从多个adonis结果中提取R2值

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r、vegan、multivariate-testing

我想知道是否有一些方法可以从vegan包中的adonis函数中提取结果，并可能将其保存为write.table？我指的是其他方法，而不是将print结果复制到控制台并将R2值复制到Excel。当对多个组合迭代运行adonis，并按照建议的将对象和结果保存到一个list中时，这可能特别有用。

浏览 0提问于2018-01-21得票数 0

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将循环的输出保存在R中(保存到数据帧中)

r、dataframe、function、loops

我有一个循环，它遍历公式列表(包括我输入数据的不同变量)，并对我的数据运行adonis函数。此循环输出一个数据帧，其中包含公式中由adonis在PERMANOVA分析中计算的每个变量的R平方和p值。data <- data.matrix(data)library(vegan) adonis_test<- for (i in 1:l

浏览 0提问于2021-07-21得票数 0

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用于测试交互作用的permanova (adonis2 in r)的意外输出表

r、anova、manova

我使用adonis来使用脚本执行一个永久性的测试： Df SumOfSqs R2 F Pr(>F) Season 2 6.4903 0.27066 8.9066nmds.div<- adonis2(nmds.dist ~ Cruise*Layer3, data = T

浏览 13提问于2022-10-20得票数 0

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在使用PERMANOVA和NMDS的多变量分析中，在我的模型中包含这两个预测因子是否合适？

r、vegan、multivariate-testing

对于NMDS排序和Permanova测试，我在纯素中使用adonis函数分别运行了这些预测器(这里的代码)：distlm0<-adonis(samp0 ~ data0permutations = 9999, method = "bray",0米距离级燃烧区的Permanova： adonisburn0<-adonis

浏览 11提问于2021-03-08得票数 1

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带有变量名错误的闪亮公式

r、shiny

Adonis可以从素食图书馆获得。phyloseq::distance(phyloseq, method="uunifrac") dis <- phyloseq::distance(phyloseq, method="uunifrac") ad <- data.frame(adonis</

浏览 1提问于2018-06-20得票数 0

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如何用固定的嵌套因子来解释高锰酸钾的输出？

vegan

当使用嵌套因素和交互时，我不太清楚如何解释adonis2输出(纯素包)中的":“。例如，没有嵌套的因素： A*B*C , data=factors,permutations = 9999, method = "euclidean") 在结果输出中，以":“表示因素之间

浏览 0提问于2019-01-17得票数 0

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在adonis* R中需要哪些对象类作为输入？*

这个问题听起来很明显--但是R中的adonis是否需要有一个距离矩阵作为输入数据，还是在函数中转换它呢？我有两个度量变量(同位素数据，都是负的，但我可以用它的绝对值代替)？如果我查看adonis代码，就无法在adonis代码中看到这一点。

浏览 6提问于2022-01-08得票数 0

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素食包中的函数adonis执行非参数MANOVA，也称为PERMANOVA。问题(或者不是，也许我只是不完全理解测试是如何工作的)是，每次我使用相同的数据运行它时，我得到的p值都略有不同。dframetest <- data.frame(X = rnorm(20), Y = rnorm(20), Z = rnorm(20), Label = c(rep("A",10),rep("B",10))) adonis(dframetest[,1:3] ~ Label, permutat

浏览 3提问于2019-07-08得票数 0

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如何将数据从ReactJS提交表单传递给AdonisJS

javascript、node.js、reactjs、npm、adonis.js

我在ReactJS中有一个表单，每次单击submit按钮时，数据都应该传递给adonis。function (error) { }); "“是带有路由'/add‘的Adonis我不知道怎么用Adonis写那条路上的状态有人能解释一下吗？

浏览 0提问于2019-08-07得票数 0

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AdonisJS -无法调用函数csrfField

node.js、csrf、adonis.js

.*/ 'Adonis/Middleware/BodyParser', 'Adonis/Middleware/AuthInit', 'App/Midd

浏览 0提问于2019-05-08得票数 3

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如何在滚动线性回归中得到残差并进行Durbin Watson检验？

我运行了下面的代码，得到了系数和r2值的结果，我需要做的是做德班沃森检验残差这里的问题是我无法从roll_

浏览 4提问于2022-03-04得票数 0

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用纯素adonis错误后更改DESeq2名称

r、vegan、contrast

我在deseq2输出的命名(对比)中遇到了这个问题，在这种情况下，输出的命名是不可复制的。只有当我运行一个不正确对比的纯素adonis模型时，问题才会发生。treat)resultsNames(dds)adonis(mat~var$y) dds <- DESeq2::DESeqDataSet

浏览 5提问于2021-02-13得票数 0

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CSV数据多级解析Shell脚本

linux、bash、csv、delimiter、fileparsing

,ColumnHeader3valcol1p1,name=testapp2 environment=qa coldata=My_Test_Logs @$ 192.168.1.1 @$ r1 @$ r2@$ GET API ,valcol3p1 我需要在ColumnHeader2列之后提取My_Test_Logs列中</

浏览 9提问于2020-03-11得票数 0

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利用J抄OS进程采样器采集脚本数据

python、command、jmeter

我的python脚本进行数据库查询并返回"r1=123 r2=456 r3=789“，有方法收集r1、r2、r3值并绘制它们吗？

浏览 3提问于2015-06-10得票数 0

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100张表格与单个大型表格

database、multithreading、innodb、analysis

在执行计算之后，还可以创建一些可视化，并且将需要将结果存储回数据库中，因为在分析结果中可能存在价值数千兆字节的数据。让我们假设结果由R1，R2，…表示虽然这有点模糊，但我想知道我们是应该为每个R1、R2等创建一个表，还是应该将所有结果存储在一个表中？可能的情况是，我们希望多个线程同时存储结果(回想一下S1、S2的线程)，所以如果只有一个表，我需要确保多个线程可以同时访问它。如果它

浏览 1提问于2011-03-16得票数 1

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阿多尼斯:公式的右边错误没有可用的术语。

r、vegan

lapply(colnames(env2), function(x) { z <- adonisform, data = env2, permutations=999)) adonis<e

浏览 0提问于2018-11-27得票数 1

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Postgresql:从数字开始提取文本

sql、postgresql

我有一个表os，它包含下面的数据-- ----2 windows2016 SQL我需要从2012 R2中提取windows server 2012 R2，从windows 2016 SQL中提取2016 SQL，从Oracle linux 7.5中</

浏览 0提问于2018-11-22得票数 0

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如何根据一列中的一组字符提取pandas数据帧的行作为列表列表？

python、pandas、dataframe

我有一个数据帧，我想通过一些条件来提取数据。我的数据帧是这样的：e1 r2 ae2 r2 a..be8 e12 c..aa : [[e1, r2], [e8, r7], [e2,r2], [e8, e12]]c : [[e5,

浏览 1提问于2019-01-28得票数 0

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如何执行Entity Framework不支持查询并获取返回数据

c#、sql-server-2008、entity-framework-4、excel-addins

我正在使用VS2010、C#、ExcelFramework4 (DB provider Microsoft SQL Server2008 R2)为.Net编写一个外接程序。其主要思想是让用户对数据库执行预定义的查询，以便将数据提取到Excel中。我对实体框架一无所知。现在，

浏览 0提问于2013-05-28得票数 1

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我可以将2个状态分配给4个状态变量吗？

system-verilog、iverilog

这应该产生x还是0，因此结果完全是x还是0？Acc.对于LRM，如果我们越界访问2状态变量，那么它应该是0。将0分配给r2是否正确。module top; bit [1:0] b; initial begin$monitor(r2);endmodule

浏览 3提问于2018-07-13得票数 2

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