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    R tips:使用!!来增加dplyr的可操作性

    的这种易用性是有代价的,假如想要对分析工作稍微增加一些编程属性时,就会发现dplyr的异常情况,比如将分组变量赋值给一个变量,使用变量来进行分组: ### 分组变量group_var无法完成工作 group_var...R中代码的运行过程 在介绍!!运算符之前,有必要先了解一下R中的代码是如何运行的。 在R console中输入一个代码,R就会返回代码的结果。...一个代码在R console中是直接运行到结束的,如果想要获得其中间态:语句,可以使用expr函数来捕获它。...为了可以让它执行,我们可以需要告诉dplyr,先对group_var求值,获得真正的分组名:gear,使用gear进行后续操作,这个先求值的操作可以通过!!运算符来完成。...也不局限于dplyr,它是R MetaProgram的一部分 比如对于ggstatplot包而言,它是一个统计及绘图的包,常规使用如下: ### 两种写法都可以 mtcars %>% ggstatsplot

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    「R」数据操作(八):dplyr 的 do, do, do

    关于dplyr的基本操作我已经写过很多笔记了,不再赘述,这篇文章重点介绍 dplyr 的一个函数 do() 的用法。...与data.table类似,dplyr也提供了do()函数来对每组数据进行任意操作。 例如将diamonds按cut分组,每组都按log(price) ~ carat拟合一个线性模型。...和data.table不同的是,我们需要为操作指定一个名称,以便将结果存储在列中。而且do()表达式不能直接在分组数据的语义下计算 ,我们需要使用.来表示数据。...,每个元素都是模型的结果,包含线性回归对象的列表。...假如我们需要分析toy_tests数据,要对每种产品的质量和耐久性进行汇总。如果只需要样本数最多的3个测试记录,并且每个产品的质量和耐久性是经样本数加权的平均数,下面是做法。

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    「r」dplyr 里的 join 与 base 里的 merge 存在差异

    今天在使用连接操作时发现:虽然都是合并操作函数,dplyr 包里的 *_join() 和基础包里面的 merge() 存在差异,不同的数据结构,结果也会存在偏差。...相同的数据,不同的操作函数存在差异 在进行连接操作时,我们会发现 dplyr 的结果会报错!...所以使用 dplyr 提供的连接函数报错是正常的,但有意思的是,基础包提供的 merge() 函数可以完成连接操作,真是优秀(感兴趣的朋友可以看下测试下 merge 函数源代码)!...data.table 构造的数据集结果: purrr::reduce(x2, dplyr::full_join) #> Joining, by = "r1" #> Error: `by` must be...2 S1 S2 S2 S1 S2 更新 在后面的一些使用过程中发现基础包的 merge() 函数在进行连接操作时会输出有问题的结果,所以建议使用的小伙伴仔细检查结果。

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    R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

    参考:李东风老师的R 语言实战 1. tidyverse 系统简介 假设数据以 tibble 格式保存。...我们可以使用tidyverse 系统来操作,其中包括了magrittr 包,readr 包,dplyr 包和 tidyr 包等。...>% pivot_wider( names_from = "variable", values_from = "value" ) %>% knitr::kable() 关于更详细用法,参见李东风的R...对于即将合并的新列,需要使用引号;但对于想要合并的多个列名,可以不用使用引号。sep 参数设定多列合并后不同数据分隔使用的分割符。...R 数据整理(六:根据分类新增列的种种方法 1.0) 其他函数 slice dplyr 包的函数 slice(.data, ...) 可以用来选择指定序号的行子集,正的序号表示保留,负的序号表示排除。

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    R 语言中的矩阵计算

    作者:张丹(Conan) 来源:http://blog.fens.me/r-matrix/ 前言 R 是作为统计语言,生来就对数学有良好的支持。矩阵计算作为底层的数学工具,有非常广泛的使用场景。...用R语言很好地封装了,矩阵的各种计算方法,一个函数一行代码,就能完成复杂的矩阵分解等操作。让建模人员可以更专注于模型推理和业务逻辑实现,把复杂的矩阵计算交给R语言来完成。...和 QR 分解法相同, 原矩阵 A 不必为正方矩阵。使用 SVD 分解法的用途是解最小平方误差法和数据压缩。...K.matrix(r, c=r) ,返回阶数为 p=r*c 的方阵,对于 r 行 c 列的矩阵 A,计算 A 和 t(A) 的直积。 计算公式: ?..., H.matrices(r, c=r) 使得 r 阶 c 阶的子列表的分量,计算从 r 行和 c 列的单位矩阵的列向量的外积导出的方阵。

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    如何使用R的sweep函数对表达矩阵进行标准化

    我们知道一般做表达谱数据分析之前,第一步就是对我们的表达矩阵进行标准化(归一化),去除由于测序深度,或者荧光强度不均一等原因造成的表达差异。...如下图所示 除了中位数标准化之外,我们还可以使用z-score的方法来对表达谱数据进行标准化: z-score=(表达量-均值)/标准差 那么下面小编就给大家演示一下如何使用前面讲到的☞R中的sweep...函数,使用z-score的方法来对表达谱矩阵进行标准化 #为了保证随机数保持一致,这里设置一下种子序列 set.seed(123) #随机生成100个数,构造一个10X10的矩阵 data=matrix...) #每一行基因表达值除以这一行的标准差 data2=sweep(data1,1,rowsd,'/') data2 得到的结果如下 如果对R里面scale这个函数比较熟悉的小伙伴,可能已经发现了,scale...=t(scale(t(data))) data3 得到的结果如下,有兴趣的小伙伴可以去对比一下跟使用sweep函数得到的结果。

