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UseGalaxy.cn生信云|零代码使用Tiverse优雅地处理数据集

Dplyr Select keep or drop columns select 函数用于选择数据框中特定,可以保留感兴趣变量,并且能够根据列名、位置或条件表达式进行灵活变量选择操作。...Dplyr Slice select rows by position slice 函数用于按行数进行切片,能够从数据框中提取特定行,支持根据行数或行号选择需要行,也支持使用负数表示从末尾开始计算行数...Dplyr Filter keep rows that match a condition filter 函数用于根据条件筛选数据行,能够仅保留满足条件观测,支持根据指定条件表达式对数据框进行灵活行筛选操作...Tidyr Pivot Longer from wide pivot_longer 函数用于将宽格式数据转换为长格式数据,能够根据用户指定将数据框中多个整理成一对 “名-值” 对,便于进一步分析和处理...Tidyr Pivot Wider from long pivot_wider 函数用于将长格式数据转换为宽格式数据,能够将数据框中分成多个根据指定列名进行展开,使得数据以更直观宽格式形式呈现

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R 数据整理(七:使用tidyr和dplyr处理数据框 2.0)

2.5 select 对行或筛选,比较有用是其一些专属函数select(test, starts_with("Petal")) #选中..开头 select(test, ends_with(...忽略最后一个即表示选择倒数第二个。 2.6 arrange 按照数据框里或某几列,对所有行进行排序。可以使用 desc 产生倒序,或写入多个使其按照多个进行排序。...按select(test,1) select(test,c(1,5)) 按列名 如果想要用向量来存放希望筛选列名,需要使用函数 one_of 来存放该向量。...") select(test, one_of(vars)) 可以使用,冒号表示范围,向号一样切片操作: d.class %>% select(age:weight) %>% head(n=3)...R 数据整理(六:根据分类新增列种种方法 1.0) 其他函数 slice dplyr函数 slice(.data, ...) 可以用来选择指定序号行子集,正序号表示保留,负序号表示排除。

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数据处理|R-dplyr

1)安装、加载dplyr包、准备数据 install.packages("dplyr") #加载dplyr使用dplyr包处理数据前,建议先将数据集转换为tbl对象。...data(iris) #本文使用iris示例数据集。 2)数据记录筛选(行筛选) filter函数:按指定条件筛选符合条件中逻辑判断要求数据记录。...%in% c("setosa","virginica")) 3)变量筛选(select函数:可以通过指定列名选择指定变量进行分析,得到选择。...select(iris,Sepal.Width,Petal.Length,Species) 其他特殊选择,可匹配: select(iris,contains("." )) #选取名称中含有字符 区别...:Filter&Select Filter:通过一些准则选择观测值(行) Select:通过名字来选择变量() 更名变量名: Select & Rename head(select(iris,Sepal.W

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懒癌必备-dplyr和data.table让你数据分析事半功倍

(V2),V3) 对V1,V3升序排序,对V2降序排序 ※arrange语法非常简单,功能也很强大,我们再也不要用order()函数select( ) 选择 select(df,V1,V2,V3...) 选择V1,V2,V3数据 select(df,V1:V3) 选择V1到V3所有数据 t<-select(df,-c(V1,V3)) 选择除了V1,V3以外所有 distinct(...) 去重 distinct(df,V1,V2) 根据V1和V2两个条件来进行去重 在基础包里面也有一个去重函数unique() ※注意distinct()可以针对某些进行去重,而unique()只能对整个数据框进行去重...使用i DT[3:5] #选取3到5行数据 class(DT) [1] "data.table" "data.frame" DT[v1=="A"] #基于条件选择 DT[v1 %in% c("A",..."B")] 使用j DT[,v1] #选择v1 那如果我要选择呢,大家注意一下这里不是用c()来选取了, 而是通过.()来选取,注意前面有一个”.”号,所以我说data.table语法有点奇怪呢

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

介绍一种按照日期范围——例如按照周、月、季度或者年——对其进行分组超简便处理方式:R语言cut()函数。...## #dplyr中基本函数 select——子集选取(筛选变量,select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...")],function(x) sum(x)) 4、subset()函数 利用subset()函数进行访问和选取数据框数据更为灵活,subset函数将满足条件向量、矩阵和数据框按子集方式返回。...##对于数据框 x是对象,subset是保留元素或者行列逻辑表达式,对于缺失值用NA代替。 Select 是选取范围,应小于x。...5、which定位函数 功能:返回服从条件观测所在位置(行数),有一定排序功能在其中。

