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【调研】GPU矩阵乘法的性能预测——Machine Learning Approach for Predicting The Performance of SpMV on GPU

通常,矩阵的大部分值都是零,因此在矩阵中,将数值为0的元素的数目远远大于非0的元素的数目,并且非0元素分布无规律时,称为稀疏矩阵;反之,则称为稠密矩阵。         ...稀疏矩阵是内存高效的数据结构,使我们能够存储具有极少非零元素的大型矩阵。         可以用稀疏度来表示矩阵的稀疏程度。         ...N表示稀疏矩阵行数,也就是要计算的输出向量的元素数。         Nnz是矩阵中非零元素的数量,与计算输出向量所需的运算(乘法和加法)的数量成正比。         ...Dis表示每一行中每对连续非零元素之间的平均距离。该指标提供了一种简单的方法来描述由对乘向量的随机访问所导致的缓存错过级别。它也被用于作为稀疏矩阵非零元素弥散程度的有效指标。         ...矩阵中非零元素的数量(nnz),与计算输出向量所需的运算(乘法和加法)的数量成正比。         每一行中每对连续非零元素之间的平均距离(dis),描述了对乘向量的随机访问。

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python的高级数组之稀疏矩阵

稀疏矩阵的定义: 具有少量非零项的矩阵(在矩阵中,若数值0的元素数目远多于非0元素的数目,并且非0元素分布没有规律时,)则称该矩阵为稀疏矩阵;相反,为稠密矩阵。...对于稀疏矩阵,采用二维数组的存储方法既浪费大量的存储单元来存放零元素,又要在运算中浪费大量的时间来进行零元素的无效运算。因此必须考虑对稀疏矩阵进行压缩存储(只存储非零元素)。...CSR是一种编码的方式 一维数组data(数值):有序地存储了所有的非零值,它具有与非零元素同样多数量的元素,通常由变量nnz表示。...Len(indice)==len(data)==nnz 备注:列索引表示数值所在的列号,从0开始。 数组data:包含矩阵中的非零元素,以行优先的形式保存。...链表稀疏格式在列表数据中以行方式存储非零元素, 列表data: data[k]是行k中的非零元素的列表。如果该行中的所有元素都为0,则它包含一个空列表。

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    盘一盘 Python 特别篇 20 - SciPy 稀疏矩阵

    引言 和稠密矩阵相比,稀疏矩阵的最大好处就是节省大量的内存空间来储存零。稀疏矩阵本质上还是矩阵,只不过多数位置是空的,那么存储所有的 0 非常浪费。...COO 采用三元组 (row, col, data) 的形式来存储矩阵中非零元素的信息,即把非零值 data 按着行坐标 row 和纵坐标 col 写成两个列表。...这种格式要求矩阵元按行顺序存储,每一行中的元素可以乱序存储。那么对于每一行就只需要用一个指针表示该行元素的起始位置即可。...使用两个嵌套列表存储稀疏矩阵: data 保存每行中的非零元素的值 rows 保存每行非零元素所在的列号 (列号是按顺序排的)。...稀疏矩阵使用 offsets 和 data 两个矩阵来表示,其中offsets 表示 data 中每一行数据在原始稀疏矩阵中的对角线位置 k: k > 0, 对角线往右上方移动 k 个单位 k < 0,

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    Matlab C混合编程

    (复)双精度矩阵: MATLAB中最常用的数据类型便是(复)双精度、非稀疏矩阵,这些矩阵的元素都是双精度(double)的,矩阵的尺寸为m×n,其中m是总行数,m是总列数。...如果一个矩阵的pi为空的话,说明它是实双精度矩阵。 稀疏矩阵(Sparse Matrices) MATLAB中稀疏矩阵的存储格式与众不同。...它是稀疏矩阵中不为零的元素的个数。 ir指向一个长度为nzmax的整型数阵列,阵列包含的是pr和pi中对应元素的行号。 jc指向一个长度为N+1的整型数阵列(N为矩阵的列数),其中包含的是列号信息。...对于任意的j,如果0≤j≥N-1,jc[j]是第j列中第一个非零项在ir、pr(以及pi)中的序号,jc[j+1]-1是第j列最后一个非零项的序号。因此jc[N]总等于nnz——矩阵中非零项的总个数。...如果nnz小于nzmax,可以继续向矩阵中添加非零项而无需分配额外的存储空间< 4、主要函数举例: ·MATFile *matOpen(const char *filename, const char

