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CellChat 三部曲3:具有不同细胞类型成分多个数据细胞通讯比较分析

分享是一种态度 此教程显示了如何将 CellChat 应用于具有不同细胞类型成分多个数据比较分析。几乎所有的CellChat功能都可以应用。...笔记要点 加载所需包 第一部分:比较分析具有略有不同细胞类型成分多个数据 第二部分:对具有截然不同细胞类型成分多个数据比较分析 加载所需包 library(CellChat) library...(ggplot2) library(patchwork) library(igraph) 第一部分:比较分析具有略有不同细胞类型成分多个数据 对于具有稍微不同细胞类型...(组)组成数据,CellChat 可以使用函数liftCellChat将细胞组提升到所有数据相同细胞标记,然后执行比较分析,作为对具有相同细胞类型成分数据联合分析。...第二部分:对具有截然不同细胞类型成分多个数据比较分析 CellChat 可用于比较来自截然不同生物背景两个 scRNA-seq 数据之间细胞-细胞通信模式。

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SQL命令大全,每条命令均有示例,小白看了也可成神!

SELECT SELECT 可能是最常用 SQL 语句,每次使用 SQL 查询数据时,几乎都会用到它。 例如,在下面的代码中,从customers表中查询name字段。...下面的示例将返回每个名称行数,但仅适用于具有 2 个以上记录名称。...SAVEPOINT SAVEPOINT_NAME; COMMIT COMMIT 用于将每个事务保存到数据库中,COMMIT 语句将释放任何可能正在使用现有保存点,并且一旦发出该语句,就无法回滚事务。...TRUNCATE TABLE customers; UNION UNION 使用两个或多个 SELECT 语句组合多个结果并消除重复行。...SELECT name FROM customers UNION SELECT name FROM orders; UNION ALL UNION ALL 使用两个或多个 SELECT 语句组合多个结果并保留重复行

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MySQL基础-多表查询

假设我有两个集合 X 和 Y,那么 X 和 Y 笛卡尔积就是 X 和 Y 所有可能组合,也就是第一个对象来自于 X,第二个对象来自于 Y 所有可能。...组合个数即为两个集合中元素个数乘积数 笛卡尔积错误会在下面条件下产生: 省略多个连接条件(或关联条件) 连接条件(或关联条件)无效 所有表中所有行互相连接 为了避免笛卡尔积, 可以在 WHERE...合并查询结果 利用UNION关键字,可以给出多条SELECT语句,并将它们结果组合成单个结果 合并时,两个表对应列数和数据类型必须相同,并且相互对应。...各个SELECT语句之间使用UNION或UNION ALL关键字分隔 UNION 操作符返回两个查询结果,去除重复记录 UNION ALL操作符返回两个查询结果。...FROM table2 注意:执行UNION ALL语句时所需要资源比UNION语句少 如果明确知道合并数据结果数据不存在重复数据,或者不需要去除重复数据,则尽量使用UNION ALL语句,以提高数据查询效率

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MADlib——基于SQL数据挖掘解决方案(25)——分类之随机森林

由于抽过程是有回放,因此一些样本可能在同一训练数据总出现多次,而其它一些却可能被忽略。一般来说,自助样本 ? 大约包含63%原训练数据,因为每一样本抽样到 ? 概率为 ?...图1 装袋例子 通过对每个基分类器所作预测使用多数表决来分类表1给出整个数据。表2给出了预测结果。...在这种情况下,装袋可能不会对基分类器性能有显著改善,装袋甚至可能降低分类器性能,因为每个训练有效容量比原数据大约小37%。...然后,让树完全增长而不进行任何修剪,这可能有助于减少结果树偏倚。树构建完毕之后,就可以使用多数表决方法来组合预测。这种方法称为Forest-RI,其中RI指随机输入选择。...如果碰到VMEM限制,考虑减小一个或多个参数。 训练函数生成模型表包含以下列: 列名 数据类型 描述 gid INTEGER 分组ID

