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R语言Circlize包绘制和弦图

,城市之间的航班往来量,还有细胞和基因数据可视化(这个领域不了解) 和弦图在线工具:http://circos.ca/intro/tabular_visualization/ 和弦图R包:Circlize...包是R语言中实现Circos功能的一个常用包,作者是Zuguang Gu 1.2....= 0:文本串左对齐;= 0.5(缺省):文本串 居中;= 1:文本串右对齐 第三类参数 ann = FALSE:不进行绘图解释标记(例如横轴标题等) 第三类参数 bg 设置绘图区背景色。...如果不需要显示自我连接的弦 则更改数据源中对应的值,使该值为0 > library(circlize) > > mat3 <- mat2 > for (cn in intersect(rownames...轨道调整 chordDiagram()默认创建2个外围轨道,一个标签(列名和行名)轨道,一个带有刻度线的网格轨道 circos.info()显示的"All your tracks"下面就是所有的轨道,

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在标签打印软件中如何快速对齐标签内容

在标签打印软件中制作标签的时候,有的时候标签内容比较多,文字长短不一,如果不好好排版的话,会感觉很乱,为了标签的美观,在标签打印软件中添加完需要的文字之后,可以选择我们想要排版的文字,点击软件中的对齐按钮...具体操作如下: 1.打开标签打印软件,新建标签之后,点击软件左侧的”实心A”按钮,在画布上绘制一个普通文本对象,双击普通文本,在图形属性-数据源中,点击”修改”按钮,在下面的状态框中,手动输入你要的信息...我们可以选中标签上的对象,点击“查看-对齐”设置对齐方式,也可以点击软件上方工具栏中的 对齐按钮,如:左对齐、右对齐、顶对齐、底对齐、垂直居中对齐、水平居中对齐、水平等间距、垂直等间距等,这里可以根据自己的需求自定义设置对齐方式为左对齐...如下图: 文字内容对齐之后,如果感觉垂直间隔比较大的时候,也可以再选中所有的文字,点击软件上方工具栏中的 垂直等间距按钮,设置一下垂直间隔。...设置好之后,可以根据自己的需求,在标签上添加其他的内容。设置文字对齐的方法如上。 以上就是有关快速对齐标签内容的操作步骤,想要了解更多标签打印软件的相应教程,可以到标签打印软件官网查询。

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    手把手教你画漂亮的和弦图(上)

    在circlize中,很容易以一种直接的或高度定制的方式绘制弦图。弦图从4个层次显示了关系的信息。1. 链接直接显示对象之间的关系;2....当然是相应的R包了,比如我们常见的ggplot2,但今天我们绘制的circle图需要的不是ggplot2,我们给大家介绍一个包— circlize 包。下面我们直接进入正题。 1....安装circlize包,安装包直接用install函数即可,安装好之后,需要加载,利用library函数即可1....安装circlize包,安装包直接用install函数即可,安装好之后,需要加载,利用library函数即可 ? 2. 数据生成。首先,我们生成一个随机矩阵。 ?...3.画圈必备chordDiagram函数,由于circlize包中含有非常多函数,我们可视化相关性的关联关系,我们最多用的便是chordDiagram函数。

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    用R语言的circlize包复现一下Microbiome期刊中的圈图

    influence of host genetics on the rumen microbiota drive body weight variance in male Hu sheep lambs 复现论文中的fig2...没有找到论文中提供的数据,我们自己来构造数据,如何利用otu表格把数据整理成作图需要用的格式,这个今天的推文不做介绍,今天的推文只介绍已经有了作图需要用到的数据后如何作图。...首先是最外圈的数据 最外圈文字的数据 第二圈数据 第三圈的数据 与第二圈的数据格式一致 第四圈的数据 第五圈的数据 利用第三圈的数据生成 最里层连线的数据 完整的代码 library(circlize...https://jokergoo.github.io/circlize_book/book/circos-heatmap.html circos.heatmap.initialize(dat06.mat...AI来拼图了 今天推文的示例数据和代码可以给推文打赏20元获取

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    Golang中的内存对齐

    例如: 现在要存储变量A(int32)和B(int64)那么不做任何字节对齐优化的情况下,内存布局是这样的[字节不对齐]字节对齐优化后是这样子的:[字节对齐.png]一看感觉字节对齐后浪费了内存, 但是当我们去读取内存中的数据给...处理器保证从系统内存当中读取或者写入一个字节是原子的,意思是当一个处理器读取一个字节时,其他处理器不能访问这个字节的内存地址。...内存对齐的规则是什么?内存对齐主要是为了保证数据的原子读取, 因此内存对齐的最大边界只可能为当前机器的字长。...当然如果每种类型都使用最大的对齐边界,那么对内存将是一种浪费,实际上我们只要保证同一个数据不要分开在多次总线事务中便可。...go语言的结构体的对齐是先对结构体的每个字段进行对齐,然后对总体的大小按照最大对齐边界的整数倍进行对齐。