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Day6——R包

BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/") install.packages("dplyr")library(dplyr)dplyr五个基础函数示例数据...按筛选按号筛选select(test,1)#选择第一select(test,c(1,5))#选择第1和第5按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)...vars <- c("Petal.Length", "Petal.Width")select(test, one_of(vars))#选择字符向量中select中不能直接使用字符向量筛选,需要使用...one_of函数R语言中使用vars参数指定数据框中需要分析字段索引范围在R语言中,我们经常需要对数据框进行分析和处理。...这时,我们可以使用vars参数来指定需要分析字段索引范围,从而提取出感兴趣字段进行后续操作。vars参数是dply包中select函数一个参数,它允许我们通过指定字段索引范围选择需要字段。

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盘一盘Tidyverse| 只要你要只要我有-filter 筛选行

near()选择”中心值“,tol()设定范围,可以是值,可以是函数 msleep %>% select(name, sleep_total) %>% filter(near(sleep_total...:基础包 grepl() 函数, stringr 包 str_detect() 函数 msleep %>% select(name, sleep_total) %>% filter(str_detect...主要筛选函数: filter_all() 所有参与筛选,根据筛选条件筛选 filter_if() 逻辑判断确定哪些参与筛选,根据筛选条件筛选 filter_at() vars()函数定义哪些参与筛选...,根据筛选条件筛选 首先指定哪些,然后确定筛选器条件,多数情况下,需要.操作符引向待筛选值。.... 3 filter_at()筛选条件 优点:自定义待筛选,无需指定待筛选类型 #筛选sleep_total, sleep_rem两个变量,所有值均大于5行 msleep %>%

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Day6 呦呦鹿鸣—学习R包

iris可知其为150×5列表dplyr五个基础函数1.mutate(),新增列mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)mutate(df, z =...x + y)2.select(),按筛选,按名称选择变量(1)按号筛选select(test,1)# 筛选test数据集第一iris %>% select(1:3)# 筛选iris数据集第一到第三...(2)按列名筛选select(test, Petal.Length, Petal.Width)iris %>% select(Species, Sepal.Length)3.filter()筛选行/返回具有匹配条件行可以按照某分类变量值进行数据筛选..., test2, by = "x")满足两个条件:有相同变量名,相同变量名里有相同元素;2.左连left_join列表书写顺序决定了最终合成列表中顺序left_join(test1, test2...= 'x')6.简单合并bind_rows(test1,test2)函数需要两个表格数相同bind_cols(test1,test2)函数则需要两个数据框有相同行数思维导图生信星球打卡任务,菜鸟一枚

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数据处理第3部分:选择基本和高级方法

---- The data 根据之前博客文章,为了方便人们复制粘贴代码和实验,我使用是内置数据集。 此数据集内置于ggplot2中,因此如果您加载tidyverse,您将获得它。...Basic row filters 在许多情况下,您不希望在分析中包括所有行,而只包括选择行。 仅使用特定行函数dplyr中称为“filter()”。...包有一些强大变体可以一次过滤多个: *filter_all()将根据进一步说明过滤所有 *filter_if()需要一个返回布尔值函数来指示要过滤。...Filter at 其中一个更强大函数是filter_at():它不会过滤所有,也不需要你指定类型,你可以通过`vars()选择要发生更改。 论据。...这个参数允许在select语句中完成任何事情:所以你可以通过名称来引用它们,也可以通过逻辑数字函数,正则表达式等来引用它们(请参阅我第一篇博客文章中选择选项)。 第二个参数是选择条件

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生信代码:数据处理( tidyverse包)

dplyr包下主要是以下几个操作: select()——选择 filter/slice()——筛选行 arrange()——对行进行排序 mutate()——修改/创建 summarize(...1 mutate() mutate()与基础函数transform()相似,都可以添加新,但是允许引用刚刚创建: mydata <- tibble(x1=c(2,2,6,4),...(1,2) ##选取1,2 df %>% select(name,score) df %>% select(-3) ##同样也可以用start_with 或 end_with筛选出具有前缀或者后缀...df %>% select(start_with("n")) 3 filter() filter()是对数据行方向选择和筛选,选出符合我们条件某些行: df %>% filter( type==...,我们如果对个人或者科目感兴趣的话,可以使用group_by(name或者type),然后利用summarize函数就可以求出分类之后各个统计值。

