首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

基于xargs命令多行命令并行管理

我在去年整理了一个关于多行命令并行管理脚本「submit.sh」,前些日子曾老师发来消息提供了更新版本,今天我们一起来探讨一下。...有些日子了 之前submit.sh主要是通过循环,将所有的命令分成多个批次,一个批次完成后才会运行下一个批次。...[1],本文主要使用以下参数 「-c」, -c后字符串读取命令 「-x」, 打印出所执行命令以及当前状态 特殊符号 「''」, 单引号,保持引号里内容不变 「“”」, 双引号,解析引号里命令变量...小结 使用xargs好处是可以将该命令写入到代码,适用于流程搭建情况(如snakemake);而之前submit.sh只能在脚本外面使用,实际上还会产生多个PID。...另外需要注意是,xargs 只能传递单个变量(本文中为F),上述命令通过-iF来传递ls输出内容;当需要输入多个文件时候(如比对),似乎是没办法实现

1.1K30
您找到你想要的搜索结果了吗?
是的
没有找到

《Linux命令行与shell脚本编程大全》第十九章 初识sed和gawk

sed编辑器会执行下列操作: 1)一次输入读取一行数据 2)根据所提供编辑命令匹配数据 3)按照命令修改流数据 4)将新数据输出到STDOUT sed将所有命令与一行数据匹配完毕后,就读取下一行重复这个过程...中指定命令添加到已有的命令 -f file       | 在处理输入时,将file中指定命令添加到已有的命令 -n            | 不产生命令输出,使用printf命令来完成输出 一般是单个命令...文件读取编辑命令 需要用-f选项来指定文件。...使用字段字段变量 它会自动给一行每个数据元素分配一个变量。...’ data.txt   // 读取包含xiaochongyong行,写入write.txt $cat write.txt 2.文件读取数据 读取(read)命令(r)允许你将一个独立文件数据插入到数据流

1.8K50

Shell 命令日志文件根据将符合内容日志输出到另一个文件

Shell 命令日志文件根据将符合内容日志输出到另一个文件 前面我写了一篇博文Shell 日志文件中选择时间段内日志输出到另一个文件,利用循环实现了我想要实现内容。...但是用这个脚本同事很郁闷,因为执行时间比较长,越大文件越长。于是找我,问我能不能实现一个更快方案。 我想了一下,觉得之前设计是脱裤子放屁,明明有更加简单实现方法。...想办法获得我要截取内容开始行号,然后再想办法获得我想截取文件结尾行号,然后用两个行号来进行截断文件并输出。就可以实现这个效果了。.../bin/bash # 设定变量 log=3.log s='2017-08-01T01:3' e='2017-08-01T01:4' # 根据条件获得开始和结束行号 sl=`cat -n $log.../^[ \t]*//g' | cut -f1` el=`cat -n $log | grep $e | tail -1 | sed 's/^[ \t]*//g' | cut -f1` # 获取结果并输出

2.5K70

【linux工具】多行文本转一行处理技巧

日常工作如果涉及将多行文本处理为一行,手工处理比较费时,本篇文章介绍如何把多行文本处理为一行数据一些linux命令。...它从标准输入读取数据,并将结果输出到标准输出。...-s 选项告诉 paste 将输入视为单个文件(而不是并排多个文件)。 -d '|' 指定使用 | 作为分隔符。...但在这里,由于 xargs 后面没有接任何具体命令,它默认会将其输入内容传递给 echo 命令。这意味着它会将多行输入转换为单行输出多行之间换行符将被空格替换。...组合多个命令: cat filelist.txt | xargs -I {} cat {} 这会读取 filelist.txt 列出文件名,并使用 xargs 和 cat 逐个显示这些文件内容

56620

详解流编辑器 sed 和 编程语言 awk

一、流编辑器 sed sed 是一个精简、非交互式流式编辑器,它在命令输入编辑命令和指定文件名,然后在屏幕上查看输出。...逐行读取文件内容存储在临时缓冲区,称为“模式空间”(pattern space),接着用sed命令处理缓冲区内容,处理完成后,把缓冲区内容送往屏幕。接着处理下一行,这样不断重复,直到文件末尾。...与 sed一样,awk不会修改输入文件内容。 可以使用重定向将awk输出保存到文件。...(一)awk简单用法 用法示 选项 -F 指定输入记录字段分隔符,默认使用环境变量IFS值 -f 指定文件读取awk_script -v 为awk设定变量 The IFS is a special...匹配任意单个字符 str1|str2 匹配 str1 或 str2 + 匹配一个或多个前一字符 ? 匹配零个或一个前一字符 ( ) 字符组 ? ?

