题：log.ir <- log(iris[, 1:4])ir.groups<- iris
浏览 4提问于2016-05-25得票数 3
1回答
聚类分析中的目标
、、、
我不明白为什么某些dataset在Iris数据库中已经有一个目标广告示例，或者其他类似的(https://scikit-learn.org/stable/datasets/index.html)在绘图数据时有一个有用的例如，在虹膜数据库中选择color= target_names这样做。我在网上找到了这段代码。principal compone
浏览 0提问于2019-03-06得票数 0
我在R w/ autoplot中看到了这个教程。他们绘制了装载和装载标签： loadings = TRUE, loadings.colour= 'blue',
对于我的数据分析，我</e
浏览 4提问于2016-08-29得票数 21
回答已采纳
1回答
我想有我自己的脚本，绘制加载和数十个PCA。主要的问题是负载和分数不是相同的单位度量(在我的数据中)。我想我需要在代码中以某种方式扩展加载。这里我试图给出一个虹膜数据PCA双图的例子，但是这段代码给出了一个错误：
# load data in
da
浏览 1提问于2017-02-02得票数 0
回答已采纳
2回答
下面是一个可重复使用的示例： set.seed(10)iris.training <- iris[pick,] pca.training <- prcomp(iris.training[-5])
pca.testing <- prcomp(
浏览 54提问于2020-12-14得票数 0
回答已采纳
我想根据数据帧中定义的特定组对树状图的分支进行着色。为什么？我怎么才能解决这个问题呢？
pca_iris <- PCA(iris[ ,1:4])colori[whichby manmade groups")
pca_
浏览 5提问于2020-05-20得票数 1
1回答
我正在用factoextra包绘制一个pca。我对每个因子都有3个点，并想在每个点周围画椭圆。但是我得到了错误Too few points to calculate an ellipse。使用stat_ellipse函数可以在ggplot2中围绕3个点绘制椭圆。我可以通过查看来自ggplot2的calculate_ellipse 来确认这一点，它说的是else if (dfd < 3) {message(&qu
浏览 0提问于2018-04-20得票数 2
我试图了解Principal Component Analysis是如何工作的，我正在sklearn.datasets.load_iris数据集上测试它。我理解每个步骤是如何工作的(例如标准化数据、协方差、特征值排序、使用K选择的维度将原始数据转换为新的轴)。
下一步是可视化这些eigenvectors在dataset上的投影位置(在PC1 vs
浏览 2提问于2016-06-22得票数 5
我有来自四个群体，四个处理和三个重复个体的数据集。每个个体只存在于一个种群中，治疗和复制组合。我从每个人身上做了四次测量。我想对每个群体、基底和复制组合的这些测量进行PCA。我知道如何对所有个人进行PCA，并且我可以将数据集分割成多个数据集，用于每个种群、基底和复制，然后在每个新的数据集上执行PCA。我
浏览 2提问于2014-10-10得票数 5
回答已采纳
我使用了我们的流式细胞仪的一些原始输出文件，它告诉我，在.csv中，它测量每个事件/细胞的波长。
这导致了一个大约25000个细胞和240个测量点的.csv。然后，我使用rPhenograph计算社区，这是很好的工作。但现在，它似乎是一个数据，或什么东西，我真的不知道如何绘制它。/类似于tSNE情节的情节。相反，我只得到了一个
浏览 0提问于2019-05-13得票数 0
回答已采纳
2回答
我有一个机器学习问题，我不知道是否有一个理论上的解决方案。
我使用标记的数据(我们称之为dataset D1)来构建随机森林分类模型，并且效果很好。现在，我的主要兴趣是将该模型应用到另一个具有零标签的dataset D2上，这意味着我不能将它用于培训。在D2上度量性能的唯一方法是检查从中预测的类的比例。问题：D2与D1 (特性不具有相同的
浏览 2提问于2016-01-07得票数 6
回答已采纳
2回答
PCA降维后的聚类
、、、
假设我们有一个大维的数据集，我们使用PCA将其降到了较低的维度，那么对所述数据使用聚类算法是否明智/准确？假设我们不知道会有多少个集群。在Iris数据集上使用PCA ( csv中的数据按顺序排列，以便列出所有的第一类，然后是第二个，然后是第三个)生成以下图：
可以看出，Iris数据集中的三个类已被保留。然而，当样
浏览 5提问于2013-09-25得票数 0
回答已采纳
1回答
我正在尝试对我的数据集执行PCA分析，我可以在基本的plot函数上绘制负载。但是我想在ggplot上这样做，但是我一直收到这个错误，"ggplot2不知道如何处理类加载的数据“。我正在使用princomp函数，并且我正在绘制我的第一个组件和第二个组件。我</
浏览 4提问于2017-08-20得票数 2
扫码
添加站长 进交流群
领取专属 10元无门槛券
手把手带您无忧上云
相关资讯
热门标签
云服务器
ICP备案
对象存储
腾讯会议
云直播活动推荐
腾讯云开发者
