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RNA-seq 差异分析的点点滴滴(2)

引言 本系列[1]将开展全新的转录组分析专栏,主要针对使用DESeq2时可能出现的问题和方法进行展开。...Tximeta:自动导入并附加元数据 Bioconductor 家族中的 tximeta 包,在 tximport 的基础上进行了扩展,不仅保留了原有功能,还增加了一项新特性:能够自动为常用的转录组数据...使用 DESeqDataSetFromMatrix 时,用户需要提供计数矩阵、样本信息(计数矩阵的列)以 DataFrame 或 data.frame 的形式,以及设计公式。...DESeq2 不会自动推断计数矩阵的哪一列对应于列数据的哪一行,这些信息在提供给 DESeq2 时必须是一致排序的。...拥有计数矩阵 cts 和样本信息 coldata 后,就可以构建一个 DESeqDataSet 对象: library("DESeq2") dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData

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.NET6 平台系列2 .NET Framework框架详解

这意味着应用的多个版本可以共存,并且应用可在构建它的 .NET Framework 版本上运行。...`使开发人员的经验在面对类型大不相同的应用(如基于 Windows 的应用和基于 Web 的应用)时保持一致。...CTS是一套CLR中的数据类型都必须遵守的规则。如果某种语言在创建数据类型时遵守了CTS,则它创建和存储的数据将能够与其他也遵守了CTS的编程语言兼容。 (2)标准化应用程序格式。....它是 FCL 的一个子集,它们为开发者提供了面向对象的特性所需的、和 CLR 紧密集成的一组可重用类的集合,并且此类库仅使用 CTS 数据类型和标准的应用程序格式编制,从而简化了应用开发过程和难度,而且很容易与第三方组件无缝集成...以下术语通常指 BCL 引用的相同 API 集合: 核心 .NET 库 框架库 运行时库 共享框架 · 基本操作 构建于BCL之上,它是FCL的一部分,是FCL为开发人员提供的基础性操作(如:数据库操作

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    「SAP ABAP」SAP包(一)【包概要简述及创建】

    除此之外,每个包还拥有个CTS (Changed Transport System)号,CTS 号用于在系统间传输程序。系统间传输程序时是以CTS号作为基本单位进行传递的。...,打开包CBUI进行观察:   可以看到包CBUI的传输层为SAP,软件组件为S4CODE,它是一个系统包,并且它勾选了选项"在传输请求中记录对象更改",会生成CTS号,用它可以根据版本管理代码 -...本地组件由于不使用自动传输功能,因此不会创建CTS号。   用$TMP包保存本地对象,即用于开发测试的包。...每追加一个用户ID的时候会自动分配包给该用户ID,软件组件为本地组件(LOCAL),不生成CTS号。  ...:初始屏幕 (一)首先输入事务码【T-CODE:SE21】进入包构建器:初始屏幕 ----  包属性维护 (一)输入要创建的包的名字(本教程使用的包的名字为"ZTEST"),然后单击创建按钮如下图所示

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    SAP ABAP——SAP包(一)【包概要简述及创建】

    除此之外,每个包还拥有个CTS (Changed Transport System)号,CTS 号用于在系统间传输程序。系统间传输程序时是以CTS号作为基本单位进行传递的。...,打开包CBUI进行观察:   可以看到包CBUI的传输层为SAP,软件组件为S4CODE,它是一个系统包,并且它勾选了选项"在传输请求中记录对象更改",会生成CTS号,用它可以根据版本管理代码 -...本地组件由于不使用自动传输功能,因此不会创建CTS号。   用$TMP包保存本地对象,即用于开发测试的包。...每追加一个用户ID的时候会自动分配包给该用户ID,软件组件为本地组件(LOCAL),不生成CTS号。  ...:初始屏幕 (一)首先输入事务码【T-CODE:SE21】进入包构建器:初始屏幕 ----  包属性维护 (一)输入要创建的包的名字(本教程使用的包的名字为"ZTEST"),然后单击创建按钮如下图所示