1.2K00

Linux三剑客(grep、sed、awk)

匹配任意单个字符 表示任意一个字符 * 字符* 匹配0或多个此字符 表示重复任意多个字符 \ 屏蔽一个元字符特殊含义 表示去掉有意义元字符含义 [] 匹配括号内字符 表示过滤括号内字符...'script' inputfile 选项 -n 不输出模式空间内容到屏幕,即不自动打印 -e 多点编辑 -f /PATH/SCRIPT_FILE: 指定文件读取编辑脚本 -r 支持使用扩展正则表达式...,追加到默认输出之后 a [\]text1 在指定行后面追加文本,支持使用\n实现多行追加 i [\]text 在行前面插入文本 c [\]text 替换行为单行或多行文本 w /path/somefile...举例子: 1、打印出文件第二行 2、打印出2-5行内容 3、将文件root全部替换为abc 直接修改读取文件内容,而不是输出到终端。...注意:以上都是内置变量,在引用时不需要前面加$,每新建一个变量,都需要加个-v,与变量名之间有无空格都可以,变量可以在引用之后再声明,但那一行输出输出空行。

1.3K10

Linux进阶 03 文本处理三驾马车

真的很难很繁琐,每个命令下面又有许多个小参数,套娃!...常见参数-w:word 精确查找某个关键词 pattern-c:统计匹配成功数量-v:反向选择,即输出没有匹配行-n:显示匹配成功行所在行号-r:目录查找pattern-e:指定多个匹配模式...-f:指定文件读取要匹配pattern-i:忽略大小写也可以查询多个关键词,用-e连接less Data/example.gtf |grep -w -e 'gene' -e 'UTR'这种方法比较麻烦...换行符之外任意单个字符?...3.3 awk内置变量FS:定义输入字段分隔符,同 -FRS:定义输入记录分隔符,Record SeparatorOFS:定义输出字段分隔符ORS:定义输出记录分隔符NF:数据文件字段总数,可以简单理解为列数

14920

Python快速入门教程1:Python 基础教程

建议你在每个缩进层次使用 单个制表符 或 两个空格 或 四个空格 , 切记不能混用     Python语句中一般以新行作为为语句结束符,但是我们可以使用斜杠( \)将一行语句分为多行显示。...Python可以在同一行中使用多条语句,语句之间使用分号(;)分割     您可以通过使用del语句删除单个多个对象引用     python单行注释采用 # 开头。     .../in_is.py     变量 a 不在给定列表 list     变量 b 不在给定列表 list     a 和 b 引用相同对象     140232573171232...Pythonfrom语句让你模块中导入一个指定部分到当前命名空间中。     模块搜索路径存储在system模块sys.path变量。...write()方法不会在字符串结尾添加换行符('\n'):     read([count])方法从一个打开文件读取一个字符串     该方法文件开头开始读入,如果没有传入count

40220

Python数据分析(一): ipython 技巧!

输入输出历史 使用ipython shell,您一定对左边这些in,out特别熟悉。 ? 但是,它们不是装饰品,它们俩是变量。 ? In和Out是两个变量,并且随着命令输入,实时更新。...所以可以这样查看具体In和Out: ? 其中需要注意是,并不是所有的In都有输出,例如[37]。 下划线和前一个输出 使用一个下划线 _ 来获取前一个输出结果,它是个变量,实时更新。 ?...相关魔法命令:%history 使用%history可以一起获取前面多个命令: ? 注意其参数-n后边跟命令行号区间。...ipython向Shell传值: 使用{变量名}形式赋值: ? 注意:不可以使用 !cd 这个文件系统导航命令。...n(ext),执行程序下一步 ,重复上一个命令 p(rint),打印变量 s(tep),进入子程序 r(eturn),从子程序跳出 分析(Profiling)和计时模式 %time,适用于对单个长时间运行表达式程序计时

