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使用SnpSift filterVCF文件进行筛选

如此大文件用Excel 操作是不现实,脚本语言处理大文件时效果也不尽人意,所以SnpEff开发团队专门开发了一款工具,叫做SnpSift, 用来VCF文件进行过滤。...VCF进行过滤是SnpSift最基本功能,除此之外,还提供了许多非常实用功能。软件是集成在SnpEff软件包中, 在下载SnpEff安装包中,就会有这款软件。...多个值变量 当一个变量有多个值时,可以使用下标进行访问,下标从0开始,比如CI95=0.04167,0.5417,这个变量进行筛选可以采用如下写法 "( CI95[0] > 0.1 ) & (...对于多个样本基因型,也可以使用上面提到通配符进行筛选。 4....函数 函数主要用来操作基因型信息,详细列表如下 ?

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python-进阶教程-列表元素进行筛选

本文主要介绍根据给定条件列表元素进行筛序,剔除异常数据,并介绍列表推导式和生成表达式两种方法。。...结论:处理少量数据用列表推导式,处理大量数据用生成器表达式 3.更复杂筛选条件 有的时候筛选标准并非如此简单,甚至涉及到异常处理等细节,这个时候可以先将复杂筛选条件写入函数,该函数返回bool值,...int型数据判断; filter()函数创建了一个迭代,前面的list是将该迭代转换为list数据。...4.实用操作 在使用列表推导式和生成器表达式筛选数据过程,还可以附带着进行数据处理工作。...itertools.compress(data, selectors):该函数会根据selectors中元素bool值筛选data对应位置元素,并返回一个迭代

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如何使用EvtMuteWindows事件日志进行筛选过滤

写在前面的话 在这篇文章中,我们将告诉大家如何使用EvtMute来Windows事件日志进行筛选过滤。...EvtMute这款工具允许我们使用YARA来进行攻击性操作,并已经报告给Windows事件日志事件进行过滤和筛选。...工具使用 EvtMuteHook.dll中包含是该工具核心功能,成功注入之后,它将会应用一个临时过滤器,允许报告所有事件,这个过滤器可以动态更新,而不必重新注入。...\SharpEvtMute.exe --Inject 钩子设置好之后,我们就可以开始添加过滤器了: ....复杂型过滤器 EvtMute过滤器是可以动态变更,而且无需重新注入钩子,这样可以方便广大研究人员随时轻松更新原有的过滤器以及过滤规则。

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ETL(六):筛选转换组件使用

,该目标表才能真正在目标数据库中创建; ④ 可以在目标数据库Oracle中edw用户中查看该创建表; 3)创建映射; ① 创建一个新映射; ② 将源表和目标表都拖拉进右侧灰色区域...; ③ 在源表和目标表中间加一个“筛选转换”组件; ④ 把给目标表所有字段,都先传递给这个“筛选转换”组件,进行过滤; ⑤ 编辑“筛选转换”组件,过滤得到我们想要数据...; ⑥ 再把“筛选转换”组件中字段,传递给目标表中; ⑦ 点击CTRL+S保存,当出现如下界面,证明映射创建成功; 4)定义任务 ① 创建任务; ② 选择该任务要执行映射...; ③ 修改源表连接对象; ④ 修改目标表连接对象; ⑤ 点击CTRL+S保存,当出现如下界面,证明任务创建成功; 5)创建一个工作流 ① 创建一个工作流...,在M客户端可以查看执行日志,当出现了错误都可以在这里进行原因查找; ⑥ 此时,取edw用户下查看重新生成edw_emp_deptno_30表,可以看到表中只有deptno=30记录;

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如何使用EDRSilencer通过为特定进程添加WFP筛选阻止EDR出站流量

