笔者最近需要使用pyspark进行数据整理,于是乎给自己整理一份使用指南。pyspark.dataframe跟pandas的差别还是挺大的。
Spark无疑是当今数据科学和大数据领域最流行的技术之一。尽管它是用Scala开发的,并在Java虚拟机(JVM)中运行,但它附带了Python绑定,也称为PySpark,其API深受panda的影响。在功能方面,现代PySpark在典型的ETL和数据处理方面具有与Pandas相同的功能,例如groupby、聚合等等。
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Pandas 是每位数据科学家和 Python 数据分析师都熟悉的工具库,它灵活且强大具备丰富的功能,但在处理大型数据集时,它是非常受限的。
本文通过介绍Apache Spark在Python中的应用来讲解如何利用PySpark包执行常用函数来进行数据处理工作。
本文中,云朵君将和大家一起学习如何从 PySpark DataFrame 编写 Parquet 文件并将 Parquet 文件读取到 DataFrame 并创建视图/表来执行 SQL 查询。还要学习在 SQL 的帮助下,如何对 Parquet 文件对数据进行分区和检索分区以提高性能。
昨日推文PySpark环境搭建和简介,今天开始介绍PySpark中的第一个重要组件SQL/DataFrame,实际上从名字便可看出这是关系型数据库SQL和pandas.DataFrame的结合体,功能也几乎恰是这样,所以如果具有良好的SQL基本功和熟练的pandas运用技巧,学习PySpark SQL会感到非常熟悉和舒适。
PySpark 在 DataFrameReader 上提供了csv("path")将 CSV 文件读入 PySpark DataFrame 并保存或写入 CSV 文件的功能dataframeObj.write.csv("path"),在本文中,云朵君将和大家一起学习如何将本地目录中的单个文件、多个文件、所有文件读入 DataFrame,应用一些转换,最后使用 PySpark 示例将 DataFrame 写回 CSV 文件。
将 dataframe 利用 pyspark 列合并为一行,类似于 sql 的 GROUP_CONCAT 函数。例如如下 dataframe :
在join操作中,我们得到一个有缺失值的dataframe,接下来将对这个带有缺失值的dataframe进行操作
在本期中,我们将讨论如何执行“获取/扫描”操作以及如何使用PySpark SQL。之后,我们将讨论批量操作,然后再讨论一些故障排除错误。在这里阅读第一个博客。
官方文档链接:https://spark.apache.org/docs/2.2.0/ml-features.html
DataFrame可以翻译成数据框,让Spark具备了处理大规模结构化数据的能力。
现在,要成为一个合格的数据分析师,你说你不会Python,大概率会被江湖人士耻笑。
在这篇文章中,我们将讨论三个令人敬畏的大数据Python工具,以使用生产数据提高您的大数据编程技能。
PySpark SQL 提供 read.json("path") 将单行或多行(多行)JSON 文件读取到 PySpark DataFrame 并 write.json("path") 保存或写入 JSON 文件的功能,在本教程中,您将学习如何读取单个文件、多个文件、目录中的所有文件进入 DataFrame 并使用 Python 示例将 DataFrame 写回 JSON 文件。
在 Spark 中,除了 RDD 这种数据容器外,还有一种更容易操作的一个分布式数据容器 DateFrame,它更像传统关系型数据库的二维表,除了包括数据自身以外还包括数据的结构信息(Schema),这就可以利用类似 SQL 的语言来进行数据访问。
在电商中,了解用户在不同品类的各个产品的购买力是非常重要的!这将有助于他们为不同产品的客户创建个性化的产品。在这篇文章中,笔者在真实的数据集中手把手实现如何预测用户在不同品类的各个产品的购买行为。
PySpark作为工业界常用于处理大数据以及分布式计算的工具,特别是在算法建模时起到了非常大的作用。PySpark如何建模呢?这篇文章手把手带你入门PySpark,提前感受工业界的建模过程!
本文主要以基于AWS 搭建的EMR spark 托管集群,使用pandas pyspark 对合作单位的业务数据进行ETL ---- EXTRACT(抽取)、TRANSFORM(转换)、LOAD(加载) 等工作为例介绍大数据数据预处理的实践经验,很多初学的朋友对大数据挖掘,数据分析第一直观的印象,都只是业务模型,以及组成模型背后的各种算法原理。往往忽视了整个业务场景建模过程中,看似最普通,却又最精髓的数据预处理或者叫数据清洗过程。
关于PySpark,我们知道它是Python调用Spark的接口,我们可以通过调用Python API的方式来编写Spark程序,它支持了大多数的Spark功能,比如SparkDataFrame、Spark SQL、Streaming、MLlib等等。只要我们了解Python的基本语法,那么在Python里调用Spark的力量就显得十分easy了。下面我将会从相对宏观的层面介绍一下PySpark,让我们对于这个神器有一个框架性的认识,知道它能干什么,知道去哪里寻找问题解答,争取看完这篇文章可以让我们更加丝滑地入门PySpark。话不多说,马上开始!
