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使用Dask，SBERT SPECTRE和Milvus构建自己的ARXIV论文相似性搜索引擎

如果你感兴趣，那么本文的主要内容总结如下： 设置环境并从Kaggle下载ARXIV数据 使用dask将数据加载到Python中 使用MILVUS矢量数据库进行语义相似性搜索 本文中使用的技术不仅仅局限在科学论文...为了有效地处理如此大的数据集，使用PANDA将整个数据集加载到内存中并不是一个好主意。为了处理这样大的数据，我们选择使用DASK将数据分为多个分区，并且仅将一些需要处理的分区加载到内存中。...Dask Bag：使我们可以将JSON文件加载到固定大小的块中，并在每行数据上运行一些预处理功能 DASK DATAFRAME：将DASK Bag转换为DASK DATAFRAME，并可以用类似Pandas...的API访问 步骤1：将JSON文件加载到Dask Bag中 将JSON文件加载到一个Dask Bag中，每个块的大小为10MB。...步骤3:遍历Dask分区，使用SPECTER进行文本嵌入，并将它们插入到Milvus。 我们需要将Dask DATAFRAME中的文本转换为嵌入向量来进行语义相似度搜索。所以首先需要生成文本的嵌入。

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别说你会用Pandas

说到Python处理大数据集，可能会第一时间想到Numpy或者Pandas。 这两个库使用场景有些不同，Numpy擅长于数值计算，因为它基于数组来运算的，数组在内存中的布局非常紧凑，所以计算能力强。...import pandas as pd # 设置分块大小，例如每次读取 10000 行 chunksize = 10000 # 使用 chunksize 参数分块读取 CSV 文件...其次你可以考虑使用用Pandas读取数据库（如PostgreSQL、SQLite等）或外部存储（如HDFS、Parquet等），这会大大降低内存的压力。...相反，你也可以使用 createDataFrame() 方法从 pandas DataFrame 创建一个 PySpark DataFrame。...# 显示前几行 print(df.head()) Dask库 import dask.dataframe as dd # 读取 CSV 文件 df = dd.read_csv('path_to_your_csv_file.csv

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干货 | 数据分析实战案例——用户行为预测

pandas特别适合处理小型结构化数据，并且经过高度优化，可以对存储在内存中的数据执行快速高 效的操作。然而随着数据量的大幅度增加，单机肯定会读取不下的，通过集群的方式来处理是最好的选 择。...这就是Dask DataFrame API发挥作用的地方:通过为pandas提供一个包装器，可以智能的将巨大的DataFrame分隔成更小的片段，并将它们分散到多个worker(帧)中，并存储在磁盘中而不是...Dask DataFrame会被分割成多个部门，每个部分称之为一个分区，每个分区都是一个相对较小的 DataFrame，可以分配给任意的worker，并在需要复制时维护其完整数据。...具体操作就是对每个分区并 行或单独操作(多个机器的话也可以并行)，然后再将结果合并，其实从直观上也能推出Dask肯定是这么做的。...Dataframes具有相同的API gc.collect() 42 # 加载数据 data = dd.read_csv('UserBehavior_all.csv')# 需要时可以设置blocksize

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一行代码将Pandas加速4倍

Pandas是处理 Python 数据的首选库。它易于使用，并且在处理不同类型和大小的数据时非常灵活。它有大量的函数，使得操纵数据变得轻而易举。 ?...panda的DataFrame(左)存储为一个块，只发送到一个CPU核。Modin的DataFrame(右)跨行和列进行分区，每个分区可以发送到不同的CPU核上，直到用光系统中的所有CPU核。...在这种情况下，“分区管理器”将以它能找到的最优方式执行分区和分配到 CPU 核上。它是非常灵活的。 为了在执行并行处理时完成大量繁重的工作，Modin 可以使用 Dask 或 Ray。...让我们在 DataFrame 上做一些更复杂的处理。连接多个 DataFrames 是 panda 中的一个常见操作 — 我们可能有几个或多个包含数据的 CSV 文件，然后必须一次读取一个并连接它们。...正如你所看到的，在某些操作中，Modin 要快得多，通常是读取数据并查找值。其他操作，如执行统计计算，在 pandas 中要快得多。

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一行代码将Pandas加速4倍

Pandas是处理 Python 数据的首选库。它易于使用，并且在处理不同类型和大小的数据时非常灵活。它有大量的函数，使得操纵数据变得轻而易举。 ?...panda的DataFrame(左)存储为一个块，只发送到一个CPU核。Modin的DataFrame(右)跨行和列进行分区，每个分区可以发送到不同的CPU核上，直到用光系统中的所有CPU核。...在这种情况下，“分区管理器”将以它能找到的最优方式执行分区和分配到 CPU 核上。它是非常灵活的。 为了在执行并行处理时完成大量繁重的工作，Modin 可以使用 Dask 或 Ray。...让我们在 DataFrame 上做一些更复杂的处理。连接多个 DataFrames 是 panda 中的一个常见操作 — 我们可能有几个或多个包含数据的 CSV 文件，然后必须一次读取一个并连接它们。...正如你所看到的，在某些操作中，Modin 要快得多，通常是读取数据并查找值。其他操作，如执行统计计算，在 pandas 中要快得多。