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    NVIDIA HugeCTR,GPU版本参数服务器---(3)

    每个样本以格式化为整数的标签开始,然后是nnz(非零数)和使用 long long(或无符号整数)格式的输入key,如图 1(a)所示。...3.1 什么是CSR 稀疏矩阵指的是矩阵中的元素大部分是0的矩阵,实际上现实问题中大多数的大规模矩阵都是稀疏矩阵,因此就出现了很多专门针对稀疏矩阵的高效存储格式,Compressed Sparse Row...上图中,第一行元素1是0偏移,第二行元素2是2偏移,第三行元素5是4偏移,第4行元素6是7偏移。最后会在行偏移之后加上矩阵总的元素个数,本例子中是9。...,可以有效存储和处理大多数元素为零的张量。...一个 SparseTensor 使用三个稠密张量来表示: indices 表示稀疏张量的非零元素坐标。 values 则对应每个非零元素的值。 shape 表示本稀疏张量转换为稠密形式后的形状。

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    NVIDIA HugeCTR,GPU版本参数服务器---(3)

    每个样本以格式化为整数的标签开始,然后是nnz(非零数)和使用 long long(或无符号整数)格式的输入key,如图 1(a)所示。...3.1 什么是CSR 稀疏矩阵指的是矩阵中的元素大部分是0的矩阵,实际上现实问题中大多数的大规模矩阵都是稀疏矩阵,因此就出现了很多专门针对稀疏矩阵的高效存储格式,Compressed Sparse Row...上图中,第一行元素1是0偏移,第二行元素2是2偏移,第三行元素5是4偏移,第4行元素6是7偏移。最后会在行偏移之后加上矩阵总的元素个数,本例子中是9。...,可以有效存储和处理大多数元素为零的张量。...一个 SparseTensor 使用三个稠密张量来表示: indices 表示稀疏张量的非零元素坐标。 values 则对应每个非零元素的值。 shape 表示本稀疏张量转换为稠密形式后的形状。

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    Matlab矩阵基本操作(定义,运算)

    逻辑运算的运算法则为: (1) 在逻辑运算中,确认非零元素为真,用1表示,零元素为假,用0表示; (2) 设参与逻辑运算的是两个标量a和b,那么,a&b a,b全为非零时,运算结果为1,否则为0。...a|b a,b中只要有一个非零,运算结果为1。~a 当a是零时,运算结果为1;当a非零时,运算结果为0。 (3) 若参与逻辑运算的是两个同维矩阵,那么运算将对矩阵相同位置上的元素按标量规则逐个进行。...在许多实际问题中遇到的大规模矩阵中通常含有大量0元素,这样的矩阵称为稀疏矩阵。Matlab支持稀疏矩阵,只存储矩阵的非零元素。...(3) 从文件中创建稀疏矩阵利用load和spconvert函数可以从包含一系列下标和非零元素的文本文件中输入稀疏矩阵。...3、其他 (1) 非零元素信息 nnz(S) % 返回非零元素的个数 nonzeros(S) % 返回列向量,包含所有的非零元素 nzmax(S) % 返回分配给稀疏矩阵中非零项的总的存储空间

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    matlab 稀疏矩阵 乘法,Matlab 矩阵运算

    逻辑运算的运算法则为: (1) 在逻辑运算中,确认非零元素为真,用1表示,零元素为假,用0表示; (2) 设参与逻辑运算的是两个标量a和b,那么,a&b a,b全为非零时,运算结果为1,否则为0。...a|b a,b中只要有一个非零,运算结果为1。~a 当a是零时,运算结果为1;当a非零时,运算结果为0。 (3) 若参与逻辑运算的是两个同维矩阵,那么运算将对矩阵相同位置上的元素按标量规则逐个进行。...在许多实际问题中遇到的大规模矩阵中通常含有大量0元素,这样的矩阵称为稀疏矩阵。Matlab 支持稀疏矩阵,只存储矩阵的非零元素。...(3) 从文件中创建稀疏矩阵 利用load和spconvert函数可以从包含一系列下标和非零元素的文本文件中输入稀疏矩阵。...3、其他 (1) 非零元素信息 nnz(S) % 返回非零元素的个数 nonzeros(S) % 返回列向量,包含所有的非零元素 nzmax(S) % 返回分配给稀疏矩阵中非零项的总的存储空间 (2)

