我已经获得了一个mppm对象，方法是使用R包spatstat中的mppm函数在几个独立的数据集上拟合模型。如何生成此模型的模拟实现并获得模拟的x、y和marks属性？我将我的模型拟合如下： data <- listof(NMJ1,NMJ2,NMJ3)model <- mppm(Poi
浏览 27提问于2021-09-08得票数 1
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我在使用R中的spatstat库。
我有几个点模式对象是从我自己的dataset构建的。点模式只包含其中点的x和y坐标。FYI，我不直接使用模拟函数，因为我希望新的模拟点模式具有模拟不给我的灵活点数。现在，如果我想处理所有的点模式，我可以构建一个点模式的hyperframe，如复制点模式章节中所描述的那样，但是它需要mppm函数
浏览 4提问于2020-08-27得票数 1
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我正在尝试基于适合于多个多类型点模式的数据集的模型来模拟点模式。但是，我无法在运行simulate.mppm时不引发错误。我附加了下面的代码(使用optimbase_1.0-9和spatstat_1.62-2)： library(spatstat)flusubset <- flu[1Int[[i]] <- MultiStraussHard(iradii=iradii, hradii=hradii)Int <- as.hype
浏览 20提问于2019-12-31得票数 0
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My object model是一个mppm对象，通过使用R包spatstat中的mppm函数将模型拟合到几个独立的数据集上而获得。因为envelope函数不接受mppm类型的输入，所以我使用了以下代码(参见问题Plot an envelope for an mppm object in spatstat)来研究它的信封： gammansims, simulate=Sims,savefuns=TRU
浏览 20提问于2021-10-08得票数 0
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最初，我拟合了一个模型，其中食草动物的反应是rivD + NDVI的一个函数，并允许系数随性别而变化(参见下面可复制的例子中的mppm1 )。因此，我增加了一年作为一个随机效应，认为如果我允许拦截每年改变，我可以解释这一点(请参阅mppm2)。
现在我想知道这是否是正确的方法？如果我正在拟合一个GAMM gamm {mgcv}，我会添加一个时间相关结构，例如correlation = corAR1(form=~year)，但不认为这在mppm<
浏览 3提问于2016-06-26得票数 1
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我有一个复制实验的点模式数据，其中每个复制中的点被限制在同一个线性网络中(这些数据来自于每天对蛇类自行车道的调查:每天给出发现动物的位置的一个单独的点模式)。我知道，在spatstat中，可以同时将点过程拟合到多个点模式(用mppm)，也可以在线性网络上拟合点过程模型(用lppm)；是否可以同时进行这两种操作？据我所知，mppm将不接受lpp对象:是否有另一种方法适合这种类型<em
浏览 2提问于2018-10-03得票数 0
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我希望使用R包将单个模型适合于spatstat中的几个独立数据集。在这里，我有三个独立的数据集(ppp对象称为NMJ1、NMJ2和NMJ3)，我想要对它们建立一个通用模型。应该使用mppm函数：data <- hyperframe(X=1:3, Points=data)在我所拟合的模型中，强度是窗口中心距离的函数，我假设一个
浏览 1提问于2021-08-30得票数 0
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我想使用复制的空间点模式在spatstat中执行假设检验。spatstat有很好的文档，您可以在这里找到关于复制点模式分析的详细信息：library(spatstat)par(mar=rep(0.5,4))
plot(split(
浏览 9提问于2016-07-02得票数 1
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我使用spatstat运行一些mppm模型，并希望能够像在predict.ppm中那样计算预测的标准错误。当然，我可以在每个点进程上单独使用predict.ppm，但我想知道这是否出于任何原因而无效，或者是否有更好的方法来做到这一点？
浏览 4提问于2020-12-29得票数 0
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" function in spatstat 我已经获得了一个mppm对象，方法是使用R包spatstat中的mppm函数在几个独立的数据集上拟合模型。我将我的模型拟合如下： data <- listof(NMJ1,NMJ2,NMJ3)model <- mppm(Points但是，信封函数不接受mppm类型<
浏览 19提问于2021-09-22得票数 0
