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数据挖掘实战:基于机器学习肺癌患者建模预测分类

公众号:尤而小屋作者:Peter编辑:Peter大家好,我是Peter~本文介绍一个完整数据挖掘实战项目,主要内容包含:数据探索性分析EDA数据编码及因子化基于重要性特征选择数据标准化交叉验证网格搜索分类模型评估基于...早期发现和诊断对于提高患者生存率和治疗效果至关重要。随着电子健康记录普及,大量医疗数据被数字化存储,包括患者临床信息、影像学资料和生物标志物等,为机器学习模型训练提供了丰富数据资源。...In 14:sns.pairplot(df, hue="LUNG_CANCER")plt.legend()plt.show()4 数据预处理为了方便后续建模,对数据进行预处理:In 15:categorical.remove...具体来说,算法会为每个超参数生成一个候选值列表,然后将这些列表进行笛卡尔积运算,生成所有可能参数组合。之后,算法会使用这些组合来训练模型,并通过交叉验证等方式评估每个模型性能。...0.9438482886216466 ± 0.016747588503435138Best Parameters: {'C': 50, 'gamma': 1, 'kernel': 'linear'}5.5 模型评估使用基于网格搜索找到最佳参数组合进行建模

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完整R语言预测建模实例-从数据清理到建模预测

本文使用Kaggle上一个公开数据集,从数据导入,清理整理一直介绍到最后数据多个算法建模,交叉验证以及多个预测模型比较全过程,注重在实际数据建模过程中实际问题和挑战,主要包括以下五个方面的挑战:...通过这个函数,我们现在可以对数据集中每一个变量都有一个整体性把握。 我们可以看出我们共有21个变量,共计3168个观测值。...步骤3:数据分配与建模 在实际建模过程中,我们不会将所有的数据全部用来进行训练模型,因为相比较模型数据集在训练中表现,我们更关注模型在训练集,也就是我们模型没有遇到数据预测表现。...因此,我们将我们数据70%数据用来训练模型,剩余30%用来检验模型预测结果。...但是在此之前,我想提一下并行计算问题,我们在开始建模之前就使用parallel 和doParallel 两个包设置了并行计算参数,在modelControl中将allowParallel值设为了TRUE

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数据挖掘】数据挖掘建模 ( 预测建模 | 描述建模 | 预测模型 | 描述模型 | 判别模型 | 概率模型 | 基于回归预测模型 )

预测建模 与 描述建模 II . 预测模型 与 函数映射 III . 预测模型分类 ( 分类 | 回归 ) IV . 预测建模 测试集 V . 预测建模 拟合过程 VI ....预测模型结构确定 VII . 基于分类判别模型 VIII . 基于分类概率模型 IX . 预测模型评分函数 X . 基于回归预测模型 I . 预测建模 与 描述建模 ---- 1 ....预测建模 : ① 目的 : 根据现有的数据 若干 ( 1 个或多个 ) 属性值 ( 特征值 / 变量 ) , 预测其它属性值 ; ② 示例 : 分类 ; 2 ....预测模型 : ① 模型形式 : 使用已知变量 ( 属性值 / 特征值 ) 表达 未知变量函数 ; ② 已知变量 : 当前数据集中样本 , 已知属性属性值 ; ③ 未知变量 : 将要预测属性值...预测建模 测试集 ---- 1 . 预测建模相关数据集 : 预测建模中用到 3 类数据集 , 训练集 , 测试集 , 新数据 ; 2 .

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预测建模常用数据预处理方法

是金子总会发光,一个未经雕琢数据,本身价值也难以得到体现,通过数据预处理,可以让数据展现真正价值;另外,不同模型对数据有不同要求,通过预处理可以让数据符合算法要求,这样也能提高模型预测能力...最有效数据预处理方法来自于建模者对数据理解,而不是通过任何数学方法。...数据预处理是一个非常系统且专业过程,如同开头说那样:最有效编码数据方法来自于建模者对数据理解,而不是通过任何数学方法,在对数据进行预处理之前,一定要仔细理解自己数据哦,结果导向思维是不对哦...pipelines mlr3:技术细节 mlr3:模型解释 mlr3实战:决策树和xgboost预测房价 使用mlr3搞定二分类资料多个模型评价和比较 mlr3校准曲线也是一样画!...使用mlr3搞定二分类资料多个模型评价和比较 使用tidymodels搞定二分类资料多个模型评价和比较 tidymodels不能画校准曲线?