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Commun | 基于网络药物组合预测

背景简介 组合治疗使用多种药物以改善临床效果相较于单一疗法具有多个优点:它提供了更高功效或通过降低个体剂量,它可以减少不良反应风险。...2.3 收集最佳配对药物组合 本研究中通过汇总来自多个数据临床数据来关注成对药物组合。在组合每种药物需要具有实验证实靶标信息。...每种药物化合物名称由MeSH和UMLS词汇表标准化,并进一步从DrugBank数据库转换为DrugBank ID,删除重复药物对。...每种药物化合物名称由MeSH和UMLS词汇表标准化,并进一步从DrugBank数据库转换至DrugBank ID 。...3.3 基于网络高血压药物组合揭示 预测有效药物组合促使研究人员使用高血压数据作为验证用于基于网络新药物组合预测。

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Pandas Merge函数详解

在日常工作中,我们可能会从多个数据集中获取数据,并且希望合并两个或多个不同数据。这时就可以使用Pandas包中Merge函数。...函数将根据给定数据索引或列组合两个数据。...列和索引合并 在上面合并数据集中,merge函数在cust_id列上连接两个数据,因为它是唯一公共列。我们也可以指定要在两个数据上连接列名。...但是如果两个DataFrame都包含两个或多个具有相同名称列,则这个参数就很重要。 我们来创建一个包含两个相似列数据。...如果在正确DataFrame中有多个重复键,则只有最后一行用于合并过程。例如将更改delivery_date数据,使其具有多个不同产品“2014-07-06”值。

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Google earth engine——清单上传!

资产 ID名称 清单中资产名称需要与 Earth Engine 中其他地方可见资产 ID 略有不同。...瓷砖 JSON 有点复杂清单结构对于提供足够灵活性来解决常见上传挑战是必要:如何描述将来自多个源文件像素组合成单个资产所有可能方式。具体来说,有两种独立方式将文件分组在一起: 马赛克。...此类文件必须作为 EE 资产中条带堆叠在一起。 (可能必须同时使用这两种方式,但这种情况很少见。) 为了描述这些选项,清单引入了tileset概念。单个图块对应于单个 GDAL 源。...因此,单个瓦片集中所有源必须具有相同 GDAL 结构(波段数量和类型、投影、变换、缺失值)。由于一个 GDAL 源可以有多个波段,一个图块可能包含多个 EE 波段数据。...图块 list 定义图块属性字典列表。有关tilesets更多信息,请参阅以下字典元素字段。 图块[i] . 数据_类型 string 指定数据数值数据类型。

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机器学习中特征工程总结!

以某个使用 street_name 作为特征来预测房价模型为例。根据街道名称对房价进行线性调整可能性不大,此外,这会假设你已根据平均房价对街道排序。...例如,unique_house_id 就不适合作为特征,因为每个值只使用一次,模型无法从中学习任何规律: unique_house_id: 8SK982ZZ1242Z 最好具有清晰明确含义 每个特征对于项目中任何人来说都应该具有清晰明确含义...那么,如下值是可以接受: quality_rating: 0.82 quality_rating: 0.37 不过,如果用户没有输入 quality_rating,则数据可能使用如下特殊值来表示不存在该值...[A x A]:对单个特征值求平方形成特征组合。 通过采用随机梯度下降法,可以有效地训练线性模型。因此,在使用扩展线性模型时辅以特征组合一直都是训练大规模数据有效方法。...线性学习器可以很好地扩展到大量数据。对大规模数据使用特征组合是学习高度复杂模型一种有效策略。神经网络可提供另一种策略。

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软件测试|深入理解SQL CROSS JOIN:交叉连接

