首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

使用R在一个面板中绘制贝叶斯先验和后验分布的解释

贝叶斯统计学是一种基于贝叶斯定理的统计推断方法,它允许我们在观测到数据之前使用先验知识来描述参数的不确定性,并通过观测数据来更新我们对参数的信念,得到后验分布。在R中,我们可以使用一些包来实现这个过程,如bayesplotggplot2

首先,我们需要定义先验分布。先验分布是对参数的初始信念,通常基于领域知识或以往的经验。常见的先验分布包括均匀分布、正态分布和伽马分布等。我们可以使用R中的函数来生成这些分布,如runif()rnorm()rgamma()

接下来,我们观测到一些数据,并使用贝叶斯定理来更新我们对参数的信念,得到后验分布。贝叶斯定理可以表示为:

后验分布 ∝ 先验分布 × 似然函数

其中,似然函数表示观测数据在给定参数下的概率密度函数。在R中,我们可以使用贝叶斯推断包如rstanJAGSbrms来进行后验分布的计算。

一旦我们得到了先验分布和后验分布,我们可以使用R中的绘图包来将它们可视化在一个面板中。例如,我们可以使用bayesplot包中的mcmc_areas()函数来绘制先验分布和后验分布的区域图。这个函数可以接受先验分布和后验分布的参数,并自动计算并绘制区域图。

另外,我们还可以使用ggplot2包来自定义绘图。我们可以使用geom_density()函数来绘制先验分布和后验分布的密度曲线,使用geom_histogram()函数来绘制直方图,或使用geom_line()函数来绘制连续变量的线图。

总结起来,使用R在一个面板中绘制贝叶斯先验和后验分布的步骤包括:定义先验分布、观测数据、计算后验分布,然后使用绘图包如bayesplotggplot2来可视化先验分布和后验分布。这样可以帮助我们更好地理解参数的不确定性和推断结果。

腾讯云相关产品和产品介绍链接地址:

  • 腾讯云容器服务(Tencent Kubernetes Engine,TKE):https://cloud.tencent.com/product/tke
  • 腾讯云人工智能(AI):https://cloud.tencent.com/product/ai
  • 腾讯云物联网(IoT):https://cloud.tencent.com/product/iotexplorer
  • 腾讯云移动开发(移动应用托管):https://cloud.tencent.com/product/baas
  • 腾讯云数据库(云数据库 MySQL 版):https://cloud.tencent.com/product/cdb
  • 腾讯云存储(对象存储 COS):https://cloud.tencent.com/product/cos
  • 腾讯云区块链(区块链服务 BaaS):https://cloud.tencent.com/product/baas
  • 腾讯云音视频(云直播、云点播):https://cloud.tencent.com/product/vod
页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

我们能从分布中学到什么?频率解释

回答这个问题方法是使用概率论规则并假设 θ 本身是具有先验分布 p(θ) 随机变量。先验分布 p(θ) 是我们观察任何样本之前对 θ 假设猜测形式化。...在这种前提下,我们可以将参数和数据联合概率分布写在一起: 利用这个公式,X捕捉到关于θ所有信息都可以总结为分布 统计是自洽且优雅:一切都可以使用概率论规则自然推导出来,而且假设总是明确且清晰...分析样本数量 N 很大时分布渐近形式——这是研究推理常用方法。然后,我展示了一般理论如何适用于高斯族简单情况。...|θ) θ 时,我们永远无法识别真正潜在分布 q — 因为我们没有正确位置搜索!强调这个问题是因为这种情况不仅限于统计,还扩展到任何参数统计方法。...拉普拉分布 这是第二种情况,一个具有单位均值拉普拉分布作为真实分布: 在这种情况下,q不属于参数族,但它仍然有一个有限均值方差。根据理论分布应该集中参数族上q伪投影参数θ*附近。

29820

【数据挖掘】公式垃圾邮件过滤应用 ( 先验概率 | 似然概率 | 概率 )

方法 步骤 3 : 比较假设概率 VI . 先验概率 P(H_1) P(H_0) VII . 似然概率 P(D|H_1) P(D|H_0) I ....引入公式 : ① 逆向概率 ( 似然概率 | 条件概率 ) : 收到垃圾邮件 , 该邮件是 D 概率 ; 这个概率可以由训练学习得到 , 数据量足够大 , 是可以知道 ; ② 先验概率...: 收到 H_0 邮件概率是已知 ; ③ 概率 : 公式计算该邮件 D 是垃圾邮件概率 : P(H_0 | D) = \frac{P(D|H_0)P(H_0)}{P(D)} IV...② 先验概率 : 收到 H_1 邮件概率是已知 ; ③ 概率 : 公式计算该邮件 D 是正常邮件概率 : P(H_1 | D) = \frac{P(D|H_1)P(H_1)}{P...获取这两个概率 : 从系统后台服务器邮件库获取垃圾邮件 正常邮件比例即可 ; VII . 似然概率 P(D|H_1) P(D|H_0) ---- 1 .