1.2K60

MySQL 数据库使用SQL SELECT语句来查询数据

SELECT 命令可以读取一条或者多条记录。 你可以使用星号(*)来代替其他字段,SELECT语句会返回表所有字段数据 你可以使用 WHERE 语句来包含任何条件。...该函数用于执行 SQL 命令,然后通过 PHP 函数 mysqli_fetch_array() 来使用或输出所有查询数据。...mysqli_fetch_array() 函数结果集中取得一行作为关联数组,或数字数组,或二者兼有 返回根据结果集取得行生成数组,如果没有更多行则返回 false。...以下实例为数据表 runoob_tbl 读取所有记录。 实例 尝试以下实例来显示数据表 runoob_tbl 所有记录。 注意:记住如果你需要在字符串中使用变量,请将变量置于花括号。...PHP 提供了另外一个函数 mysqli_fetch_assoc(), 该函数结果集中取得一行作为关联数组。 返回根据结果集取得行生成关联数组,如果没有更多行,则返回 false

2.6K20

npm、npx说起,到shell

如果Command1命令运行失败,则继续运行Command2命令 命令 说明 echo 在屏幕输出一行文本,可以将该命令参数原样输出 -n:可以取消末尾回车符,使得下一个提示符紧跟在输出内容后面...# 创建变量 $ myvar="hello world" # 读取变量 $ echo $myvar # 删除变量 $ unset myvar # 输出变量 $ export myvar="hello...输出变量 $foo $ export foo=bar # 新建子 Shell $ bash # 读取 $foo $ echo $foo bar # 修改继承变量 $ foo=baz # 退出子 Shell...$ exit # 读取 $foo $ echo $foo bar Here 文档 Here 文档(here document)是一种输入多行字符串方法,格式如下。...,别名只适合封装简单单个命令,函数则可以封装复杂多行命令 # 第一种 fn() { # codes } # 第二种 function fn() { # codes

3.8K20

三剑客命令

匹配任意单个字符 表示任意一个字符 * 字符* 匹配0或多个此字符 表示重复任意多个字符 \ 屏蔽一个元字符特殊含义 表示去掉有意义元字符含义 [] 匹配括号内字符 表示过滤括号内字符...'script' inputfile 选项 -n 不输出模式空间内容到屏幕,即不自动打印 -e 多点编辑 -f /PATH/SCRIPT_FILE: 指定文件读取编辑脚本 -r 支持使用扩展正则表达式...直接修改读取文件内容,而不是输出到终端。...awk支持正则表达式元字符 图片 BEGIN {} 在awk执行命令前做什么事情 BEGIN模块在awk读取文件之前就执行,BEGIN模式常常被用来修改内置变量ORS,RS,FS,OFS等值...END在awk读取完所有的文件时候,再执行END模块,一般用来输出一个结果(累加,数组结果)。

3.4K10

Redis专题(七)——Redis高可用(哨兵篇)

可以设置单个哨兵,也可以设置多个哨兵。 单个哨兵: ? 多个哨兵: ? 2、哨兵使用方式 现假设有一主二数据库。...该文件可以有多行,每一行表示一个主库。设置多行表示检测多个主从系统。 除了monitor,还可以配置其他监控内容,通过主库名字区分监控是哪个主从系统。...库只有主观下线,没有客观下线。因为客观下线后需要重新选出新主库,这对于库来说没有必要。 3、哨兵原理 1)哨兵进程启动时,通过读取上述提到配置哨兵配置文件,确定主库信息。...当配置文件中有多行数据,表示是多个主从系统,哨兵也可以同时检测。...当下线是主库,哨兵还会给其他哨兵发送命令,确认其他哨兵是否也认为主库主观下线,当达到指定数量(哨兵配置文件主库投票数,投票数含自身),则认为其客户下线(检测到+odown),此时重新选主库。

98560

7.管道、管道、环境变量与其他常用命令

管道右边命令必须能接受 stdin。 多个管道命令可以串联。 与文件重定向区别: 文件重定向左边为命令,右边为文件。 管道左右两边均为命令,左边有 stdout,右边有 stdin。...常见环境变量: HOME:用户家目录。 PATH:可执行文件(命令存储路径。路径与路径之间用:分隔。当某个可执行文件同时出现在多个路径时,会选择从左到右数第一个路径执行。.../directory/ -name '*.py':搜索某个文件路径下所有*.py文件 grep xxx: stdin 读入若干行数据,如果某行包含xxx,则输出该行;否则忽略该行。...读入多行数据 echo $PATH | cut -d ':' -f 3,5:输出PATH用:分割后第3、5列数据 echo $PATH | cut -d ':' -f 3-5:输出PATH用:分割后第...可以 stdin 读取多行数据 可以从命令行参数读取文件名列表 xargs:将 stdin数据用空格或回车分割成命令行参数 find .