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基于tensorflow+CNNMNIST数据集手写数字分类预测

此文在上一篇文章《基于tensorflow+DNNMNIST数据集手写数字分类预测基础上修改模型为卷积神经网络模型,模型准确率从98%提升到99.2% 《基于tensorflow+DNNMNIST...数据集手写数字分类预测》文章链接:https://www.jianshu.com/p/9a4ae5655ca6 0.编程环境 安装tensorflow命令:pip install tensorflow...image.png 3.配置环境 使用卷积神经网络模型要求有较高机器配置,如果使用CPU版tensorflow会花费大量时间。...image.png 第6行代码调用input_data文件read_data_sets方法,需要2个参数,第1个参数数据类型是字符串,是读取数据文件夹名,第2个关键字参数ont_hot数据类型为布尔...; 第9行代码表示计算模型在测试集上预测准确率,赋值给变量test_accuracy; 第10行代码打印步数、训练集预测准确率、测试集预测准确率。

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基于tensorflow+DNNMNIST数据集手写数字分类预测

此文在上一篇文章《基于tensorflowMNIST数据集手写数字分类预测基础上添加了1个隐藏层,模型准确率从91%提升到98% 《基于tensorflowMNIST数据集手写数字分类预测》文章链接...image.png 第6行代码调用input_data文件read_data_sets方法,需要2个参数,第1个参数数据类型是字符串,是读取数据文件夹名,第2个关键字参数ont_hot数据类型为布尔...5.数据观察 本章内容主要是了解变量mnist中数据内容,并掌握变量mnist中方法使用。...,因为是多分类问题,使用交叉熵作为损失函数,tf.reduce_sum函数第2个参数为1原因是表示对行求和, 如果第2个参数为0节表示对列求和。...第13行代码定义优化器optimizer,作者使用过GradientDescentOptimizer、AdamOptimizer,经过实践对比,AdagradOptimizer在此问题收敛效果较好,读者可以自己尝试设置不同优化效果

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数据观测性——使用SQL构建自己数据质量监视器

从空值和重复行,到建模错误和架构更改,数据可能由于多种原因而中断。数据测试通常是我们防范不良数据第一道防线,但是如果数据在其生命周期中中断,会发生什么呢?...实践中数据可观察性 欢迎您使用Jupyter Notebook和SQL自己尝试这些练习。 我们样本数据生态系统使用有关宜居系外行星模拟天文数据。...出于此练习目的,我使用Python生成了数据集,对我在生产环境中遇到真实事件进行了建模。 我使用是SQLite 3.32.3,它应该使数据库可以从命令提示符或SQL文件进行最少设置访问。...实际上,只要保留一些关键信息(例如记录时间戳和历史表元数据),就可以使用简单SQL“检测器”来实现数据可观察性核心原理。...还值得注意是,对于随您生产环境而增长端到端数据可观察性系统,必须使用关键ML支持参数调整。

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数据挖掘导论】书籍小册(一)绪论

数据挖掘是数据库中知识发现(KDD)不可缺少一部分,KDD是将未加工数据转换为有用信息整个过程。...如图: 数据预处理:包括清洗数据以便消除噪声和重复观测值,以及选择与当前数据挖掘任务相关记录和特征。它是整个知识发现过程中最费力、最耗时步骤。...2、描述任务 概括数据中潜在联系模式。如,聚类、趋势、相关、异常、轨迹。 除此之外,还有聚类分析、预测建模、关联分析、异常检测四种主要数据挖掘任务。...预测建模:将说明变量以函数方式进行建模预测建模任务有2类:分类和回归。 分类预测离散目标变量;如,预测一个用户是否会在网上买书。该目标变量是一个二值。...相关应用:识别用户一起访问网页;找出具有相关功能基因组;等等。 聚类分析:发现紧密相关观测值组群,使得与属于不同簇观测值相比较起来,属于同一簇观测值相互之间尽可能类似。

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使用Flow forecast进行时间序列预测分类迁移学习介绍

到目前为止,无论您是在训练一个模型来检测肺炎还是对汽车模型进行分类,您都可能从在ImageNet或其他大型(和一般图像)数据集上预先训练模型开始。...Fawaz el一篇论文(https://arxiv.org/pdf/1811.01533.pdf)。他讨论了时间序列分类迁移学习。...他们结论是: 这些实验表明,迁移学习可以改善或降低模型预测,但是取决于用于迁移数据集。 由此我们了解到,对于时间序列,源数据集和目标数据集之间相似性在许多方面比CV或NLP更为重要。...他们建议在使用特定时间序列模型进行预测之前,先使用初始模型(与重建损失一起)提取一般特征。尽管本文仅限于单变量时间序列预测用例,但该技术似乎有助于提高性能。...然而,对于像流感预测这样东西,我们可能只有新感染病例和总共四个特征天气数据(例如,没有为流感收集移动数据)。

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想搞机器学习,不会特征工程?