1.1K10

R语言JAGS回归模型分析博士生延期毕业完成论文时间|附代码数据

包括完成导入数据文件、探索汇总统计回归分析本文中,我们首先使用软件默认先验设置。第二步,我们将应用用户指定先验,对自己数据使用。准备工作本教程要求:已安装JAGS安装R软件。...主观概率观,所有的未知参数都被视为不确定,因此要用一个概率分布来描述。每个参数都是未知,而所有未知东西都会得到一个分布。...这并没有为你提供任何信息,即人口参数位于你所分析非常具体唯一样本置信区间边界内可能性有多大。分析,你推断关键是感兴趣参数分布。...问题:解释估计效果、其区间分布年龄_似乎是预测博士延期一个相关因素,平均回归系数为2.317,95%HPD(可信区间)[1.194 3.417]。...向下滑动查看结果▼问题: 每个模型都使用一个先验分布。描述一下回归系数先验分布形状。检查使用了哪些默认先验。(Jags)利用一个非常宽正态分布来得出这个无信息先验

80800

每个问题答案都是模型比较,假设竞争

模型简化是一种快速计算仅先验不同概率模型证据参数⽅法。变分贝设置,这有一个解析解,它巧妙地解决了模型比较或结构学习中大模型空间评分问题。...指定了先验之后,推断 - 也称为估计或反演 - 提供了参数概率 p(θ |y )。这些先验可能性之间由规则相关联。...先验期望值分别为 完整模型简化模型),而后期望值为 。方程11最后一个等式定义了自由能变化 ΔF,对应于变分对数因子。...除了高斯分布狄利克雷分布之外,模型简化还可以应用于一系列指数族分布。表 1 概述了简化形式以及一些常见分布证据。...作为说明性示例,附录中提供了 Gamma 分布简化证据逐步推导。 6. Worked examples 本节,我们提供静态动态、线性非线性模型背景下模型简化工作示例。

12510

独家 | ​PyMC3 介绍:用于概率编程Python包

方法可以解释这种说法。以下句子摘自《为黑客设计概率规划与方法》一书,它完美地总结了学派关键思想之一。 斯世界观将概率解释为事件可信度量度,即我们对事件发生有多少信心。...所以我认为推理是相当直观。 但是使用推断计算概念上通常具有挑战性。完成工作经常需要大量耗时而复杂数学计算。...根据规则,分布可通过以下公式计算: ? 其中p(D |θ)是似然函数,p(θ)是先验分布(在这种情况下,为Uniform(0,1))从这里开始有两种方法。...我们案例下,α=β= 1,N = 3,k = 2。 量化方法 显式方法,我们能够使用共轭先验来显式计算θ分布。但有时使用共轭先验来简化计算,它们可能无法反映现实。...我们将随机抛硬币1000次,使用PyMC3估算θ分布。然后绘制从该分布获得样本直方图。

1.5K10

R语言使用Metropolis-Hastings采样算法自适应估计与可视化

1)定义模型(即概率先验)。在此示例,让我们构建一个简单线性回归模型(对数)。...MH(li_func=li_reg,pars=c(0,1,1), 3)您可以使用plotMH()查看所有模型参数 plot(mcmc) ---- 点击标题查阅往期内容 01 02...4)输出置信区间。...R语言中网络(BN)、动态网络、线性模型分析错颌畸形数据 使用层次模型进行空间数据分析 MCMCrstan回归模型标准线性回归模型比较 python随机过程:马尔可夫链...:估计与模型比较 R语言实现MCMCMetropolis–Hastings算法与吉布采样 R语言推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例 R语言使用