EDRSilencer是一款专为红队研究人员设计安全监测绕过工具,该工具基于Windows筛选平台(WFP)实现其功能,可以有效地为特定进程添加WFP筛选阻止EDR出站流量。...功能介绍 1、搜索已知正在运行EDR进程,并添加WFP筛选以屏蔽其出站流量; 2、为指定进程添加WFP筛选; 3、移除该工具设置所有WFP筛选; 4、通过筛选ID移除指定WFP筛选; 5.../block/unblockall/unblock> 工具使用样例 为所有检测到EDR添加WFP筛选以屏蔽IPv4和IPv6出站流量: EDRSilencer.exe blockedr 为指定进程...(需要提供进程完整路径)添加WFP筛选以屏蔽IPv4和IPv6出站流量: EDRSilencer.exe block "C:\Windows\System32\curl.exe" 移除该工具设置全部...WFP筛选: EDRSilencer.exe unblockall 通过筛选IP移除一个指定WFP筛选: EDRSilencer.exe unblock 工具运行截图

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Nature|包含110亿种化合物虚拟库进行快速筛选

比如,使用1个CPU筛选100亿个化合物可能需要3000年以上(以每个化合物 10 秒标准速率对接)。 因此,需要更有效方法来搜索大规模化合物库。...通过重复对接和添加合成子步骤,筛选几百万个化合物来确定hits。随着每一次迭代,每个化合物大小都会随着分子变得更加完整而增加。...在被选中进行合成和体外测试21个最有希望化合物中,有6个可以与ROCK1酶结合,并在化合物浓度低于10微摩尔时进行抑制。这些化合物可以成为药物发现计划中进一步优化合适线索。...这篇论文为从现在可用大型化合物库中识别生物活性分子铺平了道路,使用计算资源和时间仅为标准虚拟筛选方法一小部分,而且成功率更高。...虽然该方法使用ICM-Pro对接并应用于Enamine REAL Space库,但基于迭代合成子筛选算法可以在任何可靠基于对接筛选平台上实现,并在任何可以表示为骨架和合成子组合超大型库中使用

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如何在矩阵行上显示“其他”【3】切片动态筛选猫腻

往期推荐 如何在矩阵行上显示“其他”【1】 如何在矩阵行上显示“其他”【2】 正文开始 上一篇文章末尾,我放了一张动图: 当年度切片变换筛选时,子类别中显示种类和顺序是不相同,但不变是...但是我们仔细审视一下这张图,猜测一下它实现原理。 首先这张图是按照子类别排序,又能够实现动态排序,必然采用是“按列排序”。...1.建立子类别和年度组合表 使用SUMMARIZE函数将子类别和年度组合列出来 子类别表2 = SUMMARIZE('data',data[子类别],'日期表'[年度]) 2.添加sales计算列...排名 RANKX是迭代函数,会将行上下文自动转为筛选上下文,因此需要将除了年度以外列都ALL掉,这样才能保证在每个年度内进行RANKX排序。...但是,按列排序并不考虑切片特殊性,它考虑是全局性,因为一旦切片进行了多选或者不选,那么就会出现桌子不知道是9还是7情况,所以干脆就不让你设置了。

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怎么直接未展开数据表进行筛选操作?含函数嵌套使用易错点。

小勤:Power Query里,怎么对表中表数据进行筛选啊? 大海:你想怎么筛选? 小勤:比如说我只要下面每个表里单价大于10部分: 大海:这么标准数据和需求,直接展开再筛选就是了啊。...小勤:能在不展开数据表情况下筛选吗?因为有时候筛选不会这么简单啊。 大海:当然是可以。...因为你可以通过表(Table)相关函数分别针对每一个表进行,比如筛选行可以用Table.SelectRows,筛选列可以用Table.SelectColumns……可以非常灵活地组合使用。...Table.SelectRows不是引用了“订单明细”那一列里每个表吗? 大海:嗯。所以,你想一下,如果你外面大表里也有一列叫“单价”,那,你说这个公式里这个单价,指的是谁呢?...大海:关于each以及函数嵌套参数用法的确是Power Query进阶一个比较难理解点,后面可能需要结合更多例子来训练。 小勤:好。我先理解一下这个。

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Power Pivot中如何不使用Filter函数进行同样效果筛选

