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更快更强!四种Python并行库批量处理nc数据

前言 当前镜像:气象分析3.9 资源:4核16g 注意分开运行,不然会爆内存 阅读本文你将学到: 远超循环批量处理nc文件效率技巧 四种并行库基本使用与区别 wrf变量极值经纬度索引 Dask...它提供了高级数据结构,如分布式数组(Dask Array)和数据帧(Dask DataFrame),使得用户能够分布式内存处理数据,就像操作常规NumPy数组或Pandas DataFrame一...ThreadPoolExecutor ThreadPoolExecutor 是 concurrent.futures 模块一个类,用于简化线程池管理和使用。...区别:受GIL限制,CPU密集型任务可能不会带来性能提升。 joblib joblib 是一个轻量级并行处理和内存缓存库,广泛应用于机器学习和科学计算。...默认情况下,multiprocessing 使用 pickle 模块来序列化要传递对象,但 pickle 不能序列化定义交互式会话或某些特定上下文中函数。

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再见Pandas,又一数据处理神器!

Dask: Dask是一个灵活Python并行计算库,使得工作流程中平滑而简单地实现规模化。CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF需要情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您工作流在单个GPU上足够快,或者您数据单个GPU内存轻松容纳时,您会希望使用cuDF。...Dask-cuDF: 当您希望多个GPU上分布您工作流程时,或者您数据量超过了单个GPU内存容量,或者希望同时分析许多文件中分布数据时,您会希望使用Dask-cuDF。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能数据处理,特别是当数据集太大,无法容纳单个GPU内存时。

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PandasApply函数加速百倍技巧

前言 虽然目前dask,cudf等包出现,使得我们数据处理大大得到了加速,但是并不是每个人都有比较好gpu,非常多朋友仍然还在使用pandas工具包,但有时候真的很无奈,pandas许多问题我们都需要使用...apply函数来进行处理,而apply函数是非常慢,本文我们介绍如何加速apply函数600倍技巧。...所以我们可以使用Swift进行加速,使用Swift之后,相同操作机器上可以提升到7.67s。...Pandas和Numpy最快方法是将函数向量化。...如果我们操作是可以直接向量化的话,那么我们尽可能避免使用: for循环; 列表处理; apply等操作 将上面的问题转化为下面的处理之后,我们时间缩短为:421 ms。

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cuDF,能取代 Pandas 吗?

Dask: Dask是一个灵活Python并行计算库,使得工作流程中平滑而简单地实现规模化。CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF需要情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您工作流在单个GPU上足够快,或者您数据单个GPU内存轻松容纳时,您会希望使用cuDF。...Dask-cuDF: 当您希望多个GPU上分布您工作流程时,或者您数据量超过了单个GPU内存容量,或者希望同时分析许多文件中分布数据时,您会希望使用Dask-cuDF。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能数据处理,特别是当数据集太大,无法容纳单个GPU内存时。

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再见Pandas,又一数据处理神器!

Dask: Dask是一个灵活Python并行计算库,使得工作流程中平滑而简单地实现规模化。CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF需要情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您工作流在单个GPU上足够快,或者您数据单个GPU内存轻松容纳时,您会希望使用cuDF。...Dask-cuDF: 当您希望多个GPU上分布您工作流程时,或者您数据量超过了单个GPU内存容量,或者希望同时分析许多文件中分布数据时,您会希望使用Dask-cuDF。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能数据处理,特别是当数据集太大,无法容纳单个GPU内存时。

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PandasApply函数加速百倍技巧

[ 引言 ] 虽然目前dask,cudf等包出现,使得我们数据处理大大得到了加速,但是并不是每个人都有比较好gpu,非常多朋友仍然还在使用pandas工具包,但有时候真的很无奈,pandas许多问题我们都需要使用...apply函数来进行处理,而apply函数是非常慢,本文我们介绍如何加速apply函数600倍技巧。...所以我们可以使用Swift进行加速,使用Swift之后,相同操作机器上可以提升到7.67s。...Pandas和Numpy最快方法是将函数向量化。...如果我们操作是可以直接向量化的话,那么我们尽可能避免使用: for循环; 列表处理; apply等操作 将上面的问题转化为下面的处理之后,我们时间缩短为:421 ms。