图片简介在SQL查询中,CROSS JOIN是一种用于从两个或多个表中获取所有可能组合连接方式。它不依赖于任何关联条件,而是返回两个表中每一行与另一个表中每一行所有组合。...数据透视:在数据透视和交叉分析中,可以使用CROSS JOIN来创建所有可能组合,并在结果集中进行聚合操作。...注意事项虽然CROSS JOIN在某些情况下非常有用,但也需要谨慎使用。由于它返回所有可能组合,当连接表非常大时,结果可能会非常庞大,影响查询性能和系统资源。...在使用CROSS JOIN时,务必确保结果不会无限增长,可以使用LIMIT子句限制返回行数,或者仔细筛选结果以减少返回数据量。...总结CROSS JOIN是SQL查询中一种连接方式,它返回两个或多个表中所有可能组合。它通常用于生成笛卡尔积、数据透视和生成测试数据等情况。但需要谨慎使用,确保结果不会无限增长。

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SQL查询数据库(一)

查询类型查询是执行数据检索并生成结果语句。查询可以包含以下任意项:一个简单SELECT语句,用于访问指定表或视图中数据具有JOIN语法SELECT语句,用于访问多个表或视图中数据。...合并多个SELECT语句结果UNION语句。使用SELECT语句为封闭SELECT查询提供单个数据子查询。...在嵌入式SQL中,这是一个使用SQL游标通过FETCH语句访问多行数据SELECT语句。使用SELECT语句SELECT语句从一个或多个表或视图中选择一行或多行数据。...字段这三个名称之间转换确定了查询行为几个方面。可以使用字母大小写任意组合来指定选择项目的字段名称,并且InterSystems SQL将标识相应相应属性。...结果显示中数据列标题名称是SqlFieldName,而不是select-item中指定字段名称。这就是为什么数据列标题字母大小写可能与select-item字段名称不同原因。

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分布式系统数据库分片认识

数据库分片通过将数据拆分为更小块(称为分片)并将其存储在多个数据库服务器上来克服此限制。所有数据库服务器通常都具有相同底层技术,它们协同工作以存储和处理大量数据。 为什么数据库分片很重要?...客户 ID 名称 省/市/自治区 1 John 加利福尼亚州 2 Jane 华盛顿州 3 Paulo 亚利桑那州 4 Wang 佐治亚州 分片涉及从表中分离出不同行信息,并将它们存储在不同计算机上...计算机 A 客户 ID 名称 省/市/自治区 1 John 加利福尼亚州 2 Jane 华盛顿州 计算机 B 客户 ID 名称 省/市/自治区 3 Paulo 亚利桑那州 4 Wang 佐治亚州...存储逻辑分片计算机称为物理分片或数据库节点。一个物理分片可以包含多个逻辑分片。 分片键 软件开发人员使用分片键来确定如何对数据进行分区。数据集中一列决定了哪些数据组合在一起形成分片。...例如,包含以 A 开头客户名称单个物理分片会比其他分片接收更多数据。这个物理分片将比其他分片消耗更多计算资源。 解决方案 您可以使用最佳分片键均匀分布数据。有些数据比其他数据更适合分片。

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手把手 | 如何用Python做自动化特征工程

我们将使用示例数据来演示基础知识。...EntitySet(实体)是表集合以及它们之间关系。可以将实体视为另一个Python数据结构,该结构具有自己方法和属性。)...= 'client_id', time_index = 'joined') loans数据框还具有唯一索引loan_id,并且将其添加到实体语法与clients相同。...但是,对于payments数据框,没有唯一索引。当我们将此实体添加到实体时,我们需要传入参数make_index = True并指定索引名称。...实际上,我们已经在之前函数调用中执行了dfs!深度特征仅仅是堆叠多个基元特征,而dfs是制作这些特征过程名称。深度特征深度是制作特征所需基元数量。

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手把手教你用Python实现自动特征工程

Pandas中数据表征,多个实体集合称为实体Entityset。...对于数据,必须具有唯一标识符特征,但是我们数据目前还没有。因此,我们要为这个组合数据创建唯一ID。你可能会注意到,数据集中有两个ID,一个用于item,另一个用于outlet。...接着,我们要创建一个实体EntitySet。实体是一种包含多个数据帧及其之间关系结构。那么,我们创建一个EntitySet并添加数据组合。...Featuretools能把一个数据拆分成多个表格。我们根据outlet ID Outlet_Identifier从BigMart表中创建一个新表“outlet”。...由于最终数据feature_matrix具有多个分类特征,因此我决定使用CatBoost算法。它可以直接使用分类特征,并且本质上是可扩展

