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SLURM的使用版本是17.11.9。我测试了SLURM的一些特性，例如作业数组和它的任务部署。但是，我希望与发送到集群中每个节点或CPU的不同任务进行通信，以便收集其结果(无磁盘I/O)。出于这个原因，我研究了如何使用消息队列、MPI或OpenMPI来管理它。(任何其他实现策略，作为建议或建议，都是非常感谢的。)我用一个简单的Python代码片段测试了MPI，启动了两个
浏览 126提问于2019-06-10得票数 2
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如果我在下面的代码中将'mpirun‘替换为'srun’，我的mpi+openmp作业运行速度会慢3倍！##SBATCH --output=./res_locstack4d_mpi.txt#SBATCH --ntasks=3#SBATCH --ntasks-per-node=1
#Process Manager:
浏览 18提问于2015-08-06得票数 2
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mpirun是否需要指定-np？
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/c_or_python_script 但是，在具有PBS作业提交队列的集群上(我不知道这种类型的提交被称为什么)，示例脚本不需要这个-np N参数！我还是会给你的。有什么关系？/bin/sh#PBS -N mpi_job#PBS -A etc#PBS/test_mpi.exe 如果我更改为mpirun -np 256 ./te
浏览 493提问于2021-02-03得票数 0
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使用SLURM的非对称混合映射
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我想用slurm做一个非对称的混合映射。#SBATCH --nodes 3#SBATCH --cpus-per-task 32
在此配置中，我为每个mpi task分配了但是节点0
浏览 3提问于2017-12-06得票数 2
第二个被提交以获得接下来的4个GPU(在另一个节点上)。如何确保这两个作业同时运行，从而最终实现同步(Pytorch DPP)。有一个额外的脚本来检查可用的资源是可行的，但是其他作业可能有优先级，因为它们在队列中，而不是等待.
我使用的特定分区不允许直接请求两个节点。我也知道--dependency标志，但是这只能用作第一个作业的完成检查。
浏览 31提问于2022-06-27得票数 0
我正试图在HPC中与资源管理器SLURM一起实现某种类型的主工作人员系统，我正在寻求如何实现这样一个系统的建议。我的想法是自动取款机(另见下文编辑)：我正在尝试的是：
我不确定MPI</
浏览 4提问于2021-02-16得票数 2
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在诸如XE6之类的Cray计算机上，当通过aprun启动混合MPI/pthread应用程序时，有一个深度参数，它指示每个进程可以产生的线程数。在使用Slurm的srun启动OpenMPI/pthread应用程序时，有没有类似的选项？这台机器是带有nehalem处理器和IB互连的通用HP集群。如果线程支持级别仅为MPI_THREAD_FUNNELED，这有关系吗？
浏览 1提问于2011-09-23得票数 1
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我有以下情况:我编写了一些简短的MPI测试代码，以便找出在我的代码中，发送和接收操作的哪个组合工作得最好。代码在我自己的计算机上运行得非常好(用8个进程进行测试)，但是当我运行我正在处理的集群之一时，我得到了一个巨大的错误输出，输出是一个损坏的或双释放的指针，这是输出：
我在代码中所做的是:我调用我的通信功能我发现，错误总是发生在相同的迭代中(大约在6K左右)。然
浏览 1提问于2013-04-22得票数 6
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我在一个有36个cpus和72个线程(超线程)的节点上使用mpirun运行了几个进程。当我使用不同的mpirun调用(每个都是-np 2)运行它们时，它们在相同的cpus中运行，降低了进程的效率。使用ps命令，我可以看到当我发送7调用，所有进程都在4个线程中运行。有人知道怎么解决这个问题吗？我希望将进程分布在所有线程上，以最大限度提高效率。
浏览 11提问于2021-03-09得票数 1
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最近，一位同事观察到了一些奇怪的行为，我已经能够重现它。我们有一台用于模拟的计算机，它由两个Xeon处理器驱动，每个处理器有18个内核，让我们可以使用36个内核。当我们使用2个进程启动一个应用程序时，mpi总是绑定到套接字0的内核0和1上。因此，如果我们分别使用2个进程运行4个模拟，则内核0和1在每个进程的CPU使用率为25%的情况下执行所有工作。请参阅下面报告的
浏览 4提问于2017-12-14得票数 2
我是Slurm的新手，我也发现了有关这个话题的相关问题。然而，我仍然对如何使用srun的几点感到困惑。根据正式文档，srun通常首先分配资源，然后运行并行作业。因为S批处理只负责分配资源，而不是执行程序。#SBATCH -n 20#SBATCH -o myoutputfile.txt
module load mpi&#
浏览 3提问于2020-10-13得票数 1
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在mpirun和srun之间，我正在考虑哪个进程启动程序在优化资源方面更好。假设集群中的一个计算节点总共有16个核心，我有一个作业，我想使用10个进程来运行。如果我使用启动它，它是否能够检测到我的请求的核心数量少于每个节点中可用的核数，并且将自动从单个节点分配所有10个核？与使用srun指定节点数量的-N <number>不同，mpirun似乎没有这样的</em
浏览 5提问于2020-10-28得票数 0
2回答
我无法通过一个Open MPI在Slurm下运行Slurm-script。
但是，如果通过script执行相同的操作，mpirun hostname将返回空字符串，因此无法运行mpi
浏览 2提问于2019-03-20得票数 4
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使用mpi4py，我运行了一个python程序，它并行地启动多个fortran进程，从SLURM脚本开始使用(例如)：但是已经注意到，myprog.py运行myprog.py (以下代码仅显示程序的mpi部分)：size = comm.Get_size()
data但是，对于单处理器和四个处理器，我希
浏览 1提问于2018-08-29得票数 1
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在批处理脚本中，您可以直接启动程序或脚本(例如，可执行文件myapp)，但在许多教程中，人们使用srun myapp。
尽管阅读了关于这个主题的一些文档，但我不理解其中的区别以及何时使用这些语法。我希望这个问题足够精确(第一个问题)，谢谢你的回答。
浏览 0提问于2018-12-05得票数 27
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是否可以在已经登录到集群节点上的节点上运行slurm作业？假设我已经登录了节点：casade02这样我就不用排队了。如果这很重要，我可以将ssh转换到特定的节点中，比如ssh user@casacde01。然后，我可以登录到我指定为“head”节点的节点，然后说，‘好的，在casacde02和casacde03上运行这段代码吗？’
我在看这个stackexchange帖子，它给出了S批处理的-w标志。如果我登录到一个单独的
浏览 0提问于2022-10-03得票数 1
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我知道如何使用cgroups(分配内存、cpu使用率...)和slurm(提交、挂起/停止作业)。我想知道cgroups是如何使用slurm的。当我向slurm提交作业时，我可以在哪里修复内存或CPU使用率？我阅读了Slurm Schedmd()的文档，但它没有给出很好的解释。也许这是对我的误解。谁能解释一下如何使用<
浏览 4提问于2017-05-22得票数 3
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我正在使用一种名为IAMR的流体求解器，我正试图通过我的学校集群使它执行得更快。我有添加节点和指定任务的选项，但我不知道模拟运行的区别是什么。/amr3d.gnu.MPI.OMP.ex inputs.3d.rt除了不知道要请求多少节点和任务之外，我不确定我是否正确地提交了任务。在IAMR指南中，它规定:对于MPI构建，可以使用
浏览 0提问于2020-11-05得票数 1
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