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    NVIDIA HugeCTR,GPU版本参数服务器--- (5) 嵌入式hash表

    因为其巨大的嵌入表和稀疏访问模式可能跨越多个 GPU,所以训练这种类型的 DL 系统存在独特的挑战。 HugeCTR 就实现了一种优化的嵌入实现,其性能比其他框架的嵌入层高 8 倍。...,那这个矩阵因为过于稀疏则会造成维度灾难。...所以,人们想对独热编码做如下改进: 将vector每一个元素由整型改为浮点型,从整型变为整个实数范围的表示; 把原始稀疏向量转化为低维度的连续值,也就是稠密向量。...用词汇举例,独热编码相当于对词进行编码,而分布式表示则是将词从稀疏的大维度压缩嵌入到较低维度的向量空间中。 分布式表示最大的贡献就是让相关或者相似的词在距离上更接近了。...嵌入表是稀疏类别的密集表示。 每个类别由一个向量表示,这里嵌入维度是4。来自 Using Neural Networks for Your Recommender System。

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    Spark MLlib 之 Vector向量深入浅出

    MLlib支持单机版本的local vectors向量和martix矩阵,也支持集群版本的matrix矩阵。他们背后使用的都是ScalaNLP中的Breeze。...更多内容参考我的大数据学习之路 Local Vector local vector是一种索引是0开始的整数、内容为double类型,存储在单机上的向量。...MLlib支持两种矩阵,dense密集型和sparse稀疏型。一个dense类型的向量背后其实就是一个数组,而sparse向量背后则是两个并行数组——索引数组和值数组。...比如向量(1.0, 0.0, 3.0)既可以用密集型向量表示为[1.0, 0.0, 3.0],也可以用稀疏型向量表示为(3, [0,2],[1.0,3.0]),其中3是数组的大小。...在二分类中,Label不是0就是1;在多分类中label可能从0开始,1,2,3,4....

    1.9K00

    稀疏矩阵的概念介绍

    有两种常见的矩阵类型,密集和稀疏。主要区别在于稀疏指标有很多零值。密集的指标没有。这是一个具有 4 列和 4 行的稀疏矩阵的示例。 在上面的矩阵中,16 个中有 12 个是零。...这就引出了一个简单的问题: 我们可以在常规的机器学习任务中只存储非零值来压缩矩阵的大小吗? 简单的答案是:是的,可以! 我们可以轻松地将高维稀疏矩阵转换为压缩稀疏行矩阵(简称 CSR 矩阵)。...值数组 Value array:顾名思义,它将所有非零元素存储在原始矩阵中。数组的长度等于原始矩阵中非零条目的数量。在这个示例中,有 7 个非零元素。因此值数组的长度为 7。...最后一个元素表示原始数组中非零元素的数量。长度为 m + 1;其中 m 定义为原始矩阵中的行数。...这意味着,超过 90% 的数据点都用零填充。回到嘴上面的图,这就是上面我们看到为什么pandas占用内存多的原因。 我们为什么要关心稀疏矩阵? 好吧,使用稀疏矩阵有很多很好的理由。

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    稀疏矩阵的概念介绍

    什么是稀疏矩阵? 有两种常见的矩阵类型,密集和稀疏。主要区别在于稀疏指标有很多零值。密集的指标没有。这是一个具有 4 列和 4 行的稀疏矩阵的示例。 在上面的矩阵中,16 个中有 12 个是零。...这就引出了一个简单的问题: 我们可以在常规的机器学习任务中只存储非零值来压缩矩阵的大小吗? 简单的答案是:是的,可以! 我们可以轻松地将高维稀疏矩阵转换为压缩稀疏行矩阵(简称 CSR 矩阵)。...值数组 Value array:顾名思义,它将所有非零元素存储在原始矩阵中。数组的长度等于原始矩阵中非零条目的数量。在这个示例中,有 7 个非零元素。因此值数组的长度为 7。...最后一个元素表示原始数组中非零元素的数量。长度为 m + 1;其中 m 定义为原始矩阵中的行数。...这意味着,超过 90% 的数据点都用零填充。回到最上面的图,这就是上面我们看到为什么pandas占用内存多的原因。 我们为什么要关心稀疏矩阵? 好吧,使用稀疏矩阵有很多很好的理由。