20530

R语言STAN线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围可视化检查模型收敛性|附代码数据

Stan开发团队一个目标是通过清晰语法、更好采样器(这里采样是指从分布抽取样本)以及与许多平台(包括R、RStudio、ggplot2Shiny)集成,使建模更易于使用。...探索它们,绘制它们,计算一些汇总统计。一旦你对你数据和你想用统计模型回答问题有了了解,你就可以开始建立模型迭代过程。设计你模型。选择先验分布进行采样。...关于模型一个关键是您必须使用信息分布来描述数据变化。因此,您希望确保您数据符合这些分布,并且它们将适用于您模型。...这是因为我们使用一个简单模型,并且我们参数上放置了非信息先验。将回归线估计可变性可视化一种方法是绘制来自多个估计。plot(y ~ x, pch = 20)图 4....----点击标题查阅往期内容视频:R语言中Stan概率编程MCMC采样模型左右滑动查看更多01020304尝试自己将先验更改为一些不同数字,看看会发生什么,这是建模一个常见问题,如果您先验分布非常窄

76000

R语言STAN线性回归模型分析气候变化影响北半球海冰范围可视化检查模型收敛性|附代码数据

Stan开发团队一个目标是通过清晰语法、更好采样器(这里采样是指从分布抽取样本)以及与许多平台(包括R、RStudio、ggplot2Shiny)集成,使建模更易于使用。...探索它们,绘制它们,计算一些汇总统计。一旦你对你数据和你想用统计模型回答问题有了了解,你就可以开始建立模型迭代过程。设计你模型。选择先验分布进行采样。...关于模型一个关键是您必须使用信息分布来描述数据变化。因此,您希望确保您数据符合这些分布,并且它们将适用于您模型。...这是因为我们使用一个简单模型,并且我们参数上放置了非信息先验。将回归线估计可变性可视化一种方法是绘制来自多个估计。plot(y ~ x, pch = 20)图 4....,这是建模一个常见问题,如果您先验分布非常窄,但不符合您对系统或数据分布理解,您可以运行无法有意义地解释数据变化模型。

83830

R语言JAGS回归模型分析博士生延期毕业完成论文时间|附代码数据

包括完成导入数据文件、探索汇总统计回归分析 本文中,我们首先使用软件默认先验设置。第二步,我们将应用用户指定先验,对自己数据使用。...如你所知,推理包括将先验分布与从数据获得似然性相结合。指定先验分布推断中最关键一点,应该受到高度重视(例如Van de Schoot等人,2017)。...主观概率观,所有的未知参数都被视为不确定,因此要用一个概率分布来描述。每个参数都是未知,而所有未知东西都会得到一个分布。...这并没有为你提供任何信息,即人口参数位于你所分析非常具体唯一样本置信区间边界内可能性有多大。 分析,你推断关键是感兴趣参数分布。...向下滑动查看结果▼ 问题: 每个模型都使用一个先验分布。描述一下回归系数先验分布形状。 检查使用了哪些默认先验。 (Jags)利用一个非常宽正态分布来得出这个无信息先验

31030

R语言JAGS回归模型分析博士生延期毕业完成论文时间

第二步,我们将应用用户指定先验,对自己数据使用。 准备工作 本教程要求: 已安装JAGS 安装R软件。...如你所知,推理包括将先验分布与从数据获得似然性相结合。指定先验分布推断中最关键一点,应该受到高度重视(例如Van de Schoot等人,2017)。...主观概率观,所有的未知参数都被视为不确定,因此要用一个概率分布来描述。每个参数都是未知,而所有未知东西都会得到一个分布。...这并没有为你提供任何信息,即人口参数位于你所分析非常具体唯一样本置信区间边界内可能性有多大。 分析,你推断关键是感兴趣参数分布。...向下滑动查看结果▼ 问题: 每个模型都使用一个先验分布。描述一下回归系数先验分布形状。 检查使用了哪些默认先验。 (Jags)利用一个非常宽正态分布来得出这个无信息先验

86620

R语言Gibbs抽样简单线性回归仿真分析|附代码数据

模型假设我们观察数据对于我们模型是有兴趣是作出推论如果我们方差项之前放置正态前向系数反伽马,那么这个数据完整模型可以写成:假设超参数是已知,后面可以写成一个常数比例,括号术语是数据或可能性联合分布...吉布采样是一种迭代算法,从每个感兴趣参数分布产生样本。它通过按照以下方式从每个参数条件后面依次绘制:可以看出,剩下1,000个抽签是从分布抽取。这些样本不是独立。...我们不需要使用网格方法来从条件后面绘制。因为它来自已知分布请注意,这种网格方法有一些缺点。首先,这在计算上是复杂。通过代数,希望得到一个已知分布,从而在计算上更有效率。...仿真结果现在我们可以从每个参数条件进行采样,我们可以实现Gibbs采样器。这是附带R代码第2部分完成。它编码上面R概述相同算法。...然后我们概述了从后面抽取样本Gibbs算法。在这个过程,我们认识到Gibbs方法依赖于每个参数条件分布顺序绘制。这是一个容易识别的已知分布

