)) %>% ungroup() %>% mutate(lab = type,type = as.numeric(fct_reorder(type, lq, median))) 定义绘图函数...margin(t = 10))) # 保存图像 ggsave(glue("plot/artists-{.state}.png"), height = 12, width = 8.5) } 绘制单个图
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝最近VIP群内有朋友询问火山图的绘制方法,那么本节就来详细介绍在R中如何使用「ggplot2绘制火山图」,小编添加了详细的注释希望各位观众老爷能够喜欢。...("data.xls", header = TRUE, sep = "\t") 数据清洗 plot_data % janitor::clean_names() %>% # 使用...janitor 包的 clean_names() 函数将列名转换为小写 mutate(fold_change = 2^log_fc) %>% # 计算折叠变化值 fold_change =...Il15", "Il34")) 数据可视化 plot_data %>% ggplot(aes(x = log2(fold_change), y = -log10(adj_p_val))) + # 绘制基础散点图...size = 1) geom_point(aes(color = gene_type), alpha = 0.6, shape = 16, size = 1) + # 从 up_genes 数据框中绘制特定形状的散点图
约翰·霍普金斯大学提供了一份数据集,使用这份数据集我们可以绘制一幅气泡地图展示这些确诊患者的分布,代码比较简单: 首先导入我们需要的几个 R 包: library(ggplot2) library(sf...worldmap % st_transform(crs = 4326) 把疫情数据读取进来并根据经纬度坐标把这个数据框转换成 sf 对象,同样使用...colnames% st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326) -> con_df 最后绘制地图...Novel Coronavirus (COVID-19) Cases, provided by JHU CSSE\nhttps://github.com/CSSEGISandData/COVID-19\n绘制
绘制条形图,简单调整柱子的宽度以及加上 x,y 轴标题。...这里的细节调整包括:使用 ggthemes 包中的 theme_tufte() 主题,viridis 包的 scale_fill_viridis() 离散配色。...注意:这里将柱子按照类别进行填充,当然你也可以使用另一个变量进行填充(下面会给例子)。...主要细节调整:geom_col() 中的 aes(fill = score),连续性变量填充使用 scale_fill_gradient2() 以及加上了图例。...当然这种技巧也可以使用其他图形中。读者如有需求,可以自行探索。
1绘制 ggplot(mydata) + + geom_bar(aes(x=a, y=b),width = 1,stat="identity", + colour = "black...(size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) 4.png 2绘制不带空心的玫瑰图...size=0.25), + axis.text.x=element_text(size = 13,colour="black",angle = myAngle)) image.png 3绘制带空心的玫瑰图
本节将从基础统计图形函数的功能、调用方式、参数说明和代码展示来探索统计函数的基本使用方法。由于不可能涉及到所有方面,如果有不全之处,可以评论或者网上查询。...1 bar()函数——柱状图 函数功能:在x轴上绘制定性数据的分布特征 调用方式:plt.bar(x, y) 参数说明: x:标识在x轴上的定性数据类别 y:每种定性数据的数量 代码展示: import...确定对齐方向,一般居中对齐,值为'center',为默认值,也是推荐值 color:柱体颜色,可以用颜色名称,也可以用十六进制颜色值 tick_label:x轴的标签,参数是一个列表 hatch:填充项,一般使用...:绘制离散有序数据 调用方式:plt.stem(x, y) 参数说明: x:指定棉棒的x轴基线上的位置 y:绘制棉棒长度 linefmt:棉棒样式 basefmt:指定基线样式 代码展示: x = np.linspace...', markerfmt = 'o', basefmt='-') plt.show() 8 boxplot()——箱线图 函数功能:绘制箱线图,可以识别异常值 调用方式:plt.stem(x) 参数说明
计算Bonferroni校正后的显著性阈值。这是通过将0.05除以GWAS数据中的行数(即测试的总数)来实现的,用于调整多重比较的影响。
绘制分段函数也是很常见的需求,实现分段函数的绘制也有多种方式。以下面 分段函数为例,进行说明。 ---- 方法一:直接根据分段函数的含义,根据x值的不同,相对应的函数值也不同,进行描点连线。...y=[y,0]; elseif(xx>=1.5 && xx<2) y=[y,(xx-1.5)*2]; else y=[y,1]; end end plot(x,y) %函数图像上加一个点...x0],[y0 y0],'r--') %画线 plot([x0 x0],[0 y0],'r--') hold off 运行效果 ---- 方法二:直接根据x判定结果的特性0,1值,把对x的判断巧妙的使用一个公式来实现不同情形要的结果...*(x>=2) plot(x,y) %函数图像上加一个点 x0=1.75 y0=0.5 hold on plot([0 x0],[y0 y0],'r--') %画线 plot([x0 x0],[0 y0...],'r--') hold off 实现相同的效果: 总之,绘制图像的时候要记得本质是“描点连线” ,可以以不同的实现方式来实现自己的目的。