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R语言筛选方法--select

我们知道,R语言学习,80%时间都是在清洗数据,而选择合适数据进行分析和处理也至关重要,如何选择合适进行分析,你知道几种方法? 如何优雅高效选择合适,让我们一起来看一下吧。 1....使用R语言默认方法:选择 这一种,当然是简单粗暴方法,想要哪一,就把相关号提取出来,形成一个向量,进行操作即可。...而且,后面如果想要根据特征进行提取时(比如以h开头,比如属性为数字或者因子等等),就不能实现了。 这就要用到tidyverse函数了,select,rename,都是一等一良将。...还要使用select进一步提取: 4. tidyverseselect函数 如果使用select函数,一行代码就可以搞定: a1 = fm %>% select(ID=TreeID, F1 = Rep...像这种情况,解决办法有两种: 5.1 绝对引用函数使用select时,要用dplyr::select a3 = a2 %>% dplyr::select(ID,F1,y1,y2,y3) 这样也比较麻烦

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左手用R右手Python系列5——数据切片与索引

----- R语言: ------------------ library(ggplot2) 我使用ggplot2内置mpg数据集来进行案例演示,数据框可以通过方括号传入行列下标的方式筛选各种符合条件取值范围...subset函数主要接受三个参数,数据框名称,筛选行,select筛选。或与且得逻辑表达与上述案例一致。...还有一种更加高级优雅得方式是使用dplyr包中select和filter函数进行行列索引与切片。...通过指定序号范围来提取行: mydata[1:10] #默认情况下序列范围是针对行切片(字符串默认则是针对索引) mydata[200:] #切出201个之后所有记录(Python数据类型默认从...好吧,讲了这么多,终于可以开始总结一下R语言与Python切片索引规则重要区别了: R语言中生成数据框使用圆括号,Python中则根据不同数据类型分别定义(列表用方括号、元组用圆括号、字典和几何用花括号

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R数据科学-1(dplyr

两个软件包中命令都可以与管道函数(%>%)很好地配合使用,这可以使代码更具可读性。详细内容可参考Cheatsheet手册。...head(mtcars),可以看到数据前面6行,属于数据一个预览。但是看不到各个属性。 %>%管道函数,其实就是将f()写在了数据后面,下面示例两个操作,都得到df,效果一样。...那么就涉及到变量提取。就会用到select函数,可以提取需要变量。有一个好处就是,不修改原是数据。...# … with 22 more rows 3.数据-变量条件筛选 dplyr::filter()函数对上述新产生变量数据df,进行筛选。...使用mutate函数。可以看到mpg1与new都变成了chr与fct。 提取new,看一下。

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【R语言】基础知识|dplyr管道函数处理表格

01 select()变形函数 dplyr安装就不展示了,dplyr包是内含多函数且功能强大数据处理包。...select(data, "销售城市", "产品类别", "销售员", "金额") ? 02 filter( ) filter( ) 函数 筛选数据框内容,选择产品类型是纯棉口罩数据。 ?...多条件筛选,只要在filter中多增加筛选条件即可 ? 03 mutate( ) mutate( )函数用来创建新数据框,创建新1为销售额。 ?...06 %>%管道操作符 %>%管道操作符,这个是我在dplyr包中最喜欢一个操作符了,它运用起来特别方便,能够连接前后两个步骤,实现嵌套使用简化代码同时还能避免存储多余中间值而节省内存空间。...它作用是把符号左侧返回结果,作为符号右侧调用函数第1个参数。实际上,x %>% f(...)相当于于f(x, ...)。 ?

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R&Python Data Science 系列:数据处理(1)

这一部分介绍一下R和Python数据处理用到筛选、衍生以及计算函数。主要介绍如何使用R语言和Python中两个程序包进行数据处理,R语言中dplyr和Python中dfply第三方包。...注意Python与R语言中有点不同,Python中使用X记录了每一步结果,当需要选择结果中是需要使用X,而R语言则不需要这个中间变量。...4 筛选函数 4.1 select函数 select函数用于选择数据集中某(几): Python实现 ##选择cut和price,取前3行 diamonds >> select(X.cut...,这里需要注意是,查看某列有几个唯一值,python中需要先select()函数选择这一,然后再使用distinct,或者先distinct,再使用select;若直接使用distinct,则所有全部输出...注意在python和R中distinct()函数有细微差别。 4.5 filter_by函数 按照某种条件进行筛选,python中也可以使用mask()函数,两者等价。

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