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R︱高效数据操作——data.table包(实战心得、dplyr对比、key灵活用法、数据合并)

2、按条件行筛选 从前用subset方式进行筛选比较多, new=14,select=a:f) (1)单变量 现在data.table与dplyr from_dplyr =...DT数据集按照x分组,然后计算v变量和、最小值、最大值。 (2)dplyr函数利用%>%(链式操作)来改进: 链式操作是啥意思呢?...在data.table中有三类数据合并方式: 1、直接用[] data_one[data_two,nomatch=NA,mult="all"] 以第一个数据为基准,依据key进行合并,只出现重复部分...—————————————————————————————————————————————— 六、额外参数(来源:R语言data.table速查手册) 1、mult参数 mult参数是用来控制i匹配到哪一行返回结果默认情况下会返回该分组所有元素...nomatch参数用于控制,当在i中没有到匹配数据返回结果,默认为NA,也能设定为0。

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左手用R右手Python系列6——变量计算与数据聚合

transform与mutate两个函数都是新建变量,但是前者仅能基于所提供数据框内变量进行新建,而后者则可以直接在新建变量基础上进行操作。...aggregate是专门用于分组聚合函数: aggregate(value~class,data,fun) #表达式左侧是要聚合目标度量,右侧是分组依据,紧接着是数据框名称,最后是聚合函数。...library(dplyr) 使用group_by函数结合summarize可以方便完成分组聚合功能。...R语言中分组聚合如果使用矢量函数来进行操作,会大大提升其执行效率: tapply(iris$Sepal.Length,iris$Species,mean) tapply(iris$Sepal.Length...使用pandas中groupby方法可以很快捷进行分组数据聚合。

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R语言数据处理:飞机航行距离与到达延误时间有什么关系??

数据分析有一半以上时间会花在对原始数据整理及变换上,包括选取特定分析变量、汇总并筛选满足条件数据、排序、加工处理原始变量并生成新变量、以及分组汇总数据等等。...带着这个问题,我们将首先使用dplyr包对给出航班数据进行处理。...在这个环节,主要历经三个过程: 数据分组(Split):可以指定目标变量,将数据进行分组。...3.2 应用函数及组合结果 我们使用dplyr包中summarize()函数,进行数据统计指标的获取及组合。计算出不同目的地平行航行距离以及平均延误时间。...这种运算符编写方式使得编程者可以按数据处理时思路写代码, 一步一步操作不断叠加,在程序上就可以非常清晰体现数据处理步骤与背后逻辑。

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R tips:使用!!来增加dplyr可操作性

这种易用性是有代价,假如想要对分析工作稍微增加一些编程属性时,就会发现dplyr异常情况,比如将分组变量赋值给一个变量使用变量进行分组: ### 分组变量group_var无法完成工作 group_var...辅助dplyr完成编程工作 上面的例子中,之所以group_var不起作用,是因为dplyr直接将group_var当做变量名,然后去mtcars中寻找名字叫做group_var列,这肯定是会报错。...为了可以让它执行,我们可以需要告诉dplyr,先对group_var求值,获得真正分组名:gear,使用gear进行后续操作,这个先求值操作可以通过!!运算符来完成。...,首先map逐一将分组变量group_v元素传递给mean_manual函数,传入mean_manual时,先使用!!...在mutate中完成新变量编程 假如想要在mutate中使用变量对新变量进行设置,其结果并不会如愿,比如,将新变量名var_name赋值为“gear_new",使用var_name进行mutate操作

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【R语言】dplyr对数据分组取各组前几行

所以在画图时候,也需要区分这三类。下面这张表就是GO富集分析得到结果,我们可以根据ONTOLOGY这一列来分组,就可以得到BP,CC和MF三个组。...然后取每一个组前10个条目或者前5个条目来绘制柱形图或者气泡图。 那么问题来了,如何分组取前几行。今天小编就跟大家分享一个专业处理数据框函数dplyr。...% head(n = 5) 虽然,我们使用了group_by进行分组,但是head并没有应用到三个分组上面,而是直接应用到了整个数据框上,事与愿违。...,wt是排序依据,根据校正之后p值来排序,n=-5是按从小到大排序。...filter(row_number() <= 5) r6 通过filter来控制行数<=5 最后我们来看看这六种方法得到结果究竟是不是一样dplyr这个包里面有函数叫all_equal专门用来判断两个数据框是不是一样

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从一件数据清洗小事说起

这是一个类json格式嵌套数据,其中存在两个变量,第一个变量是cusnum作为序号,第二个是一个类json嵌套变量,里面以类jsno格式嵌套了很多变量。 需要将这个数据集转换成如下格式: ?...实际上,for循环“只会在不恰当使用时”降低性能。 然而大佬毕竟是大佬,用科学态度做了实验并给出了结论: ?...其实这一期这么扯淡讲这么多事情,只是为了说明一点,data.table真的有很好性能,尤其在处理海量数据方面(在分组特别多时候,相比dplyr和pandas有2x~10x提升,来自官方文档)。...编程效率最重要来自于框架,框架如果一开始就不那么有效率,再怎么改进都是有限。 那么data.table框架优秀在哪儿呢? data.table之所以比dplyr要快,在于两者设计哲学不同。...相较之下,data.table则通过把数据处理中最常见“选取行”、“修改列”、“分组”三大操作通过dt[i,j,by]语法统一了一起来。

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「Workshop」第二期:程序控制与数据操作流

涉及编程数据和代码都会放到 https://github.com/XSLiuLab/Workshop 推荐图书 《R for Data Science》[1] 《R 语言编程指南》 《R 实战》 其他推荐见.../geek-r-tutorial/base.html 内容: 基础语法 控制与循环结构 函数与包 数据读取和保存 read....count summarize 简单汇总 分组汇总 group_by, ungroup 汇总函数 合并 bind_rows bind_cols semi_join anti_join left_join...write_* data.table 与 base 数据导入 fread 数据导出 fwrite data.table 语法 dt[i, j, by] 数据过滤与合并等操作与 R 基础语法一致,也可以使用...tidyverse 处理 整数索引 逻辑索引 命名索引 进一步学习参考小抄、文档和《R 语言编程指南》 后几期主题 本期未讲述内容???