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    滤波器的使用及算例

    所谓滤波器,即设计一个方法,滤掉不要的频率成分,保留感兴趣的频率成分。图2是设计一个滤波器,滤掉图1时域信号中400Hz的频率成分。...03 — 滤波器的构造 滤波器的构造,实际上是设计一个频谱的传递函数(不管是频域滤波还是时域滤波都是该传递函数),下面的公式是一个4阶滤波器的传递函数,自变量是频率f(或角频率w)。 ?...图7 04 — 时域滤波器 前面构造的滤波器参数b, a 对于时域滤波很重要,我们仍然拿4阶Butterworth滤波器举例: ? 这个过程是z变换的转换过程。...图15 以上是个人在滤波器应用中的一些算法总结,不管是频域滤波还是时域滤波,关键是构造滤波器的频响函数及计算参数。...同样的滤波器:频域滤波采用滤波器的频响传函H;时域滤波采用构成滤波器传函的参数 b, a。

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    Matlab滤波器设计:滤波器设计工具的使用方法

    Matlab滤波器设计:滤波器设计工具的使用方法 一、滤波器设计工具整体简介 !! ✨ Matlab版本为R2022b,与以前的版本兼容。...本文展示了如何使用Matlab自带的滤波器设计工具filterDesigner进行滤波器设计,使得我们从命令行滤波器设计函数中脱离出来,从而开展模型化的FIR或IIR滤波器设计工作,其具有的主要功能如下所示...其启动方法在命令行输入filterDesigner,即可快速启动Matlab的滤波器设计工具如下图所示,其主要包括三个区域: 当前滤波器信息区域: 用于显示滤波器属性,包括滤波器结构、阶数、使用的节数以及滤波器的稳定性等信息...二、滤波器设计 这里以一个FIR等波纹低通滤波器的设计为例,使得所有小于等于奈奎斯特频率20%的频率通过,并衰减大于或等于奈奎斯特频率50%的频率,具体的设置如下所示: 图片 根据设计滤波器器的需求,设置如下图所示的内容...如下图所示,即可将设计的滤波器导出为Siumulink模型: 四、滤波器设计工具的其他高级功能 (1)目标菜单的使用 通过滤波器设计中的目标菜单,我们可以生成生成如下各种类型的代码来表示设计好的滤波器

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    R 语言 安装DESeq2,dplyr 包遇到报错的彻底解决方案

    一、问题 今天想使用 R 重新对数据进行差异表达分析,在安装DESeq2的时侯,遇到下面的报错: *Error: package or namespace load failed for ‘GenomeInfoDb...Error: 无法载入程辑包‘GenomeInfoDb’ In addition: Warning messages: 1: 程辑包‘DESeq2’是用R版本4.1.1 来建造的 2: 程辑包...‘GenomicRanges’是用R版本4.1.2 来建造的 3: 程辑包‘GenomeInfoDb’是用R版本4.1.2 来建造的 我现在使用的是笔记本电脑,我的台式电脑安装就没有遇到问题,不知道为什么...,于是开始搜索了一下教程,发现大家安装 DESeq2, dplyr 的时侯都会遇到**不存在叫 RCurl 这个名字的程辑包**的问题。...,就是直接安装二进制 binary 版本的R包。

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    Matlab滤波器设计:滤波器设计规格对象函数fdesign的使用方法

    一、滤波器设计规格对象函数fdesign简介 !! ✨ Matlab版本为R2022b,与以前的版本兼容。...1.1 滤波器设计流程 本文展示了如何使用Matlab中滤波器设计规格对象函数fdesign的使用方法。根据fdesign创建的滤波器规格对象,可以使用design函数直接设计滤波器。...确定针对滤波器规格队形的滤波器设计方法; 步骤三: 如果想要进一步修改滤波器的参数,可以查看designoptions函数的使用方法,进行具体的滤波器参数设置。...步骤四: 使用design方法从滤波器规格对象设计一个滤波器,并以步骤二中的设计方法作为输入。...基于上面的滤波器规格参数spec,可以使用design函数设计滤波器,代码如下所示: % 使用默认规格参数的滤波器规格对象d d = fdesign.lowpass % 滤波器规格包括`Fp, Fst

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    Google Earth Engine——使用 R、dplyr 和 ggplot 可视化科罗拉多州丹佛市的每小时交通犯罪数据

    丹佛市在其开放数据目录中公开保存过去五年的犯罪数据。在本教程中,我们将使用 R 访问和可视化这些数据,这些数据本质上是具有犯罪类型、社区等特征的时空参考点。 首先,我们将加载一些稍后会用到的包。...library(dplyr) library(ggplot2) library(lubridate) 然后,我们需要下载包含原始数据的逗号分隔值文件。...下面的代码使用该dplyr包对数据进行子集化以仅包括交通事故犯罪 ( filter(...))...我们还将创建一个新变量offense_type,它是该offense-type-id列的更易于阅读的版本。使用 ggplot,我们将为一周中的每一天创建一个带有颜色的密度图。...此工作流用于dplyr处理我们的数据,然后将结果通过管道传输到ggplot2,以便我们在全局环境中仅创建一个对象p,即我们的绘图。

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