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加速python科学计算方法(二)

假如你对Numpy和pandas具有一定熟悉程度,那么当使用这个库时,完全不必考虑学习难度了,因为其调用语法基本上和Numpy以及pandas内部是一,可以说是无缝兼容了。...用下图可以形象地解释这个问题: 文件这么导入之后,剩下工作几乎和在pandas中一了,这就取决你想怎么分析这些数据了。...乍一听,感觉dask好像很牛逼,是不是Numpy和pandas中所有的操作都可以dask中高效地实现呢?不存在dask也有自身瓶颈。...所以还有很多API还没有得到重写,自然也就不支持dask运算了。 可以高效运用功能主要有以下部分(太多了,我懒,所以直接官网截图): 其实基本上包括了所有常用方面了,该有的都有了。...简单地说,只要要求苛刻,用dask准没错。

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用于ETLPython数据转换工具详解

但是那些工作基本上是一次性工作或者很小数据量,使用access、DTS或是自己编个小程序搞定。可是在数据仓库系统,ETL上升到了一 定理论高度,和原来小打小闹工具使用不同了。...但在数据仓库,ETL有几个特点,一是数据同步,它不是一次性倒完数据拉到,它 是经常性活动,按照固定周期运行,甚至现在还有人提出了实时ETL概念。...优点 可扩展性— Dask可以本地计算机上运行并扩展到集群 能够处理内存不足数据集 即使相同硬件上,使用相同功能也可以提高性能(由于并行计算) 最少代码更改即可从Pandas切换 旨在与其他...优点 最小化系统内存使用,使其能够扩展到数百万行 对于SQL数据库之间进行迁移很有用 轻巧高效 缺点 通过很大程度地减少对系统内存使用,petl执行速度会变慢-建议性能很重要应用程序中使用...使用CSV等数据格式会限制延迟执行,需要将数据转换为Parquet等其他格式 缺少对数据可视化工具(如Matplotlib和Seaborn)直接支持,这两种方法都得到了Pandas良好支持 进一步阅读

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干货 | 数据分析实战案例——用户行为预测

dask库来处理海量数据,它大多数操作运行速度比常规pandas等库快十倍左右。...pandas分析结构化数据方面非常流行和强大,但是它最大限制就在于设计时没有考虑到可伸缩性。...这就是Dask DataFrame API发挥作用地方:通过为pandas提供一个包装器,可以智能将巨大DataFrame分隔成更小片段,并将它们分散到多个worker(帧),并存储磁盘而不是...dask数表处理库 import sys # 外部参数获取接口 面对海量数据,跑完一个模块代码就可以加一行gc.collect()来做内存碎片回收,Dask Dataframes与Pandas...data["Be_type"] # 使用dask时候,所有支持pandas函数后面需加.compute()才能最终执行 Be_counts = data["Be_type"].value_counts

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深入Pandas从基础到高级数据处理艺术

引言 日常数据处理工作,我们经常会面临需要从 Excel 读取数据并进行进一步操作任务。Python中有许多强大工具,其中之一是Pandas库。...本文中,我们将探讨如何使用Pandas库轻松读取和操作Excel文件。 Pandas简介 Pandas是一个用于数据处理和分析强大Python库。...最后,使用to_excel将新数据写入到文件。 数据清洗与转换 实际工作,Excel文件数据可能存在一些杂乱或规范情况。...Pandas提供了多种方法来处理缺失值,例如使用dropna()删除包含缺失值行,或使用fillna()填充缺失值。...'] = df['existing_column'].apply(custom_function) 性能优化与大数据处理 Pandas处理大数据集时可能会面临性能瓶颈,但它提供了一些优化方法,如使用Dask