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我正在尝试将MultiStraussHardcore交互与spatstat (flu)中的一个样本数据集相匹配。我正在为所有类型和点模式维护相同的交互和核心半径。我正在运行以下代码块：library("optimbase")
typelist <- lapply(lapply(flusubsetInt[[i]] <- MultiStraussHard(iradii=iradii, hr
浏览 13提问于2019-08-16得票数 1
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我希望使用R包将单个模型适合于spatstat中的几个独立数据集。在这里，我有三个独立的数据集(ppp对象称为NMJ1、NMJ2和NMJ3)，我想要对它们建立一个通用模型。应该使用mppm函数：data <- hyperframe(X=1:3, Points=data)model <- mppm
浏览 5提问于2021-11-19得票数 0
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我最近对空间点模式的研究使我开始研究LGCP过程。在我的例子中，我实际上有一系列的点模式，我想要适应一个单一的模型。我之前的一次询问让我用mppm来训练这样的模特(谢谢禤浩焯！)我的下一个问题是在mppm环境下使用这种Cox模型。
这是否可能将不均匀的LGCP Cox过程(或其他类型的Cox过程)与使用mppm的复制点模式相匹配？对kppm<em
浏览 4提问于2021-03-31得票数 0
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最近，我尝试了一点点模式分析，并怀疑是否有任何标准做法来创建标记相关结构变化的点间距离的点位置。显然，我理解如何模拟独立的标记，因为这是经常提到的。library(spatstat)set.seed(0907)plot(finpines)
更广泛地说，假设我们有相当多的点，例如，在任意观察窗口(例如矩形)中，
浏览 1提问于2022-09-07得票数 1
从here那里，我学到了如何在多处理器上运行spatstat函数，我想知道我们是否可以在GPU上运行spatstat函数。如果是，我非常感谢您提到我们如何在GPU上运行以下代码。诚挚的问候 library(spatstat)envlist <- parallel::mclapply(ppplist, spatstat::envelope, savefuns = TRUE, ns
浏览 11提问于2020-04-10得票数 0
例如first = runiflpp(10, as.linnet(chicago), nsim = 2)上面的代码给出了一个点进程和一个绘图命令的两个实现，因为我们请求的是nsim=2。但是它使用绘图标题‘模拟1’和‘模拟2’来绘制这两个实现。谢谢
浏览 2提问于2017-07-04得票数 0
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我的目标是分析线性网络上关于欧氏距离的简单点模式，而不是在linearK中实现的最短路径距离，以及spatstat及其子包的相关函数。通过网页浏览，我发现了有前途的命名函数linearKEuclid()和相关函数。不幸的是，我无法在我的Win机器上运行这些功能，例如，我在这样的错误中运行
Error in xysegMcircle(Y$x, Y$y, D, df$x0, df$y0, df$x1,
浏览 12提问于2022-09-15得票数 3
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这个问题对你们中的一些人来说可能是微不足道的，但它就在这里。实际上，我正在尝试用一个截距和一个变量来模拟一个简单的非齐次点过程。我的目标是只使用包spatstat和rstan来恢复这两个系数。以下是模拟的代码：library(sf)library(maptools)library(fields)Return a list
浏览 1提问于2020-08-11得票数 0
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我正在使用spatstat包在R中创建统计模式。我有一堆ppp对象，我想对它们进行比较，找出它们的模式中的细微差别，我可能会通过查看热图等方式错过它们。我还想以某种方式量化这些模式之间的差异。一个问题是，每个模式的窗口形状都不同(略有不同)。我正在将spatstat应用到植物叶子上；下面是生成的镶嵌，给你一个窗口形状的概念，等等：
我该如何比较这些模式，并找出它们的不同之处？我还想看
浏览 0提问于2019-09-05得票数 0
我在ppp对象的大型超帧上使用studpermu.test，它返回一个错误。我在一个有250个ppp对象的大型超帧上使用studpermu.test，每个对象有几千个点(~ 2000-5000)，以及一个具有5个级别的分组因子，具有相等的组大小50。该函数在较小的点模式子集上成功运行，但当我尝试在整个超帧上运行该函数时返回错误。 这是一个较小的可重现的例子，它给出了相同的错误。
浏览 11提问于2019-10-10得票数 0
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