使用TREATAS链接关系函数进行平行筛选 Calculate(Sum('表1'[成绩]),Treatas({"张三","李四","王五"},...{“张三”,”李四”,”王五”}实际上是一个列表,这个关系是并列。 5)....使用TREATAS链接关系函数进行叠加筛选 Calculate(Sum('表1'[成绩]),Treatas({("数学",90),...列顺序对应了列字段关系。也就是计算条件为:学科=数学,成绩=90以及学科=英语,成绩=85成绩之和。 我们知道了,在筛选时候可以通过列,也可以通过表来进行筛选,那是否可以有替代性方案呢?...使用现有条件列或者条件表来进行筛选 同理我们现在有一个条件表 表2 ? 那我们需要根据条件表列或者条件表整体来进行求和。 根据表条件求和 我们可以直接在上面那个公式基础上使用替换方式。

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【Python】使用 pyecharts 模块绘制动态时间线柱状图 ① ( 列表排序 | 使用 sorted 函数容器进行排序 | 使用 list.sort 函数列表进行排序 | 设置排序函数 )

一、列表排序 1、使用 sorted 函数容器进行排序 在之前博客 【Python】数据容器总结 ② ( 数据容器元素排序 | 字符串大小比较 | 字符大小比较 | 长短一样字符串大小比较 | 长短不一样字符串大小比较...) 中 , 介绍了使用 sorted 函数 容器中元素进行排序 ; sorted 函数语法如下 : sorted(iterable, key=None, reverse=False) iterable...list.sort 函数列表进行排序 在数据处理中 , 经常需要对 列表 进行排序 ; 如果在排序同时 , 还要指定排序规则 , 那么 就不能使用 sorted 函数 了 , 该函数无法指定排序规则...list.sort 函数列表进行排序 - 设置排序函数 list.sort 函数 key 参数 , 需要传入一个排序函数 , 该函数规则如下 : 指定排序函数应该 接受一个参数 并 返回一个值...list.sort 函数列表进行排序 - 设置 lambda 匿名排序函数 list.sort 函数 key 参数 , 需要传入一个排序函数 , 该函数规则如下 : 指定排序函数应该 接受一个参数

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盘点两种方法判断一个列表里面,按关键词进行筛选,留下有关键词标题

看上去并不是很难样子,这个示例代码,看上去逻辑什么也没有问题,但是结果输出就是有些不对。究其原因,因为title里边是列表,而不是字符串,需要再多加一层提取就好了。...方法一:常规读取 这个方法和示例代码中逻辑相似,只不过针对列表多取了一次,得到了列表里边具体元素,结果就出来了。...keywordlist[0] in luwen[0] and keywordlist[1] in luwen[0]: print(luwen) 运行后,代码结果如下: ​ 方法二:使用...如果你真感兴趣,这里也提供一个思路,可以将得到结果去列表中对应找索引值,将找到索引存起来,然后针对没有找到索引进行删除即可。...三、总结 本文针对列表关键词包含问题,给出了两种解决方法。虽然文中例举了两种方法,但是小编相信肯定还有其他方法,也欢迎大家在评论区谏言。

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使用webbench不同web服务进行压力测试

1、webbench在linux下安装步骤,如果安装过程失败,请检查当前用户执行权限,如果报找不到某个目录错,请自行创建指定目录: #wget http://home.tiscali.cz/~cz210552...http并发连接数,-t 表示测试多少秒,默认是30秒: # webbench -c 200 -t 60 http://www.qq.com/index.html 3、结果,pages/min表示每分钟输出页面数...,bytes/sec表示每秒传输字节数,Requests:成功处理请求数,failed:失败请求数。...Requests: 534 susceed, 0 failed. 4、查看linux服务负载,load average:后3个值分别表示 1分钟 5分钟 15分钟内系统负载情况,一般不要超过系统...服务测试处理请求数多,且系统负载低,那么就证明这台应用服务所处架构环境能承载更高并发访问量。

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DENVIS:使用具有原子和表面蛋白口袋特征图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选

