前言 当前镜像:气象分析3.9 资源:4核16g 注意分开运行,不然会爆内存 阅读本文你将学到: 远超循环批量处理nc文件效率的技巧 四种并行库的基本使用与区别 wrf变量极值经纬度索引 Dask...它提供了高级的数据结构,如分布式数组(Dask Array)和数据帧(Dask DataFrame),使得用户能够在分布式内存中处理数据,就像操作常规的NumPy数组或Pandas DataFrame一样...ThreadPoolExecutor ThreadPoolExecutor 是 concurrent.futures 模块中的一个类,用于简化线程池的管理和使用。...区别:受GIL限制,在CPU密集型任务中可能不会带来性能提升。 joblib joblib 是一个轻量级的并行处理和内存缓存库,广泛应用于机器学习和科学计算中。...默认情况下,multiprocessing 使用 pickle 模块来序列化要传递的对象,但 pickle 不能序列化定义在交互式会话或某些特定上下文中的函数。
Dask: Dask是一个灵活的Python并行计算库,使得在工作流程中平滑而简单地实现规模化。在CPU上,Dask使用Pandas来并行执行DataFrame分区上的操作。...Dask-cuDF: Dask-cuDF在需要的情况下扩展Dask,以允许其DataFrame分区使用cuDF GPU DataFrame而不是Pandas DataFrame进行处理。...何时使用cuDF和Dask-cuDF cuDF: 当您的工作流在单个GPU上足够快,或者您的数据在单个GPU的内存中轻松容纳时,您会希望使用cuDF。...Dask-cuDF: 当您希望在多个GPU上分布您的工作流程时,或者您的数据量超过了单个GPU内存的容量,或者希望同时分析许多文件中分布的数据时,您会希望使用Dask-cuDF。...Dask-cuDF允许您在分布式GPU环境中进行高性能的数据处理,特别是当数据集太大,无法容纳在单个GPU内存中时。
前言 虽然目前dask,cudf等包的出现,使得我们的数据处理大大得到了加速,但是并不是每个人都有比较好的gpu,非常多的朋友仍然还在使用pandas工具包,但有时候真的很无奈,pandas的许多问题我们都需要使用...apply函数来进行处理,而apply函数是非常慢的,本文我们就介绍如何加速apply函数600倍的技巧。...所以我们可以使用Swift进行加速,在使用Swift之后,相同的操作在我的机器上可以提升到7.67s。...Pandas和Numpy的最快方法是将函数向量化。...如果我们的操作是可以直接向量化的话,那么我们就尽可能的避免使用: for循环; 列表处理; apply等操作 在将上面的问题转化为下面的处理之后,我们的时间缩短为:421 ms。
[ 引言 ] 虽然目前dask,cudf等包的出现,使得我们的数据处理大大得到了加速,但是并不是每个人都有比较好的gpu,非常多的朋友仍然还在使用pandas工具包,但有时候真的很无奈,pandas的许多问题我们都需要使用...apply函数来进行处理,而apply函数是非常慢的,本文我们就介绍如何加速apply函数600倍的技巧。...所以我们可以使用Swift进行加速,在使用Swift之后,相同的操作在我的机器上可以提升到7.67s。...Pandas和Numpy的最快方法是将函数向量化。...如果我们的操作是可以直接向量化的话,那么我们就尽可能的避免使用: for循环; 列表处理; apply等操作 在将上面的问题转化为下面的处理之后,我们的时间缩短为:421 ms。
假如你对Numpy和pandas具有一定的熟悉程度,那么当使用这个库时,完全不必考虑学习难度了,因为其调用语法基本上和Numpy以及pandas内部是一样的,可以说是无缝兼容了。...用下图可以形象地解释这个问题: 文件这么导入之后,剩下的工作几乎和在pandas中一样了,这就取决你想怎么分析这些数据了。...乍一听,感觉dask好像很牛逼,是不是Numpy和pandas中所有的操作都可以在dask中高效地实现呢?不存在的。dask也有自身的瓶颈。...所以还有很多API还没有得到重写,自然也就不支持在dask中运算了。 可以高效运用的功能主要有以下部分(太多了,我懒,所以就直接官网截图的): 其实基本上包括了所有常用的方面了,该有的都有了。...简单地说,只要要求不苛刻,用dask准没错。