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再见Pandas，又一数据处理神器！

Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库，使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上，Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask，以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您的工作流在单个GPU上足够快，或者您的数据在单个GPU的内存中轻松容纳时，您会希望使用cuDF。...当数据量不大，可以在单个GPU内存中处理时，cuDF提供了对单个GPU上高性能数据操作的支持。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能的数据处理，特别是当数据集太大，无法容纳在单个GPU内存中时。

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cuDF，能取代 Pandas 吗？

Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库，使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上，Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask，以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您的工作流在单个GPU上足够快，或者您的数据在单个GPU的内存中轻松容纳时，您会希望使用cuDF。...当数据量不大，可以在单个GPU内存中处理时，cuDF提供了对单个GPU上高性能数据操作的支持。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能的数据处理，特别是当数据集太大，无法容纳在单个GPU内存中时。

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让python快到飞起 | 什么是 DASK ？

Dask 由两部分组成： 用于并行列表、数组和 DataFrame 的 API 集合，可原生扩展 Numpy 、NumPy 、Pandas 和 scikit-learn ，以在大于内存环境或分布式环境中运行...Dask 包含三个并行集合，即 DataFrame 、Bag 和数组，每个均可自动使用在 RAM 和磁盘之间分区的数据，以及根据资源可用性分布在集群中多个节点之间的数据。...对于可并行但不适合 Dask 数组或 DataFrame 等高级抽象的问题，有一个“延迟”函数使用 Python 装饰器修改函数，以便它们延迟运行。...以下是 NVIDIA 使用 Dask 正在进行的许多项目和协作中的几个： | RAPIDS RAPIDS 是一套开源软件库和 API，用于完全在 GPU 上执行数据科学流程，通常可以将训练时间从几天缩短至几分钟...DASK 在企业中的应用：日益壮大的市场 随着其在大型机构中不断取得成功，越来越多的公司开始满足企业对 Dask 产品和服务的需求。

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再见Pandas，又一数据处理神器！

Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库，使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上，Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask，以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您的工作流在单个GPU上足够快，或者您的数据在单个GPU的内存中轻松容纳时，您会希望使用cuDF。...当数据量不大，可以在单个GPU内存中处理时，cuDF提供了对单个GPU上高性能数据操作的支持。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能的数据处理，特别是当数据集太大，无法容纳在单个GPU内存中时。

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用于ETL的Python数据转换工具详解

从使用效果来说，确实使用这些工具能够非常快速地构建一个job来处理某个数据，不过从整体来看，并不见得他的整体效率会高多 少。问题主要不是出在工具上，而是在设计、开发人员上。...Pandas在Python中增加了DataFrame的概念，并在数据科学界广泛用于分析和清理数据集。 它作为ETL转换工具非常有用，因为它使操作数据非常容易和直观。...优点 广泛用于数据处理 简单直观的语法 与其他Python工具(包括可视化库)良好集成 支持常见的数据格式(从SQL数据库，CSV文件等读取) 缺点 由于它会将所有数据加载到内存中，因此无法扩展，并且对于非常大...从本质上讲，Dask扩展了诸如Pandas之类的通用接口，供在分布式环境中使用-例如，Dask DataFrame模仿了。...Python库集成 缺点 除了并行性，还有其他方法可以提高Pandas的性能(通常更为显着) 如果您所做的计算量很小，则没有什么好处 Dask DataFrame中未实现某些功能 进一步阅读 Dask文档

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并行计算框架Polars、Dask的数据处理性能对比

测试内容 这两个脚本主要功能包括: 从两个parquet 文件中提取数据，对于小型数据集，变量path1将为“yellow_tripdata/ yellow_tripdata_2014-01”，对于中等大小的数据集...__ == "__main__": main() 测试结果对比 1、小数据集 我们使用164 Mb的数据集，这样大小的数据集对我们来说比较小，在日常中也时非常常见的。...Polars Dask 总结 从结果中可以看出，Polars和Dask都可以使用惰性求值。...所以读取和转换非常快，执行它们的时间几乎不随数据集大小而变化; 可以看到这两个库都非常擅长处理中等规模的数据集。...上面是测试使用的电脑配置，Dask在计算时占用的CPU更多，可以说并行性能更好。 作者：Luís Oliveira

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使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算的问题

如何将20GB的CSV文件放入16GB的RAM中。 如果你对Pandas有一些经验，并且你知道它最大的问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...大多数Dask API与Pandas相同，但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以在集群上运行，但这是另一个话题。 今天你将看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...为了让事情更复杂，我们将创建20个文件，从2000年到2020年，每年一个。 在开始之前，请确保在笔记本所在的位置创建一个数据文件夹。...一个明显的赢家，毋庸置疑。 让我们在下一节结束这些内容。 结论 今天，您学习了如何从Pandas切换到Dask，以及当数据集变大时为什么应该这样做。...Dask的API与Pandas是99%相同的，所以你应该不会有任何切换困难。 请记住—有些数据格式在Dask中是不支持的—例如XLS、Zip和GZ。此外，排序操作也不受支持，因为它不方便并行执行。

