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SciPy 稀疏矩阵(5):CSR

因此,获取 LIL 格式的稀疏矩阵中的某一行(第 i 行)的非零元素的索引元素只需要分别访问 rows 属性(数组)第 i 个元素(动态数组) data 属性(数组)的第 i 个元素(动态数组)...part 05、SciPy CSR 格式的稀疏矩阵 BETTER LIFE SciPy CSR 格式的稀疏矩阵就是如上图所示的新数据结构,属性名也是一样的,唯一的不一样只有一个,就是 indptr 属性...实例化 SciPy CSR 格式的稀疏矩阵类的定义位于 scipy.sparse 包中的 csr_matrix 类,对其进行实例化就能获取一个 SciPy CSR 格式的稀疏矩阵的实例。...最后还是通过第 5 种实例化方法实例化一个稀疏矩阵,但是这里很明显之前不一样的地方就是它第 1 行的索引存在重复,出现了 2 次 0,在这里处理的方式是把一行中重复列索引的对应相加, COO 格式的稀疏矩阵差不多...part 06、下回预告 BETTER LIFE 不同于 LIL 格式的稀疏矩阵把相邻两行的非零元素的索引元素存储在内存的不同位置,CSR 格式的稀疏矩阵中相邻两行的非零元素的索引元素在内存中是紧密相连的

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python的高级数组之稀疏矩阵

稀疏矩阵的格式 存储矩阵的一般方法是采用二维数组,其优点是可以随机地访问每一个元素,因而能够容易实现矩阵的各种运算。...Scipy.sparse模块提供了许多来自于稀疏矩阵的不同存储格式。这里仅描述最为重要的格式CSR、CSCLIL。...CSR、CSC是用于矩阵-矩阵矩阵-向量运算的有效格式,LIL格式用于生成更改稀疏矩阵。Python不能自动创建稀疏矩阵,所以要用scipy中特殊的命令来得到稀疏矩阵。...Len(indice)==len(data)==nnz 备注:索引表示数值所在的号,0开始。 数组data:包含矩阵中的非零元素,以行优先的形式保存。...即例如第0行的索引为indices[0:2]=[0,2](第i行中非零元素的索引组成的整数数组),为data[0:2]=[1,2];第1行的索引为indices[2:3]=[2],为data[

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SciPy 稀疏矩阵(6):CSC

“ 上回说到,CSR 格式的稀疏矩阵基于程序的空间局部性原理把当前访问的内存地址以及周围的内存地址中的数据复制到高速缓存或者寄存器(如果允许的话)来对 LIL 格式的稀疏矩阵进行性能优化。...” PART. 01 SciPy CSC 格式的稀疏矩阵 SciPy CSC 格式的稀疏矩阵 SciPy CSR 格式的稀疏矩阵差不多,属性名都是一样的,唯一不一样的地方就是 SciPy CSC 格式的稀疏矩阵稀疏矩阵看成有序稀疏向量组而...SciPy CSR 格式的稀疏矩阵稀疏矩阵看成有序稀疏行向量组。...、行索引序列以及索引序列来实例化一个 3 行 3 元素为 32 位有符号整数的稀疏矩阵,只不过这次我们看看相同的行列索引重复出现会怎样: >>> row = np.array([0, 1, 2,...PART. 02 下回预告 不同于 LIL 格式 CSR 格式都是把稀疏矩阵看成有序稀疏行向量组,然后对行向量组中每一个行向量进行压缩存储,CSC 格式把稀疏矩阵看成有序稀疏向量组,然后通过模仿 CSR

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推荐系统为什么使用稀疏矩阵?如何使用python的SciPy包处理稀疏矩阵

这意味着当我们在一个矩阵中表示用户(行)行为()时,结果是一个由许多零组成的极其稀疏矩阵。 ? 在真实的场景中,我们如何最好地表示这样一个稀疏的用户-项目交互矩阵?...实现背后的思想很简单:我们不将所有存储在密集的矩阵中,而是以某种格式存储非零(例如,使用它们的行索引)。...压缩稀疏行(CSR) 尽管在SciPy中有很多类型的稀疏矩阵,比如键的字典(DOK)列表的列表(LIL),但我只讨论压缩稀疏行(CSR),因为它是最常用最广为人知的格式。...为了有效地表示稀疏矩阵CSR使用三个numpy数组来存储一些相关信息,包括: data(数据):非零,这些是存储在稀疏矩阵中的非零 indices(索引):索引的数组,第一行(从左到右)开始...第二行包含两个b, c,然后我们1:3开始索引,以此类推。