85120

【干货】线性回归简介(附完整代码)

如果我们没有提前做出任何估计,那么我们可以使用非信息性先验来确定正态分布等参数。 2. :执行线性回归结果是基于数据先验可能模型参数分布。...实现线性回归 在实践,评估模型参数分布对于连续变量是难以处理,所以我们使用抽样方法从后面抽取样本以近似。从分布抽取随机样本以近似分布技术是蒙特卡罗方法一种应用。...线性建模应用 我将跳过本文代码,但实现线性回归基本过程是:为模型参数指定先验(我本例中使用了正态分布),创建模型映射训练输入到训练输出,然后用马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)算法从分布抽取样本作为模型参数...(推断,变量范围称为可信区间,与频率推理置信区间解释略有不同)。 当我们想用模型进行线性拟合时,我们可以绘制一系列线条,而不是仅显示估计值,每条线条表示模型参数不同估计值。...有了所有的数据点,OLS拟合几乎完全相同,因为数据可能性使得先验数据逐渐被覆盖。 当使用我们线性模型预测单个数据点输出时,我们得到仍是一个分布

3.9K50

线性回归多元线性回归构建工资预测模型|附代码数据

劳动经济学领域,收入工资研究为从性别歧视到高等教育等问题提供了见解 工资模型 本文中,我们将分析横断面工资数据,以期在实践中使用方法,如BIC模型来构建工资预测模型。...如果使用   参考先验     ,然后均值标准差分别等于频数估计标准差。...因此,αβ概率都遵循933自由度t分布,因为df非常大,这些分布实际上是近似正态参考先验p(α,β,σ2)∞1/σ2下,给出β95%置信区间,即IQ系数。...虽然0.0455概率听起来很小,但它比分配给它统一先验概率大得多,因为有216个可能模型。 模型平均法下,还可以可视化系数分布。我们将智商系数分布绘制如下。...plot(coef_bma_wage_red, ask = FALSE) 预测 统计一个主要优点是预测预测概率解释。大部分贝预测都是使用模拟技术来完成

95000

PythonPyMC3ArviZ统计实战(上)

所以,这是我简化它方法:与其开始时使用过多理论或术语,不如让我们关注分析机制,特别是如何使用PyMC3ArviZ进行分析可视化。...ArviZ是一个与PyMC3携手工作Python库,它可以帮助我们解释可视化分布。...我们将把方法应用到一个实际问题中,展示一个端到端分析,它从构建问题到建立模型到获得先验概率再到Python实现最终分布。...只能是正,因此使用半正态分布。再来一次,非常宽广。 票价似然函数选择: y是一个观测变量,代表数据来自正态分布参数μ、σ。 使用螺母取样绘制1000个样本。...我们还可以通过生成一个分布均值最高密度(HPD)图来直观地看到上述总结,并解释报告推断结果。 az.plot_posterior(trace_g); ?

2.5K41

R语言中block Gibbs吉布采样多元线性回归|附代码数据

模型 假设我们有一个样本量主题。多元回归假设该向量是从多元正态分布中提取 ,通过使用恒等矩阵,我们假设独立观察结果。 到目前为止,这与多元正态回归相同。...则将概率最大化可得出以下解 : 模型是通过指定为一个先验分布得到 。...在此示例,我将在以下情况下使用 先验值  block Gibbs 在对采样器进行编码之前,我们需要导出Gibbs采样器 每个参数条件分布。 条件取更多线性代数。...这是一个非常漂亮直观结果。条件协方差矩阵是协方差矩阵估计, 还要注意,条件一个多元分布。因此,Gibbs采样器每次迭代,我们从绘制一个完整矢量 。...例如,如果我们有二元数据,则可以将其建模为: 然后在上放一个先验分布。这个想法将线性回归推广到GLM。 本文中概述线性情况下,可以更灵活地对协方差矩阵建模。