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有比Pandas 更好替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

表格是存储数据最典型方式,Python环境没有比Pandas更好工具来操作数据表了。尽管Pandas具有广泛能力,但它还是有局限性。...我们想法是使用Dask来完成繁重工作,然后将缩减后更小数据集移动到pandas上进行最后处理。这就引出了第二个警告。必须使用.compute()命令具体化查询结果。...与PySpark一dask不会提示您进行任何计算。准备好所有步骤,并等待开始命令.compute()然后开始工作。 为什么我们需要compute() 才能得到结果?...但在相对较小数据上使用Spark不会产生理想速度提高。 Vaex 到目前为止,我们已经看到了将工作分散更多计算机核心之间以及群集中通常有许多计算机之间平台。...尽管Julia是一种不同语言,但它以python方式做很多事情,它还会在合适时候使用自己技巧。 另一方面,python,有许多种类库完成相同功能,这对初学者非常不友好。

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资源 | Pandas on Ray:仅需改动一行代码,即可让Pandas加速四倍

因此,高系统性能需要用明显更加陡峭学习曲线来折中。大多数现有用户可能只是想让 Pandas 运行得更快,并不希望特定硬件环境优化他们工作流。...案例,我想在 10KB 和 10TB 数据上使用相同 Pandas 脚本,并且希望 Pandas 处理这两种不同量级数据时速度一快(如果我有足够硬件资源的话)。...我们为现在 Pandas 用户设计了该系统,旨在帮助他们程序运行得更快,并且无需大量代码改动就能够进行更好扩展。这项工作最终目标就是云环境中使用 Pandas。...一旦修改了 import 语句,你就可以像使用 Pandas使用 Pandas on Ray 了。...使用 Pandas on Ray 时候,用户看到数据帧就像他们在看 Pandas 数据帧一

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Spark vs Dask Python生态下计算引擎

Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好兼容性,并且...Spark 是独立于 Python 生态另一个项目,但如果是 JVM 环境下开发,并且十分需要使用 Spark SQL 等特性,可以考虑使用Spark。...但是因为 Dask 需要支持分布式,所以有很多 api 不完全和 pandas 一致。并且涉及到排序、洗牌等操作时, pandas 很慢, dask 也会很慢。...并且可以通过 UDF 执行使用 Python 编写自定义算法。 对于深度学习支持 Dask 直接提供了方法执行 tensorflow,而tensorflow本身支持分布式。...如果你问题超出了典型 ETL + SQL,并且你希望为现有的解决方案添加灵活并行性,那么 Dask 可能是一个更好选择,特别是你已经使用 Python相关库,比如 Numpy 和 Pandas

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安利一个Python大数据分析神器!

来源:Python数据科学 作者:东哥起飞 对于Pandas运行速度提升方法,之前已经介绍过很多回了,里面经常提及Dask,很多朋友没接触过可能不太了解,今天推荐一下这个神器。...1、什么是DaskPandas和Numpy大家都不陌生了,代码运行后数据都加载到RAM,如果数据集特别大,我们就会看到内存飙升。但有时要处理数据并不适合RAM,这时候Dask来了。...官方:https://dask.org/ Dask支持PandasDataFrame和NumpyArray数据结构,并且既可在本地计算机上运行,也可以扩展到集群上运行。...这些集合类型每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区数据,以及分布群集中多个节点上数据。...Dask使用是非常清晰,如果你使用NumPy数组,就从Dask数组开始,如果你使用Pandas DataFrame,就从Dask DataFrame开始,依此类推。

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使用Dask DataFrames 解决Pandas并行计算问题

