ggplot2 更改图例的顺序 箱线图添加误差线这个自己老是记不住,每次作图都得现查,今天的推文记录一下实现代码,方便自己以后查看。...首先是示例数据集 示例数据集还是使用鸢尾花数据集 部分如下 image.png 收下是读取数据 df<-read.csv("iris.csv") head(df) 宽格式转换为长格式 reshape2...))+ geom_boxplot() image.png 添加误差线 这里使用到的是stat_boxplot()函数 ggplot(data = dfa, aes(x=Species...stat_boxplot()函数和geom_boxplot()函数里分别加上position = position_dodge(0.5)参数,目的是使误差线和箱子的位置对应上 如果不加这两个参数,效果如下...image.png 这里还有一个疑问是 箱线图中间的线好像是中位数,如何把这个线更改为平均值呢?
箱线图展示的就是分位数,中间的线表示的是中位数,也就是50%分位数,如果非要在箱线图上画上表示平均值的线段也是可以实现的,今天介绍一下实现代码 示例数据集我们用R语言的内置数据集PlantGrowth...image.png 首先是画一个最普通的箱线图 df<-read.csv("PlantGrowth.csv") library(ggplot2) library(tidyverse) p1<-ggplot...=mean_value, yend=mean_value), color="red") image.png 这里如果不想要中位数的线的话...找到一种办法是重新画一条线把原来的中位数的线给盖住 p1+ geom_segment(data=df1, aes(x=xmin,xend=xmax,...不知道有没有比较好的办法 (猜测geom_boxplot函数里应该是有一个步骤计算中位数的,试着看看源代码,看能不能把中位数的代码改为平均值) 还有一个问题是如果是分组的箱线图那么应该如何来实现呢?
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...,用竖直线来表示 geom_path 几何路径,由一组点按顺序连接 geom_point 点 geom_pointrange 一条垂直线,线的中间有一个点(与Crossbar图和箱线图相关,可以用来表示线的范围...stat_identity 绘制原始数据,不进行统计变换 stat_qq 绘制Q-Q图 stat_quantile 连续的分位线 stat_smooth 添加平滑曲线 stat_spoke 绘制有方向的数据点...(由x和y指定位置,angle指定角度) stat_sum 绘制不重复的取值之和(通常用在三点图上) stat_summary 绘制汇总数据 stat_unique 绘制不同的数值,去掉重复的数值 stat_vline
,Q3),表示整体数据中有75%的数据少于该值; 箱体中间的线代表中位数,是一组数从小到大排列,居于正中间的单个数或正中间两个数的均值; 箱体的长度代表第三四分位数和第一四分位数的差值,也称为四分位间距...为了鼓励科研者使用箱线图,2014年的Nature Method专门推出2篇文章详细论述了使用箱线图的好处,并发布了一个在线绘制箱线图的工具[1]。...箱线图与抖动图 箱线图只展示数据的5个核心指标,可以增加原始数据点,展示更多信息。...箱线图绘制方法 R语言学习 - 箱线图(小提琴图、抖动图、区域散点图) R语言 - 箱线图一步法 ggplot2高效实用指南 (可视化脚本、工具、套路、配色) 推荐使用功能强大的在线绘图网站-ImageGP...- 富集分析和表达数据可视化 一个震撼的交互型3D可视化R包 - 可直接转ggplot2图为3D 学习津贴 单篇留言点赞数的第一位(点赞数至少为8)可获得我们赠送的在线基础课的9折优惠券。
小提琴图是通过使用密度曲线描述一组或多组的数值数据分布。每条曲线的宽度对应于各区域数据点的近似频率。...通常密度会随附一种叠加的图表类型,如箱形图,以提供一些其他的数据信息,即矩形上下边框代表第一个和第三个四分位数,中间点是中位数。 小提琴图可以用来观察数据的分布情况,也可用于比较多个组之间的分布。...每个组的密度曲线的波峰、谷线和尾部可以进行比较,以确定哪些组是相似的,哪些组是不同的。...这里的小提琴图是箱形图和核密度图的组合。...legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法
