在Linux Mint 17.1上执行此操作。
当我尝试的时候:
pip install hdf5
我得到了错误
"Could not find a version that satisfies the requirement hdf5 (from versions: ) No matching distribution found for hdf5"
从长远来看,我正在尝试安装netcdf4,但在安装hdf5之前,我无法做到这一点。假设从上周我尝试使用netcdf4开始,我应该使用pip install netcdf4,err hdf5...at,至少在hdf5的情况下。
如
我正在尝试将常规python对象(几个键/值对)写入hdf5文件。我使用的是h5py 2.7.0和python3.5.2.3。
现在,我正试图将一个完整的对象写入dataset:
#...read dataset, store one data object in 'obj'
#obj could be something like: {'value1': 0.09, 'state': {'angle_rad': 0.034903, 'value2': 0.83322}, 'value3': 0.3
我正在做一个涉及网络消息队列(msgpack,zmq,...)的项目。在RHEL6.3 (x86_64)系统上。
放弃后,我返回到我的代码,不知何故,我设法破坏了我的hdf5 / h5py安装- h5py在导入时找不到libhdf5.so.7。我立即在RHEL6.3 (x86_64)上的/usr/local/hdf5中重新安装了hdf5-1.8.9,如下所示:
./configure --prefix=/usr/local/hdf5
make
make check
sudo make install
make check install
它似乎工作得很好。然后我重新安装了h5py (在Pyth
问题是
如何将数据从N x N x N x... h5py数据集复制到1D标准Python列表,而不对数据进行中间复制?
我可以想出几种不同的方法来用中间拷贝来完成这个任务。例如:
import h5py
import numpy as np
# initialize list, put some initial data in it
myList = ['foo']
# open up an h5py dataset from a file on disk
myFile = h5py.File('/path-to-my-data', 'r'
我已经使用下面的代码使用H5PY在python中打开了一些在MATLAB中生成的HDF5文件:
import h5py as h5
data='dataset.mat'
f=h5.File(data, 'r')
然而,我得到了以下错误:
OSError: Unable to open file (File signature not found)
我已经检查了我试图打开的文件是7.3版本的MAT文件,并且是HDF5格式。事实上,我以前已经使用H5PY成功地打开了相同的文件。我已经确认文件存在并且可以访问,所以我不确定错误是从哪里来的。任何建议都将非常感谢,提前感
这可能是个问题。我试图从本地文件中加载conda环境,并得到了大量冲突错误,如下所示:
UnsatisfiableError: The following specifications were found to be incompatible with each other:
Output in format: Requested package -> Available versions
Package scipy conflicts for:
keras-base==2.2.2=py36_0 -> scipy[version='>=0.14']
ke
我有一个小的python程序,它使用h5py模块创建hdf5文件。我想编写一个python模块来处理hdf5文件中的数据。我怎么能这么做呢?
更具体地说,我可以将numpy数组设置为PyArrayObject并使用PyArg_ParseTuple读取它们。这样,我就可以在编写python模块时从numpy数组中读取元素。如何读取hdf5文件以访问单个元素?
更新:感谢你下面的回答。我需要从C中读取hdf5文件,而不是从Python中-我知道如何做到这一点。例如:
import h5py as t
import numpy as np
f=t.File('\tmp\tmp.h5'
我使用vaex.from_csv()将csv转换为hdf5。 import vaex
vaex.from_csv("/Users/xxxx/development/vaex/dataAN/testdata1.csv", convert=True) 到达 IPython/core/interactiveshell.py:3331: DtypeWarning: Columns (53,55) have mixed types.Specify dtype option on import or set low_memory=False.
exec(code_obj, sel
我想通过使用阅读h5py
In [117]: def printname(name):
...: print(name)
...:
In [118]: data['/digitStruct'].visit(printname)
bbox
name
数据中有两个组,bbox和name,name是对应于文件名数据的组名,bbox是对应于宽度、高度、顶部、左边和标签数据的组名。
如何访问name和bbox组中的所有数据?
我尝试过使用中的以下代码,但它只是返回HDF5对象引用。
In [119]: for i in data['/digitStr
每次从HDF5文件加载模型时,我都会收到这个错误。下面是我的错误跟踪。
Traceback (most recent call last):
File "D:\Anaconda3New\Datasets\train.py", line 63, in <module>
model = load_model(args["model"])
File "D:\Anaconda3New\lib\site-packages\keras\engine\saving.py", line 419, in
load_model
m