如何将20GBCSV文件放入16GBRAM。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以集群上运行,但这是另一个话题。 今天你将看到Dask处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...: 15分半钟似乎太多了,但您必须考虑到在此过程中使用了大量交换内存,因为没有办法将20+GB数据放入16GBRAM。...调用compute()函数之前,不会执行任何操作,但这就是库工作方式。...DaskAPI与Pandas是99%相同,所以你应该不会有任何切换困难。 请记住—有些数据格式Dask是不支持—例如XLS、Zip和GZ。此外,排序操作也不受支持,因为它不方便并行执行。

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让python快到飞起 | 什么是 DASK

Dask 由两部分组成: 用于并行列表、数组和 DataFrame API 集合,可原生扩展 Numpy 、NumPy 、Pandas 和 scikit-learn ,以大于内存环境或分布式环境运行...Dask 可提供低用度、低延迟和极简序列化,从而加快速度。 分布式场景,一个调度程序负责协调许多工作人员,将计算移动到正确工作人员,以保持连续、无阻塞对话。多个用户可能共享同一系统。...例如,Dask 与 Numpy 工作流程一起使用地球科学、卫星图像、基因组学、生物医学应用程序和机器学习算法实现多维数据分析。...DASK 企业应用:日益壮大市场 随着其大型机构不断取得成功,越来越多公司开始满足企业对 Dask 产品和服务需求。...Dask 拥有低代码结构、低用度执行模型,并且可轻松集成到 Python、Pandas 和 Numpy 工作流程,因此 Dask 正迅速成为每个 Python 开发者必备工具。

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八大工具,透析Python数据生态圈最新趋势!

它能帮助你将数据分成块并负责并行处理调度工作Dask是用纯Python写成,它自己也使用了一些开源Python库。...Dask有两种用法:普通用户主要使用Dask提供集合类型,用法就和NumPy跟Pandas差不多,但Dask内部会生成任务图。...现在Python生态圈中有很多库看起来功能都差不多比如说Blaze、Dask和Numba,但其实应该用在数据处理不同层面上,做一个类比的话Blaze相当于数据库查询优化器,而Dask则相当于执行查询引擎...数据并行和模型并行在现代机器学习算法中都有出现,所以Petuum针对这两种方法提供了两种平台。 Flink Flink是一个开源批处理和流处理数据平台。...对R语言来说有Shiny来简化数据科学家开发网页工作,而Pyxley相当于Python版Shiny。使用Pyxley不光不用写HTML、CSS,你还可以加入自己JavaScript来进行定制。

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八个 Python 数据生态圈前沿项目

普通用户将主要利用 Dask 提供集合类型,它用法类似于 NumPy 和 Pandas 这样常规程序库,但它内部包含了画图功能。另一方面, Dask 开发者可以直接制作图表。...Ibis 允许使用 100% 端到端用户工作流,也整合了现有的 Python 数据生态圈(Pandas, Scikit-learn, NumPy 等)。...它利用 SSP (Stale Synchronous Parallel )一致性模型,该模型允许牺牲算法正确性情况下使用异步功能。...Shiny 包给使用 R 语言数据科学家提供了一个不必通过编写Javascript, HTML 和 CSS就可以构建交互式网页应用程序框架,但是 Python 却没有类似的功能。...Pyxley 相当于 Python 版 shiny ,它简化了网页应用程序开发过程并可以通过 Flask, PyReact 和 Pandas来加入自定义 Javascript 代码。

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Python处理大数据,推荐4款加速神器

该工具能用于多个工作站,而且即使单块 CPU 情况下,它矩阵运算速度也比 NumPy(MKL)快。 ?...项目地址:https://github.com/dask/dask 官方文档:https://docs.dask.org/en/latest/ CuPy CuPy 是一个借助 CUDA GPU 库英伟达...基于 Numpy 数组实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好并行加速。CuPy 接口是 Numpy 一个镜像,并且大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...库,对于和你硬盘空间一大小表格数据集,它可以有效进行可视化、探索、分析乃至实践机器学习。...Vaex采用了内存映射、高效外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以瞬间打开它(0.052 秒)。

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