特征是机器学习系统原材料,对最终模型影响是毋庸置疑。 特征工程重要意义 数据特征会直接影响你使用预测模型和实现预测结果。准备和选择特征越好,则实现结果越好。...选择信息量大、有差别性、独立特征是模式识别、分类和回归问题关键一步。...3、特征提取 一些观测数据如果直接建模,其原始状态数据太多。像图像、音频和文本数据,如果将其看做是表格数据,那么其中包含了数以千计属性。...特征提取是自动地对原始观测降维,使其特征集合小到可以进行建模过程。...抽象特征表达可以自动得到,但是你无法理解和利用这些学习得到结果,只有黑盒方式才可以使用这些特征。你不可能轻易懂得如何创造和那些效果很好特征相似或相异特征。

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【机器学习】特征工程

特征是机器学习系统原材料,对最终模型影响是毋庸置疑。 特征工程重要意义 数据特征会直接影响你使用预测模型和实现预测结果。准备和选择特征越好,则实现结果越好。...选择信息量大、有差别性、独立特征是模式识别、分类和回归问题关键一步。...特征提取(Feature Extraction) 一些观测数据如果直接建模,其原始状态数据太多。像图像、音频和文本数据,如果将其看做是表格数据,那么其中包含了数以千计属性。...特征提取是自动地对原始观测降维,使其特征集合小到可以进行建模过程。...抽象特征表达可以自动得到,但是你无法理解和利用这些学习得到结果,只有黑盒方式才可以使用这些特征。你不可能轻易懂得如何创造和那些效果很好特征相似或相异特征。

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判别模型 和 生成模型

- 主要特点: 寻找不同类别之间最优分类面,反映是异类数据之间差异。 - 优点: 分类边界更灵活,比使用纯概率方法或生产模型得到更高级。...用于随机生成观察值建模,特别是在给定某些隐藏参数情况下。在机器学习中,或用于直接对数据建模(用概率密度函数对观察到draw建模),或作为生成条件概率密度函数中间步骤。...通过使用贝叶斯rule可以从生成模型中得到条件分布。 如果观察到数据是完全由生成模型所生成,那么就可以fitting生成模型参数,从而仅可能增加数据相似度。...但数据很少能由生成模型完全得到,所以比较准确方式是直接对条件密度函数建模,即使用分类或回归分析。 与描述模型不同是,描述模型中所有变量都是直接测量得到。...- 主要特点: 一般主要是对后验概率建模,从统计角度表示数据分布情况,能够反映同类数据本身相似度。

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A.机器学习入门算法:基于英雄联盟数据LightGBM分类预测

机器学习系列入门系列[七]:基于英雄联盟数据LightGBM分类预测 1.1 LightGBM原理简介 LightGBM是2017年由微软推出可扩展机器学习系统,是微软旗下DMKT一个开源项目...例如金融风控、购买行为识别、交通流量预测、环境声音分类、基因分类、生物成分分析等诸多领域。...2.相关流程 了解 LightGBM 参数与相关知识 掌握 LightGBM Python调用并将其运用到英雄联盟游戏胜负预测数据集上 Part1 基于英雄联盟数据LightGBM分类实践 Step1...提供了主流Python\C++\R语言接口,用户可以轻松使用LightGBM建模并获得相当不错效果。 高效可扩展。在处理大规模数据集时高效迅速、高准确度,对内存等硬件资源要求不高。 鲁棒性强。...提供了主流Python\C++\R语言接口,用户可以轻松使用LightGBM建模并获得相当不错效果。 高效可扩展。在处理大规模数据集时高效迅速、高准确度,对内存等硬件资源要求不高。 鲁棒性强。

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打造自动化数据科学家:新分类预测函数

这就是一个自动化数据科学家例子,它其实是一个系统,你可以对其抛出任意数据并获得分析或预测。 将此变为现实一个关键因素是学习预测模型能力,而人类除了数据之外无需给出任何规范。...同样,我们可以使用得到函数进行预测: ? 我们可以获得预测分布: ?...在分类器或预测器上使用 ClassifierInformation 和 PredictorInformation 时,将显示一个类似的面板: ?...我们希望对这些曲线轻松访问可以简化建模工作流程(例如,可能减少使用 ClassifierMeasurements 和 PredictorMeasurements 需要)。...我们程序思想是从多个我们认为可以表现良好配置(比方说100个)开始,在小数据集上训练这些配置,并使用在这些"实验"中收集信息,预测配置在完整数据集上表现。