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【学术】一篇关于机器学习中的稀疏矩阵的介绍

多个数据结构可以用来有效地构造一个稀疏矩阵;下面列出了三个常见的例子。 Dictionary of Keys。在将行索引映射到时使用字典。 List of Lists。...矩阵的每一行存储为一个列表,每个子列表包含索引。 Coordinate List。一个元组的列表存储在每个元组中,其中包含行索引索引。...还有一些更适合执行高效操作的数据结构;下面列出了两个常用的示例。 压缩的稀疏行。稀疏矩阵用三个一维数组表示非零、行的范围索引。 压缩的稀疏。...与压缩的稀疏行方法相同,除了索引外,在行索引之前被压缩读取。 被压缩的稀疏行,也称为CSR,通常被用来表示机器学习中的稀疏矩阵,因为它支持的是有效的访问矩阵乘法。...你可能会在数据数据准备机器学习的子领域中遇到稀疏矩阵。 有许多有效的方法可以存储使用稀疏矩阵,而SciPy提供了你可以直接使用的实现。 ?

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稀疏矩阵的概念介绍

答案是空间复杂度时间复杂度。当涉及数百万行/或数百时,pandas DataFrames 变得最糟糕,这时因为 pandas DataFrams 存储数据的方式。...有两种常见的矩阵类型,密集稀疏。主要区别在于稀疏指标有很多零。密集的指标没有。这是一个具有 4 4 行的稀疏矩阵的示例。 在上面的矩阵中,16 个中有 12 个是零。...对于这种压缩我们的要求是压缩后的矩阵可以应用矩阵运算并以有效的方式访问指标,所以CSR并不是唯一方法,还有有更多的选项来存储稀疏矩阵。...如果关心的是有效的访问矩阵操作 - 使用 CSR 或 CSC 上面说到了很多名词为简单起见我们深入研究一个CSR的示例。考虑下面的矩阵。 将上述矩阵转换为 CSR 矩阵的情况。...索引数组 Column index array:此数组存储数组中元素的索引

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稀疏矩阵的概念介绍

答案是空间复杂度时间复杂度。当涉及数百万行/或数百时,pandas DataFrames 变得最糟糕,这是因为 pandas DataFrames 存储数据的方式。...什么是稀疏矩阵? 有两种常见的矩阵类型,密集稀疏。主要区别在于稀疏指标有很多零。密集的指标没有。这是一个具有 4 4 行的稀疏矩阵的示例。 在上面的矩阵中,16 个中有 12 个是零。...对于这种压缩我们的要求是压缩后的矩阵可以应用矩阵运算并以有效的方式访问指标,所以CSR并不是唯一方法,还有有更多的选项来存储稀疏矩阵。...这些通常用于构建矩阵; 如果关心的是有效的访问矩阵操作 - 使用 CSR 或 CSC。 上面说到了很多名词为简单起见我们深入研究一个CSR的示例。考虑下面的矩阵。...索引数组 Column index array:此数组存储数组中元素的索引

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scipy.sparse、pandas.sparse、sklearn稀疏矩阵的使用

SciPy 稀疏矩阵笔记 Sparse稀疏矩阵主要存储格式总结 Python数据分析----scipy稀疏矩阵 1.1 SciPy 几种稀疏矩阵类型 SciPy 中有 7 种存储稀疏矩阵数据结构...由于在内存中存储顺序的差异,csc_matrix 矩阵更适合取切片, 而 csr_matrix 矩阵更适合用来取行切片。...矩阵属性 from scipy.sparse import csr_matrix ### 共有属性 mat.shape # 矩阵形状 mat.dtype # 数据类型 mat.ndim # 矩阵维度...mat.nnz # 非零个数 mat.data # 非零, 一维数组 ### COO 特有的 coo.row # 矩阵索引 coo.col # 矩阵索引 ### CSR\CSC\BSR...## 获取矩阵数据 mat.getcol(j) # 返回矩阵列j的一个拷贝,作为一个(mx 1) 稀疏矩阵 (向量) mat.getrow(i) # 返回矩阵行i的一个拷贝,作为一个(1 x n)

