使用collapseAll预设Cytoscape布局，并在展开节点组上更改布局

Cytoscape是一款用于可视化和分析网络的开源软件库。它提供了丰富的功能和工具，可以帮助用户构建、布局和分析各种类型的网络。

在Cytoscape中，collapseAll是一个预设布局，用于将节点组折叠成单个节点，并在展开时更改布局。当网络中存在大量节点组时，使用collapseAll可以有效地减少网络的复杂性，提高可视化效果。

使用collapseAll预设Cytoscape布局的步骤如下：

1. 导入Cytoscape库：首先，需要在项目中导入Cytoscape库，以便使用其功能和工具。可以通过在HTML文件中添加以下代码来实现：

<script src="https://unpkg.com/cytoscape/dist/cytoscape.min.js"></script>

1. 创建Cytoscape实例：接下来，需要创建一个Cytoscape实例，用于构建和操作网络。可以通过以下代码创建一个简单的实例：

var cy = cytoscape({
  container: document.getElementById('cy'), // 指定容器元素
  elements: [ /* 网络元素 */ ],
  layout: { /* 布局选项 */ },
  style: [ /* 样式规则 */ ]
});

1. 定义节点组：在网络中定义节点组，可以使用Cytoscape提供的add方法。例如，可以使用以下代码创建一个节点组：

cy.add([
  { group: 'nodes', data: { id: 'group1' }, position: { x: 100, y: 100 } },
  { group: 'nodes', data: { id: 'group2' }, position: { x: 200, y: 200 } },
  { group: 'edges', data: { id: 'edge1', source: 'group1', target: 'group2' } }
]);

1. 应用collapseAll布局：使用Cytoscape的layout方法，可以将collapseAll布局应用于节点组。以下是一个示例代码：

cy.layout({
  name: 'preset',
  positions: function (node) {
    if (node.data('id') === 'group1') {
      return { x: 100, y: 100 };
    } else if (node.data('id') === 'group2') {
      return { x: 200, y: 200 };
    } else {
      return node.position();
    }
  }
}).run();

在上述代码中，我们使用preset布局，并通过positions函数指定了节点组的位置。对于其他节点，我们保持其原始位置不变。

通过以上步骤，我们可以使用collapseAll预设Cytoscape布局，并在展开节点组时更改布局。这样可以有效地管理和可视化大型网络，并提供更好的用户体验。

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