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理解生成模型与判别模型

该问题目标是给定一个样本向量x(可以是原始数据如图像,声音,也可以是提取出来特征向量),在这里我们将它称为输入变量,目标是预测出这个样本类别y即标签值,一般是一个离散标量,即类别编号。...事实上,这种做法不仅仅局限于分类问题,如果将x看做可以观测变量,y看做不可观测变量,只要具有这种特征问题,我们都可以建立生成模型。...如果神经网络最后一层是softmax变换,即softmax回归,则可以归到第二种情况里,如果没有使用,则是这第三种情况。 支持向量机预测函数是: ?...其他算法如随机森林,kNN,也是如此。 这类模型没有使用概率观点进行建模,而是用几何或者分析(函数)手段建模,如找出分类超平面或者曲面,直接得到映射函数。...一般来说,我们把使用第一种模型分类器称为生成式分类器,把使用第二种和第三种模型分类器称为判别式分类器。 第二种定义 除此之外,对生成模型和判别模型还有另外一种定义。

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机器学习算法(五):基于企鹅数据决策树分类预测

机器学习算法(五):基于企鹅数据决策树分类预测 本项目链接:https://www.heywhale.com/home/column/64141d6b1c8c8b518ba97dcc 1 逻决策树介绍和应用...但医生非常清楚剧烈咳嗽一般都会被立刻检查治疗,这意味着患有剧烈咳嗽哮喘病人都会马上得到收治。用于建模数据认为这类病人风险很小,是因为所有这类病人都得到了及时治疗,所以极少有人在此之后患病或死亡。...:数据和模型可视化 Step4:模型预测 Part2 基于企鹅(penguins)数据决策树分类实践 Step1:库函数导入 Step2:数据读取/载入 Step3:数据信息简单查看 Step4...:可视化描述 Step5:利用 决策树模型 在二分类上 进行训练和预测 Step6:利用 决策树模型 在三分类(多分类)上 进行训练和预测 3 算法实战 3.1Demo实践 Step1: 库函数导入...(palmerpenguins)进行方法尝试训练,该数据集一共包含8个变量,其中7个特征变量,1个目标分类变量。

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在机器学习项目中,如何使预测建模问题数据收益最大化

预测建模成功与否,可能取决于你使用数据,以及你使用这些数据方法。问题数据和框架可能是你完成项目的最大筹码。...问题框架意味着以下元素结合: 输入 输出 问题类型 比如: 无论数据多少,你都可以将其作为模型输入数据吗? 你能预测其他事情吗? 你能把问题变成回归、分类、序列等问题吗?...向领域内专家展示统计图。 你在寻求对数据更深入了解,这些可以使用想法能够帮你更好地选择、工程和准备建模数据,这样就会得到好结果。...你可以尽情猜想; 你可以使用领域内专家建议; 您甚至可以从特征选择方法中获得建议。 然而这些都只是猜想。每一组建议输入特征都是问题中一个想法——关于什么特征可能对建模预测输出变量有用。...利用自由联想、计算等方法,收集尽可能多不同想法输入数据。设计实验并仔细地测试比较每个想法。用数据评估哪些特征和视图是最具预测。 6.特征工程 用特征工程来创建预测建模问题中额外特征和想法。

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Nature | 数据驱动地球系统深度学习与过程理解

本文不讨论如何改进传统机器学习方法,而是讨论这些空间或者时间信息是如何被使用而成为深度学习一部分,从而对地球系统科学问题有更深层次理解,如改善季节预报预测效果和跨多个时间尺度远程空间关联建模等。...因此,机器学习被广泛应用于地球科学领域分类、变化检测和异常检测等问题上。在过去几年时间里,地球科学开始使用深度学习来更好地表示数据空间和时间结构特征,这些特征通常是传统机器学习难以提取。...土地使用和变化检测 逐像素光谱分类 仅适用或者没有使用浅层空间背景 卷积神经网络 回归 根据大气条件预测通量 随机森林,核方法,前馈神经网络 没有考虑记忆和滞后效应 循环神经网络,长短期记忆网络...同样,海洋CO2浓度和通量已通过神经网络进行了时空映射,其中分类和回归方法已结合起来,用于数据分层和预测。最近,随机森林方法被用于预测降水时空变化。...例如,尽管通常所谓代价函数(如普通最小二乘)会惩罚模型与数据不匹配,但它也可以进行修改,以避免对湖泊温度模式进行物理上不可预测[58]。

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