但是那些工作基本上是一次性工作或者很小数据量,使用access、DTS或是自己编个小程序搞定。可是在数据仓库系统中,ETL上升到了一 定的理论高度,和原来小打小闹的工具使用不同了。...但在数据仓库中,ETL有几个特点,一是数据同步,它不是一次性倒完数据就拉到,它 是经常性的活动,按照固定周期运行的,甚至现在还有人提出了实时ETL的概念。...优点 可扩展性— Dask可以在本地计算机上运行并扩展到集群 能够处理内存不足的数据集 即使在相同的硬件上,使用相同的功能也可以提高性能(由于并行计算) 最少的代码更改即可从Pandas切换 旨在与其他...优点 最小化系统内存的使用,使其能够扩展到数百万行 对于在SQL数据库之间进行迁移很有用 轻巧高效 缺点 通过很大程度地减少对系统内存的使用,petl的执行速度会变慢-不建议在性能很重要的应用程序中使用...使用CSV等数据格式会限制延迟执行,需要将数据转换为Parquet等其他格式 缺少对数据可视化工具(如Matplotlib和Seaborn)的直接支持,这两种方法都得到了Pandas的良好支持 进一步阅读
dask库来处理海量数据,它的大多数操作的运行速度比常规pandas等库快十倍左右。...pandas在分析结构化数据方面非常的流行和强大,但是它最大的限制就在于设计时没有考虑到可伸缩性。...这就是Dask DataFrame API发挥作用的地方:通过为pandas提供一个包装器,可以智能的将巨大的DataFrame分隔成更小的片段,并将它们分散到多个worker(帧)中,并存储在磁盘中而不是...dask中的数表处理库 import sys # 外部参数获取接口 面对海量数据,跑完一个模块的代码就可以加一行gc.collect()来做内存碎片回收,Dask Dataframes与Pandas...data["Be_type"] # 使用dask的时候,所有支持的原pandas的函数后面需加.compute()才能最终执行 Be_counts = data["Be_type"].value_counts
引言 在日常的数据处理工作中,我们经常会面临需要从 Excel 中读取数据并进行进一步操作的任务。Python中有许多强大的工具,其中之一是Pandas库。...在本文中,我们将探讨如何使用Pandas库轻松读取和操作Excel文件。 Pandas简介 Pandas是一个用于数据处理和分析的强大Python库。...最后,使用to_excel将新数据写入到文件中。 数据清洗与转换 在实际工作中,Excel文件中的数据可能存在一些杂乱或不规范的情况。...Pandas提供了多种方法来处理缺失值,例如使用dropna()删除包含缺失值的行,或使用fillna()填充缺失值。...'] = df['existing_column'].apply(custom_function) 性能优化与大数据处理 Pandas在处理大数据集时可能会面临性能瓶颈,但它提供了一些优化方法,如使用Dask
表格是存储数据的最典型方式,在Python环境中没有比Pandas更好的工具来操作数据表了。尽管Pandas具有广泛的能力,但它还是有局限性的。...我们的想法是使用Dask来完成繁重的工作,然后将缩减后的更小数据集移动到pandas上进行最后的处理。这就引出了第二个警告。必须使用.compute()命令具体化查询结果。...与PySpark一样,dask不会提示您进行任何计算。准备好所有步骤,并等待开始命令.compute()然后开始工作。 为什么我们需要compute() 才能得到结果?...但在相对较小的数据上使用Spark不会产生理想的速度提高。 Vaex 到目前为止,我们已经看到了将工作分散在更多计算机核心之间以及群集中通常有许多计算机之间的平台。...尽管Julia是一种不同的语言,但它以python的方式做很多事情,它还会在合适的时候使用自己的技巧。 另一方面,在python中,有许多种类库完成相同的功能,这对初学者非常不友好。