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    .NET 体系概览图集- 2024 最全总结

    可以把CTS看做是规范,CLR是对CTS的具体实现。...CLS制定了一种以.NET平台为目标的语言所必须支持的最小特征,以及该语言与其他.NET语言之间实现互操作性所需要的完备特征。...AOT编译(Ahead of Time Compilation,预先编译或静态编译),在构建(发布)时将高级语言编译为本地机器码,让程序更快的启动、运行。...MSBuild (Microsoft Build Engine)是由Microsoft开发的构建工具和构建系统。它用于自动化软件项目的构建过程,包括编译源代码、打包、运行测试、部署和生成文档等。...由CLR来负责内存管理、垃圾回收、类型安全性和异常处理等任务,所以我们写(C#)托管代码时,就可以随意申明变量、创建对象,而不用去管内存的分配、管理和回收,使得代码更容易编写、维护和调试。

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    android cts测试超时设置,Android的CTS测试「建议收藏」

    http://blog.163.com/yingmm_hi@126/blog/static/6457858820122133859132/ Android的CTS测试,英文为Compatibility...在android源代码目录下输入make cts命令来编译CTS,之后会在out/host/linux-x86/cts/下生成android-cts文件夹。...object heap 从字面上看是在初始化java Vm的时候不能获取足够的堆空间,于是修改了build/core/definition.mk文件中的编译core.jar和framework.jar时需要的...-JXmx为1024m,此参数代表编译上述两个包时需要的最大内存,此初始值为2048M,由于我的PC电脑总的内存才2G,系统运行会占据一部分内存,故编译android的时候肯定不会分配2G内存, 解决:...(5)将android设备的语言设置为英文。

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    FasterViT | 英伟达提出分层注意力,达成SOTA性能-吞吐量均衡

    以网络第三阶段为例,特征分辨率为 14 \times 14 ,这为更强表达能力的算子(如LN、SE、自注意力等对吞吐量影响较小)提供了操作空间。...}_{3 \times 3}(\hat{\mathbf{x}})) + \mathbf{x} HierarchicalAttention 上图给出了本文所提新型窗口注意力示意图,通过如下操作,本文构建了分层注意力...它以SwinT所引入的局部窗口为出发点, 引入了一种CT(Carrier Tokens)进行完整局部窗口信息聚合,第一个注意力模块作用于CTs以进行全局信息建模; 将局部窗口Token与CTs进行拼接并执行自注意力处理以促进局部与全局信息交互...,表示如下: \hat{\mathbf{x}} = \text{Split}_{k \times k}(\mathbf{x}) 本文方案的关键在于Carrier Tokens(CTs)的构建,它有助于以更低的消耗保持注意力机制...注2: 上述CT初始化步骤仅在每个stage执行一次,每个Stage有自己独一的CTs。

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    .NET面试题系列 - .NET框架基础知识(1)

    1.4 CTS(公共类型系统)和CLS(公共语言规范) 简单的说,CTS就是说话的语法和规范。你可以理解为,英语是一种语言,英语的CTS(至少绝大一部分)就是“实用英语语法(张道真)”这本书。...同理所有服从CTS的语言,都可以被看成.NET框架的语言。 CTS中定义了类型,允许它有属性,字段,方法等。 .NET框架的众多语言各自实现了CTS的一部分功能。...由于.NET框架的众多语言在编译时都要转换为IL,因此IL实现的CTS功能是它们的并集,也就是CTS全部的功能。你可以理解为,虽然.NET框架语言那么多,但一编译了之后,就成了一种语言。...在调用方法时,CLR会检查方法的存根,如果存根为空,则执行JIT编译过程,并将该方法被编译后的本地机器代码地址写入到方法存根中。...但过度的优化可能会出现问题,在CLR via C#的易失构造中,作者举了一个例子。

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    CTS、CTS Verify、GTS测试以及GMS认证介绍