4.1K20

有比Pandas 更好的替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

为了验证这个问题，让我们在中等大小的数据集上探索一些替代方法，看看我们是否可以从中受益，或者咱们来确认只使用Pandas就可以了。...即使在单台PC上，也可以利用多个处理核心来加快计算速度。 Dask处理数据框的模块方式通常称为DataFrame。...你可能会想，为什么我们不能立即得到结果，就像你在Pandas手术时那样?原因很简单。Dask主要用于数据大于内存的情况下，初始操作的结果（例如，巨大内存的负载）无法实现，因为您没有足够的内存来存储。...另外这里有个小技巧，pandas读取csv很慢，例如我自己会经常读取5-10G左右的csv文件，这时在第一次读取后使用to_pickle保存成pickle文件，在以后加载时用read_pickle读取pickle...文件，不仅速度上会快10几倍，文件的大小也会有2-5倍的减小（减小程度取决于你dataframe的内容和数据类型） 最后总结还是那句话，当数据能全部加载到内存里面的时候，用Pandas就对了 作者：

4.5K10

Spark vs Dask Python生态下的计算引擎

Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark的架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中的 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好的兼容性，并且在...性能 Dask 中的 dataframe 基本上由许多个 pandas 的 dataframe 组成，他们称为分区。...但是因为 Dask 需要支持分布式，所以有很多 api 不完全和 pandas 中的一致。并且在涉及到排序、洗牌等操作时，在 pandas 中很慢，在 dask 中也会很慢。...当通过 spark-submit 提交一个 PySpark 的 Python 脚本时，Driver 端会直接运行这个 Python 脚本，并从 Python 中启动 JVM；而在 Python 中调用的...如果你的问题超出了典型的 ETL + SQL，并且你希望为现有的解决方案添加灵活的并行性，那么 Dask 可能是一个更好的选择，特别是你已经在使用 Python相关的库，比如 Numpy 和 Pandas

6.4K30

资源 | Pandas on Ray：仅需改动一行代码，即可让Pandas加速四倍

让我们修改一下 DataFrame 中的索引，以便设置基于日期的查询。...尽管这些数字令人印象深刻，但是 Pandas on Ray 的很多实现将工作从主线程转移到更异步的线程。文件是并行读取的，运行时间的很多改进可以通过异步构建 DataFrame 组件来解释。...在 Dask 上进行实验 DataFrame 库 Dask 提供可在其并行处理框架上运行的分布式 DataFrame，Dask 还实现了 Pandas API 的一个子集。...我什么时候应该调用 .persist() 将 DataFrame 保存在内存中？ 这个调用在 Dask 的分布式数据帧中是不是有效的？ 我什么时候应该重新分割数据帧？...我们采用了从 60KB 到 2GB 大小不等的四个数据集： 泰坦尼克数据集：60KB（https://www.kaggle.com/c/titanic/data） Yelp 数据集：31MB（https

3.3K30

【玩转GPU】基于GPU云服务器实现MySQL数据库加速

摘要:本文通过在GPU云服务器上部署和配置MySQL数据库,并使用RAPIDS GPU数据处理库进行加速,来详细阐述如何利用GPU强大的并行计算能力,加速MySQL数据库的查询和分析操作,使其比传统CPU...设置innodb_io_capacity=2000,增大IOPS吞吐量。调节tmp_table_size和max_heap_table_size,增大内存表大小。...和cuml组件,可以将数据库中数据加载到GPU内存,并使用GPU来进行聚合、排序、机器学习等复杂运算,可实现数十倍的加速效果。...LocalCUDACluster()并行读取数据分片import dask.dataframe as dddf = dd.read_csv('data-*.csv') 在多GPU上分布式处理df = df.map_partitions...(transform_on_gpu) df = df.groupby(['dept']).mean().compute()上述代码使用Dask在多GPU上并行读取数据分片和处理,可以实现数百GB甚至TB

1.3K11

xarray系列｜数据处理和分析小技巧

因为我主要接触的是nc格式，以nc数据为主： 在利用 xr.open_mfdataset 批量读取文件时，建议设置 engine=h5netcdf，比默认的 engine=netcdf4 要更快； 利用...xr.open_mfdataset 批量读取文件时可以设置 parallel=True 能显著改善文件读取效率；注意chunks 不要随便设置，整不好会降低读取的速度； xr.open_mfdataset...zarr 格式文件，想要合并时，可能会出现 chunk 不一致的问题，这时候可以通过 .chunk 方法重新设置 chunk 大小进行合并，比如： zarr3 = (xr.concat([zarr1,...数据处理 数据处理的内容比较多，这里主要以数据的索引、筛选为主，关于数据的插值和统计计算以后再说（又拖了一次，哈哈） 第一个要说的是后台留言询问的，如果从daily的nc文件中抽取某些年份1-4月的数据...进行插值和统计计算时建议使用 xr.apply_ufunc 和 map_blocks 函数，可以显著改善处理效率，结合 dask 的话简直如有神助。 这几天在处理数据时就碰到了此类问题。

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