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【水了一篇】Scipy简单介绍

文章目录 1 简介 2 常量模块 3 优化器 4 稀疏矩阵 5 图结构 6 空间数据 ---- 1 简介 Scipy是基于Numpy的科学计算库,用于数学、科学、工程学等领域,很多有一些高阶抽象物理模型需要使用...优化算法 scipy.signal 信号处理 scipy.sparse 稀疏矩阵 scipy.spatial 空间数据结构算法 scipy.special 特殊数学函数 scipy/stats 统计函数...主要使用以下两种类型的稀疏矩阵: CSC-压缩稀疏(Compressed Sparse Column),按压缩。 CSR-压缩稀疏行(Compressed Sparse Row),按行压缩。...(0, 8) 2 结果解析: 第一行:在矩阵第一行(索引0)第六(索引5)个位置有一个数值1。...第二行:在矩阵第一行(索引0)第七(索引6)个位置有一个数值1。 第三行:在矩阵第一行(索引0)第九(索引8)个位置有一个数值2。

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SciPy 稀疏矩阵(2):COO

因此,将非零元素的外加上其对应的行构成一个三元组(行索引索引)。然后再按照某种规律存储这些三元组。...与此同时,针对稀疏矩阵类我们还可以添加一些功能,比如获取矩阵的行、多个三元组的行索引外加上列索引均重复该如何处理等等。...与此同时,针对稀疏矩阵类我们还可以添加一些功能,比如获取矩阵的行、多个三元组的行索引外加上列索引均重复该如何处理等等。...在 SciPy COO 格式的稀疏矩阵中,行索引序列的属性名就是 row,索引序列的属性名就是 col,元素序列的属性名就是 data。...当然,SciPy COO 格式的稀疏矩阵也有缺点: 不支持元素访问以及切片访问

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如何使用python处理稀疏矩阵

这与稠密矩阵相反,稠密矩阵元素多。 ? 通常,我们的数据是密集的,拥有的每个实例填充特征。...如果使用有限的来可靠地描述某些事物,则通常为给定数据点分配的描述性已被剪掉,以提供有意义的表示:一个人,一张图像,一个虹膜,房价,潜在的信用风险等。...我们如何更好地表示这些稀疏矩阵?我们需要一种方法来跟踪零不在哪里。那么关于列表,我们在其中一个中跟踪row,col非零项目的存在以及在另一中其对应的情况呢?请记住,稀疏矩阵不必只包含零一。...如果我们决定逐行进行,那么刚刚创建了一个压缩的稀疏矩阵。如果按,则现在有一个压缩的稀疏矩阵。方便地,Scipy对两者都支持。 让我们看一下如何创建这些矩阵。...显然,也可以直接创建这些稀疏SciPy矩阵,从而节省了临时的占用内存的步骤。 总结 之后遇到处理一个大的数据集,并考虑通过适当地使用稀疏矩阵格式节省内存。

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SciPy 稀疏矩阵(3):DOK

既然如此,是否存在一个方法在不改变存储信息(非零元素的行、外加上)的情况下可以降低这一操作的时间复杂度?今天要介绍的 DOK 格式的稀疏矩阵就是这样!...这种高效性使得散列表在需要快速查找访问数据的场景中特别有用,比如在搜索引擎的索引中。散列表的基本实现涉及两个主要操作:插入(Insert)查找(Lookup)。...(零元素改非零元素) 增加关键字对应 按照行列索引修改对应(非零元素改零元素) 删除关键字对应 优缺点 SciPy DOK 格式的稀疏矩阵有着以下优点: 一点一点(逐个元素或者逐个矩阵块)...地构造稀疏矩阵的效率非常高 按照行列索引访问或者修改元素的时间复杂度为 O(1) 切片操作灵活且高效 改变非零元素的分布的效率非常高 转换为 COO 格式的稀疏矩阵的效率非常高 当然,SciPy DOK...至于存储方式也不需要我们去实现,SciPy 已经实现了这样的稀疏矩阵存储方式,它就是另一个板块,这个板块共有 4 种稀疏矩阵格式,分别是{BSR, CSC, CSR, LIL},下一回先介绍 LIL 格式的稀疏矩阵