因此,高系统性能需要用明显更加陡峭的学习曲线来折中。大多数现有用户可能只是想让 Pandas 运行得更快,并不希望在特定的硬件环境中优化他们的工作流。...在我的案例中,我想在 10KB 和 10TB 的数据上使用相同的 Pandas 脚本,并且希望 Pandas 在处理这两种不同量级的数据时速度一样快(如果我有足够的硬件资源的话)。...我们为现在的 Pandas 用户设计了该系统,旨在帮助他们的程序运行得更快,并且无需大量代码改动就能够进行更好的扩展。这项工作的最终目标就是在云环境中使用 Pandas。...一旦修改了 import 语句,你就可以像使用 Pandas 一样使用 Pandas on Ray 了。...使用 Pandas on Ray 的时候,用户看到的数据帧就像他们在看 Pandas 数据帧一样。
Spark vs Dask 首先先上Dask和Spark的架构设计图~ [设计架构] 生态 Dask 对于 Python 生态中的 Numpy、Pandas、Scikit-learn等有很好的兼容性,并且在...Spark 是独立于 Python 生态的另一个项目,但如果是在 JVM 环境下开发,并且十分需要使用 Spark SQL 等特性,可以考虑使用Spark。...但是因为 Dask 需要支持分布式,所以有很多 api 不完全和 pandas 中的一致。并且在涉及到排序、洗牌等操作时,在 pandas 中很慢,在 dask 中也会很慢。...并且可以通过 UDF 执行使用 Python 编写的自定义算法。 对于深度学习的支持 Dask 直接提供了方法执行 tensorflow,而tensorflow本身就支持分布式。...如果你的问题超出了典型的 ETL + SQL,并且你希望为现有的解决方案添加灵活的并行性,那么 Dask 可能是一个更好的选择,特别是你已经在使用 Python相关的库,比如 Numpy 和 Pandas
来源:Python数据科学 作者:东哥起飞 对于Pandas运行速度的提升方法,之前已经介绍过很多回了,里面经常提及Dask,很多朋友没接触过可能不太了解,今天就推荐一下这个神器。...1、什么是Dask? Pandas和Numpy大家都不陌生了,代码运行后数据都加载到RAM中,如果数据集特别大,我们就会看到内存飙升。但有时要处理的数据并不适合RAM,这时候Dask来了。...官方:https://dask.org/ Dask支持Pandas的DataFrame和NumpyArray的数据结构,并且既可在本地计算机上运行,也可以扩展到在集群上运行。...这些集合类型中的每一个都能够使用在RAM和硬盘之间分区的数据,以及分布在群集中多个节点上的数据。...Dask的使用是非常清晰的,如果你使用NumPy数组,就从Dask数组开始,如果你使用Pandas DataFrame,就从Dask DataFrame开始,依此类推。
如何将20GB的CSV文件放入16GB的RAM中。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大的问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...大多数Dask API与Pandas相同,但是Dask可以在所有CPU内核上并行运行。它甚至可以在集群上运行,但这是另一个话题。 今天你将看到Dask在处理20GB CSV文件时比Pandas快多少。...: 15分半钟似乎太多了,但您必须考虑到在此过程中使用了大量交换内存,因为没有办法将20+GB的数据放入16GB的RAM中。...在调用compute()函数之前,不会执行任何操作,但这就是库的工作方式。...Dask的API与Pandas是99%相同的,所以你应该不会有任何切换困难。 请记住—有些数据格式在Dask中是不支持的—例如XLS、Zip和GZ。此外,排序操作也不受支持,因为它不方便并行执行。
Dask 由两部分组成: 用于并行列表、数组和 DataFrame 的 API 集合,可原生扩展 Numpy 、NumPy 、Pandas 和 scikit-learn ,以在大于内存环境或分布式环境中运行...Dask 可提供低用度、低延迟和极简的序列化,从而加快速度。 在分布式场景中,一个调度程序负责协调许多工作人员,将计算移动到正确的工作人员,以保持连续、无阻塞的对话。多个用户可能共享同一系统。...例如,Dask 与 Numpy 工作流程一起使用,在地球科学、卫星图像、基因组学、生物医学应用程序和机器学习算法中实现多维数据分析。...DASK 在企业中的应用:日益壮大的市场 随着其在大型机构中不断取得成功,越来越多的公司开始满足企业对 Dask 产品和服务的需求。...Dask 拥有低代码结构、低用度执行模型,并且可轻松集成到 Python、Pandas 和 Numpy 工作流程中,因此 Dask 正迅速成为每个 Python 开发者的必备工具。