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R入门?从Tidyverse学起!

这种入门学习路径属于base R first,学习流程基本是先了解变量类型、数据结构,再深入点就会学到循环与自定义函数。...有些类似于先认识编程,再按照数据处理、可视化、统计分析等应用方向开始下一个学习旅程。...那么,tidyverse就提供了一个很好学习思路(tidyverse first),让我们先忽略编程这道大关,其理念是一开始不谈向量、矩阵、数据框、因子、流程控制等概念,直接从数据操纵入手,让初学者在最短时间内学会数据处理与可视化应用...数据整理 tibble格式 R中对多变量数据标准保存形式是 dataframe,而tibble是dataframe进化版,它有如下优点: 1....5. summarise & group_by group_by通常与summarise搭配使用,如果我们需要对不同species数据计算均值,那么利用group_by指定需要分组列,summarise

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广义估计方程和混合线性模型在R和python中实现

控制变量(controlled variable):又称额外变量(extraneous variable)、无关变量,是除了实验因素(自变量)以外,所有可能影响实验变化和结果并需要进行控制潜在条件或因素...同时,它指与因变量有线性相关并在探讨自变量与因变量关系时通过统计技术加以控制 变量。常用变量包括因变量前测分数、人口统计学指标以及与因变量明显不同个人特征等。协变量应该属于控制变量一种。...有些控制变量可以通过实验操作加以控制(如照明、室温等),也称为无关变量;而另一些控制变量由于受实验设计等因素限制,只能借助统计技术来加以控制,即成了统计分析中变量,因而属于统计概念。...通过协变量patient考虑到他们内部观测值相关性后再对总体效应进行推断,如何确定分组需要考虑到组群变量。...区分混合线性模型中随机效应和固定效应是一个重要概念。固定效应是具有特定水平变量,而随机效应捕捉了由于分组或聚类引起变异性。比如下方正在探究尿蛋白对来自不同患者GFR影响。

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R语言︱数据集分组、筛选(plit – apply – combine模式、dplyr、data.table)

介绍一种按照日期范围——例如按照周、月、季度或者年——对其进行分组超简便处理方式:R语言cut()函数。...## #dplyr中基本函数 select——子集选取(筛选变量,列) select(Hdma_dat,pclass,survived) ##选择pclass变量 ?...2.aggregate函数不能对分组数据进行多种汇总计算,因此要用两句代码分别实现sum和max算法,最后再用cbind拼合。显然,上述代码在性能和易用性上存在不足。...tapply 只对单字段分组适用,在进行双字段联合分组时其结果为二维矩阵,用户还需要进行复杂处理才行,比如 tapply(orders$AMOUNT, orders[,c("SELLERID","CLIENT...在使用data.table时候,需要预先布置一下环境: data<-data.table(data) 如果不布置环境,很多内容用不了。

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分组统计你只想到group_by操作吗?

最近在研究excel透视图,想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅,顺便学习分享一下。R自带数据集比较多,今天就选择一个我想对了解mtcars数据集带大家学习一下R语言中分组计算(操作)。...目录 1 dplyr包中group_by联合summarize 1.1 group_by语法 1.2 summarise语法 1.3 group_by和summarise单变量分组计算 1.4...$ carb: num 4 4 1 1 2 1 4 2 2 4 ... 1 dplyr包中group_by联合summarize 1.1 group_by语法 data为数据集 ...为分组变量...> library(dplyr) #加载dplyr包 > by_cyl <- group_by(mtcars,cyl) #对mtcars数据集根据cyl变量进行分组注意行5 > by_cyl # A...2 10 19.2 6 168. 123 3.92 3.44 18.3 1 0 4 4 # ... with 22 more rows # 对分组数据相关变量进行函数计算

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R语言 分组计算,不止group_by

最近在研究excel透视图,想到好像自己在R-分组操作并不是很流畅,顺便学习分享一下。R自带数据集比较多,今天就选择一个我想对了解mtcars数据集带大家学习一下R语言中分组计算(操作)。...目录 1 dplyr包中group_by联合summarize 1.1 group_by语法 1.2 summarise语法 1.3 group_by和summarise单变量分组计算 1.4...$ carb: num 4 4 1 1 2 1 4 2 2 4 ... 1 dplyr包中group_by联合summarize 1.1 group_by语法 data为数据集 ...为分组变量...> library(dplyr) #加载dplyr包 > by_cyl <- group_by(mtcars,cyl) #对mtcars数据集根据cyl变量进行分组注意行5 > by_cyl # A...2 10 19.2 6 168. 123 3.92 3.44 18.3 1 0 4 4 # ... with 22 more rows # 对分组数据相关变量进行函数计算

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