PySpark StructType 和 StructField 类用于以编程方式指定 DataFrame 的schema并创建复杂的列,如嵌套结构、数组和映射列。StructType是StructField的集合,它定义了列名、列数据类型、布尔值以指定字段是否可以为空以及元数据。
本文主要以基于AWS 搭建的EMR spark 托管集群,使用pandas pyspark 对合作单位的业务数据进行ETL —- EXTRACT(抽取)、TRANSFORM(转换)、LOAD(加载) 等工作为例介绍大数据数据预处理的实践经验,很多初学的朋友对大数据挖掘,数据分析第一直观的印象,都只是业务模型,以及组成模型背后的各种算法原理。往往忽视了整个业务场景建模过程中,看似最普通,却又最精髓的数据预处理或者叫数据清洗过程。
Spark成功的实现了当年的承诺,让数据处理变得更容易,现在,雄心勃勃的Databricks公司展开了一个新的愿景:让深度学习变得更容易。 当然牛好吹,也是要做些实际行动的,所有便有了spark-deep-learning项目。这件事情已经有很多人尝试做了,但显然太浅了,DB公司则做的更深入些。
pyspark读取hive数据非常简单,因为它有专门的接口来读取,完全不需要像hbase那样,需要做很多配置,pyspark提供的操作hive的接口,使得程序可以直接使用SQL语句从hive里面查询需要的数据,代码如下:
01 前 言 Spark成功的实现了当年的承诺,让数据处理变得更容易,现在,雄心勃勃的Databricks公司展开了一个新的愿景:让深度学习变得更容易。 当然牛好吹,也是要做些实际行动的,所有便有了spark-deep-learning(https://github.com/databricks/spark-deep-learning)项目。这件事情已经有很多人尝试做了,但显然太浅了,DB公司则做的更深入些。 02 原 理 要做深度学习,肯定不能离开TensorFlow, MXNet之类的。 spark
在PySpark中包含了两种机器学习相关的包:MLlib和ML,二者的主要区别在于MLlib包的操作是基于RDD的,ML包的操作是基于DataFrame的。根据之前我们叙述过的DataFrame的性能要远远好于RDD,并且MLlib已经不再被维护了,所以在本专栏中我们将不会讲解MLlib。
Spark SQL中,SQLContext、HiveContext都是用来创建DataFrame和Dataset主要入口点,二者区别如下:
PySpark是Python和Apache Spark的结合,是一种用于大数据处理的强大工具。它提供了使用Python编写大规模数据处理和分析代码的便利性和高效性。本篇博客将向您介绍PySpark的基本概念以及如何入门使用它。
parquet数据:列式存储结构,由Twitter和Cloudera合作开发,相比于行式存储,其特点是:
Pandas作为大数据分析最流行的框架之一。用好Pandas就像大数据工程师用好SQL用好Excel一样重要。如果你打算学习 Python 中的数据分析、机器学习或数据科学工具,大概率绕不开Pandas库。Pandas 是一个用于 Python 数据操作和分析的开源库。
编者注:完整文章首发于作者博客 http://huboqiang.cn/ 在这篇文章中,作者利用大数据平台 IBM data science 对生信技能树论坛的一道生物信息入门题进行了分析。 由于文章篇幅较长,我们将分为上篇和下篇分别进行推送。 其中上篇部分主要为大家介绍IBM data science 平台相关知识;下篇则为大家具体展示如何通过该平台运用pySpark来解决我们具体的问题。 希望对那些苦于没有自己的服务器而无法进行生物数据分析学习的朋友有所启发。同时,这篇文章也是非常好的大
本文中我们将探讨数据框的概念,以及它们如何与PySpark一起帮助数据分析员来解读大数据集。
大数据(Big Data)是指无法在一定时间内用常规软件工具对其内容进行抓取、管理和处理的数据集合。大数据技术,是指从各种各样类型的数据中,快速获得有价值信息的能力。
实用工具:线性代数,统计,数据处理等工具 特征工程:特征提取,特征转换,特征选择 常用算法:分类,回归,聚类,协同过滤,降维 模型优化:模型评估,参数优化。
在Spark中, DataFrame 是组织成 命名列[named colums]的分布时数据集合。它在概念上等同于关系数据库中的表或R/Python中的数据框,但在幕后做了更丰富的优化。DataFrames可以从多种来源构建,例如:结构化数据文件、Hive中的表、外部数据库或现有RDD.
