使用cytoscape指定节点坐标

文章/答案/技术大牛

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graph、theory、cytoscape

首先，我想创建节点，每个节点都有一个(x，y)对，但在CYTOSCAPE中找不到合适的方法。然后，我想通过提供一个链接长度来连接节点(这将给出合理的物理含义)。最后，我想给每个节点分配属性，并派生一些结果(中心性)。请对建设网络的任何见解，将非常感谢。谢谢,

浏览 50提问于2019-07-17得票数 0

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是否有方法使用x，y坐标作为每个节点的属性来使用另一个程序计算的坐标来布局一个图？如果没有，是否有可能以某种方式实现这一目标--我们是如何开始这样做的？是否有一种标准的方法，如何以某种方式向cytoscape.js web查看器提供节点位置？背景:使用Python计算某些在Cytoscape中不受支持的布局非常简单，而且将坐标存储为节点属性也很简单。然后，所需要的只是一些方法，让Cytos

浏览 5提问于2020-05-29得票数 1

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有没有一种方法可以使用Javascript来判断Cystoscape节点是否在某个坐标上？

javascript、cytoscape.js

我有一个应用程序，用户可以使用Cytoscape JS创建图形。要添加节点，用户单击Cytoscape容器，然后在单击位置添加一个节点。最近，我添加了我自己的snap- to -grid方法，我想知道是否有任何方法可以检查节点是否已经存在于特定的坐标处，从而不允许用户创建重叠的节点。我在Cytoscape JS文档中搜索了一遍又一遍，没有找到任何有用的东西。未来感谢您的帮助

浏览 12提问于2021-01-07得票数 0

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如何使用Cytoscape分析“一对多”数据值

cytoscape、network-analysis

我对使用Cytoscape分析基因之间的分子关系很感兴趣，我一直在阅读Cytoscape网站上的教程，但我不确定如何使用Cytoscape进行“一对多”比较。例如，每个基因通常被指定为“节点”，其“边”对应于与其他基因的交互作用。Cytoscape使用“属性”将节点或边名称映射到特定的数据值。看起来很清楚Cytoscape将如何使用这些类型的数据来构建交互网络。但是，对于每个基因

浏览 1提问于2020-06-02得票数 1

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允许在复合中定位子级的cytoscape.js布局(例如，像点的排名)

cytoscape.js、graph-layout

我正在尝试使用cytoscape来替换我的dot输出，并使其具有交互性(移动节点和复合、展开/折叠复合等)。当第一次加载图形时，用户应该看到一个默认布局。在我的图中，我有代表组件的复合节点。组件包含其他组件和/或状态、转换、变量。每个组件都可以指定inputs和outputs。我还没有找到一个完全支持在复合中定位节点的布局。我研究了使用cytoscape.js-cola布局和以下选项： name: &

浏览 2提问于2017-07-18得票数 4

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CytoscapeJs完整的邻里

cytoscape.js

当使用neighborhood()时，Cytoscape只提供直接的周围节点。是否也有内置选项来接收完整的邻域/连接节点？文档并没有在附近区域指定任何内容。

浏览 8提问于2022-08-09得票数 0

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如何让Cytoscape.js自动创建类似于Cytoscape创建的布局？

cytoscape.js、cytoscape

在使用Cytoscape.js之前，我使用了Cytoscape进行生物网络可视化。 Cytoscape能够使用其内部布局算法从我们的网络文件中创建一个自动布局。布局布局是非常合理的--相互连接的节点被放置在附近，节点与每组节点中心的中心节点很好地分布在一起，这对生物网络来说是很好的，因为节点太多，节点之间的连接也很多。现在我正在使用Cytoscape</e

浏览 2提问于2017-03-04得票数 3

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在鼠标光标的位置添加胞景节点

javascript、graph、cytoscape.js

我想在鼠标箭头的位置，在画布上的单击事件上添加一个胞景节点。我的方法：(不太好用)$("#cy").click(function(event){ cy.add([我应该如何定义这个函数以使节点呈现在正确的位置，而不管胞景画布的位置如何？

浏览 1提问于2013-10-01得票数 4

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python网络图中的破折号--不符合节点坐标

python、networkx、plotly-dash、cytoscape.js

我正在尝试学习Dash Cytoscape，并希望执行以下操作:生成一个带有网络的图形，应用fruchterman-reingold算法来定位节点，将数据转换为胞景格式，并在Dash应用程序中显示它。以下是代码： to Dash cytoscapeimport dash_cytoscape as cytocy = nx.cytoscape

浏览 5提问于2022-03-10得票数 0

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节点的轴心点/锚点(Cytoscape.js)

cytoscape.js

我正在加载一个包含节点的xlsx表。该表包含节点的x，y坐标、节点名称和其他信息。我有一堆x坐标= 0的节点，但是y坐标不同。当我加载节点时，因为节点的轴心点在中心，所以我得到了这张图片 ? 我需要一张这样的照片 ? 我在文档中没有找到该节点的任何轴心点或锚点。如果节点的x坐标不在中心工作，而是沿着节点的右边缘工作，那么一切都将完美。