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第06章_多表查询

多表查询,也称为关联查询,指两个或更多个表一起完成查询操作。 前提条件:这些一起查询表之间是有关系(一对一、一对多),它们之间一定是有关联字段,这个关联字段可能建立了外键,也可能没有建立外键。...一个案例引发多表连接 # 1.1 案例说明 从多个表中获取数据: #案例:查询员工姓名及其部门名称 SELECT last_name, department_name FROM employees...假设我有两个集合 X 和 Y,那么 X 和 Y 笛卡尔积就是 X 和 Y 所有可能组合,也就是第一个对象来自于 X,第二个对象来自于 Y 所有可能组合个数即为两个集合中元素个数乘积数。...语法说明: 可以使用 ON 子句指定额外连接条件。 这个连接条件是与其它条件分开。 ON 子句使语句具有更高易读性。...UNION 使用 合并查询结果 利用 UNION 关键字,可以给出多条 SELECT 语句,并将它们结果组合成单个结果。合并时,两个表对应列数和数据类型必须相同,并且相互对应。

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数据库之关系模型介绍「建议收藏」

大家好,又见面了,我是你们朋友全栈君。 本篇文章是数据库系列第一篇文章,本系列文章是笔者在学习《数据库系统概念》这本书总结内容,使用数据库是MySQL。...表中一行代表了一组值之间联系,而表就是这种联系一个集合,表这个概念和数学上关系概念是密切相关,这也是关系数据模型名称由来。...超码(superkey)是一个或多个集合,这些属性组合可以使我们在一个关系中唯一标识一个元组。...例如,在city表中,city_id属性足以把不同城市元组区分开来,因此city_id是一个超码。而state不是一个超码,可以看到多个元组state属性是可以相同。...超码中可能包含无关紧要属性。例如city_id和state组合也是关系city一个超码,如果属性集合K是一个超码,那么K任意超也是超码。

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Apache Hive Join

 笛卡尔积――是关系乘法,它将分别来自两个数据集合中行以所有可能方式进行组合。...SELECT语句FROM子句可以指定以下几种类型连接 FROM子句关键字 相应结果 CROSS JOIN 笛卡尔乘积(所有可能行对) INNER JOIN...在功能上,它等价于对这两个数据集合分别进行左外连接和右外连接,然后再使用消去重复行并操作将上述两个结果集合并为一个结果。...它不使用连接条件来限制结果集合,而是将分别来自两个数据源中行以所有可能方式进行组合数据集合中一每个行都要与数据集合二中每一个行分别组成一个新行。...field1, field2参数指定被联接字段名称。且这些字段必须有相同数据类型及包含相同类型数据,但它们不需要有相同名称

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IT课程 CSS基础 020_选择器

ID选择器应该确保在文档中是唯一,不应重复使用相同ID。 示例: #myID { /* 样式规则 */ } 类选择器(.) 通过元素类名选择元素。...示例: div p { /* 样式规则 */ } 并选择器(,) 将多个选择器组合在一起,选择所有匹配任一选择器元素。并选择器用于同时选择多个不同类型元素,并应用相同样式规则。...示例: h1, h2, h3 { /* 样式规则 */ } 选择器列表 将多个选择器按照优先级顺序列举,选择最匹配一个。选择器列表允许按照不同选择器组合选择多个元素,以满足不同条件样式需求。...选择器名称必须以字母或下划线开头。 选择器名称不能以数字开头。 选择器名称不能包含空格。 建议: 使用有意义名字: 选择器名字应该能够清晰地反映出所选择元素作用或用途。...遵循语义化: 使用具有语义化选择器,以提高代码可读性和维护性。

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