假设你有1亿条记录,有时候用到75%数据量,有时候用到10%。也许你该考虑10%的使用率是不是导致不能发挥最优性能模型的最关键原因。
笔者最近在尝试使用PySpark,发现pyspark.dataframe跟pandas很像,但是数据操作的功能并不强大。由于,pyspark环境非自建,别家工程师也不让改,导致本来想pyspark环境跑一个随机森林,用 《Comprehensive Introduction to Apache Spark, RDDs & Dataframes (using PySpark) 》中的案例,也总是报错…把一些问题进行记录。
数据清理是数据分析过程中的关键步骤,它涉及识别缺失值、重复行、异常值和不正确的数据类型。获得干净可靠的数据对于准确的分析和建模非常重要。
PySpark和Pandas之间改进性能和互操作性的其核心思想是将Apache Arrow作为序列化格式,以减少PySpark和Pandas之间的开销。
看过近期推文的读者,想必应该知道笔者最近在开一个数据分析常用工具对比的系列,主要是围绕SQL、Pandas和Spark三大个人常用数据分析工具,目前已完成了基本简介、数据读取、选取特定列、常用数据操作以及窗口函数等5篇文章。当然,这里的Spark是基于Scala语言版本,所以这3个工具实际分别代表了SQL、Python和Scala三种编程语言,而在不同语言中自然是不便于数据统一和交互的。
传统的机器学习算法,由于技术和单机存储的限制,比如使用scikit-learn,只能在少量数据上使用。即以前的统计/机器学习依赖于数据抽样。但实际过程中样本往往很难做好随机,导致学习的模型不是很准确,在测试数据上的效果也可能不太好。随着 HDFS(Hadoop Distributed File System) 等分布式文件系统出现,存储海量数据已经成为可能。在全量数据上进行机器学习也成为了可能,这顺便也解决了统计随机性的问题。然而,由于 MapReduce 自身的限制,使得使用 MapReduce 来实现分布式机器学习算法非常耗时和消耗磁盘IO。因为通常情况下机器学习算法参数学习的过程都是迭代计算的,即本次计算的结果要作为下一次迭代的输入,这个过程中,如果使用 MapReduce,我们只能把中间结果存储磁盘,然后在下一次计算的时候从新读取,这对于迭代频发的算法显然是致命的性能瓶颈。引用官网一句话:Apache Spark™ is a unified analytics engine for large-scale data processing.Spark, 是一种"One Stack to rule them all"的大数据计算框架,期望使用一个技术堆栈就完美地解决大数据领域的各种计算任务.
众所周知,Spark 框架主要是由 Scala 语言实现,同时也包含少量 Java 代码。Spark 面向用户的编程接口,也是 Scala。然而,在数据科学领域,Python 一直占据比较重要的地位,仍然有大量的数据工程师在使用各类 Python 数据处理和科学计算的库,例如 numpy、Pandas、scikit-learn 等。同时,Python 语言的入门门槛也显著低于 Scala。
在讲Spark SQL前,先解释下这个模块。这个模块是Spark中用来处理结构化数据的,提供一个叫SparkDataFrame的东西并且自动解析为分布式SQL查询数据。我们之前用过Python的Pandas库,也大致了解了DataFrame,这个其实和它没有太大的区别,只是调用的API可能有些不同罢了。
用过Python做过机器学习的同学对Python当中pandas当中的DataFrame应该不陌生,如果没做过也没有关系,我们简单来介绍一下。DataFrame翻译过来的意思是数据帧,但其实它指的是一种特殊的数据结构,使得数据以类似关系型数据库当中的表一样存储。使用DataFrame我们可以非常方便地对整张表进行一些类似SQL的一些复杂的处理。Apache Spark在升级到了1.3版本之后,也提供了类似功能的DataFrame,也就是大名鼎鼎的SparkSQL。
pyspark: • pyspark = python + spark • 在pandas、numpy进行数据处理时,一次性将数据读入 内存中,当数据很大时内存溢出,无法处理;此外,很 多执行算法是单线程处理,不能充分利用cpu性能 spark的核心概念之一是shuffle,它将数据集分成数据块, 好处是: • 在读取数据时,不是将数据一次性全部读入内存中,而 是分片,用时间换空间进行大数据处理 • 极大的利用了CPU资源 • 支持分布式结构,弹性拓展硬件资源。
这个并不是书籍里的章节,因为书籍中的 pandas 节奏太快了,基本都是涉及很多中高级的操作,好容易把小伙伴给劝退。我这里先出几期入门的教程,然后再回到书籍里的教程。这几章节作为入门,书籍作为进阶。
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