它能帮助你将数据分成块并负责并行处理的调度工作。Dask是用纯Python写成的,它自己也使用了一些开源的Python库。...Dask有两种用法:普通用户主要使用Dask提供的集合类型,用法就和NumPy跟Pandas的差不多,但Dask内部会生成任务图。...现在Python生态圈中有很多库看起来功能都差不多比如说Blaze、Dask和Numba,但其实应该用在数据处理的不同层面上,做一个类比的话Blaze就相当于数据库中的查询优化器,而Dask则相当于执行查询的引擎...数据并行和模型并行在现代机器学习算法中都有出现,所以Petuum就针对这两种方法提供了两种平台。 Flink Flink是一个开源的批处理和流处理数据平台。...对R语言来说有Shiny来简化数据科学家开发网页的工作,而Pyxley就相当于Python版的Shiny。使用Pyxley不光不用写HTML、CSS,你还可以加入自己的JavaScript来进行定制。
普通用户将主要利用 Dask 提供的集合类型,它的用法类似于 NumPy 和 Pandas 这样的常规程序库,但它内部包含了画图功能。另一方面, Dask 开发者可以直接制作图表。...Ibis 允许使用 100% 的端到端用户工作流,也整合了现有的 Python 数据生态圈(Pandas, Scikit-learn, NumPy 等)。...它利用 SSP (Stale Synchronous Parallel )一致性模型,该模型允许在不牺牲算法正确性的情况下使用异步功能。...Shiny 包给使用 R 语言的数据科学家提供了一个不必通过编写Javascript, HTML 和 CSS就可以构建交互式网页应用程序的框架,但是在 Python 中却没有类似的功能。...Pyxley 就相当于 Python 版的 shiny ,它简化了网页应用程序开发的过程并可以通过 Flask, PyReact 和 Pandas来加入自定义的 Javascript 代码。
Dask Dask在大于内存的数据集上提供多核和分布式并行执行。...在Dask中,一个DataFrame是一个大型且并行的DataFrame,由许多较小的 pandas DataFrames组成,沿索引拆分。...Modin Modin是一个多进程的Dataframe库,可以加速Pandas的工作流程。多进程意味着,如果在多核的计算机上查询速度就会成倍的提升。...Modin具有与pandas相同的API,使用上只需在import导入时修改一下,其余操作一模一样。...Polars Polars是使用 Apache Arrow Columnar Format 作为内存模型在 Rust 中实现的速度极快的 DataFrames 库。
该工具能用于多个工作站,而且即使在单块 CPU 的情况下,它的矩阵运算速度也比 NumPy(MKL)快。 ?...项目地址:https://github.com/dask/dask 官方文档:https://docs.dask.org/en/latest/ CuPy CuPy 是一个借助 CUDA GPU 库在英伟达...基于 Numpy 数组的实现,GPU 自身具有的多个 CUDA 核心可以促成更好的并行加速。CuPy 接口是 Numpy 的一个镜像,并且在大多情况下,它可以直接替换 Numpy 使用。...库,对于和你硬盘空间一样大小的表格数据集,它可以有效进行可视化、探索、分析乃至实践机器学习。...Vaex采用了内存映射、高效的外核算法和延迟计算等概念来获得最佳性能(不浪费内存),一旦数据存为内存映射格式,即便它的磁盘大小超过 100GB,用 Vaex 也可以在瞬间打开它(0.052 秒)。
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