2.箱线图的组成 箱形图使用第25,50和75百分位数(也称为下四分位数(Q1),中位数(m或Q2)和上四分位数(Q3),以及四分位数范围(IQR = Q3-Q1,涵盖50%的中央数据)来反映样本的分布...垂直或水平都可以,但水平时,样本的分布要按顺序。线延伸到最极端的数据点,有不超过不超过1.5×IQR的Tukey风格,也有一直延伸到最大值和最小值的Spear风格。...用四分位数绘制箱形图的是一个公认的惯例:永远不应使用箱子或线来显示平均值、标准差或标准误。中位数不一定在箱子中心,两边延伸的线也不一定是对称的。...对于n <5,建议显示所有数据点。 ? 箱线图的组成 样本大小可以通过成比例的调整箱线图的宽度实现,如上图b中的第二个箱线图,箱子的凸凹程度表示样本量的多少。...其次,一些软件如R使用铰链hinges而非四分位数来作为箱边界,下铰链和上铰链分别是数据下半部分和上半部分的中位值,这种箱线图与基于四分位数的箱线图略有不同。
你会得到一个空白图,需要使用运算符指定图层+。 几何对象是图层的一种。是在图上添加的具体图形。...例子包括: 点(geom_point,geom_jitter为散点图,散点图等) 线(geom_line,时间序列,趋势线等) 箱线图(geom_boxplot) 所有几何对象的详细列表及使用场景,请查看...已经有了用ggplot2进行绘图所需的所有信息,可以尝试绘制一个箱线图。...箱形图提供了基于五分位数的数据分布图。框的顶部和底部代表第一和第三个四分位数(分别为25%和75%)。框内的线代表中位数(50%)。在框的上方和下方延伸到的点代表数据集的最大值和最小值。...ggbox 注意:如果要更改这些箱线图的颜色,scale_fill_manual()可以在代码中添加另一个图层,并在函数中使用values参数指定要使用的颜色。
不要使用三维饼图,只会变得更糟糕。 4、直方图:显示的是度量的计数或密度,对度量进行离散化(分组)可以使计数变得更有意义。这种图可以更好的观察度量的分布。 5、线图:对于时间趋势十分有效。...6、堆积条形图:相同字段的不同分类画在了彼此的最顶端。最大的问题在于除了堆积条形图最低端的条形,其他条形的长度很难度量。若必须使用,数量限制在2-3个,以避免堆积失调。 7、箱线图:即盒须图。...这组数据显示出: 最小值(minimum)=5 下四分位数(Q1)=7 中位数(Med--也就是Q2)=8.5 上四分位数(Q3)=9 最大值(maximum)=10 平均值...区间外的值被视为outlier显示在图上. mild outlier = 3.5 extreme outlier = 0.5 、用“〇”标出温和的异常值,用“*”标出极端的异常值。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。
相关性热图 用来显示哪些样本相似性高 每个色块表示两个样本的相关性,图片为关于对角线对称的 差异基因热图 2.散点图和箱线图 图片 箱形图(Box-plot)又称为盒须图、盒式图或箱线图,是一种用作显示一组数据分散情况资料的统计图...箱线图的绘制方法是:先找出一组数据的上边缘、下边缘、中位数和两个四分位数;然后, 连接两个四分位数画出箱体;再将上边缘和下边缘与箱体相连接,中位数在箱体中间。...箱形图的绘制步骤: 1、画数轴,度量单位大小和数据批的单位一致,起点比最小值稍小,长度比该数据批的全距稍长。 2、画一个矩形盒,两端边的位置分别对应数据批的上下四分位数(Q3和Q1)。...相同值的数据点并列标出在同一数据线位置上,不同值的数据点标在不同数据线位置上。至此一批数据的箱形图便绘出了。统计软件绘制的箱形图一般没有标出内限和外限。...图片 PCA图中,图中不同颜色代表不同分组,图上的一个小点表示一个样本,点与点之间的距离表示样本间的相似程度。离得近就更相似,离得远差异大。
split选项将页面分割为一个指定行数和列数的矩阵,然后将图形放置到该矩阵中。...型添加回归线和置信区间带 ? 传动类型定义了行分面,而气缸数则定义了列分面。...数据点的大小代表了汽车马力 的评分: library(ggplot2) mtcars$cyl<-factor(mtcars$cyl,levels=c(4,6,8), labels...这意味着你可通过鼠标对观测点进行选择和识别,并且对其中一幅图形的观测点突出显示时,其他被打开的图形将会自动突出显示相同的观测点。另外,还可通过鼠标来收集图形对象(诸如点、条、线)和箱线图的信息。...例如,你可以右击箱线图(mpg)窗口,将图形转变为一个平行坐标图(PCP)。 拖动鼠标可选择不止一个对象(点、条等),或使用Shift键通过单击选择不邻接的对象。