传统分子对接算法使用基于物理模拟,通过估计查询蛋白配体结合方向和相应结合亲和度评分来解决这一挑战。近年来,经典和现代机器学习架构显示出超越传统对接算法潜力。...在氨基酸序列级别处理目标信息算法家族以在更高表示级别处理蛋白质数据为代价,避免了这一情况。本文介绍了深度神经虚拟筛选(DENVIS),一种使用图神经网络(GNNs)进行虚拟筛选端到端管道。...通过在两个基准数据库上进行实验,本文证明了本文方法与几种基于分子对接、基于机器学习以及基于分子对接与机器学习结合算法相比具有竞争力。...由于避免了中间分子对接步骤,DENVIS筛选时间比基于分子对接和混合模型都要快几个数量级(即更高吞吐量)。与筛选时间相当基于氨基酸序列机器学习模型相比,DENVIS性能显著提高。...我们方法一些关键元素包括使用原子和表面特征组合蛋白质口袋建模,模型集成使用,以及在模型训练期间通过人工负采样数据增强。

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盘点两种方法来判断一个列表里面,按关键词进行筛选,留下包含有关键词论文题目

看上去并不是很难样子,这个示例代码,看上去逻辑什么也没有问题,但是结果输出就是有些不对。究其原因,因为title里边是列表,而不是字符串,需要再多加一层提取就好了。...方法一:常规读取 这个方法和示例代码中逻辑相似,只不过针对列表多取了一次,得到了列表里边具体元素,结果就出来了。...keywordlist[0] in luwen[0] and keywordlist[1] in luwen[0]: print(luwen) 运行后,代码结果如下: 方法二:使用...如果你真感兴趣,这里也提供一个思路,可以将得到结果去列表中对应找索引值,将找到索引存起来,然后针对没有找到索引进行删除即可。 三、总结 我是Python进阶者。...本文基于粉丝提问,针对列表关键词包含问题,给出了两种解决方法,顺利帮助粉丝解决了问题。虽然文中例举了两种方法,但是小编相信肯定还有其他方法,也欢迎大家在评论区谏言。

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JCIM|DENVIS:使用具有原子和表面蛋白口袋特征图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选

作者提出了DENVIS(DEep Neural VIrtual Screening),一种使用具有原子和表面蛋白袋特征图神经网络进行可扩展和高通量虚拟筛选新型算法。...DENVIS使用原子和表面特征组合进行蛋白质口袋建模,实现了具有竞争力先进虚拟筛选性能。 概要 虚拟筛选计算方法可以通过识别特定目标的潜在hit,显著加快早期药物发现。...本文引入了深度神经虚拟筛选(DENVIS),这是一种使用图形神经网络(GNN)进行虚拟筛选端到端管道。...总之,DENVIS实现了与最先进虚拟筛选性能相比竞争力,同时提供了使用最少计算资源扩展到数十亿分子潜力。 方法 DENVIS通过每个目标蛋白所有可能配体进行排序来解决虚拟筛选问题。...排名是通过给定目标的所有蛋白质-配体结合亲和力得分估计来进行。DENVIS利用GNN分别提取配体和蛋白质高维连续矢量表示。

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大连理工IIAU Lab提出MS-APS:结合多源信息,动静预测自动筛选视频目标分割网络(ACM MM’21 Oral)

在视频目标分割领域中,为了规避低质量光流网络产生不可逆影响,本文设计了一个光流质量评估网络,其能够同时实现静态/运动目标预测结果自动筛选以及评估光流图中包含目标信息有效程度....为了规避低质量光流网络产生不可逆影响,本文设计了一个光流质量评估网络,其能够同时实现静态/运动目标预测结果自动筛选以及评估光流图中包含目标信息有效程度。...在第三阶段,所提出自动预测筛选网络(APS)将根据输入(RGB+SOS, RGB+Optical Flow+MOS)图评分来判断SOS和MOS预测结果哪个可信度更高。...添加APS后能明显高于SOS与MOS二者中任一个,这表明了APS确实学习到了静态或运动目标预测可信度判别能力。...2.本文是第一个旨在评估光流质量(包含运动目标有效性信息)工作。 3.本文是第一个实现自动地静态/运动预测筛选工作。

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