    1.7K20

    如何使用python处理稀疏矩阵

    只有给定购物者所购买给定项目的路口才需要有一个“是”表示形式,例如1。给定句子中给定单词的出现也是如此。你会看到为什么这样的矩阵包含多个零,这意味着它们将是稀疏的。...在矩阵表示的标准方法中,也不得不记录事物的不存在,而不是简单地记录事物的存在。 事实上,一定有更好的方法! 碰巧有。稀疏矩阵不必以标准矩阵形式表示。...我们如何更好地表示这些稀疏矩阵?我们需要一种方法来跟踪零不在哪里。那么关于列表,我们在其中一个列中跟踪row,col非零项目的存在以及在另一列中其对应值的情况呢?请记住,稀疏矩阵不必只包含零和一。...只要大多数元素为零,无论非零元素中存在什么,矩阵都是稀疏的。 我们还需要创建稀疏矩阵的顺序, 我们是一行一行地行进,在遇到每个非零元素时存储它们,还是一列一列地进行?...为此,要从左到右逐行遍历元素,并在遇到它们时将其输入到此压缩矩阵表示中。 压缩稀疏列矩阵又如何呢?

    3.5K30

    SciPy 稀疏矩阵(3):DOK

    既然如此,是否存在一个方法在不改变存储信息(非零元素的行、列外加上值)的情况下可以降低这一操作的时间复杂度?今天要介绍的 DOK 格式的稀疏矩阵就是这样!...当一个元素被插入到散列表中时,如果当前位置已经存在另一个元素,那么新元素将被添加到链表的末尾。这种方法的一个优点是它能够处理更多的冲突,而且不会产生聚集效应。...如果想存储三元组表示的稀疏矩阵的同时又要确保按照行列索引对元素进行访问的效率高,在存储三元组(非零元素)信息的过程中使用散列表是有必要的。...虽然我们之前试过把一个全 0 矩阵中的非主对角线上的零元素修改成了非零元素 1,存储的非零元素数量发生了变化,从 0 变成了 20。...(零元素改非零元素) 增加关键字和对应值 按照行列索引修改对应值(非零元素改零元素) 删除关键字和对应值 优缺点 SciPy DOK 格式的稀疏矩阵有着以下优点: 一点一点(逐个元素或者逐个矩阵块)

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    SciPy 稀疏矩阵(4):LIL(上)

    因为稀疏矩阵中的非零元素在存储和运算过程中需要占用更多的存储空间和计算资源。而压缩存储可以有效地减少这些开销,使得矩阵运算更加高效。...因此,针对有序稀疏向量组的压缩存储是稀疏矩阵处理中一个非常有效的方法。 稀疏向量的压缩存储是一种高效的数据存储方式,它只存储非零元素的索引和值,而不是存储整个向量。...通过只存储非零元素,可以避免存储大量的零值,从而减少了存储空间的浪费。同时,由于只存储非零元素,在进行向量运算时,可以只对非零元素进行操作,从而提高了运算的效率。...(非零元素改非零元素) 有序顺序表的二分查找(找到并修改) O(log₂n) 按照行列索引修改对应值(零元素改非零元素) 有序顺序表的二分查找(找不到并插入) O(n) 按照行列索引修改对应值(非零元素改零元素...) 有序顺序表的二分查找(找到并删除) O(n) 通过上表,理解为什么 SciPy 官方文档为什么说 LIL 格式的稀疏矩阵插入一个元素(零元素改非零元素)的最坏时间复杂度是 O(n) 就非常简单了。

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    scipy.sparse、pandas.sparse、sklearn稀疏矩阵的使用