图表中可加入直线或曲线来辅助分析,并显示当所有数据点凝聚成单行时的模样,通常称为「最佳拟合线」或「趋势线」。 如您有一对数值数据,可使用散点图来查看其中一个变量是否在影响着另一个变量。...38、连接地图 连接地图 (Connection Map) 是用直线或曲线连接地图上不同地点的一种图表。...连接地图非常适合用来显示地理连接和关系,也可以通过研究连接地图上的连接分布或集中程度来显示空间格局。...41、箱形图 箱形图又称为「盒须图」或「箱线图」,能方便显示数字数据组的四分位数,可以垂直或水平的形式出现。...在词云图上使用颜色通常都是毫无意义的,主要是为了美观,但我们可以用颜色对单词进行分类。
当数据集很大的时候,散点图上的数据会互相重叠,此时,很难在图上清晰的显示所有的数据点。通常,我们会先对数据进行汇总给,然后再绘制散点图。这里也会介绍一些数据汇总的操作。...Q:对数据集建立拟合回归模型之后,如何将模型对应的拟合线添加到散点图上?...#使用更小的点 ) *值得注意的是:这里没有使用ggplot2,因为它无法绘制散点图矩阵,现在GGally包已经被开发出来用来作为ggplot的拓展包,其中的ggpair()函数可以用来绘制这种图。...(outlier.size = 1.5, outlier.shape = 21) *之前我们探索了一些关于箱线图的原理 箱线图是由箱和须两部分组成,箱的范围是从数据的下四分位数到上四分位数,也就是四分距...IQR IOR=25%分位-75%分位 箱中间的线是中位数,也就是50%分位数 须是箱边缘超过1.5IQR的点,超过这个点的数据点就是异常值,也就是outlier,并且画上点 这个图就展示了一个偏态数据集直方图
绘图系统 ggplot2初识 更多下期详解 引言 不同类型变量常用的图表 连续数值变量 一个数值变量可以用:柱状图,点图,箱图 两个数值变量可以用:散点图 分类变量 一个分类变量的可视化:频率表,条形图...这样就可以使用这个变量作为条件变量了 #连续型变量x将会被分割为#个区间,重叠度为proportion,每个区间内观测数相等 myx<- equal.count(x, number = #, overlap...用来分组的变量(因子) index.cond 列表,设定面板的展示顺序 key(或auto.key) 函数,添加分组变量的图例符号 layout 两元素数值型向量,设定面板的摆放方式(行数和列数);如有需要...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离,然后按图层叠加的方式作图,通过+进行叠加。...#生成数据 > ggplot(df, aes(gp, y)) #建立映射关系,此情况下仅输出基本画布信息,并没有数据点/线 ?
通过散点图我们可以很容易地可视化数据分布 Line Plot 折线图类似于散点图,但点是用连续的线按顺序连接起来的。在二维空间中寻找数据流时,折线图更加直观。...Box Plot 箱线图是一种基于五数汇总(“最小值”、第一四分位数 [Q1]、中位数、第三四分位数 [Q3] 和“最大值”)显示数据分布的标准化方法。它可以显示异常值等信息。...Hexagonal Binning 六边形分箱图是用六边形直观表示二维数值数据点密度方法。 Contour Plot 2D等高线密度图是可视化特定区域内数据点密度的另一种方法。...它可以提供了关于数据的更多见解。 Point Plot 点坐标图包含了一些名为误差线的线的折线图。 通过上图所示的点的位置来表示数值变量的集中趋势,误差线表示变量的不确定性(置信区间)。...地理空间数据可视化 地理空间数据可视化侧重于数据与其物理位置之间的关系,地理空间可视化的独特之处在于其规模都不较大。 地理可视化将变量叠加在地图上,使用纬度和经度来显示信息。
Line Plot 折线图类似于散点图,但点是用连续的线按顺序连接起来的。在二维空间中寻找数据流时,折线图更加直观。 上图可以看到weight是如何连续变化的。...Box Plot 箱线图是一种基于五数汇总(“最小值”、第一四分位数 [Q1]、中位数、第三四分位数 [Q3] 和“最大值”)显示数据分布的标准化方法。它可以显示异常值等信息。...Contour Plot 2D等高线密度图是可视化特定区域内数据点密度的另一种方法。它可以方便地找到两个数值变量的密度。例如下面的图表显示了每个阴影区域中有多少个数据点。...它可以提供了关于数据的更多见解。 Point Plot 点坐标图包含了一些名为误差线的线的折线图。 通过上图所示的点的位置来表示数值变量的集中趋势,误差线表示变量的不确定性(置信区间)。...地理空间数据可视化 地理空间数据可视化侧重于数据与其物理位置之间的关系,地理空间可视化的独特之处在于其规模都不较大。 地理可视化将变量叠加在地图上,使用纬度和经度来显示信息。