62430

一些shell脚本

注释多行 命令行实现多条shell set命令 显示文件夹下所有文件绝对路径 awk $变量值 secure.sh ?...命令执行命令行 adb pull -a /sdcard/screencap.png cap`date +%m%d%H%M%S`.png 注释多行 :<<eof 被注释多行内容 eof 命令行实现多条...-a:标示已修改变量,以供输出至环境变量。...awk '{print $1}' //第1列 awk '{print $(NF-1)}' //倒数第2列 NR表示awk开始执行后,按照记录分隔符读取数据次数,默认记录分隔符为换行符,因此默认就是读取数据行数...在awk处理多个输入文件时候,在处理完第一个文件后,NR并不会1开始,而是继续累加,因此就出现了FNR。 NF表示目前记录被分割字段数目,NF可以理解为Number of Field。

68820

Linux命令操作之cat与cut

-e 等价于 -vE -E, --show-ends 在每行结束处显示 $ -n, --number 对输出所有行编号 -s, --squeeze-blank 不输出多行空行 -t 与 -vT 等价...(注:这里发现被我写错了,EOF写成了OEF,输出时候要对应输出,咱不去究其原因) cat 连接多个文件内容并且输出到一个新文件命令是: [root@localhost ~]# cat name1...)并输出到一个新文件sir04.txt 。...使用说明: cut 命令文件每一行剪切字节、字符和字段并将这些字节、字符和字段写至标准输出。 如果不指定 File 参数,cut 命令读取标准输入。必须指定 -b、-c 或 -f 标志之一。...值得注意是'-'表示是一个区间,‘,’表示单个字符 例子二:以‘:’为分隔符,截取PATH环境变量第五个位置字符 先来看看PATH变量内容是什么 [2013012974@teach shell

4.4K50

史上最全 Linux Shell 文本处理工具集锦,快收藏!

比如grep,比如find; 将多行输出转化为单行输出 cat file.txt| xargs 是多行文本间定界符 将单行转化为多行输出 cat single.txt | xargs -n 3 -n:...指定每行显示字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 (默认为空格 多行定界符为 ) -n 指定输出多行 -I {} 指定替换字符串,这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行命令需要多个参数时...2.文件或stdin读入一行,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数print时,会打印当前行; echo.../linux/' #不包含linux文本行 设置定界符 使用-F来设置定界符(默认为空格) awk -F: '{print $NF}' /etc/passwd 读取命令输出 使用getline,将外部...shell命令输出读入到变量cmdout; echo | awk '{"grep root /etc/passwd" | getline cmdout; print cmdout }' 在awk中使用循环

4K50

Linux文本处理工具,看这篇就够了。

比如grep,比如find; 将多行输出转化为单行输出 cat file.txt| xargs 是多行文本间定界符 将单行转化为多行输出 cat single.txt | xargs -n 3 -n:...指定每行显示字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 (默认为空格 多行定界符为 ) -n 指定输出多行 -I {} 指定替换字符串,这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行命令需要多个参数时...2.文件或stdin读入一行,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数print时,会打印当前行; echo.../linux/' #不包含linux文本行 设置定界符 使用-F来设置定界符(默认为空格) awk -F: '{print $NF}' /etc/passwd 读取命令输出 使用getline,将外部...shell命令输出读入到变量cmdout; echo | awk '{"grep root /etc/passwd" | getline cmdout; print cmdout }' 在awk中使用循环

4.4K10

Linux Shell 文本处理工具集锦

比如grep,比如find; 将多行输出转化为单行输出 cat file.txt| xargs \n 是多行文本间定界符 将单行转化为多行输出 cat single.txt | xargs -n 3...-n:指定每行显示字段数 xargs参数说明 -d 定义定界符 (默认为空格 多行定界符为 \n) -n 指定输出多行 -I {} 指定替换字符串,这个字符串在xargs扩展时会被替换掉,用于待执行命令需要多个参数时...; 2.文件或stdin读入一行,然后执行statements2,重复这个过程,直到文件全部被读取完毕; 3.执行end语句块; print 打印当前行 使用不带参数print时,会打印当前行;.../linux/' #不包含linux文本行 设置定界符 使用-F来设置定界符(默认为空格) awk -F: '{print $NF}' /etc/passwd 读取命令输出 使用getline,将外部...shell命令输出读入到变量cmdout; echo | awk '{"grep root /etc/passwd" | getline cmdout; print cmdout }' 在awk中使用循环

3.2K70
领券