本文利用R语言的ggplot2包,从头带您绘制文献级别的KEGG富集分析气泡图。...一 载入数据集和R包 library(ggplot2) pathway = read.csv("KEGG.csv",header=TRUE,check.names = FALSE) head(pathway...二 绘制KEGG气泡图 2.1初始化数据并绘制散点图 ggplot(pathway,aes(Pvalue,PATHWAY)) + geom_point() ?...scale_color_gradient(low="green",high = "red")+ # labs(color=expression(-log[10](Qvalue)),size="Gene", ##expression函数定义函数样式...四 参考资料 ggplot2:数据分析与图形艺术 好了,更换成自己的数据集即可以自己动手绘制KEGG通路气泡图了。
>% arrange(-age) %>% mutate(g_rank = row_number(), name = fct_reorder(name, age)) %>% ungroup() 绘制一个基础图...cent_bee$g_rank ) %>% arrange(x) %>% # 根据x坐标排序 mutate(id = row_number()) # 为每行添加一个唯一的id 调整点的位置 # 使用...circleRepelLayout函数调整点的位置,以避免重叠 pp_repel <- circleRepelLayout(pp_df, wrap = FALSE, sizetype = "area")...# 使用circleLayoutVertices函数获取调整后的点的坐标 pp_repel_out <- circleLayoutVertices(pp_repel$layout) 数据整合 pp_plot
❝本节来介绍如何使用「ggplot2」来绘制嵌套圆形图,图形绘制倒也简单主要是细节的调整结果仅供参考❞ 加载R包 library(tidyverse) 导入数据 bytes_total <- read_csv
这次我们将只使用3个库:httr通过GET函数检索数据;tidyverse 和 sf 用于空间分析和数据整理。...边界框 在我们用ggplot2做魔术之前再走几步。我们的目标包括欧洲和中东,因此我们希望确保我们主要占领欧洲。我们通过制作一个边界框来做到这一点。让我们使用 WGS84 坐标定义边界框的参数。...好了,伙计们,我们准备绘制欧洲河流的地图了。...我们首先绘制河流线,并根据定义的宽度根据类和宽度分配特定颜色。 由于我们的目标是将视野缩小到欧洲,因此我们使用coord_sf根据预定义的边界框设置纬度和经度限制。...我们将使用蓝色阴影来绘制我们的河流类。此外,我们将大小限制定义为从 0 到 0.3 的数值范围。我鼓励你玩这个范围,看看你会得到什么。
上一篇教程介绍了绘制完整地图的方法:R 语言绘制十段线地图,给特定省份填色,今天我们将继续探索分省市地图的绘制。 本文的所有代码以及数据可以在公众号后台回复 [中国地图绘制] 免费获得。...library(rgdal) library(ggplot2) library(maptools) library(mapproj) library(ggsn) library(readxl) library...然后,使用 left_join() 合并数据。...= `geometry`), color = 'Black',size=2)+ xlab("Long (°E)") + ylab("Lat (°N)") + ##更改图形颜色,不加这个语句使用随机配色...合并数据 小编使用的是 xlsx 格式的数据,因为可以创建多个 sheet,调用起来比较方便。
❝本节来绘制一个简单的绘图案例;暂且称之为轨道图;下面小编就通过一个详细的案例介绍如何绘制此图;关于此图的实践应用以后在做介绍 加载R包 library(tidyverse) library(systemfonts
欢迎关注R语言数据分析指南 ❝本节来介绍使用ggplot2绘制多组面积线图来展示趋势变化,下面小编就通过一个案例来进行展示,数据无实际意义仅作图形展示用,希望各位观众老爷能够喜欢。...group 列设为 stock_symbol 的值 stock_symbol = .x # 将 stock_symbol 列设为当前迭代的值 .x ) }) |> # 使用...companies 进行左连接操作 left_join(companies,by="stock_symbol") 数据可视化 df_base |> ggplot() + # 添加线图,使用...列用于区分不同的股票 geom_line(aes(date, close, group = group),alpha = 0.5,size = 0.1,colour = "grey") + # 添加面积图,使用...close, colour = stock_symbol, fill = stock_symbol), prices, alpha = 0.2, size = 0.5) + # 使用
❝本节来介绍如何对常见的柱状图稍加改造绘制成一张美观的面积图,下面通过一个小例子来进行展示; 加载R包 library(tidyverse) library(ggtext) 导入数据 df <-...ggplot(aes(x = year, y = mean_probability, fill = legend_text)) + geom_area(alpha = 0.95)+ # 也可使用...geom_col()来绘制条形图 geom_line(position = "stack", size = 0.1, color = 'gray40') + # 给面积添加灰色轮廓
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