上图显示了2021年的每日温度数据 上图像显示了1990-2021年的每日温度数据 虽然我们可以在第一张图上看到细节,但第二张图由于包含了很长的时间序列数据,所以无法看到细节,一些有重要的数据点可能会被隐藏...例如,添加两条线来查看平均温度高于和低于20.5°C和-5°C的一天。...4、查看数据分布 箱形图是一种通过四分位数展示数据分布的方法。箱形图上的信息显示了局部性、扩散性和偏度,它还有助于区分异常值,即从其他观察中显著突出的数据点。我们只需一行代码就可以直接绘箱形图。...在可视化时间序列数据时,通常会考虑随时间移动的连续线。...本文展示了6种用于绘制长时间序列数据的可视化方法,通过使用交互函数和改变视角,我可以使结果变得友好并且能够帮助我们更加关注重要的数据点。 最后这些方法只是一些想法。
4.6 ggplot2程序包 ggplot2是R中用于绘图的高级程序包,它将绘图视为一种映射—数学空问到图形元索空间的映射,例如将不同的数值映射为不同的颜色或其他图形属性。...p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后,通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数,在图中绘制图形元素其他类型的图形,如直方图、箱线图等。...如点、线、多边形等,还可以用来绘制. ? 上面函数内部的基本参数都是一样的。...使用标度类的函数,相当于添加一个新的图层,因此仍然用“+”连接函数,除了基本图层ggplot()其他图层的设置都可以应用于函数qplot() 设置坐标轴样式的标度函数一般以“scale x"开头 ?...例如用stat_smooth对数据作loess平滑,在carat-price散点图上添加非线性回归线。
6.箱线图 (不同专业录取分数线箱线图) 在描述性统计中,箱线图是通过四分位数以图形方式描述数据的一种方便方法。方框图从方框(晶须)垂直延伸的线,表示上四分位数和下四分位数之外的可变性。...例如,可以有一个折线图,其中各行显示每个客户细分一段时间内的平均销售额,然后可以有另一行显示所有客户细分的组合平均值。 16.连接地图 连接地图是通过直线或曲线将放置在地图上的点连接起来绘制的。...虽然连接地图非常适合在地理位置上显示连接和关系,但它们也可以用于通过单个链接显示地图路线。连接图还可以通过连接的分布或连接在地图上的集中程度来显示空间模式。...28.折线图 (不同类型客户销售额趋势以及按照线性回归模型预测未来销量) 折线图连接视图中的各个数据点。...图上的每个圆表示一个刻度上的值,而径向分隔符(从中心跨越的线)用于每个类别或间隔(如果是直方图)。通常,刻度上的较低值从中心开始,随着每个圆的增大而增大。
它将系列中的每个数据点与表示缺失数据点的粗略近似值的拟合曲线连接起来。 plotly code 在 plotly 中,它是通过将 line_shape 指定为 spline 来实现的。...盒子的一端位于数据的第 25个百分位。第25个百分位数是绘制的线,其中 25% 的数据点位于其下方。盒子的另一端位于第 75个百分位数(其定义类似于第 25个百分位数)百分位如上)。...这些须线之外的数据点被称为“异常值”,因为它们与其余数据点有显着差异。...箱形图又称盒须图、盒式图或箱线图,是利用数据中的五个统计量:最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数与最大值来显示一组数据分布情况的统计图。...中位数(小提琴图上的一个白点) 四分位数范围(小提琴中心的黑色条)。 较低/较高的相邻值(黑色条形图)--分别定义为第一四分位数-1.5 IQR和第三四分位数+1.5 IQR。
本文介绍了数据科学家必备的五种检测异常值的方法。 简介 在统计学中,异常值是指不属于某一特定群体的数据点。它是一个与其他数值大不相同的异常观测值,与良好构成的数据组相背离。...因此,如果你有任何出现在三个标准差范围外的数据点,那么那些点就极有可能是异常值。 箱线图 箱线图是指通过分位数对数值型数据的图形化描述。这是一种非常简单但有效的异常值可视化方法。...把上下须触线看作数据分布的上下边界。任何出现在下须触线下面或上须触线上面的数据点可以被看作异常值。 四分位差是重要的,因为它用于定义异常值。...它是第三个四分位数和第一个四分位数的差(IQR=Q3-Q1). 这种情况下的异常值被定义为低于(Q1-1.5IQR)或低于箱线图下须触线或高于(Q3+1.5IQR)或高于箱线图上须触线的观测值。...低的分数值表示数据点是“正常的”,高的值表示数据中存在异常。“低”和“高”的定义取决于应用,但是一般实践表明,超过平均值三个标准差的分数被认为是异常的。算法的细节可以在这篇文章中找到。
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