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我使用的是来自gplots的heatmap.2。但是，最终的图形分别显示X轴和Y轴的"Value“和"Count”。library(gplots)
heatmap.2(mat)
浏览 2提问于2012-11-22得票数 0
我需要使用表格中排序的轴绘制热图。我的数据是csv格式："1" "DR" 15.33559 14.7499 14.7556 14.32343 89.78054
浏览 2提问于2018-02-17得票数 0
我正在脚本中绘制大量的热图，并且不时地有一个具有相同值的热图。目前它没有产生任何东西..。min; returning Inf
，我本来以为地图上到处都是红色的.
浏览 1提问于2014-03-05得票数 0
我找不到一种方法来设置热图本身的轴标签大小。传递给heatmap.2的cex.lab参数无效。调用par(cex.lab = 2.5)会对图例轴标签和标题产生影响(所有这些加在一起，我无法想象如果只想更改标题……)。无论如何，我的问题是关于热图轴标签的大小。示例代码：x <- as.matrix(mtcars)
heatmap.2(
浏览 21提问于2017-02-15得票数 4
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我正在使用gplots库中的heatmap.2函数来绘制一个热图。我成功地创建了热图，但是没有多少关于轴的问题。我希望热图只显示选定的轴值。请参阅下面所附的热图。我想知道如何在X轴上只显示X76.100、X176.200、X276.300等点，以及Y轴上只显示Y76.100、Y176.200、Y276.300等点，同时在两个轴上隐藏其他点。我到目前为止使用
浏览 1提问于2014-01-08得票数 0
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我想使用gplots包中的heatmap.2函数创建一个热图。这是一个最小的例子。require(gplots)
x = matrix(rnorm(100), nrow=10)x[upper.trinrow(x)]
varcols = setNames(rainbow(nrow(x)), rownames(x))
# c
浏览 2提问于2015-12-07得票数 2
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在R中，我使用heatmap.2 (从gplots包)对一些数据进行聚类和可视化。x = matrix(runif(250), nrow= 50) h = heatmap.2(x)
'dendrogram' with 2 branchesand 5 members total, at height 3.033438
是否有一种方法可以知道属于第一个分支的列
浏览 1提问于2014-01-10得票数 1
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我使用gplots包中的heatmap.2()函数，这是一个非常好的函数。
该函数使用hlcust构造树来重新排序数据。我的问题是，hclust不能用邻居连接的方法来构造树。我的问题是，如何使用带有heatmap.2函数的Nj算法。我尝试了heatmap.2( hclustfun = func
浏览 1提问于2017-05-03得票数 0
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当使用来自heatmap.2包的R gplots函数时，可以传递参数rowsidecolors，然后在树状图旁边插入一列。我想知道是否有可能将列重新定位到排标签旁边的热图的另一边？
浏览 0提问于2013-03-27得票数 1
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亲爱的堆栈溢出社区，我已经从下面的R代码生成了一个随机矩阵上的热图。我有困难解释颜色键和直方图在左上角的情节。library("gplots")m<-matrix(rexp(200, rate=.1), ncol=20)heatmap.2
浏览 3提问于2016-08-18得票数 2
3回答
正如上面的截图所示，我在这里使用了函数heatmap.2()。如何将颜色编码栏中的“值”更改为任何其他名称 library(gplots)
<
浏览 1提问于2012-10-24得票数 4
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我从来自gplots包的增强的gplots开始。由于我想忽略集群或重新排序，根据文档和堆栈建议(例如)，我设置了适当的参数另一方面，当我使用了来自heatmap的基本stats函数，并抑制了树状图。,
浏览 1提问于2017-12-12得票数 1
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下面的代码 mydata <- mtcars distfunc<- function(x) dist(x,method="euclidean")
heatmap.2(as.matrix(mydata),dendrogram="row",trace="none", margin=c(8,9
浏览 4提问于2013-12-10得票数 5
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我在R中使用heatmap.2函数生成热图，并试图进行两次修改
colors = c(seq(0,5，length=100)，seq(5,10，length=100)，seq(10,15，length=100))数字(如1，23，直到行总数)显示在每一行的末尾，而我无法删除它。所以，我期待有任何建议来设置标度，去掉编号的Y轴.lib
浏览 3提问于2014-11-10得票数 0
当从给定矩阵在R中绘制热图时，它会自动重新排序行和列，以便可视化更容易。我希望这是有意义的。
谢谢
浏览 1提问于2017-03-27得票数 0
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我已经做了一个热图使用函数heatmap.2的gplots在R，但我不知道如何着色的分枝和勾标每组(例如。如果我把这棵树砍成四粒，就像我的第二个数字一样)。我已经检查过是否可以单独使用dendextend包对树状图进行着色。有人能帮我解决这个问题吗？更新
我希望有一个这样的</
浏览 2提问于2015-03-25得票数 6
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这里是新的R用户。我正在尝试将树状图添加到我使用ggplot2创建的热图中。我该怎么做呢？我已经将我的代码添加到下面的热图中。p <- p + scale_fill_gradient2(low=RtoBrange(100), mid="black", high=BtoGrange(100))谢谢你的帮忙
浏览 2提问于2016-08-03得票数 2
2回答
多种热图的标度热图颜色
、、、
我在heatmap.2()包中使用ggplot2函数。如何使热图之间的颜色保持一致？例如，使提供颜色的值成为绝对值，而不是相对值。
但是我无法理解ggplot函数；我一直收到一条错误消息，说“图中没有层”。在阅读了关于上述问题的评论后，我尝试使用scales::rescale()和<
浏览 4提问于2014-05-23得票数 1
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我想在R中调整heatmap.2函数代码中的跟踪参数(热图中可见的行划分)，以最终删除虚线，但保留实线。更广泛地说，我也想学习如何调整用户定义的函数。
我在这里找到了一个关于如何做到这一点的建议：。但是，当我调整代码中的任何内容(例如，跟踪参数的行类型)(或者使用函数fix()或者用另一个名称创建一个新函数，但使用相同的代码)时，我开始收到某些<
浏览 8提问于2017-10-24得票数 0
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