    CTS测试的目的 3.4 CTS测试套件目录文档结构 3.5 CTS测试环境准备 3.5.1 测试环境 3.5.2 测试准备工作 3.5.3 手机端配置 3.5 CTS测试流程 3.6 查看测试结果...测试 以自动化测试为基础,测试Android系统的兼容性; ② CTS Verify 一个手工测试的apk,完成自动化测试无法完成的操作(锁屏、蓝牙、摄像头等); ?...卡) 写入合法的IMEI号(手机的身份证,每一个手机都会有唯一的一个IMEI号) 连接一个可翻墙的WIFI网络(可以使用香港专线,网络比较稳定) 3.5.3 手机端配置 手机恢复出厂设置 手机语言设置为英语...、Contact Sync、 Calendar Sync、Talk、 Maps、 Steet View、 YouTube、 Android Market (Play store)等服务,当用户使用谷歌时,...连接外网 插入SIM卡,打开移动数据 打开蓝牙 显示中睡眠时间显示最大 竖屏 语言选择英语 键盘选择谷歌键盘 打开定位、高精度 安全中锁屏选择None 时间将自动获取时间和日期关闭,选择太平洋时区、24小时制

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    RTS与CTS协议学习

    缺省时是DCE向DTE发送数据,当DTE决定向DCE发数据时,先有效RTS,表示DTE希望向DCE发送。...一般DCE不能马上转换收发状态,DTE就通过监测CTS是否有效来判断可否发送,这样避免了DTE在DCE未准备好时发送所导致的数据丢失。...二、MODEM硬件流控中的RTS与CTS 按照SIMCOM公司的解释,RTS和CTS是独立, 1.RTS是模块的输入端,用于MCU通知模块,MCU是否准备好,模块是否可向MCU发送信息,RTS的有效电平为低...2.CTS是模块的输出端,用于模块通知MCU,模块是否准备好,MCU是否可向模块发送信息,CTS的有效电平为低 从文字看,RTS和CTS是独立的,不存在每次单向数据传输的发起者问题。...在参数配置中,若使用RTS/CTS协议,同时设置传送上限字节数----一旦待传送的数据大于此上限值时,即启动RTS/CTS握手协议:首先,A向B发送RTS信号,表明A要向B发送若干数据,B收到RTS后,

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    安卓CTS测试(测试手机性能的软件)

    : 一般将SIM卡放入手机后开启数据流量就会自己校准时间 17、时区: 将时区设置为0时区(伦敦时间或者太平洋时间) 18、SIM卡本机号码设置: 要将本机号码写入到SIM卡中 注:SIM卡最好用联通卡.../cts-tradefed 选择CTS测试脚本 ⑩run cts –plan CTS 3、把失败项继续执行的方法如下: ①先输入“l r”查询ID号 ②run cts –continue-session...) –session ID -r [pass/fail/notExecuted/] 运行命令为: run cts –plan (plan_name) –disable-reboot 5、测试的过程中最好在测试机下垫一个东西.../xts-tradefed ⑪ run xts –plan XTS(GTS4,0的运行命令为:run gts –plan GTS) 6、GTS替换失败项与执行失败项和CTS都是一样的道理,具体路径是.../cts-usb-accessory会弹出一个提示框,记得要打钩 3、Ctrl+C–>方向键上键–>回车键(复测) 五、注意事项: 1、如果浏览器问题需要敲命令将浏览器主页设置为google搜索的主页:

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    Asp.Net Core 轻松学-多线程之取消令牌

    通过上面的输出接口,可以看出,红色部分是模拟请求,这个请求时多线程进行的,Post 和 Love 交替出现,是因为在程序中通过线程休眠的方式模拟网络阻塞过程,蓝色为合并结果部分,可以看到,虽然“文章信息...控制台打印结果黄色部分为令牌状态,显示为 True ,令牌已取消。...分别注册了 Register 取消回调委托,然后,使用 HttpClient 发起 3 组网络请求;其中,设置 cts2 在请求开始 1秒 后退出,预期结果为:当 cts2 退出后,由于 cts3 是使用...当程序执行 cts1.Cancel() 方法后,取消令牌立即执行了回调委托,并输出线程ID为:1;cts2.CancelAfter(500) 表示 500ms 后取消,为了获得令牌状态,这里使线程休眠了...,其线程 ID 为 4;最后,cts3由于直接调用了 Dispose() 方法,但是其 IsCancellationRequested 的值为 False,表示未取消,而输出结果也表明,没有执行回调委托