浏览 30提问于2021-11-04得票数 0

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cytoscape中不同边缘组的不同颜色编码

cytoscape.js

我是cytoscape的新手，但我正在研究使用cytoscape.js来显示多个航空公司的拓扑结构。我需要显示这些航空公司的两个国家之间的航班。我的计划是创建一个cytoscape实例。为每条航空公司创建边和节点，并指定样式。在样式中，我想指定边缘的颜色。然而，我不能看到我为每次迭代分配的不同颜色编码。取而代之的是，所有的边和节点，获得在最后一个iteration.Here中分配的相同颜色，这是我的代码， var cy = cytoscape<

浏览 1提问于2016-11-30得票数 1

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Cytoscape默认情况下折叠所有父节点

reactjs、cytoscape.js

我正在使用带有react-cytoscape和cytoscape-undo-redo和cytoscape-expand-collapse的cytoscape.js。我还为我的图形使用了COSEBilkent布局(因为我需要有复合节点的选项)。首先，我接收所有节点和扩展的组。我希望首先将这些复合节点折叠起来，但我找不到解决方案。有人能帮帮忙吗？ ?

浏览 32提问于2020-08-28得票数 0

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如何在Cytoscape.js中指定位置添加节点？

javascript、cytoscape.js

我想在指定的位置添加节点。首先，我尝试在相同位置添加两个节点(x=0，y=0)，如下所示： container: document.getElementById，一个对另一个节点。我得到的是：事实上，无论我指定的x和y值是多少，节点的位置都是相同的。我也尝试了renderedPosition而不是position，但是没有结果。我正在搜索Cy

浏览 5提问于2015-02-07得票数 6

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Cytoscapejs: Sankey-like边缘大小

javascript、css、cytoscape.js、sankey-diagram

有没有一种方法可以在cytoscape.js中创建像Sankey一样的边宽图？需要说明的是，我不想在cytoscape.js中创建Sankey图。我想要创建的边的总大小与它们所在节点的大小相同。修改边宽度的一种方法是通过强度属性，但我没有找到一种方法来指定该属性与原始节点的大小相关。安迪

浏览 3提问于2016-07-25得票数 1

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如何在cytoscape* js中自动移动任何节点*

cytoscape.js

我使用cytoscape js automove extention，我可以一起移动两个节点： nodesMatching: cy.$('#b')但是我必须指定节点#a和#b，现在只要我移动任何节点，它的邻域就会一起移动，而不是一个特殊的节点。所以我试着这样做： #cy{ height:800px&

浏览 0提问于2018-04-09得票数 2

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有可能让一个节点变得粘性吗？

cytoscape.js

在cytoscape.js中，有没有办法设置特定节点的绝对位置，使其不与图形的其余部分平移/缩放？我可以使用nodes.layoutPositions()设置相对位置，但整个场景仍会平移/缩放。禁用特定节点的平移/缩放功能就足够了，但这可能吗？如果可能，为特定节点指定绝对位置也可能足够好。谢谢!

浏览 0提问于2018-03-13得票数 2

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使用collapseAll预设Cytoscape布局，并在展开节点组上更改布局

reactjs、cytoscape.js

我使用的是cytoscape js与react cytoscape和cytoscape undoRedo，以及cytoscape expand collapse。在第一次渲染时，我想要按预设布局(我有所有节点的位置)。它工作得很好，但是当我执行api.collapseAll()时，它看起来节点没有这些位置。即使分组的节点具有与父节点相同的位置。在expand上，我想使用cose bilkent layout。有办法做

浏览 13提问于2020-08-31得票数 0

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如何在Cytoscape.JS中淡出边缘？

cytoscape.js

在有几条边的Cytoscape.JS图中，我如何才能只淡入其中一条边？在style标签中有没有什么东西可以做到这一点？

浏览 58提问于2018-07-23得票数 2

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在cytoscape.js中求最小图高

javascript、layout、cytoscape.js

我有固定的节点大小和缩放的cytoscape.js图。我想要适应整个图形(DAG，几乎与少数“非树”边缘)到视口固定宽度和无限高。我很难实现它。我使用breadthfirst布局。我试着把它推到相当大的包围框中，然后从节点位置计算出图形的高度，然后调整边界框。这是行不通的，因为布局试图使用尽可能多的空间驴和延伸的边缘。是否有一个cytoscape.js布局，可以执行类似BFS的操作，并指定级别之间的最大距离？还是有更好的方法来解决我的问题？

浏览 1提问于2015-09-18得票数 0

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如何将节点传递给cytoscape-cola.js中的gapInequalities？

cytoscape.js、webcola

[{"axis":"y", "left":node1, "right":node2, "gap":25}]maxkfranz很有帮助地指出这些对象需要是的它们包含对指定节点(“元素”)的引用，并通过查询cytoscape.js“核心对象”来创建。例如，要指定节点b应放在节点a的上方，下面代码中的???

浏览 11提问于2019-11-21得票数 3

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