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【python语言学习】(一)向量、矩阵和数组

1, 2], [1, 2]]) NumPy提供了专门的数据结构来表示矩阵,但不推荐使用矩阵数据结构 实际上数组才是NumPy的标准数据结构 绝大多数NumPy操作返回的是数组而不是矩阵对象 1.3创建一个稀疏矩阵...(●’◡’●)表示只有零星非零数据 稀疏矩阵只保存非零元素并假设剩余元素的都是零,节省大量的计算成本 稀疏行(CSR) 下标的编号0开始 Scipy #加载库 import numpy as...[3, 0]]) #创建一个压缩的稀疏行(Compressed Sparse Row,CSR)矩阵 matrix_sparse = sparse.csr_matrix(matrix) 1.4选择元素 (...1行第2行以及所有 print(matrix[:2,:]) print('--------') #选取所有行以及第二 【注意】 print(matrix[:,1:2]) 1.5展示一个矩阵的属性..., [7, 8, 9], [7, 8, 9]]) # 查看行数数 print(matrix.shape

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Scipy 高级教程——稀疏矩阵

Python Scipy 高级教程:稀疏矩阵 Scipy 提供了处理稀疏矩阵的工具,这对于处理大规模数据集中的稀疏数据是非常有效的。...常用的稀疏矩阵类型有 csr_matrix(压缩稀疏矩阵)、csc_matrix(压缩稀疏矩阵)、coo_matrix(坐标列表稀疏矩阵)等。...from scipy.sparse.linalg import spsolve # 定义稀疏矩阵右侧向量 A = csr_matrix([[4, 0, 0], [0, 5, 0], [0, 0, 6...总结 通过本篇博客的介绍,你可以更好地理解使用 Scipy 中的稀疏矩阵工具。这些工具在处理大规模稀疏数据、线性代数问题以及图算法等方面具有广泛的应用。...在实际应用中,根据具体问题选择合适的稀疏矩阵表示操作将有助于提高数据分析的效率可靠性。希望这篇博客对你有所帮助!

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机器学习基础与实践(二)——数据转换

但是scale StandardScaler只接受scipy.sparse的矩阵作为输入,并且必须设置with_centering=False。...scalers接受压缩的稀疏行(Compressed Sparse Rows)压缩的稀疏(Compressed Sparse Columns)的格式(具体参考scipy.sparse.csr_matrix...注:稀疏数据输入: normalize Normalizer 既接受稠密数据(dense array-like),也接受稀疏矩阵(from scipy.sparse)作为输入 稀疏数据需要转换成压缩的稀疏行...注:稀疏数据输入: binarize Binarizer 既接受稠密数据(dense array-like),也接受稀疏矩阵(from scipy.sparse)作为输入 稀疏数据需要转换成压缩的稀疏行...在稀疏矩阵中,缺失被编码为0存储为矩阵中,这种格式是适合于缺失比非缺失多得多的情况。

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【实验楼-Python 科学计算】SciPy - 科学计算库(下)

稀疏矩阵对于数值模拟一个大的方程组是很有帮助的。...SciPy稀疏矩阵有着很好的支持,可以对其进行基本的线性代数运算(比如方程求解,特征计算等)。 有很多种存储稀疏矩阵的方式。...一般常用的有坐标形式(COO),列表嵌套列表的形式(LIL),压缩(CSC),压缩行(CSR)等。 每一种形式都有它的优缺点。...当我们创建一个稀疏矩阵的时候,我们需要选择它的存储形式: from scipy.sparse import *# dense matrixM = array([[1,0,0,0], [0,3,0,0],...scipy是很方便的:interp1d 函数以一组X,Y数据为输入数据,返回一个类似于函数的对象,输入任意x给该对象,返回对应的内插y: from scipy.interpolate import

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SciPy 稀疏矩阵(4):LIL(上)

至于存储方式也不需要我们去实现,SciPy 已经实现了这样的稀疏矩阵存储方式,它就是另一个板块,这个板块共有 4 种稀疏矩阵格式,分别是{BSR, CSC, CSR, LIL},这一回先介绍 LIL 格式的稀疏矩阵...因此,针对有序稀疏向量组的压缩存储是稀疏矩阵处理中一个非常有效的方法。 稀疏向量的压缩存储是一种高效的数据存储方式,它只存储非零元素的索引,而不是存储整个向量。...因此,稀疏向量的压缩存储在处理大规模数据高维数据时具有非常重要的作用。 对于稀疏向量的压缩存储,虽然只涉及到非零元素的索引,但其代码实现方式多种多样。...实际上,基于稀疏向量的稀疏矩阵的存储策略主要可以分为两种:稀疏向量序列法索引分离法。...上述定义除了属性名有一点不同(意思是一样的),其他几乎没有什么区别。在 SciPy LIL 格式的稀疏矩阵中,行向量组索引序列就是属性名 rows,行向量组元素序列就是属性名 data。

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