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    代码海洋-你想模仿的这里都有啊

    可以从中学到其他人的代码技巧,比如判断哪些包没有安装,甚至批量安装R包 cat(sprintf("\n\n##=========== checking if required packages are...docker系列之第4讲:docker容器资源调度问题(MAC版本) 使用阿里云+Docker分析RNA-Seq与ChIP-Seq Docker应用之一键化安装Wordpress(无需代码基础) 如何从看不懂...,就是基于codeocean的r-base:3.4.4-ubuntu16.04这个初始化的空白电脑系统,然后安装几个这篇文章绘图需要的R包,就可以啦!...假如你感兴趣绘制这个图的代码,就可以点开看具体的代码实现,如下: suppressMessages(library(circlize)) library(BBmisc) library(reshape2...和 circos.trackPlotRegion两个函数,来自于circlize这个R包。

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    从CPU角度理解Go中的结构体内存对齐

    而这64位指的就是CPU一次可以从内存中读取64位的数据,即8个字节。...03 struct字段内存对齐 了解了CPU从内存读取数据是按块读取的之后,我们再来看看开头的T1结构体各字段在内存中如果紧密排列的话会是怎么样的。...如果我们的程序想要读取t1.f2字段的数据,那CPU就得花两个时钟周期把f2字段从内存中读取出来,因为f2字段分散在两个字中。...所谓的数据对齐,是指内存地址是所存储数据大小(按字节为单位)的整数倍,以便CPU可以一次将该数据从内存中读取出来。 编译器通过在T1结构体的各个字段之间填充一些空白已达到对齐的目的。...没超过1个字长(8字节),但在内存中的分布是如下图这样: 我们发现b并没有直接在a的后面,而是在a中填充了一个空白后,放到了偏移量为2的位置上。为什么呢? 答案还是从内存对齐的定义中推导出来。

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    ~人人必会的Chord diagram你不来学一学吗!?

    2用到的包 rm(list = ls()) library(tidyverse) library(circlize) 3示例一 邻接矩阵绘制显chord diagram 3.1 示例数据 我们先创建一个邻接矩阵...- paste0("orig-", seq(1,20)) colnames(data) <- paste0("dest-", seq(1,5)) head(data) ---- 3.2 可视化 chordDiagram...邻接矩阵(adjacency matrix)是一种用于表示图形的矩阵,其中每个元素表示两个节点之间是否存在边。在邻接矩阵中,行和列分别表示图形中的节点,矩阵的元素表示相应节点之间是否存在边。...在无向图中,邻接矩阵是对称的,因为如果有一条从节点i到节点j的边,那么也一定有一条从节点j到节点i的边。在有向图中,邻接矩阵通常不是对称的。...library(ggsci) mypal <- pal_aaas(alpha = 0.7)(10) chordDiagram(data, col = mypal) ----

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    Circos图神器--circlize包

    导语 GUIDE ╲ circlize包是由德国癌症中心的华人博士Zuguang Gu开发,这个R包包含两个文件,一个是介绍绘制简单圈图的方法,另一个专门介绍基因组数据绘制圈图。...circlize包安装 首先安装circlize包以及配色R包RColorBrewer install.packages("circlize") install.packages("RColorBrewer...") circlize的使用 01 简单和弦图的绘制 首先我们一起看一下R包中包含的函数 circos.initialize() ##创建Circos图布对象 circos.track() ##创建...(df,grid.col = brewer.pal(9,"Set1")[1:9],link.border = "grey") 02 绘制circos plot 使用circlize包中的函数去绘制circos.../book 3、https://blog.csdn.net/kMD8d5R/article/details/79447473 小编总结 R语言中的circlize包提供了chordDiagram(

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    maven中的dependencyManagement标签