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    stm32串口USART 硬件流控 --学习笔记

    因而,不同的厂商在做 RS232 时,多少会有不同,流控也都会存在差异。以下我们与大家一起探讨流控的作用、搭建及如何操作。   本文着重探讨硬件流控。   为什么需要流控?   ...,一根叫 RTS(Require To Send 为输出信号)。...在图3中,当没有收到CTS信号的时候,TX 发送线上数据是连续发送的,表现形式为:在 STOP 位后紧跟着就是下一个数据的 Start bit。   ...,而是要等待,直到在 CTS 管脚上检测为低电平后,TX脚上才会开启 Data 3 的 Start 信号。   ...软件配置   ▲ 图4,软件配置   在 CubeMX 里可以选择一个串口模式为异步模式,之后在它下面的硬件流控 RS232 中选择 CTS/RTS。

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    .Net中异步任务的取消和监控

    CancellationTokenSource 主要用来创建或取消令牌 CancellationToken 监听令牌状态,注册令牌取消事件 OperationCanceledException 令牌被取消时抛出的异常...,可以由监听者自主决定是否抛出异常 CancellationTokenSource 创建令牌: CancellationTokenSource cts = new CancellationTokenSource...() CancellationToken token=cts.Token; 取消释放令牌: cts.Cancel(); CancellationToken 监听令牌取消事件: token.Register...(() => Console.WriteLine("令牌被取消")); 判断令牌是否取消 //返回一个bool,如果令牌被取消为true token.IsCancellationRequested /...其实每种类的设计和实现都可以有很多不同的策略,CTS和CT从这个两个类提供的为数不多的公开方法中就可以看出,CTS用来控制Token的生成和取消等生命周期状态,CT只能用来监听和判断,无法对Token的状态进行改变

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    .NET Core 3.0之深入源码理解ObjectPool(一)

    当我们需要获取某个对象时,可以从池中获取。既然有了对象池,那么也就很方便我们就很容易建立起对象的管理与追踪了了。...对象池的工作机制 通常情况下,当客户端程序需要某个对象时,对象池首先尝试提供一个已经创建的对象。如果没有可用的对象,则会创建一个新对象。这类似于一个GetOrAdd的操作。...这就是为什么对象池有助于重用性、并减少了在获取对象时创建对象所涉及的开销的原因。 另外,需要注意的是,只要池中至少有一个对象,该池就会一直保留在内存中。...当对象池用于并发操作时,需要确保对象池是线程安全的,而且其本身还要有很高的性能。...该示例可以进一步扩展为围绕IProducerConsumerCollection 构建,该数据由bag数据结构实现,ConcurrentQueue 和ConcurrentStack 也是如此

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    开源 | SegVol 通用且可交互的医学体素分割模型

    本文为粉丝投稿。 我们很高兴介绍在上周开源的 SegVol 医学通用分割模型。...通过在90k无标注CTs和6k分割CTs数据上进行训练,该基础模型支持point, box和text prompt,能够对200多个解剖类别进行分割。...这可能归因于global一级的point prompt相对稀疏,当zoom in到local区域时,其稀疏性变得更加明显,从而限制了该机制的潜力。...Dataset Scale: 数据规模是基础模型构建的关键因素之一。我们进行了消融研究,以研究Image和Mask的数量对SegVol性能的影响。...作为轻量级模型,当只使用一个数据集时,SegVol的性能不是最优的。然而,随着数据量的增加,SegVol的Dice score显著增加,特别是在使用text prompt进行分割的情况下。

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