    : SciPy 稀疏矩阵笔记 Sparse稀疏矩阵主要存储格式总结 Python数据分析----scipy稀疏矩阵 1.1 SciPy 几种稀疏矩阵类型 SciPy 中有 7 种存储稀疏矩阵的数据结构...由于在内存中存储顺序的差异,csc_matrix 矩阵更适合取列切片, 而 csr_matrix 矩阵更适合用来取行切片。...mat.nnz # 非零个数 mat.data # 非零值, 一维数组 ### COO 特有的 coo.row # 矩阵行索引 coo.col # 矩阵列索引 ### CSR\CSC\BSR...() # 转为array mat.todense() # 转为dense # 返回给定格式的稀疏矩阵 mat.asformat(format) # 返回给定元素格式的稀疏矩阵 mat.astype(...() # 非0元索引 mat.diagonal() # 返回矩阵主对角元素 mat.max([axis]) # 给定轴的矩阵最大元素 ### 矩阵运算 mat += mat # 加 mat

    1.8K10

    NVIDIA HugeCTR,GPU版本参数服务器--- (6) --- Distributed hash表

    哈希表中的值称为 hash_table_value_index,表示嵌入特征在嵌入表中的行号(row number)。...数据特点 :前面提到过,CTR的特点是高维,稀疏,这说明嵌入表10000000 行之中可能只有500行是有意义的数值,其余为空, **低维矩阵 ** : HugeCTR 内部实际上不可能内部存放一个巨大矩阵...在 hash_table 内部,逻辑上来看每一个元素可以认为是 (其实内部是个黑盒子,只是对外逻辑表示为一个哈希表 ); 哈希表中的键称为...哈希表中的值称为 hash_table_value_index,表示 CSR 对应的嵌入特征在嵌入表中的行号。...因此 hash_value_index_tensors_ 实际上记录了每个元素对应的低维矩阵offset 数值,hash_value_index_tensors_ 其事实上就是和CSR之中元素位置一一对应

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    【JAVA-Day30】 为什么稀疏数组能在Java中有效地节省内存空间?

    ⌨ 为什么稀疏数组能在Java中有效地节省内存空间? 摘要 在Java编程中,内存管理是一个关键问题。稀疏数组是一种数据结构,它在某些情况下可以有效地节省内存空间。...稀疏数组是一种特殊的数据结构,它旨在解决这个问题,只存储非默认值的元素及其位置信息,从而显著减少内存占用。 一、什么是稀疏数组 稀疏数组是一种用于表示大部分元素为默认值(通常是零或空)的数据结构。...矩阵运算: 稀疏数组在数学和科学计算中的应用非常重要,特别是在处理大规模线性代数问题时。许多矩阵在实际应用中大部分元素都是零,这种矩阵被称为稀疏矩阵。...通过使用稀疏数组来表示这些矩阵,可以大幅提高计算效率,因为只需处理非零元素。 文本索引: 在搜索引擎和数据库中,文本索引用于加速文本检索操作。...三、如何定义稀疏数组 在Java中,你可以使用二维数组来表示稀疏数组。每个元素的值表示非默认值,而元素的位置信息包括行和列。

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    稀疏数组如何帮助我们节省内存,提升性能

    什么是稀疏矩阵 稀疏矩阵是指矩阵中大部分元素为零的矩阵。在实际应用中,很多矩阵都是稀疏的,比如网络图、文本数据等。由于矩阵中存在大量的零元素,因此稀疏矩阵的存储和计算都具有一定的特殊性。...一般来说,在矩阵中,若数值为0的元素数目远远多于非0元素的数目,并且非0元素分布没有规律时,则称该矩阵为稀疏矩阵;与之相反,若非0元素数目占大多数时,则称该矩阵为稠密矩阵。...在实际应用中通常使用三元组表示稀疏矩阵: 三元组的表示方法是:对于一个 m×n 的稀疏矩阵 A,我们只存储矩阵中非零元素的信息,具体来说,将每个非零元素的行下标、列下标和值存储下来,得到一个三元组(i,...定义了一个 SparseMatrix 类来表示稀疏矩阵。...在构造函数中,我们传入矩阵的行数和列数,并创建了一个 HashMap 对象 matrix 来存储非零元素。

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