    使用pom.xml中的dependencyManagement元素能让所有子项目中引用一个依赖而不用显示的列出版本号。...maven会沿着父子层次向上走,直到找到一个拥有dependencyManagement元素的项目,然后它就会使用这个dependencyManagement元素中指定的版本号。...:如果有多个子项目都引用同一个依赖,则可以避免在每个使用的子项目里都声明一个版本号,这样当想升级或者切换到另一个版本时,只需要在顶层父容器里更新,而不需要一个一个子项目的修改;另外如果某个子项目需要另外的一个版本...3、总结 dependencyManagement里只是声明依赖,并不实现引入,因此子项目需要显示的声明需要用的依赖。...,那么会使用子项目中指定的jar版本。

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    HTML中的容器标签

    什么是容器标签?在HTML开发中我们常常会使用一类标签作为容器放置一些内容,我们把这类标签称之为容器标签,可以作为容器标签的包括列表标签、表格标签、框架标签、布局标签,在这里我们就来总结下这些内容。...框架标签 框架是互联网早期的标签,现在开发中基本上已经不再使用了,但是在一些早期的网站中还可以看到这些内容,所以有必要了解这些内容。常见的框架标签包括、两种,下表是我们整理的一些框架相关的代码。...View Code 这个标签可以十分方便的让我们实现菜单目录的功能,对于页面的重复利用非常方便,所以很受欢迎。 ? ? 这种标签可以十分方便的在我们的网站中嵌入一些其他网站的页面。...布局标签 所谓布局标签,很简单就是用来实现网页布局的 ? 这些标签,是现在设计网页中重要的HTML标签。...不过值得说明的是这些标签没有实际的语义,只是作为容器来放置一些内容,所以建议在实际开发中不要滥用,否则的话HTML的结构会特别复杂,代码也会特别多。 感谢阅读 喜欢看小编文章的点个订阅或者喜欢!

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    Mybatis中的动态sql语句 if标签 where标签 foreach标签 sql标签

    Mybatis中的动态sql语句 首先写个方法 /** * 跟进传入参数条件查询 * @param user 查询的条件:有可能有用户名,有可能有性别,也有可能有地址,还有可能都有...* @return */ List findByCondition(User user); if标签 对应resource中也要添加 <!...89 OR id=16) SELECT * FROM USERS WHERE username LIKE ‘%张%’ AND id IN (10,89,16) 这样我们在进行范围查询时,就要将一个集合中的值...标签用于遍历集合,它的属性: collection:代表要遍历的集合元素,注意编写时不要写#{} open:代表语句的开始部分 close:代表结束部分 item:代表遍历集合的每个元素...Sql 中可将重复的 sql 提取出来,使用时用 include 引用即可,最终达到 sql 重用的目的。

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    Golang中containerlist包中的坑

    但是list包中大部分对于e *Element进行操作的元素都可能会导致程序崩溃,其根本原因是e是一个Element类型的指针,当然其也可能为nil,但是golang中list包中函数没有对其进行是否为...)) //panic: runtime error: invalid memory address or nil pointer dereference fmt.Println(value1) } 从程序中可以直观的看出程序崩溃...基本实现思想是取出other中所有元素,将其顺次挂载在l列表中,但是golang中实现有问题,代码如下。...问题就出现在循环n次,如果在这个过程中other的元素变化的话,例如其中有些元素被删除了,这就导致e的指针可能为nil,此时再利用e.Value取值,程序便会崩溃。如下所示。...建议: 在golang中如果对与list的操作只有串行操作,则只需要注意检查元素指针是否为nil便可避免程序崩溃,如果程序中会并发处理list中元素,建议对list进行加写锁(全局锁),然后再操作。

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    CC++中内存对齐的问题的讲解

    内存对齐规则在C/C++中的结构体或类,存在内存对齐问题。内存对齐是为了方便计算机进行寻址,优化寻址速度的一个措施,其代价是消耗不必要的内存空间。...(不同的编译器其默认对齐数不同,64位系统中VS默认的对齐数是8,在Linux中没有默认的对齐数)- 可以在程序开端声明`#pragma pack(数字)`来设置默认对齐值结构体总大小为最大对齐数(...如果嵌套了结构体的情况,嵌套的结构体对齐到自己的最大对齐数的整数倍处,结构体的整体大小就是所有最大对齐数(含嵌套结构体的对齐数)的整数倍。...根据数据类型在内存中的对齐规则,int类型占用4个字节,在内存中占用0,1,2,3地址处,而double类型占用8个字节,需要放在地址偏移量为8的位置上。因此,test2的大小为16个字节。...struct默认是public继承因此,对于struct的对齐规则同样是class的对齐规则,在c++中,还必须注意在存在虚函数时类有一个虚表指针的情况:(在64位中指针大小为8字节,32为4字节) class

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