60630

R语言BUGSJAGS分析: 马尔科夫链蒙特卡洛方法(MCMC)采样|附代码数据

MCMC本质上是一种特殊类型随机数生成器,旨在从难以描述(例如,多元,分层)概率分布采样。许多/大多数情况下,分布是很难描述概率分布。...一种实现方法是使用以下代码,该代码从具有相关参数ρ双变量标准正态分布绘制并可视化任意数量独立样本。...然而,并没有对参数相关性提出相同假设,因为概率可以反映在后分布。然后,我们需要一个函数,该函数可以计算参数空间中任何给定跳转概率比率。...很多情况下,我们不能直接制定出我们模型分布,但我们 可以 分析出条件分布。尽管如此,即使它在分析上不易处理,我们也可以使用单变量MH程序作为最后方法。...copula分层混合模型诊断准确性研究R语言线性回归多元线性回归构建工资预测模型R语言推断与MCMC:实现Metropolis-Hastings 采样算法示例R语言stan进行基于推断回归模型

1.4K20

eLife:EEGMEG相位数据分析

本研究建议,与传统统计方法相比,方法更具描述性解释性,并且检测与刺激相关差异时对参与者数量要求更低。...完整模型还包括参数先验分布,旨在计算分布,即给定实验数据参数概率分布。这种计算遵循贝叶斯定理,其中似然代表了在给定一些参数情况下数据分布。...展示了参与者专注度和局部电极效应。图A,作者绘制了形容词-名词(AN)条件下参与者效应50/90%最高密度区间(HDIs)中位数。图B,展示了每个条件下参与者斜率标准差分布。...通过使用模拟数据验证,研究表明电极效应没有实际意义时,模型更符合数据,强调了使用适当统计方法来准确解释脑电数据重要性。图5清晰展示了当电极效应没有实际意义时,模型对数据更为忠实。...图8,展示了对统计学习数据集进行分析。图8A显示了对EXP - BL条件差异分布,涵盖了所有感兴趣频率。

11410

独家 | 为什么要尝试AB测试方法(附链接)

Levitin,说谎实地指南:信息时代批判性思维 绪论 深入研究使用估计方法之前,我们需要了解一些概念。...这种新想法称为想法(概率)。 方法: 1. 探索观察到数据。 2. 选择一个概率分布来表示数据。这成为了你似然函数。 3. 考虑你对似然函数参数主观想法去选择一个先验分布。...通过使用方法使用数据更新先验分布,以获得分布分布是一种概率分布,它描述了观察数据你对参数更新想法。 我知道这里有很多专业术语,但我会尽力解释例子所有内容。...在此示例,我们使用Beta分布作为先验,因为它是伯努利二项式似然函数共轭先验。Beta分布参数越大,你应该越有信心。参数是成功失败。...结果 图中,我们可以看到变量分布变量差异。分布越宽,我们对p(A)p(B)真实值把握就越小。真实变量不确定性与样本量大小成正比。使用方法好处是现在我们可以量化不确定性了。

1.3K41

R语言广义线性混合(多层次水平嵌套)模型GLMM、逻辑回归分析教育留级影响因素数据|附代码数据

p=24203 本教程使用R介绍了具有非信息先验 GLM(广义线性模型)  。 当前教程特别关注逻辑回归二元结果计数/比例结果场景使用,以及模型评估相应方法。...这些估计解释频率论模型是相同。然而,请注意,不确定性区间解释两个模型之间是不同。...但是,这两种方法不适用于模型。相反,模型利用所谓 预测 P 值 (PPP) 来评估模型拟合度。此外,许多模型还使用 因子 来量化数据对模型支持。...请注意,对于非高斯模型(例如逻辑回归),我们需要设置“ppd = T”,以便方差计算基于预测分布。...#提取所有随机效应项分布 RdEffct <- rf(aoFl) #提取 "sd(Intecpt) "分布 r_ec %。

1.5K30

斯坦福 Stats60:21 世纪统计学:第十章到第十四章

分析一个重要方面是它可以是顺序。一旦我们有了一个分析,它可以成为下一个分析先验!...当我们没有简单方法来数值表达分布时,这种方法特别有用,而在真实数据分析通常是这种情况。这样一种方法(拒绝抽样)本章末尾附录中有更详细解释。...总想法是,推断结合了先验似然信息,权衡了每个相对强度。 这个例子也突出了分析顺序性质 - 一个分析可以成为下一个分析先验。...如果我们计算会发生什么呢? 图 11.4:A:先验分布影响。基于平坦先验原始分布以蓝色绘制。基于 20 人中 10 名回答者观察先验以虚线黑色线绘制使用先验以红色绘制。...图 11.4 C 面板,我们看到没有任何值密度,其中先验被设为零 - 数据被绝对先验所压倒。 11.5 选择先验 统计中最具争议方面是先验对推断结果影响。什么是正确先验

19511
领券